Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Кто занимается клонированием, секвенированием и синтезом ДНК в России? -- Какие компании, институты? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Кураторы темы:* RYM
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 09:08     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #51 множественное цитирование

(RYM @ 23.06.2017 00:00)
Ссылка на исходное сообщение  Да есть несколько мест, где именно компании могут получить гранты. Сколково, например. Я знаю людей, которые успешно получили там грант.


Несколькими постами выше вы писали о том, что рассказы типа: "я знаю нескольких людей в США успеешно сделавших и реализовавших стартапы" для вас не информативны. Ну, в общем, теперь зеркально примерте это про Сколкова на себя. smile.gif
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 09:17     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #52 множественное цитирование

(MMM @ 23.06.2017 09:08)
Ссылка на исходное сообщение  Несколькими постами выше вы писали о том, что рассказы типа: "я знаю нескольких людей в США успеешно сделавших и реализовавших стартапы" для вас не информативны. Ну, в общем, теперь зеркально примерте это про Сколкова на себя. smile.gif


Разумеется, далеко не все заявки выигрывают гранты. Гарантии, конечно, нет. Но кто не рискует...
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 09:51     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #53 множественное цитирование

(kb1 @ 23.06.2017 00:06)
Ссылка на исходное сообщение  Боюсь все очень печально. Вы хотите коммерциализировать Ваше изобретение (нужное, полезное и с большим потенциалом), и поэтому не раскрываете его "широкой общественности". Наладить собственный выпуск китов для клонирования или других продуктов Вы не смогли или не пытались. Как результат "общественность" не может оценить (попробовать) чего у нее нет и не требует Ваших продуктов и технологий в "аптеках города".
Большим компаниям Вы с Вашим изобретением тоже не нужны. У них уже есть продукты для клонирования и для других аппликаций (хотя и менее эффективные, но вполне прибыльные). Зачем им менять линейку продуктов если и старая приносит стабильный доход? К тому же, эти компании управляются клерками, которые не склонны принимать столь ответственные решения. В общем, это как предлагать саудовским шейхам технологию получения бензина из воды.
Итог. Или опубликовать Ваше изобретение и получит заслуженную славу (но не деньги), или "...в Сколково... " и "... все делать одному" . Ну, а партнёры (вернее бизнес партнеры) ..., зачем они нужны Вам - понятно, а зачем им нужны Вы? Вы же не готовы передать им все права на коммерческое использование Вашей технологии, а без этого "бизнесмены" в России даже разговаривать не будут. Другое дело "меценаты", но где их взять?


Разумеется, я не готов передать кому бы то ни было "все права на коммерческое использование моих технологий" и остаться ни с чем. Но я не настолько жадный, чтобы требовать всё одному себе. Мои бизнес-партнеры будут совладельцами этих технологий и будут получать соответствующую часть прибыли от их коммерциализации. В конце концов, это основной принцип, на котором основано инвестирование в хайтек компании.

Но боюсь, Вы не совсем поняли, в каком смысле я говорил о бизнес-партнерах. Мне от них нужны не только деньги. Мне нужно, чтобы они занимались большинством бизнес-вопросов компании. Я предпочел бы заниматься научными и техническими проблемами. Именно потому, что мне слишком много пришлось заниматься в прошедшие годы этими бизнес-вопросами. Я знаю, как это делать, могу это делать. Но как выяснилось, это просто не моё дело. Чтобы успешно продавать что-то, долгое время, надо получать от этого удовольствие. Я по складу ума и характеру ученый, изобретатель, а не коммерсант.

А на "Большим компаниям Вы с Вашим изобретением тоже не нужны. У них уже есть продукты для клонирования и для других аппликаций (хотя и менее эффективные, но вполне прибыльные). Зачем им менять линейку продуктов если и старая приносит стабильный доход?" ответ простой - деньги. Возможность при весьма малых первоначальных инвестициях стать доминирующим игроком сначала на мировом рынке клонирования и синтеза ДНК, затем в производстве ГМО, генной терапии и производстве новых лекарств. Потому что на самом деле, клонирование - это только первый этап применения комплекса этих технологий. Подчеркиваю, я все время говорю о мировом рынке, а не российском. Это достижимо.

У меня не получилось сделать это в США по ряду причин. Как объективных, так и субъективных. Одну я уже назвал - коммерция просто не мое дело, мне были нужны партнеры, кто взяли бы на себя эти задачи, а я пытался делать это сам. Кроме того, я принял ряд бизнес-решений (не научных или технических), которые оказались ошибочными. В результате, я потратил много времени и денег впустую. И третья причина - постоянная острая нехватка денег.

На ошибках учатся - я не хочу наступать на те же грабли.
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 11:22     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #54 множественное цитирование

--Мои бизнес-партнеры будут совладельцами этих технологий и будут получать соответствующую часть прибыли от их коммерциализации.

Юрий! Так начинать надо с описания того самого продукта, котрый будет коммерциализоваться, и который возможен исключительно с вашей технологией. Вот тогда у инвестора-партнера появится интерес, а так........

Сообщение было отредактировано MMM - 23.06.2017 11:24
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 15:14     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #55 множественное цитирование

(MMM @ 23.06.2017 11:22)
Ссылка на исходное сообщение  --Мои бизнес-партнеры будут совладельцами этих технологий и будут получать соответствующую часть прибыли от их коммерциализации.

Юрий! Так начинать надо с описания того самого продукта, котрый будет коммерциализоваться, и который возможен исключительно с вашей технологией. Вот тогда у инвестора-партнера  появится интерес, а так........


Вообще-то начинал я с того, что ищу работу, и спрашивал - какие компании, институты занимаются клонированием, секвенированием и синтезом ДНК в России, особенно "сложных" ДНК. Остальное появилось при ответах на вопросы. У меня не было цели найти инвесторов прямо сейчас, особенно на этом форуме.

О ряде продуктов и сервисов, которые возможны исключительно с моей технологией, я уже писал. Ограничусь только клонированием, т.е. тем, что можно делать прямо сейчас, вся методика отработана.

Это сервис клонирования очень сложных ДНК – как геномных, так и кДНК. Ряд длинных кДНК, несмотря на то, что известны и их 3’, и 5’ концы, до сих пор не клонированы. Это клонирование и секвенирование ранее неклонированных и несеквенированных участков человеческого и других геномов. Деньги здесь можно получить через международные гранты.

Но тема человеческого генома тем самым не закроется: уже есть, и далее будет только расти, международный рынок секвенирования геномов индивидуальных людей в диагностических целях (для предсказания предрасположенности к заболеваниям и выбора оптимальных лекарств). Единственная компания, способная секвенировать геном пациента полностью, будет иметь значительное преимущество перед конкурентами и сможет занять наиболее высокооплачиваемый сегмент этого рынка. Миллионеров в мире многие миллионы, у всех есть семьи, и большинство из них захочет получить наиболее полную информацию о потенциальных угрозах своему здоровью и лучшей методике предотвращения и лечения своих болезней. Одно это даст миллиарды долларов в год. И никто из конкурентов не сможет обеспечить такую же полноту генетической информации этим миллионерам и их детям.

Другие продукты и сервисы - библиотеки, геномные, кДНК и белковые. Такого качества и полноты никто не может предоставить. Доступные сейчас геномные библиотеки, в плазмидах или лямбда фаге, не содержат гетерохроматин и многие другие участки генома. Библиотеки кДНК крайне обеднены длинными последовательностями. Белковые библиотеки будут производиться позднее, когда мы завершим программу по клонированию и секвенированию всех кДНК полной длины человека, затем других организмов. Остальные продукты и сервисы можно производить и продавать с самого начала.

Гранты нужны не только и не столько как источник денег, но в наибольшей степени – как возможность создать компании и ее технологиям мощнейшую рекламу. Публикации в ведущих журналах, уровня Nature, Science, Cell, результатов полного клонирования и секвенирования человеческого генома, затем геномов других организмов, послужат доказательством, что наша технологи клонирования действительно в тысячи раз лучше всех других методов. Что привлечет множество клиентов. Я, опять же, говорю про мировой рынок, не только российский.
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 15:33     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #56 множественное цитирование

Юрий, вам тут все участники пропели хором
что вот это вот:

сервис клонирования очень сложных ДНК – как геномных, так и кДНК. Ряд длинных кДНК, несмотря на то, что известны и их 3’, и 5’ концы, до сих пор не клонированы. Это клонирование и секвенирование ранее неклонированных и несеквенированных участков человеческого и других геномов.
или

Другие продукты и сервисы - библиотеки, геномные, кДНК и белковые. Такого качества и полноты никто не может предоставить.

В России они никого не интересуют, эти продукты, предлагаемые к реализации на рынке, имееют в России ценность меньше чем сказка про рыбку с зонтиком.

В науке кто-то может вас взять на временную ставку что бы вы ему что-то клонировали, но вряд ли науч. рук такого сотрудника будет ему платить больше, чем аспиранту превого второго года, ибо ценность вашего метода она в голове любого науч. рука ооочень виртуальна.

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): -Ъ-, sceptique
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 15:36     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #57 множественное цитирование

(MMM @ 23.06.2017 15:33)
Ссылка на исходное сообщение  Юрий, вам тут все участники пропели хором
что вот это вот:

  сервис клонирования очень сложных ДНК – как геномных, так и кДНК. Ряд длинных кДНК, несмотря на то, что известны и их 3’, и 5’ концы, до сих пор не клонированы. Это клонирование и секвенирование ранее неклонированных и несеквенированных участков человеческого и других геномов.
или

Другие продукты и сервисы - библиотеки, геномные, кДНК и белковые. Такого качества и полноты никто не может предоставить.

В России они никого не интересуют, эти продукты, предлагаемые к реализации на рынке, имееют в России ценность меньше чем сказка про рыбку с зонтиком.

В науке кто-то может вас взять на временную ставку что бы вы ему что-то клонировали, но вряд ли науч. рук такого сотрудника будет ему платить больше, чем аспиранту превого второго года, ибо ценность вашего метода она в голове любого науч. рука ооочень виртуальна.


Я много раз отвечал, что я ориентируюсь на мировой рынок и на международные гранты.
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 17:14     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #58 множественное цитирование

--Я много раз отвечал, что я ориентируюсь на мировой рынок и на международные гранты.
C 2014 года Россия враг всея того рынка, на который вы ориентируетесь. Подумайте о том как можно ориентироваться на мировой рынок и международные гранты и при этом находясь и что-то делая в России. Можете поинтересоваться как это получается у Сибэнзима и Еврогена. Из Еврогена вам уже в личку предлагали обратится.

Все то, что вы писали про организацию конторы "рога и копыта" в США в разделе "организация работы лаборатории", а потом стерли. Это конечно мило, но подходит либо для аферистов, либо для компаний с маленьким оборотом. У нас такие компании называют компаниями с гаражными технологиями.
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 18:01     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #59 множественное цитирование

(MMM @ 23.06.2017 17:14)
Ссылка на исходное сообщение  --Я много раз отвечал, что я ориентируюсь на мировой рынок и на международные гранты.
C 2014 года Россия враг всея того рынка, на который вы ориентируетесь. Подумайте о том как можно ориентироваться на мировой рынок и международные гранты и при этом находясь и что-то делая в России. Можете поинтересоваться  как это получается у Сибэнзима и Еврогена. Из Еврогена вам уже в личку предлагали обратится.

Все то, что вы писали про организацию конторы "рога и копыта" в США в разделе "организация работы лаборатории", а потом стерли. Это конечно мило, но подходит либо для аферистов, либо для компаний с маленьким оборотом. У нас такие компании называют компаниями с гаражными технологиями.


Для того, что воспользоваться какой-то возможностью, надо знать, что она существует. Надо понимать, как система устроена и работает. А американская система бизнеса и торговли устроена совершенно иначе, чем нынешняя российская и тем более советская. Поэтому психология наших людей иная, представления о системе США зачастую ошибочны.

Те же китайцы, между прочим, очень активно используют возможности американской системы в своих целях, успешно продвигают свои товары в США, создали множество компаний в самих США, в том числе в биотех индустрии. И некоторые из этих компаний используют именно ту стратегию, что я описал: регистрируют американскую компанию и продают через нее китайские товары (не только одежду, но и хайтек). Китайские бизнесмены получают грин карты как инвесторы, инвестируя в новосозданные компании по полмиллиона долларов, получают Н1 визы для других китайцев. И т.д.

И никакого мошенничества в этом нет - так функционирует американская система, и американские госорганы и чиновники в этом заинтересованы. Потому что США заинтересованы в росте бизнеса, экономики, ВНП. Чем больше иностранных компаний переведут свой бизнес в США, тем выгоднее это для американской экономики, уровня жизни, количества собранных налогов.

Госорганы США воздвигают все возможные препятствия перед компаниями из России и многих других стран (даже европейские компании ведут свой бизнес в США не на равных с американскими компаниями), но дают зеленый свет для тех же компаний, если они станут, в той или иной степени, американскими. Хотя бы из-за налогов, которые платят эти компании, из-за созданных рабочих мест.

Просто - еще раз - мало кто в России понимает, как функционирует американская система и что нужно делать, чтобы, в частности, продавать свои продукты в США. Надо достаточно долгое время вариться в этом бульоне, разговаривать с множеством людей, чтобы понять, как они думают, их психологию. Американцы - не русские. Огромное число отличий.

Сообщение было отредактировано RYM - 23.06.2017 18:11
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение 23.06.2017 18:25     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #60 множественное цитирование

(RYM @ 23.06.2017 13:14)
Ссылка на исходное сообщение   Ряд длинных кДНК, несмотря на то, что известны и их 3’, и 5’ концы, до сих пор не клонированы.

Их можно синтезировать, если известны последовательности.
И опять таки, если надо клонировать что-то очень длинное - то это делается по кускам.

Сообщение было отредактировано ship - 23.06.2017 18:27
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 18:47     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #61 множественное цитирование

(ship @ 23.06.2017 18:25)
Ссылка на исходное сообщение  Их можно синтезировать, если известны последовательности.
И опять таки, если надо клонировать что-то очень длинное - то это делается по кускам.


Известны последовательности геномной ДНК. Не кДНК. В ряде случаев, все попытки сделать RT-PCR, несмотря на известные 3' и 5' концы, провалились. И по кускам не вышло. Синтезированы были теоретически предсказанные кДНК. В связи с огромным числом вариантов альтернативного сплайсинга для длинных РНК, достоверность таких теоретических кДНК довольно мала.
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение 23.06.2017 18:51     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #62 множественное цитирование

(RYM @ 23.06.2017 13:14)
Ссылка на исходное сообщение 
Но тема человеческого генома тем самым не закроется: уже есть, и далее будет только расти, международный рынок секвенирования геномов индивидуальных людей в диагностических целях (для предсказания предрасположенности к заболеваниям и выбора оптимальных лекарств). Единственная компания, способная секвенировать геном пациента полностью, будет иметь значительное преимущество перед конкурентами и сможет занять наиболее высокооплачиваемый сегмент этого рынка. Миллионеров в мире многие миллионы, у всех есть семьи, и большинство из них захочет получить наиболее полную информацию о потенциальных угрозах своему здоровью и лучшей методике предотвращения и лечения своих болезней. Одно это даст миллиарды долларов в год. И никто из конкурентов не сможет обеспечить такую же полноту генетической информации этим миллионерам и их детям.

А вы можете привести цифры относительно того, какой % генома человека в настоящий момент не секвенирован?

Я уверен, что информация, которую в настоящий момент можно получить после секвенирования полного генома человека (такая услуга доступна), и так будет избыточна с точки зрения клиники и пациентов. И ее с лихвой хватит, чтобы покрыть 99.9% клиничеки релевантных мутаций ,СНП и тп.
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение 23.06.2017 18:58     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #63 множественное цитирование

(RYM @ 23.06.2017 16:47)
Ссылка на исходное сообщение  Известны последовательности геномной ДНК. Не кДНК. В ряде случаев, все попытки сделать RT-PCR, несмотря на известные 3' и 5' концы, провалились. И по кускам не вышло. Синтезированы были теоретически предсказанные кДНК. В связи с огромным числом вариантов альтернативного сплайсинга для длинных РНК, достоверность таких теоретических кДНК довольно мала.

конкретный пример давайте. у вас одни общие слова.
и вы противоречите сами себе : " Известны последовательности геномной ДНК. Не кДНК." и "несмотря на известные 3' и 5' концы"
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 19:19     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #64 множественное цитирование

(ship @ 23.06.2017 18:51)
Ссылка на исходное сообщение  А вы можете привести цифры относительно того, какой % генома человека в настоящий момент не секвенирован?

Я уверен, что информация, которую в настоящий момент можно получить после секвенирования полного генома человека (такая услуга доступна), и так будет избыточна с точки зрения клиники и пациентов. И ее с лихвой хватит, чтобы покрыть 99.9% клиничеки релевантных мутаций ,СНП  и тп.


Согласно той же Вики, 8% человеческого генома не секвенировано.

Избыточна? Мало того, что 8% не секвенировано, так и остальной геном пока совершенно не изучен. Функции генов, регуляция, мутации и их связи с болезнями - мы только в начале пути. Какая уж тут избыточность.

Так что, несмотря на то, что тот же гетерохроматин не содержит или почти не содержит генов, мутации в нем могут иметь большое значение для предрасположенности к каким-то болезням. В конце концов, гетерохроматин для чего-то нужен? Хотя бы структурную роль играет?
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 19:26     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #65 множественное цитирование

(ship @ 23.06.2017 18:58)
Ссылка на исходное сообщение  конкретный пример давайте. у вас одни общие слова.
и вы противоречите сами себе : " Известны последовательности геномной ДНК. Не кДНК." и "несмотря на известные 3' и 5' концы"


В чем противоречие? 5' концы известны, потому что локализованы промотеры в геномной ДНК. 3' концы - потому что синтез кДНК начинается с поли(А) хвостов и последовательности на 3' концах практически всех мРНК были получены, достаточно давно. Не были получены полные последовательности ряда длинных или "сложных" мРНК (содержащих повторы).

А чтобы найти конкретные примеры, мне надо потратить достаточно много времени. Читал раньше ряд статей на эту тему, но не сохранил их. Не было нужды.

Сообщение было отредактировано RYM - 23.06.2017 20:11
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение 23.06.2017 19:27     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #66 множественное цитирование

(RYM @ 23.06.2017 17:19)
Ссылка на исходное сообщение  

Избыточна? Мало того, что 8% не секвенировано, так и остальной геном пока совершенно не изучен. Функции генов, регуляция, мутации и их связи с болезнями - мы только в начале пути. Какая уж тут избыточность.

Вы секвенировать хотите? или изучать связь генов с болезнями, регуляцию транскрипции и тп?

92% процента секвенировано -и это еще до конца не изучено, как вы сами и сказали.
Так как вы думаете, сможете ли убедить всех в том, что 8% так важны?
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 19:40     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #67 множественное цитирование

(ship @ 23.06.2017 18:51)
Ссылка на исходное сообщение  
Я уверен, что информация, которую в настоящий момент можно получить после секвенирования полного генома человека (такая услуга доступна), и так будет избыточна с точки зрения клиники и пациентов.


Кстати, такая услуга недоступна. По определению. Потому что до сих пор никто не просеквенировал весь геном. Причем, надо учитывать, что секвенирование, которое производится сейчас как платная услуга, дает информацию отнюдь не о 92% генома пациента, а гораздо меньше. Потому что, чтобы дойти до 92%, множеству исследователей пришлось годами извращаться, по маленькому кусочку выцарапывая остатки. И недовыцарапали по сию пору. Для сравнения, в 2001 г. Селера, просеквенировав геном человека методом дробовика 10 раз (т.е. просеквенировав 30 млрд п.о., что превышает 1 геном в 10 раз), получила только порядка 70% генома. Хотя, конечно, сейчас эти компании секвенируют без клонирования, так что выход у них может быть побольше. Верить рекламным заявлениям (мы секвенируем 100%) я не могу, потому что минимум 8% они не секвенируют, а реальных цифр не знаю. Надо копать статьи, но не вижу смысла.

Сообщение было отредактировано RYM - 23.06.2017 19:52
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.06.2017 19:50     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #68 множественное цитирование

(ship @ 23.06.2017 19:27)
Ссылка на исходное сообщение  Вы секвенировать хотите? или изучать связь генов с болезнями, регуляцию транскрипции и тп?

92% процента секвенировано -и это еще до конца не изучено, как вы сами и сказали.
Так как вы думаете, сможете ли убедить всех в том, что 8% так важны?


Зачем мне убеждать в этом всех? Если руководители Human Genome Project многократно давали гранты на завершение этого проекта? Много миллионов долларов было потрачено, после официальной декларации еще в 2003 г. о завершении секвенировании генома. Но не шмогли. По чуть-чуть, по кусочку добавляли. Но не полностью.

Проблема не решена - и руководство NIH, аналогичных европейских, японских и пр. организаций по-прежнему хотят ее решить. Так что если мы сможем доказать нашу (и только нашу) способность решить эту проблему, получение грантов на это нам практически гарантировано. Правда, в том только случае, если в числе исполнителей грантов будет американская компания (наша дочерняя компания).
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 24.06.2017 09:46     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #69 множественное цитирование

(sceptique @ 23.06.2017 20:34)
Ссылка на исходное сообщение  Сейчас уже начали секвенировать ридами по 7-12 тысяч нуклеотидов подряд. Все ваши протяженные повторы стали проходиться "в лоб", от края 5' до 3'. Не то что без клонирования, но даже уже без амплификации.


Вот когда PacBio опубликует недостающие участки человеческого генома, в частности, весь гетерохроматин, тогда можно будет поверить в их способность читать по 10-60 тысяч п.о.

http://www.pacb.com/smrt-science/smrt-sequ...g/read-lengths/
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 24.06.2017 09:47     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #70 множественное цитирование

В последние месяцы у оксфордцев (ONT) средняя длина ридов достигла 60...70 т.п.н., хотя иногда получают больше 100 т.п.н.. Встречаются единичные риды длиной свыше 1 млн.п.н.. Что приятно, эта технология не требует клонирования. Но требует пришивки концевых адапторов для формирования сайтов посадки хеликазы.
По-моему, Ваш способ клонирования неклонируемых генов неплохо вписывается в эту технологию. Хорошо бы приспособить его также для получения ДНК-наноболлов и перевода их в двунитевую форму. Т.е. для многократного секвенирования фрагментов ДНК. Сейчас делают только двукратное секвенирование, и точности такого чтения явно не хватает.
Успехов! beer.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 24.06.2017 09:51

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): -Ъ-, RYM
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 24.06.2017 10:18     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #71 множественное цитирование

(genseq @ 24.06.2017 09:47)
Ссылка на исходное сообщение  В последние месяцы у оксфордцев (ONT) средняя длина ридов достигла 60...70 т.п.н., хотя иногда получают больше 100 т.п.н.. Встречаются единичные риды длиной свыше 1 млн.п.н.. Что приятно, эта технология не требует клонирования. Но требует пришивки концевых адапторов для формирования сайтов посадки хеликазы.
По-моему, Ваш способ клонирования неклонируемых генов неплохо вписывается в эту технологию. Хорошо бы приспособить его также для получения ДНК-наноболлов и перевода их в двунитевую форму. Т.е. для многократного секвенирования фрагментов ДНК. Сейчас делают только двукратное секвенирование, и точности такого чтения явно не хватает.
Успехов! beer.gif


Спасибо. Да, моя технология (в особенности ноу-хау) может быть адаптирована и для совместного использования с другими методами. В будущем, так и произойдет, скорее всего.

Что же касается современных подходов к NGS, у меня пока не было возможности самому поработать с ними, понять их особенности и недостатки. Что там реклама, что действительно работающая технология, мне трудно судить. В особенности, какова точность и достоверность результатов. Единственный надежный критерий оценки этих новых технологий, который я могу применить к ним, - это их способность генерировать новые данные, которые ранее было невозможно получить, более старыми методами. На первом месте здесь как раз ранее несеквенированные участки человеческого генома. Если за 1 ран они получают миллиард п.о. и это стоит несколько тысяч долларов, где публикации о гетерохроматине и других несеквенированных участках?

Хотя я отнюдь не отрицаю и не отвергаю этих технологий. В конце концов, прогресс в этой области налицо - достаточно сравнить с тем, что было 20-30 лет назад.
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 26.06.2017 13:46     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #72 множественное цитирование

Вынужден чистить ветку от мусора и оскорблений.

Набросами с нами щедро делились некий аноним (он регистрировался под несколькими никами, специально чтобы нагадить) и sceptique. Второго я долго игнорировал, но надо же знать меру. Возможно, конечно, что это один и тот же персонаж.

Сообщение было отредактировано RYM - 26.06.2017 16:05
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 26.06.2017 19:20     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #73 множественное цитирование

(sceptique @ 26.06.2017 19:34)
Ссылка на исходное сообщение  Я Вам помогу, последнее сообщение сам стер.

Совесть замучила... yes.gif
Завистливые и злобные долго не живут. tongue.gif
Рекомендую в третий раз перечитать, но уже после ужина. lol.gif

Сообщение было отредактировано -Ъ- - 26.06.2017 19:21

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): RYM, pApA2017
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 27.06.2017 01:35     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #74 множественное цитирование

Нееее, это разные люди.
Участник оффлайн! watchesbiz
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  23.11.2021 15:15     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #75 множественное цитирование

http://replicarolexwatches.simpsite.nl/
https://www.smore.com/rj7kh-best-replica-watches
https://www.athleticsnation.com/users/Replicarolexwatches
https://pastebin.pl/view/ab0e458a
https://mix.com/watcheshutukcom
https://www.woddal.com/post/359216_tiny-acc...nybody-039.html
https://share.naturalnews.com/posts/3904099
https://demo.wowonder.com/post/214429_the-i...-producers.html
https://rapichat.com/post/5369_our-purpose-...ible-there.html
https://dashburst.com/replicarolexwatches/1
https://sway.office.com/KifcQvn36MK821G8
https://flipboard.com/@replicarolex24
https://getpocket.com/redirect?url=https%3A...eshut.uk.com%2F
https://www.openstreetmap.org/user/Hints%20...20Rolex%20Watch

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 20.04.24 02:39
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft