Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Новости генной терапии и молекулярной эволюции -- об интересной науке без волногонева --
Чёрный список: гости
     NB! в теме нельзя обсуждать тех, кто внесён в чёрный список
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 30.06.2020 13:43     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Решил начать аккомулировать интересные новости,

Ученые из США разработали метод генной терапии мышечной дистрофии Дюшенна (МДД) и проверяют его в клиническом исследовании, которое началось в ноябре 2017 года и продлится до марта 2021 года. Предварительные результаты опубликованы в журнале JAMA Neurology. У всех пациентов — участников исследования наблюдаются улучшения биологических и клинических показателей.

В клиническом исследовании SRP-9001 приняли участие четыре пациента — мальчики 4–7 лет. Препарат вводился пациентам однократно, внутривенно.

Биопсии мышечных тканей пациентов забирали до начала исследования и через 90 дней после введения препарата. Ученые использовали их для гистологического анализа, а также для проверки экспрессии микродистрофина методом иммуноблоттинга.

Серьезных побочных эффектов от введения препарата не наблюдалось. После инфузии SRP-9001 в мышцах детектировался микродистрофин. На основе анализа биопсий авторы делают вывод, что введение гена микродистрофина приводит к восстановлению функций белкового комплекса, ассоциированного с дистрофином.

Динамику мышечной функции пациентов оценивали по шкале NSAA. Через год после введения препарата у всех мальчиков наблюдались улучшения моторики. У пациентов также детектировалось значительное снижение уровня креатинкиназы в крови. Данная работа послужила основанием для дальнейших испытаний SRP-9001 на большей выборке больных. В настоящее время проходит рандомизированное плацебо-контролируемое исследование препарата с участием 41 пациента.

«На данный момент миодистрофия Дюшенна остается смертельной болезнью, и, как правило, пациенты не живут дольше 20–30 лет. Это заболевание сложно лечить, и генная терапия предоставляет нам долгожданные возможности постараться изменить течение этой болезни», — говорит доктор Джерри Мендел, первый автор статьи и главный исследователь Центра генной терапии при Общенациональной детской больнице.

Подробнее со ссылкой на статью: https://pcr.news/novosti/vektornaya-dostavk...ofii-dyushenna/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 11.07.2020 03:58     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Biomineralization toolkit
Вышла статья «The ‘biomineralization toolkit’ and the origin of animal skeletons», которую, как я полагал, Александр Марков осветит в Элементах. В статье рассматривается гипотеза ‘biomineralization toolkit’, согласно которой хотя скелеты во многих группах животных возникли от бесскелетных форм независимо, в их основе лежит общий набор неких генов и некий органический каркас для будущего минерального скелета. В этой статье мне понравилась схема эволюции неорганического скелета, на которой показаны разный минеральный состав. Кремневые скелеты встречаются у низших многоклеточных и, по-видимому, являются одними из древнейших, однако потом полностью утрачивают актуальность. Обогащенные магнием кальциты почти не встречаются в более молодых группах. А вот фосфатные и арагонитовые скелеты – «хиты скелетной эволюции».

https://olnud.livejournal.com/379137.html
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 12.07.2020 23:06     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Блокировка белка MDM2, способствующего росту злокачественной опухоли, увеличивает эффективность противораковой иммунотерапии. Об этом сообщается в статье, опубликованной в Cell Death Discovery.

https://pcr.news/novosti/immunoterapiyu-opu...wCRmsKE0bHWEFkw
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 14.07.2020 10:05     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

Происхождение митохондрий: общий предок с риккетсиями и неизвестными морскими альфа-протеобактериями

Хотя происхождение митохондрий от альфа-протеобактерий считается общепризнанным, детали филогенетической связи митохондрий и современных альфа-протеобактерий остаются не до конца понятными. В новом исследовании показано, что предки митохондрий являются обособленной ветвью в эволюционном дереве альфа-протеобактерий. Они разделяют общего предка с риккетсиями, а также с пока еще не описанными группами морских альфа-протеобактерий.

Чтобы проверить, насколько исключение из анализа быстро эволюционирующих последовательностей исказило результаты предыдущих исследований происхождения митохондрий, ученые применили несколько альтернативных биоинформатических подходов. Чтобы избавиться от «филогенетического шума», неизбежно возникающего при исследовании эволюции далеких групп организмов, авторы систематически исключали из последовательных процедур анализа геномов некоторые таксоны, на каждом этапе сохраняя информацию о выявленных заменах во всех областях.

Результаты нового, более глубокого и детального анализа подтвердили, что предки митохондрий относятся к альфа-протеобактериям. Наиболее близки к митохондриальным предшественникам бактерии группы Rickettsiales. Кроме того, включение в анализ метагеномных данных выявило близких родственников митохондрий среди пока еще не описанных морских альфа-протеобактерий, известных по метагеномному анализу.

Подробнее и ссылка на оригенальную статью: https://pcr.news/novosti/proiskhozhdenie-mi...BoWCPyzqvr1RoCc
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 14.07.2020 10:15     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Может общепринятая "упрощенность" рикетсий это не регресс, а первоначальная простота?
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 14.07.2020 15:21     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

Мечта диванодава: съел таблетку, и как бы стал Шварценеггером!

Из плазмы мышей ученые выделили белок, уровень которого повышался при физической активности. Это гликозилфосфатидилинозитол (GPI)-специфическая фосфолипаза Di (Gpld1), фермент, образующийся в печени. В крови тренированных мышей его концентрация была выше, чем в крови нетренированных. Ученые обнаружили корреляцию между концентрацией Gpld1 в плазме мышей и улучшением выполнения тестов на обучение и память. Содержание Gpld1 в плазме старых мышей удалось повысить введением соответствующего гена, это привело к стимуляции нейрогенеза и к улучшению выполнения тестов на обучение и память. Более того, у активных пожилых людей уровень Gpld1 в плазме также оказался выше, чем у пожилых людей, ведущих неактивный образ жизни.

По-видимому, Gpld1— это тот самый циркулирующий в крови фактор, который опосредует эффект физической активности на работу гиппокампа в пожилом мозге. Вместе с тем, его уровень повышался в крови, а не в мозге, так как Gpld1 не проходит через гематоэнцефалический барьер. Биологическая роль Gpld1 не вполне ясна, но было показано, что он участвует в нескольких сигнальных путях, вовлеченных в важные биологические процессы. Ученые считают, что нашли связующее звено между печенью и мозгом, которое передает последнему эффект физических упражнений.

Из этой работы возникает очень интересное предположение, что можно имитировать эффект физической активности с помощью лекарства.

«Мы всегда убеждаем людей больше заниматься физическими упражнениями, но далеко не каждый способен это делать, — говорит молекулярный биолог из Принстонского университета Колин Мёрфи, изучающий вопросы старения. — Возможность вместо этого принять таблетку выглядит очень заманчиво».
https://pcr.news/novosti/belok-iz-krovi-tre...ykh-zhivotnykh/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 18.07.2020 11:24     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

ТАСС, 14 июля ( https://nauka.tass.ru/nauka/8963391?fbclid=...WPhX_lLDWUqip2A ). Ученые впервые полностью расшифровали структуру Х-хромосомы, создав полную "побуквенную" виртуальную копию этой части генома. Результаты их исследования опубликовал научный журнал Nature.
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2547-7
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 18.07.2020 19:52     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Природа очень "любит" многофункциональные ферменты

Ученые из Канады открыли новую функцию РНК-полимеразы II: она участвует в регуляции биогенеза рибосом.
https://pcr.news/novosti/rnk-polimeraza-ii-...enezom-ribosom/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 19.07.2020 03:39     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

Исследователи из США и Китая заявили о создании редактора цитозина на основе дезаминазы APOBEC3G и никазы Cas9. Новый редактор оснований отличается повышенной точностью и способен различать два цитозина в мотиве 5’-CC-3’, модифицируя только второй из них.

Редакторы цитозина, созданные путем слияния дезаминазы с никазой Cas9, считаются более точным инструментом для устранения точечных мутаций, чем программируемое редактирование генома с помощью введения двуцепочечных разрывов при помощи Cas9 и последующей репарации. Однако все редакторы такого рода имеют общий существенный недостаток: они модифицируют все остатки цитозина, которые находятся в зоне их действия, а не только один остаток, который требуется. Особенно сложны для изменения с помощью редактора цитозиновых оснований последовательности, в которых таргетный цитозин соседствует с другим цитозином (5’-CC-3’) — все существующие редакторы цитозиновых оснований превратят в тимин оба. В то же время, около 38% патогенных однонуклеотидных полиморфизмов человека связаны с заменой T на C (в результате замены получается последовательность CC), поэтому создание высокоточных редакторов цитозиновых оснований необходимо.

В статье, опубликованной в Science Advances, сообщается о создании нового высокоточного редактора цитозиновых оснований, который даже в последовательности 5’-CC-3’ модифицирует не оба цитозина, а лишь тот, который расположен ближе к 3’-концу. Точность редактора повышена за счет использования дезаминазы APOBEC3G.

Подробнее: https://pcr.news/novosti/vysokotochnyy-reda...-v-cc-motivakh/

По ссылке возможно обсуждение.
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 19.07.2020 10:20     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Вирусы как эволюционный фактор!

Исследователи из Национальных институтов здравоохранения, США, показали, что белок оболочки человеческого эндогенного ретровируса регулирует дифференцировку стволовых клеток в нейроны.
https://pcr.news/novosti/vyklyuchenie-musor...etki-v-neyrony/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 24.07.2020 20:32     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

Исследованы геномы возбудителя натуральной оспы у древнего населения Северной Европы. Для четырех образцов получены практически полные геномные последовательности. Оказалось, что вирус эпохи викингов принадлежал к вымершей кладе вируса натуральной оспы, сестринской по отношению к более современным.

Международная группа под руководством вирусолога Терри Джонса из Института вирусологии клинического центра Шарите (Берлин) и палеогенетика Мартина Сикоры из университета Копенгагена вместе с Барбарой Мюлеман из Шарите провела поиск древних геномов вируса оспы. В исследовании приняли участие российские ученые — сотрудники НИИ и музея антропологии МГУ, истфака МГУ и Музея антропологии и этнографии им. Петра Великого (Санкт-Петербург).

«Когда мы узнаем, как болезнь мутировала во времени, это дает нам возможность составить каталог мутаций, которые могут появиться в будущем: какие мутации и их комбинации делают такой патоген жизнеспособным и успешным? Если у них были эти мутации в прошлом, они, скорее всего, могут получить их снова. (…) Это один из немногих примеров, когда древние генетические исследования имеют прямое значение для современного и будущего здравоохранения», — говорит Мартин Сикора. Оспа побеждена, но в природе существуют родственные вирусы.

https://pcr.news/novosti/genomy-virusa-ospy...AJaIRkJneSkMIIQ
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 24.07.2020 21:09     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

Создан флуоресцентный краситель, который связывается с четырехнитевой структурой ДНК — G-квадруплексами. Впервые ученые наблюдали образование таких структур в живых клетках в режиме реального времени.

https://pcr.news/novosti/chetyrekhnitevuyu-...-zhivoy-kletke/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 29.07.2020 05:29     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

Причины половых различий в строении головного мозга мужчин и женщин активно обсуждаются. Часть исследователей склоняются к «гонадоцентричной» версии, полагая, что эти анатомические различия связаны с воздействием половых гормонов. Разумеется, необходимо учитывать и воздействия среды, вызванные принадлежностью человека к женскому или мужскому полу. Однако результаты, полученные сотрудниками NIMH, показывают, что особенности развития головного мозга мужчины и женщины могут напрямую зависеть от активности генов в половых хромосомах нервных клеток.

«Тот факт, что мы наблюдали очень высокий уровень воспроизводимости анатомических половых различий в разных группах мужчин и женщин, а также связь между этими различиями и экспрессией генов половых хромосом, предполагает, что эти различия, вероятно, не являются результатом одних только воздействий окружающей среды», — говорит доктор Армин Разнанан, руководитель отдела нейрогеномики развития NIMH и один из авторов работы. Вклад этих различий в особенности мышления, поведения, психического здоровья у того и другого пола еще предстоит исследовать, отмечается в статье.

https://pcr.news/novosti/polovoy-dimorfizm-...h-khromosomakh/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 10.08.2020 00:31     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

Близкородственные скрещивания в Палестине скорее всего связаны с большим религиозным разнообразием. И религиозным инбридингом Интересно, есть ли разница в заболеваниями в зависимости от религии? Конечно, это должно быть связано с эффектом основателя, а религиозными различиями. Еврейская популяция в Иерусалиме панмиксная.

В ходе исследования, проведенного в 2000–2003 гг. было показано, что дети в палестинской популяции почти в 7 раз чаще страдают врожденной или ранней глухотой, чем дети еврейского происхождения в Иерусалиме. При этом в Палестине все еще распространены близкородственные браки (таковыми можно считать 24% от всех браков, заключенных с 2005 по 2009 годы). В новой работе ученые описали генетические факторы наследственной потери слуха и связали их с близкородственными браками.
https://pcr.news/novosti/genomnyy-analiz-na...oy-populyatsii/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 10.08.2020 05:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

Нехватка функционального фактора ASF1 приводит к альтернативному удлинению теломер — независимому от теломеразы основанному на рекомбинации механизму поддержания теломер. Это явление характерно для ряда злокачественных опухолей и наблюдается в клетках линии U2OS (клетки остеосаркомы), но не в клетках HeLa. В отсутствие TLK1/2 в клетках HeLa альтернативное удлинение теломер активировалось, а в клетках U2OS — дополнительно усиливалось. В обоих случаях альтернативное удлинение теломер приводило к запуску сигнального пути врожденного иммунитета cGAS-STING-TBK1. Остановка удлинения теломер приводила к уменьшению активности этого сигнального пути.

Авторы исследования продемонстрировали, что уровень экспрессии гена TLK2 во многих видах раковых клеток человека положительно связан с уровнем хромосомной нестабильности, однако отрицательно связан с активностью сигнальных путей, которые задействованы в работе врожденного и приобретенного иммунитета. Поскольку хромосомная нестабильность и альтернативное удлинение хромосом запускают сигнальные пути иммунной защиты, высокие уровни TLK ослабляют распознавание злокачественных клеток иммунитетом.

Таким образом, ингибирование TLK-киназ может быть одним из новых подходов в онкотерапии.

Источник
Sandra Segura-Bayona et al. // Tousled-Like Kinases Suppress Innate Immune Signaling Triggered by Alternative Lengthening of Telomeres // Cell Reports, Vol. 32, No. 5, 2020.
DOI: 10.1016/j.celrep.2020.107983

https://pcr.news/novosti/kinazy-tlk-meshayu...nkozabolevaniy/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 10.08.2020 07:10     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

С одной стороны вирус избегает бытрого иммуного ответа, но такое избегание требует от вируса увеличение затрат на производство антииммуного щита. Типичная для эволюции соревнование меча и щита. - ВШ

Замечание к данной статье: https://pcr.news/novosti/aktivatsiya-makrof...ov-v-setchatke/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 13.08.2020 22:13     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

Для сохранения кораллов изменим их генетику?

Coral reefs get their genetic revolution
Using genetic tools, it's now possible to predict which corals will survive bleaching events.
Lucy Marita Jakub
Scientists have concocted many schemes to save coral reefs from climate change. Assisted migration. Selective breeding. Manipulating the coral microbiome.

Many of these conservation techniques are risky and unproven, but the stakes are high; the United Nations Intergovernmental Panel on Climate Change predicts that with a 2˚C increase in global temperatures, 99 percent of corals will be lost to bleaching.

"We are desperate," Mónica Medina, a coral reef biologist at Penn State University, told EHN.

There's a glimmer of good news. A new study published yesterday in Science offers a new roadmap for coral conservation using the tools that have revolutionized our understanding of the human genome. With cutting-edge genetics, it's now possible to predict which corals will bleach and which ones won't.

"That's a great asset to conservation efforts," Stephen Palumbi, a coral reef biologist at Stanford University who was not involved with the study, told EHN.

The effort is a fruitful symbiosis between population geneticists and coral biologists.

Marine heatwaves devastate reefs, causing coral polyps to eject the symbiotic algae that live within their tissues. Without their photosynthesizing tenants to make sugars and nutrients, the polyps starve. But some corals can weather the heat, and hold onto their symbionts—a trait that turns out to be largely heritable.

By propagating branches from these survivors it's possible to selectively breed heat tolerant individuals, and use them to repopulate reefs.

This strategy has an obvious drawback: we only know which corals are hardy after everything else dies. But if you can screen for that adaptation in a coral's genome, "you don't have to wait for mass bleaching events to reveal these tolerant corals," Zachary Fuller, a population geneticist at Columbia University and lead author of the study, told EHN.
https://www.dailyclimate.org/coral-reef-cli...7JE31SglkD4PavA
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 23.08.2020 03:20     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

Ученые из Германии испытали на мышиной модели новый подход к генной терапии наследственной слепоты, не связанный с редактированием или доставкой функционального гена. Выполненная с помощью CRISPR-Cas активация транскрипции (трансактивация) собственного неактивного гена организма, сходного с геном, пораженным мутацией, улучшила состояние сетчатки и замедлила деградацию фоторецепторов. Работа опубликована в Science Advances.

Один из привлекательных подходов к генной терапии — использование каталитически неактивного dCas9, слитого с активатором транскрипции (dCas9-VPR); такая конструкция, нацеленная на неактивный ген, «включает» его. У многих генов, ассоциированных с заболеваниями, есть гомологи, которые выполняют сходные функции, но экспрессируются в клетках другого типа. Активация транскрипции такого гена может скомпенсировать заболевание.

https://pcr.news/novosti/degradatsiyu-setch...hyu-crispr-cas/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 23.08.2020 13:06     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

Исследователи из Финляндии изучили, как химический состав слизи шейки матки влияет на сперматозоиды, несущие разные варианты HLA. Они взяли образцы спермы у 8 мужчин и образцы слизи у 9 женщин и изучили подвижность, гиперактивацию и жизнеспособность сперматозоидов во всех возможных комбинациях. Все мужчины и 8 женщин имели европейское происхождение, еще одна участница исследования была родом из Азии. Чтобы нивелировать эффект физических свойств слизи, перед экспериментом ученые разрушали муцин и разбавляли ее, понижая вязкость. Все участники исследования были предварительно генотипированы с помощью полногеномного анализа однонуклеотидных полиморфизмов, также для них были определены аминокислотные последовательности HLA I и II классов.

Авторы работы показали, что помимо индивидуальных особенностей спермы и слизи, важную роль в успешном оплодотворении играет именно удачная комбинация слизи и спермы. Иными словами, влияние слизи одной и той же женщины на свойства сперматозоидов от разных партнеров существенно различается. В тех случаях, когда варианты HLA у мужчины и женщины совпадают, подвижность сперматозоидов в слизи меньше, чем у сперматозоидов иммуногенетически далекого мужчины. Впрочем, сила выраженности воздействия слизи зависит и от генотипа самого мужчины. В то же время степень генетических различий между партнерами на уровне целых генотипов не связана с подвижностью сперматозоидов в слизи. По этой причине, как полагают ученые, в ходе эволюции механизм посткоитальной регуляции эффективности оплодотворения возник не как способ защиты от инбридинга, а как путь для повышения иммуногенетического разнообразия потомства и, соответственно, для лучшей адаптации к различным патогенам.

https://pcr.news/novosti/na-uspekh-oplodotv...-spermatozoida/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 23.08.2020 13:10     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

Итак, у природы есть механизм противостоящий снижению разнообразия. В реальях такой механизм противостоит тому, что называется "естесственный отбор" - ВШ
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 25.08.2020 02:19     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

Исследователи показали, что болезнь Паркинсона сопровождается изменением метилирования и гидроксиметилирования энхансеров — регуляторных участков генов в нейронах префронтальной коры. Ключевую роль в этих изменениях играет ген TET2, активность которого повышена при болезни Паркинсона. Снижение уровня продукта этого гена может стать новым путем терапии заболевания.
https://pcr.news/novosti/v-razvitie-bolezni...ad-epigenetika/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 25.08.2020 02:35     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #22 множественное цитирование

Ученые подтвердили возможность детекции РНК-вирусов с помощью ДНК-нанопереключателей на вирусе Зика. Для экспериментов они использовали плазмиду pFLZIKV, содержащую полную последовательность генома вируса. РНК с плазмиды транскрибировалась in vitro.

Так как длинная РНК вируса может образовывать вторичные структуры, снижающие вероятность ее связывания с нанопереключателем, авторы расщепили ее на фрагменты короче 200 нуклеотидов. Детекция фрагментированной РНК вируса Зика с помощью одного нанопереключателя прошла успешно. Ученые повысили чувствительность платформы, сконструировав множество нанопереключателей, каждый из которых распознавал свой участок вирусного генома. При использовании комбинации из 18 ДНК-переключателей система детектировала РНК вируса Зика в концентрации 2,1×106 копий в 10 мкл реакционной смеси.

Специфичность платформы подтвердили на геномах вирусов Зика и денге. Было показано, что нанопереключатели, распознающие вирус Зика, не реагируют на вирус Денге, и наоборот. Авторы сконструировали нанопереключатели для детекции вирусов Зика и денге таким образом, что при связывании с мишенями они мигрировали в геле с разной скоростью. Это дало возможность одновременно выявлять присутствие РНК двух возбудителей в смеси. Далее ученые показали, что аналогичным образом можно дифференцировать штаммы одного возбудителя, например, штаммы вируса Зика из Камбоджи (FSS13025) и Уганды (MR766).

Детекции РНК патогена в биологических жидкостях могут мешать нуклеазная активность и вариабельность вирусной нагрузки у пациентов. Для преодоления этих ограничений авторы предложили два подхода: дополнительная обработка клинических образцов для экстракции РНК или предварительная амплификация. Ученые имитировали инфицированные клинические образцы, смешивая частицы вируса Зика с человеческой мочой. Для проверки первого подхода они использовали коммерческие наборы для выделения РНК и добились чувствительности 1,7×105 копий вирусных геномов в 1 мл. Второй подход предполагает использование техники изотермической амплификации РНК NASBA. Эта техника позволила увеличить чувствительность метода до 102 копий/мл и сократить время анализа до пяти часов.

Наконец, ученые показали, что с помощью ДНК-нанопереключателей и стратегии NASBA можно детектировать РНК SARS-CoV-2. Метод позволял обнаружить транскрибированную in vitro РНК нового коронавируса в человеческой слюне в минимальной концентрации 200 копий/мл.

Авторы отмечают, что анализ с помощью ДНК-нанопереключателей не требует сложной лабораторной инфраструктуры, а потому имеет относительно низкую стоимость. Они утверждают, что процесс конструирования и очистки нанопереключателей быстрый и несложный: платформу можно адаптировать к новому вирусному патогену в течение одного-двух дней с момента получения последовательности-мишени, что позволит снизить экономический и демографический ущерб от эпидемии.

Источник
Lifeng Zhou, et al. // Programmable low-cost DNA-based platform for viral RNA detection. // Science Advances 21 Aug 2020: eabc6246; DOI: 10.1126/sciadv.abc6246  https://pcr.news/novosti/dnk-nanopereklyuch...i-virusnoy-rnk/



Очень интересный подход. Как всегда проблема выбора наиболее консервативного участка вируса, чтобы избежать зависимости от мутаций. Но это и ахиллесова пята метода. Консервативные участки могут совпадать у разных видов и изолятов вируса. Особенно это критично для вируса лихорадки денге.
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 28.08.2020 00:41     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Геном каждого человека уникален и содержит множество генетических вариаций - особенностей, закодированных в ДНК. Эти вариации влияют на нашу внешность, поведение, способности, склонности к болезням у нас и детей. Первое прочтение генома человека обошлось в миллионы долларов, но сейчас эта процедура доступна для многих, главное - правильно понять результаты.

В нашей энциклопедии собрана информация о наиболее значимых вариациях человеческого генома, о генах, о связанных с ними признаках и болезнях. Все статьи имеют ссылки на публикации в научных журналах и курируются экспертами. Энциклопедия постоянно пополняется новыми данными.

Генетическая энциклопедия "Генокарта" создана экспертами компании ООО "РуДжин", сотрудниками Новосибирского государственного университета, и авторами из научной и медицинской среды России.

Редакция приглашает к сотрудничеству новых авторов.

Приглашаем в команду проекта Новостного редактора, PR менеджера, Специалиста по продвижению в научном сообществе и Руководителя проекта.

https://genokarta.ru/about


Сообщение в колонке новостей: Информация, связанная с нашей профессиейСообщение в колонке новостей, раздел "Информация, связанная с нашей профессией"
28.08.2020 00:41
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 28.08.2020 08:44     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #24 множественное цитирование

Для создания базы кишечных виромов авторы статьи в Cell Host&Microbe воспользовались результатами метагеномного секвенирования из 32 исследований, находящихся в открытом доступе. Эти исследования охватывали метагеномы как здоровых детей и взрослых, так и пациентов с различными заболеваниями (например, с диабетом или ВИЧ-инфекцией) либо после фекальной трансплантации. Кроме того, исследования проводились в разных областях земного шара. Наибольшее количество данных было получено из США и Китая. База виромов получила название Gut Virome Database (GVD) и доступна на ресурсе iVirus.

С помощью кластерного анализа ученые выявили в базе виромов более 33 тысяч вирусных популяций (общностей близкородственных вирусов). Среди них около 97,7% относились к бактериофагам, 2,1% составили вирусы эукариот, 0,1% — вирусы архей.

В процессе анализа выяснилось, что метагеномные данные из различных исследований, связанных с одними и теми же болезнями, плохо сопоставимы, так как технические аспекты сильнее влияют на состав вирусных популяций, чем статус пациента. В результате кластеризуются вирусные популяции, полученные в исследованиях со схожей методологией, а не со схожими характеристиками пациентов.
https://pcr.news/novosti/raznoobrazie-virus...it-ot-vozrasta/
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 30.08.2020 21:57     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #25 множественное цитирование

Для колонизации кишечника бактериям важно удержаться на субстрате. В статье, опубликованной в Nature Communications, описан механизм, позволяющий R. champanellensis — бактерии, осуществляющей гидролиз целлюлозы в кишечнике человека — оставаться связанной с растительным субстратом. Связь осуществляется за счет целлюлосомы — сети высокоаффинных белков докеринов и когезинов, заякоренной на стенке бактерии комплексом DocB:CohE. Исследователи изучили структуру этого комплекса при воздействии сил разной величины с помощью атомно-силовой микроскопии и FRET. Оказалось, что белки соединяются двумя способами: один позволяет удерживать сеть при возрастающей нагрузке, второй — открепляться при низкой. В переключении играет роль примыкающий к докерину домен XMod. Авторы также подтвердили кинетику компьютерным моделированием.

https://pcr.news/stati/voskresnoe-chtenie-o...Xhx-uCOE_hXqYIQ
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 03.09.2020 15:12     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #26 множественное цитирование

Андрей Яковенко

Довольно интересная статья и новость, которая 2 недели назад по крайней мере у меня в ленте прошли незамеченными.
Рыночная капитализация относительно небольшой биофармацевтической компании BioMarine Pharmaceuticals упала почти вдвое после того, как FDA отказалось одобрить заявку по препарату генной терапии для лечения гемофилии Valoctocogene Roxaparvovec (BMN 270). Один укол и необходимый фактор свертывания начинает вырабатываться сам.
Самое интересное, что результаты-то получены хорошие и регулятор это признал. Но затребовал дополнительных данных по сохранению эффективности в течении еще пары лет. Да, сомнения в сохранении эффективности на долгом сроке определенные появились, но они вполне могли быть решены в ходе пострегистрационных исследований.
Современные схемы лечения подразумевают регулярное введение довольно дорогого человеческого или рекомбинантного фактора свертывания VIII. Нет, я не думаю, что Валрокса будет дешевле, но тем не менее.
Интересно, что Spark Therapeutics, дочка Roche, разрабатывает аналогичный препарат, но с некоторым опозданием.
Вся история ставит по сомнения быстрое одобрение препаратов генной терапии, если препарат не является совсем уж орфанным-орфанным и лечить соответствующее заболевание практически нечем.
В общем оптимизм по поводу генной терапии, конечно, никуда не делся, но существенно убавился

https://www.facebook.com/permalink.php?stor...100011432260227
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 03.09.2020 15:14     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #27 множественное цитирование

Если препарат разрешат, то отсохнет индустрия производства факторов. Это громадные деньги. Интересы больных FDA не интересует.
Участник оффлайн! Asgard




 прочитанное сообщение 04.09.2020 16:21     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #28 множественное цитирование

Совсем не факт. Генная терапия - это очень дорого...Посмотрите на те же Нусинерсен и Золгесму.
Участник онлайн! Vadim Sharov
moderator
Россия



 прочитанное сообщение 04.09.2020 22:37     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #29 множественное цитирование

Ссылками не поделитесь?
С ребятами BioMarine Pharmaceuticals я лично знаком. Я работал в обществе больных гемофилией и в курсе сколько тратиться на факторы. Операция по вводу гена фактора окупается зва три года.

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Конференции · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 19.09.20 13:13
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft