Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Агарозный гель-электрофорез -- comments to a permanent page of the site --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Тема связана с: Агарозный гель-электрофорез
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Forum robot
Постоянный участник
на сервере в Москве



 прочитанное сообщение 11.01.2006 20:33     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Комментарии к постоянной странице сайта: Агарозный гель-электрофорез

Проведение и параметры агарозного гель-электрофореза. Выбор % геля для разделения: линейных; суперскрученных и кольцевых; одноцепочечных молекул DNA. Напряжённость поля. Количество DNA, которое можно наносить на дорожку. Выбор красителя для контроля фореза: Выбор красителя: бромфеноловый синий; ксиленцианол; Cresol red; OrangeG.
Гость
IP-штамп: frftLGqhpFF.A
гость



 прочитанное сообщение 11.01.2006 20:33     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Для оптимального разделения не очень больших фрагментов, можно пользоваться буфером для внесения по рецепту, указанному в каталоге MBI Fermentas:

6x Orange Loading Dye Solution (#R0631)
0.2% orange G
0.05% xylene cyanol FF
60% glycerol
60 mM EDTA

При этом ксиленцианол мигрирует с > 4 kb, а оранжевый - с 50 bp. Такой подход позволяет оптимизировать рабочее напряжение, а, соответственно, и разделение.

И еще - я человек в мол.биологии непросвещенный, а потому да простят меня профессионалы, если я скажу всем известную вещь: вносить образцы в лунки гораздо проще, если под камеру подложить листок темной (черной или синей) бумаги, чтобы оттеняла лунки.
Гость
IP-штамп: frl40BbmgYAq.
гость



 прочитанное сообщение 24.01.2006 14:40     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Люди, хелп! Если кто-нибудь знает что-то про технологию внесения биополимеров в гель под названием Shark Teeth, напишите, пожалуйста!
Участник оффлайн! mesentsev
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 24.01.2006 17:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

А почему бы заодно не добавить в текст, что рабочая концентрация бромистого этидия, например, 0,5 мкг/мл и что его можно добавлять прямо в гель, что гель с добавленным в него EthBr спокойно стоит ночь под электродным буфером без заметного вымывания из него краски? Полезные, вобшем-то факты, хоть и мелкие, но, с моей точки зрения, вполне не лишние.
Участник оффлайн! Re
Участник



 прочитанное сообщение 24.01.2006 19:16     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

(Гость @ 24.01.2006 11:40)
Ссылка на исходное сообщение  Люди, хелп! Если кто-нибудь знает что-то про технологию внесения биополимеров в гель под названием Shark Teeth, напишите, пожалуйста!

Акульи зубы - не гель. а гребенка в виде этих самых зубок. Втыкается в гель, и не вынимается, а образец наносится тонким-тонким носом в дырки между зубами. См. инструкцию к Макрофору. Только это не про агарозный форез.

Сообщение было отредактировано Re - 24.01.2006 19:16
Гость
IP-штамп: frl40BbmgYAq.
гость



 прочитанное сообщение 25.01.2006 13:42     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

2Re: что это гребенка такая, я знаю... Только сейчас вижу, что по формулировке моего вопроса кажется, будто это гель так называется:) Все, спасибо, уже поздно:) Только по моим данным, это имено про форез. Не знаю уж, про агарозный или ПААГ, по-моему, в данном случае не суть важно
Участник оффлайн! Oligolamer

Украина



 прочитанное сообщение 30.05.2006 15:09     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

Народ, а какова длина волны для визуализации ПЦР-фрагментов?
Я так понял, если окрашивают этидиум бромидом - то и Агарозный или ПААГ гель-электрофорез - всё равно?

Хм, нашёл ответы на свой вопрос:
ПДРФ и сиквенс
вопрос про трансиллюминаторы
Трансиллюминаторы

Лучше читать последнюю.

Сообщение было отредактировано Oligolamer - 01.06.2006 13:02
Участник оффлайн! Totty

Санкт-Петербург



 прочитанное сообщение 25.09.2006 23:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

народ, а как точно называется маркер мол веса (лестница)? и куда, как ее наносить?
:)
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение 26.09.2006 11:35     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

а почему в гел Этьбромид а не GelStar ? GelGreen ? GelRed ? SYBRSafe ?

а почему ТБЕ ТАЕ а не SB (sodium borate) ?

а почему UV а не Blue ( Safe Imager , Dark Reader , FlashGel)


А ПОКОЧАНУ smile.gif))))
:)
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение 26.09.2006 11:40     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

ответ от радио Molbiol - Не выпендрюйся Василий Иваныч-слушай свои "Валенки" smile.gif
:)
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  27.09.2006 12:53     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

1: Biotechniques. 2004 Feb;36(2):214-6. Links

Erratum in:
Biotechniques. 2005 Jan;38(1):60.
Sodium boric acid: a Tris-free, cooler conductive medium for DNA electrophoresis.

* Brody JR,
* Kern SE.

Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, MD, USA.

PMID: 14989083 [PubMed - indexed for MEDLINE]
:)
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  27.09.2006 12:54     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

All: 1
Review: 1
[Click to change filter selection through My NCBI.]

1: Electrophoresis. 2001 Mar;22(5):814-28.Click here to read Links
A whole new way of looking at things: the use of Dark Reader technology to detect fluorophors.

* Seville M.

Clare Chemical Research, Inc, Denver, CO 80206, USA. mseville@clarechemical.com

The Dark Reader optical system (Clare Chemical Research, Denver, CO, USA) uses relatively low intensity broad-band visible blue light in combination with broad-band optical filters to detect fluorescence with a level of sensitivity that often surpasses that of UV transilluminators and can rival that of laser-based scanners. Applications of DR (Clare Chemical Research) devices include the detection of DNA and SYBR-stained protein samples following, and also during, electrophoresis. Unlike laser-based imaging systems, the fluorescence is directly visible to the user as well as being fully compatible with charge-coupled device (CCD) and Polaroid camera-based detection and imaging. Additionally, the DR optical system functions well in multicolor fluorophor environments. Because the Dark Reader does not emit any UV light, the extent of DNA damage incurred when visualizing DNA samples is drastically reduced compared to the damage produced by a UV device and this can have a significant benefit on downstream cloning protocols. Furthermore, dye photobleaching is minimal, extending the length of time that a fluorescent sample is visible. The inherent flexibility of the DR optical system allows many different configurations of the Dark Reader to be constructed such as transilluminators, hand lamps and integrated transilluminator-electrophoresis units.

PMID: 11332748 [PubMed - indexed for MEDLINE]
:)
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  27.09.2006 13:01     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

Today's Featured Review
Biotium GelRed



Nucleic Acid dye

Until recently Sybr green had been our labs nucleic stain of choice. We have, however, recently migrated to Biotium’s GelRed. GelRed is a newer nucleic acid gel stain that is safer and more temperature stable than other dyes. GelRed is safer because it is non mutagenic and is diluted in water. It is more thermostable than Sybr dyes because it does not degrade with repeated freeze-thaws or long storage (couple months at RT) and can be stored at room temperature, and sensitivity seems to at least equal if not exceed Sybr green when visualized with UV transilluminator.

The dye is used similarly to Sybr dyes with staining (available at 10,000X ) or direct sample additions. The technology is not particularly ground breaking or new but the safety profile of this product makes it a viable alternative to potentially more dangerous dyes.

Review by Vitelli
Join Today
Scientific & Medical Experts Needed!
:)
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  27.09.2006 13:06     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

Using GelGreen 'In-Gel'
GelGreen DNA used in-agarose and viewed on a Dark Reader transilluminator Save Time......
GelGreen can be added to the agarose just before pouring a gel. DNA bands are stained almost immediately and there is no need to incubate in a bath of stain after electrophoresis.

Save even more Time......
Because GelGreen is very stable in aqueous solution, it is possible to make up and store agarose containing GelGreen for immediate use at a later date. Left; DNA samples separated using agarose containing GelGreen and viewed on a Dark Reader transilluminator.

GelGreen Safety
GelGreen is among the safest of the nucleic acid stains. Based on the Ames test, GelGreen shows no mutagenic effects on bacterial strains TA98 and TA1537 both with and without metabolic activation. Download the Biotium safety report here.
GelGreen versus SYBR Safe
GelGreen is more sensitive than SYBR Safe GelGreen is 2 - 3 times more sensitive than SYBR Safe. Using GelGreen in-agarose, it is possible to detect about 0.5 ng of dsDNA by eye and about 0.2 ng using a CCD camera.
:)
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  27.09.2006 13:17     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

FlashGel™ DNA System
Home > Research Products > Electrophoresis > Nucleic Acid Electrophoresis > FlashGel™

The FlashGel System is the fastest way to separate DNA and the only way to watch DNA migration as it happens. This revolutionary new tool separates DNA in 2 – 7 minutes. Monitor gel runs right at the bench, without UV light. The highly sensitive system allows a 5X reduction in DNA levels – saving both time and money.

* Get results in 5 minutes or less.
* Watch DNA migrate at your bench, in real-time without UV light.
* Enjoy outstanding resolution and exquisite sensitivity.

The FlashGel System consists of enclosed, disposable, precast agarose gel cassettes and a combination electrophoresis and transilluminator unit.

* FlashGel Cassettes contain precast, prestained agarose gels and buffer – no need for gel preparation, buffer addition or gel staining.
* The FlashGel Dock is an electrophoresis apparatus with a built-in transilluminator that provides both separation and detection.

See FlashGel Run!
:)
IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2
гость



 прочитанное сообщение 27.09.2006 13:23     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

это все называется "ДНК технология" - не путайте с одноименной фирмой smile.gif
Участник оффлайн! Ameba




 прочитанное сообщение 30.04.2007 19:03     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

всем привет.
вопрос: какие установки нужны для источника питания Эльф кроме вольтажа на см ванночки. Т.е. какие цифры в Амперах и Ваттах надо устанавливать???
спасибо
Участник оффлайн! varvarka




 прочитанное сообщение 23.07.2007 22:14     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

Здравствуйте!
Есть ли у кого-нибудь что-то по типу таблицы, выражающей зависимость подвижности красителей(бромфеноловый синий и ксилен цианол) от процентности агарозного геля? Какому размеру фрагментов они соответствуют при разделении в 0,7%, 0,8%, 1%, 2% и 3% геле? Заранее спасибо ответившим, особенно ответившим правильно wink.gif mol.gif
Участник оффлайн! varvarka




 прочитанное сообщение 23.07.2007 22:17     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

"...При этом ксиленцианол мигрирует с > 4 kb, а оранжевый - с 50 bp..."

а при какой процентности геля? Я так понимаю, как мигрируют красители именно от этого и зависит
Участник оффлайн! Alexkiev




 прочитанное сообщение 25.07.2007 14:44     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

Как лучше выделить днк 200п.н. из геля для последующей амплификации. Скорее всего малая концентрация? Спасибо
guest: ммм
IP-штамп: frwHRv5zEzGDY
гость



 прочитанное сообщение 25.07.2007 16:56     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

--Заранее спасибо ответившим, особенно ответившим правильно

--...При этом ксиленцианол мигрирует с > 4 kb, а оранжевый - с 50 bp..."

--а при какой процентности геля? Я так понимаю, как мигрируют красители именно от этого и зависит.

Вроде красители в агарозе мигрируют на одно и тоже Rf не зависимо от процентности.

А вот фрагменты сильно зависимо от процентности.

Берете 2 маркера 100b и 1000b и в разных процентностях агарозы гоните с красителями и очень хорошо определяете, что с чем бежит.

3 процентный агароз вам уже трудно будет растворить. Я так дУмаю-у<c>
Ъ
IP-штамп: frNwv0U1khjS.
гость



 прочитанное сообщение 25.07.2007 18:24     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #22 множественное цитирование

(Alexkiev @ 25.07.2007 14:44)
Ссылка на исходное сообщение  Как лучше выделить днк 200п.н. из геля для последующей амплификации. Скорее всего малая концентрация? Спасибо

Мне кажется это лишняя работа элюировать ДНК из геля для последующей амплификации. Срез геля в воду, заморозить-разморозить и 1-2 мкл на ПЦР. Вы реамплифицируете кг.
Участник оффлайн! Alexkiev




 прочитанное сообщение 26.07.2007 14:46     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #23 множественное цитирование

(Ъ @ 25.07.2007 18:24)
Ссылка на исходное сообщение  Мне кажется это лишняя работа элюировать ДНК из геля для последующей амплификации. Срез геля в воду, заморозить-разморозить и 1-2 мкл на ПЦР. Вы реамплифицируете кг.


Спасибо, попробую на следующей неделе. А что если уже выделил из геля с помощью QG и при исходнике с приблизительной количеством 50 нг получил 40 мкг в 40 мкл. На форезе 1,2% в 10 мкл пробы ясен перец ничего не видно, агароза супер. Поставил на ПЦР, отправил 20 мкл в смесь, жду результатов. Сколько приблизительно может быть продукта? Спасибо
Guest
IP-штамп: frk8PufZKUro2
гость



 прочитанное сообщение 27.07.2007 00:16     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #24 множественное цитирование

Вопрос 1: Может ли в реакции сильнее амплифицироваться плазмида, чем нужная вставка??
Вопрос 2: Кстати, знает ли кто-нибудь можно ли полученный продукт из ПЦР, точнее всю смесь после реакции ПЦР (уже полученная вставка, с конц. 1нг в 1 мкл, праймеры, нуклеот., полимераза, вода...), разделить на двое (по 25мкл) и довести оба эппендорфа до 50 мкл, добавив dNTP, праймеры, полимеразу... и запустить реакцию по новой, тем самым обезвредив концентрацию пирофосфатов... и в результате получить больше нужного продукта? ПЦР не дает внушительного количества. Спасибо
Участник оффлайн! Lesha
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 07.05.2009 12:21     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #25 множественное цитирование

Если требуется разделить суперскрученный и линейный 3kbp вектор, лучше использовать ~1% агарозу (в 2% линейная ДНК идет очень близко к суперскрученной, в 0.7% -- близко к релаксированной).

Если требуется проконтролировать циклизацию 3kbp фрагмента, то надо использовать 2% агарозу.
Участник оффлайн! RJ Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 08.05.2009 14:09     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #26 множественное цитирование

(Guest @ 27.07.2007 01:16)
Ссылка на исходное сообщение  Вопрос 1: Может ли в реакции сильнее амплифицироваться плазмида, чем нужная вставка??
Вопрос 2: Кстати, знает ли кто-нибудь можно ли полученный продукт из ПЦР, точнее всю смесь после реакции ПЦР (уже полученная вставка, с конц. 1нг в 1 мкл, праймеры, нуклеот., полимераза, вода...), разделить на двое (по 25мкл) и довести оба эппендорфа до 50 мкл, добавив dNTP, праймеры, полимеразу... и запустить реакцию по новой, тем самым обезвредив концентрацию пирофосфатов... и в результате получить больше нужного продукта? ПЦР не дает внушительного количества.  Спасибо

если у Вас не нарабатывается большое кол-во продукта (20 нг в мкл и выше), дело уж конечно не в пирофосфатах- откуда бы им взяться, коли буквы не включились в амплификат (его мало)? Скорее всего проблемы с праймерами- посмотрите, нет ли "бомбы" (димер праймеров) внизу, или полимераза дохнет, что вря ли. Если проблема не лечится "в лоб", то просто замешайте исходно большой объем смеси, грубо говоря, накопите продукт экстенсивным путем, и всех делов.
Ъ
IP-штамп: frh5mdI9nB8Yg
гость



 прочитанное сообщение 08.05.2009 14:59     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #27 множественное цитирование

(Guest @ 27.07.2007 00:16)
Ссылка на исходное сообщение  Вопрос 1: Может ли в реакции сильнее амплифицироваться плазмида, чем нужная вставка??
Вопрос 2: Кстати, знает ли кто-нибудь можно ли полученный продукт из ПЦР, точнее всю смесь после реакции ПЦР (уже полученная вставка, с конц. 1нг в 1 мкл, праймеры, нуклеот., полимераза, вода...), разделить на двое (по 25мкл) и довести оба эппендорфа до 50 мкл, добавив dNTP, праймеры, полимеразу... и запустить реакцию по новой, тем самым обезвредив концентрацию пирофосфатов... и в результате получить больше нужного продукта? ПЦР не дает внушительного количества.  Спасибо

Я наверное перегрелся на солнцепёке (отпуск все-таки) - не понимаю в чем проблема confused.gif плазмида или вставка, одна пара праймеров... confused.gif По классике в ПЦР сильнее амплифицмруется всегда более короткий фрагмент... Без бутылки не разберешься, дождусь вечера. smile.gif
guest: dragon
IP-штамп: fr.xhxKG0LvkM
гость



 прочитанное сообщение 08.07.2009 09:55     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #28 множественное цитирование

Здравствуйте, подскажите чем красить агарозный гель после щелочного электрофореза? И на какой стадии (до или после фиксирования в кислоте). Обязательно ли сушить?
Спасибо
guest: ммм
IP-штамп: frdsQJwk7r3sc
гость



 прочитанное сообщение 08.07.2009 12:08     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #29 множественное цитирование

-Здравствуйте, подскажите чем красить агарозный гель после щелочного электрофореза?

Бромий этидием или сибирским зеленым и иже с ними

-до или после фиксирования в кислоте.
После нейтрализации
-Обязательно ли сушить?
нет
Guest
IP-штамп: frbPGnT4OGKa6
гость



 прочитанное сообщение 22.07.2009 22:15     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #30 множественное цитирование

"если я скажу всем известную вещь: вносить образцы в лунки гораздо проще, если под камеру подложить листок темной (черной или синей) бумаги, чтобы оттеняла лунки"

Чем тогда думали в Сигма, если сделали столик в камере для фореза из белого пластика, к тому же скользкого smile.gif
Участник оффлайн! Dmitry S

Москва



 прочитанное сообщение 24.07.2009 11:19     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #31 множественное цитирование

(Guest @ 23.07.2009 02:15)
Ссылка на исходное сообщение   ...если сделали столик в камере для фореза из белого пластика, к тому же скользкого smile.gif


в первом случае можно наклеить синей изоленты под место, где карманы)) Но от скольжения избавиться сложно - гель частенько уплывает от любых дуновений во время фореза. хоть гвоздями прибивай
Участник оффлайн! Бору
Постоянный участник
Киев. обл., Украина



 прочитанное сообщение 16.06.2010 17:24     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #32 множественное цитирование

Можно ли заменить ТВЕ-буфер на Трис-СІ+EDTA для фореза ДНК, и какой молярности?

Сообщение было отредактировано Бору - 16.06.2010 17:28
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 16.06.2010 18:19     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #33 множественное цитирование

(Бору @ 16.06.2010 18:24)
Ссылка на исходное сообщение  Можно ли заменить ТВЕ-буфер на Трис-СІ+EDTA для фореза ДНК, и какой молярности?

За Трис.НСI в форезном буфере ставлю кол. no.gif
Участник оффлайн! Бору
Постоянный участник
Киев. обл., Украина



 прочитанное сообщение 16.06.2010 18:37     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #34 множественное цитирование

Борная кислота испорчена у нас.
Мож трис-ацетат тогда приготовить? Только порошок все равно 2в1 - Трис-СІ, других Трисов нет...
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 17.06.2010 08:49     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #35 множественное цитирование

(Бору @ 16.06.2010 16:37)
Ссылка на исходное сообщение  Борная кислота испорчена у нас.
Мож трис-ацетат тогда приготовить? Только порошок все равно 2в1 - Трис-СІ, других Трисов нет...


Похоже, это ко мне jump.gif . Поставляем наборы готовых гелей для электрофореза ДНК, рассчитанные на использование в ПЦРных лабораториях. В каждый комплект входит пузырёк ТАЭх20 (50 мл) для приготовления литра электрофоретического буферного раствора (EtBr 0,5 мкг/мл). Если нужно, то эти пузырёчки можно продавать и без гелей rolleyes.gif . Если интересно, то пишите. Ели реклама здесь неуместна, то удалите.

Файл/ы:

скачать файл ГОТОВЫЕ_ГЕЛИ_05.pdf
размер: 19.19к
кол-во скачиваний: 1634


Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 17.06.2010 11:40     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #36 множественное цитирование

(Бору @ 16.06.2010 19:37)
Ссылка на исходное сообщение  Борная кислота испорчена у нас.
Мож трис-ацетат тогда приготовить? Только порошок все равно 2в1 - Трис-СІ, других Трисов нет...

Ну как может испортиться борная кислота? confused.gif Купите тогда в аптеке.
Только ТРИС.ОН. Никаких CI- и Na+ в буфере для фореза.
5 mM борат тоже годится в качестве буфера для агарозного фореза. Читайте выше или поищите по форуму.
Участник оффлайн! Бору
Постоянный участник
Киев. обл., Украина



 прочитанное сообщение 17.06.2010 13:02     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #37 множественное цитирование

Борная кислота старая и "Ч." по квалификации чистоты. Надо заказывать новые реактивы.
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 18.06.2010 12:04     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #38 множественное цитирование

(Бору @ 17.06.2010 14:02)
Ссылка на исходное сообщение  Борная кислота старая и "Ч." по квалификации чистоты. Надо заказывать новые реактивы.

Могу отсыпать сухой (белый порошок) ТВЕ. И дам пропись как самому готовить. Но про Трис.НСI для фореза - забудь. Лучше водопроводную воду...
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.07.2010 21:22     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #39 множественное цитирование

(-Ъ- @ 18.06.2010 10:04)
Ссылка на исходное сообщение  Но про Трис.НСI для фореза - забудь. Лучше водопроводную воду...


Забудьте и про Трис-HCl, и про все прочие буферы на основе Триса. Наиболее продвинутые пользователи за бугром переходят на Li-борат и Li-ацетат. Давно хотел попробовать карбонатный буфер, но всё руки не доходили. Недавно дошли. Приготовили Li-карбонатный буфер. Форезы получаются отлично! При 10V/см ни перегрева, ни закисления или защелачивания. Очень рекомендую!
Участник оффлайн! mrotzek
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.07.2010 21:27     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #40 множественное цитирование

(genseq @ 21.07.2010 22:22)
Ссылка на исходное сообщение  Забудьте и про Трис-HCl, и про все прочие буферы на основе Триса. Наиболее продвинутые пользователи за бугром переходят на Li-борат и Li-ацетат. Давно хотел попробовать карбонатный буфер, но всё руки не доходили. Недавно дошли. Приготовили Li-карбонатный буфер. Форезы получаются отлично! При 10V/см ни перегрева, ни закисления или защелачивания. Очень рекомендую!



* ubMed will retrieve 2 records.

J Virol Methods. 2010 May 13. [Epub ahead of print]
Fast short-fragment PCR for rapid and sensitive detection of shrimp viruses.

Mrotzek G, Haryanti, Koesharyani I, Tretyakov AN, Sugama K, Saluz HP.

Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology, Hans Knoell Institute, Beutenbergstrasse 11a, 07745 Jena, Germany; Friedrich-Schiller-University, Jena, Germany.
Abstract

This article describes a fast short-fragment PCR method for the detection of white spot syndrome virus (WSSV), infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus (IHHNV), and monodon baculovirus (MBV). Fast two-temperature (95 degrees C denaturation and 60 degrees C annealing/extension) PCRs were performed in 5-10mul volume samples in miniaturized microplates using a fast Peltier thermal cycler. 40 cycles were completed in 25-30min. Rapid high-resolution agarose gel electrophoresis of 70-150bp PCR fragments was performed in 10min. High sensitivity of PCR product detection (50-100pg) was obtained using ultra sensitive dyes such as GelStar(®) and a gel documentation system equipped with a blue-light transilluminator. This novel method is faster and more sensitive than its TaqMan(®) real-time PCR counterparts. Copyright © 2010. Published by Elsevier B.V.
Участник оффлайн! Tom1
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.07.2010 21:29     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #41 множественное цитирование

да уж сам себя не похвались как оплеванный ходишь......©
Такие времена....©
Участник оффлайн! mrotzek
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.07.2010 21:30     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #42 множественное цитирование

(Tom1 @ 21.07.2010 22:29)
Ссылка на исходное сообщение  да уж сам себя не похвались как оплеванный ходишь......©
Такие времена....©


Томычь - получишь по морде smile.gif
Участник оффлайн! mrotzek
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.07.2010 21:33     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #43 множественное цитирование

(Tom1 @ 21.07.2010 22:29)
Ссылка на исходное сообщение  да уж сам себя не похвались как оплеванный ходишь......©
Такие времена....©


Кстати - тебе не лень баблоебством заниматся на www.molbiol.ru ? smile.gif
Участник оффлайн! Tom1
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.07.2010 21:42     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #44 множественное цитирование

Лень просто себя ломаю....
Такие времена....©
Участник оффлайн! achiffa
Участник



 прочитанное сообщение 23.09.2011 11:25     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #45 множественное цитирование

Подскажите, в чем можно мыть агарозные гели. Раньше мыла в ванночках для проявки фотографий, а сейчас их нет. Может, продаются специальные емкости?

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): basil2
guest: ммм
IP-штамп: frQlBxj4iQSg.
гость



 прочитанное сообщение 23.09.2011 11:44     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #46 множественное цитирование

Чашки Петри Вот она наша ванночка. А так иже коробочки и под маргарина и ПП контейнеры для холодильника.
Участник оффлайн! basil2
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.09.2011 12:27     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #47 множественное цитирование

(guest: ммм @ 23.09.2011 12:44)
Ссылка на исходное сообщение  Чашки Петри Вот она наша ванночка. А так иже коробочки и под маргарина и ПП контейнеры для холодильника.

... и не забыть добавить фейри!
В деревне Виллариба трагедия: горят их конопляные поля. А деревне Виллабаджио праздник! Ветер дует в их сторону! (с)
Участник оффлайн! RJ Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.09.2011 13:25     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #48 множественное цитирование

зачем мыть? Что мыть? А потом что? Не понял ничего. Новые высокие технологии?
Участник оффлайн! achiffa
Участник



 прочитанное сообщение 25.09.2011 11:51     Сообщение для модератора         Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #49 множественное цитирование

Если красить в этидии после фореза и потом промыть, чтобы не было излишнего перекрашивания фона. Понятно, все используют подручные средства. smile.gif
Участник оффлайн! Daemonarchestratygos
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  25.09.2011 14:02     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #50 множественное цитирование

картинка: facepalm2.jpg\\\\\

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): -Ъ-

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 17.12.18 23:38
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft