zbio.net - main page Zbio.net > Calculations > Sequence tools > Six-frame translation Rambler's Top100  Russian version
Stormoff - laboratory for proffesionals project sponsor — "Stormoff"
MAIN PAGE · PROJECT · PROTOCOLS · PROGRAMS · LITERATURE · WEB · COMPANIES · MARKETPLACE · CLASSIFIED · FORUMS ·

Six-Frame Translation

 
       Name (not necessary):  
       Nucleotide sequence without name:
    (case insensitive, all letters except agctuswrymkhbdvn are disregarded)


       

       Nucleotide sequence:
       Output: nucleotides in one line;
       display the initial sequence;
       display complementary sequence in 5' --> 3' direction;

       Translation:
       Output: aminoacids in one line, code:  
       Frame number:
        +1;     +2;     +3;     all
        -1;     -2;     -3;    


       Alignment:
       align amino acids sequences relative to nucleic acid.


    This program translate nucleic acid sequence. Rare codons may be displayed with "Search of rare codons in nucleotide sequence".

    For manipulations with nucleic acid sequence (reverse, reverse/complement, double stranded) it is possible to use Sequence Utilities program.

    Standard symbols for polymorph nucleotides:

    Sg,CHA,C,T
    WA,TBC,g,T
    RA,gDA,g,T
    YC,TVA,C,g
    MA,CNA,g,C,T
    Kg,T  


Zbio.net: http://zbio.net
e-mail: editor@zbio.net
seen: 49987

    Supplement





       


See also:
/web-links/
Last modification: 24/02/06

MAIN PAGE · PROJECT · PROTOCOLS · PROGRAMS · LITERATURE · WEB · COMPANIES · MARKETPLACE · CLASSIFIED · FORUMS ·

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте.  ·  Новая сауна в Москве для парения.  ·  здесь можно скачать фильмы бесплатно  · 
--- сервер арендован в компании euhoster.ru, Финляндия, г.Хельсинки ---
 ·  term paper  ·  free dating sites  ·  Если нужна работа, заходите на Slando  · 
--- администрирование сервера: Intervipnet ---
 ·  Купить bluetooth гарнитуру на SotMarket.ru  ·  отличный выбор ванны чугунные с доставкой  ·  недорогие межкомнатные двери в интернет-магазине  · 

zbio.net  ·  editor@zbio.net  ·  advertizing

molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов   Rambler