Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Neo 777 Участник |
если мне, условно, хочется синтезировать полипептид из 50 - 100 и более РАЗНЫХ (вплоть до 20) аминокислот заданной последовательности, - это возможно? сколько это стоит? к кому обращаться? какая сейчас предельная длина полипептида, которую можно синтезировать искусственно? чтобы на выходе получалось достаточное количество требуемого белка (десятки грамм)? есть ли гарантии точного синтеза? Буду благодарен всем, кто откликнется. |
MMM Постоянный участник |
пообщайтесь вот с этим человеком по повуду петидного синтеза в промышленных масштабах |
Neo 777 Участник |
а насчет гарантий не совсем понятно... условно говоря из 100 синтезированных молекул длиной 100аа сколько будут именно заданной мною конструкции? |
MMM Постоянный участник |
Сообщение было отредактировано MMM - 31.07.2017 15:58 |
Neo 777 Участник |
Интересно есть ли в природе коллективы-энтузиасты, которые смогут выполнять такой синтез бесплатно? На каком оборудовании осуществляется подобный синтез? |
Neo 777 Участник |
|
MMM Постоянный участник |
(Neo 777 @ 31.07.2017 17:25) Нееет! Там ведь еще и прекурсоры денег стоят не малых. На каком оборудовании осуществляется подобный синтез? Синтезаторы - конечно это агрегаты(достаточно дорогие это если речь идет и милиграмовых масштабах). Но ведь и обычный синтез это типа, как на кухне поварить, вроде как не больно тяжкий труд. Осуществляется ли такой синтез полностью автоматически или все еще велика доля ручного труда? Автоматически, то автоматически. Ну сама эта машина не едет, там очень много нюансов, что бы отпаханные циклы не привели к пшику и потере дорогих прекурсоров в педальное ведро, нужен не малый опыт общения как с машиной, так и с прекурсорами. Сообщение было отредактировано MMM - 31.07.2017 20:22 |
Neo 777 Участник |
И Ваш левый стеб мне безразличен. По проблеме: выходит, что все дорого, трудоемко. Да и не умеем мы многого. Кто может указать какие-то прямые координаты лабораторий, смогущих осуществить качественный синтез полипептидов заданной последовательности в значительных объемах? |
MMM Постоянный участник |
да, и уровень вашей квалификации не высок, что спецу будет видно за 5 сек. А разговор спеца со школьником начальной школы, имеет свою специфику. Имейте это ввиду.
|
sceptique Постоянный участник временной жизни |
Граммы Вам никто варить не будет, забудьте. |
MMM Постоянный участник |
(Neo 777 @ 03.08.2017 16:30) Вот - вот, - украсть, подсидеть, подслушать, стыбзить, присвоить, - это мы умеем. Конкретные примеры будут кто, у кого, что и как украл? |
MMM Постоянный участник |
Да еще потребуется время на получениеш штамма продуцета и технологии очистки продукта из биомассы.
|
vb Постоянный участник |
допустим, до 30 ак точно дешевле твердофазным синтезом. И быстрее. 30-60 фифтифифти зависит от объекта, больше 60 всетаки продуцент делать дешевле. |
avor moderator |
Не надо переходить на личности и давать необоснованные оценки друг другу и мировому научному сообществу. Если будет продолжаться перепалка в духе: "какой я один умный, а все остальные дураки" Тема будет закрыта, а участники перепалки получат пока временные баны. Если они будут упорствовать, как это любит делать ППГ, то будут забанены навсегда. |
Neo 777 Участник |
Может оно и к лучшему - тему об искусственном синтезе полипептидов нужно сохранить. Прошу всех, кто хочет принять участие в конструктивном диалоге по поводу нерешенных проблем науки, в том числе биологии и медицины, - посещать форум "Беседа", тему "Безумные идеи"; это действительно более подходящая площадка для обсуждения неоднозначных тем. Давайте заморочимся дальше непосредственно по данной теме. Что получается: 1. Синтезировать белок заданной АА можно, но дорого и долго (для частного исследователя). 2. Синтезировать белок заданной АА можно как из непосредственно аминокислот, так и с помощью соответсnвующей mRNA, вырабатываемой организмом-продуцентом. 3. Синтезировать белок заданной АА в граммовых и килограммовых количествах - чрезвычайно проблематично для отдельного исследователя или маленького исследовательского коллектива. Если пункты 1-3 где-то не соответствуют истине, поправьте меня. Сможете помочь мне ответить и на такой вопрос (если ответ известен) - в организме, например, человека - наскольно вариабельны по нуклеотидной последовательности mRNA, кодирующие один и тот же белок? Известен ли какой-либо фактический материал по этому вопросу? Действительно ли понятие "каноническая последовательность mRNA" для каждого конкретного белка, или фактически это словосочетание - миф, не отражающий реальной ситуации? Ведь, повторюсь, теоретически каждый белок, найденный в организме, может кодироваться огромным количеством разных по нуклеотидной последовательности mRNA (по причине того, что часто одной аминокислоте соответствует несколько триплетов генетического кода). |
Neo 777 Участник |
"горячую часть" дискуссии перенесли в форум "Беседа", в тему "Выделено из Искусственный синтез полипептидов". Прошу всех участников этой дискуссии передислоцироваться в форум "Беседа", в тему "Безумные идеи", - там будем обсуждать острые, проблемные и перспективные направления науки, биологии, медицины. С уважением. |
MMM Постоянный участник |
Все относительно вы в своем футлярчике живете и все на него примеряете. То что не возможно для вас, для Ротшильда говно-вапрос. Ну и так можно по каждому пункту. Только, как показал опыт бессмысленно. Ибо ваши цели туманны, а средства вообще неизвестны. --Сможете помочь мне ответить и на такой вопрос (если ответ известен) - в организме, например, человека - насколько вариабельны по нуклеотидной последовательности mRNA, кодирующие один и тот же белок? В Америке есть такая структура : National Center for Biotechnology Information она поддерживает в интернете не хилую тучу баз данных. В частности баз данных расшифрованных нуклеотидных последовательностей различных организмов. В чем мы не сомневаемся так это в том, что нуклеотидная последовательность mRNA комплементарна (и следовательно в некотором смысле идентична) последовательности в геномной ДНК. Соответственно все эти расшифрованные последовательности вы можете найти в этих базах данных и следовательно установить вариабельность тех или иных RNA для тех или иных белков в тех или иных организмах. Удачи вам так сказать в ваших изысканиях. |
Neo 777 Участник |
Спасибо за Ваши часто обстоятельные ответы. Работал с разными базами данных, и, насколько понял, все-таки нуклеотидные последовательности mRNA могут быть вариабельны для одного и того же белка - в том числе у разных организмов. В целом, конечно, выяснение точного ответа на данный вопрос - тема отдельной кандидатской работы, - идею которой, как видите, дарю желающему через этот форум. Все-таки с чисто теоретических позиций жаль, что словосочетание "каноническая последовательность mRNA" - термин, вероятно мало имеющий отношение к реальной ситуации. Про Ротшильда и относительность - вполне с Вами согласен. |
vb Постоянный участник |
|
genseq Постоянный участник |
(Neo 777 @ 30.07.2017 15:30) Народ, если мне, условно, хочется синтезировать полипептид из 50 - 100 и более РАЗНЫХ (вплоть до 20) аминокислот заданной последовательности, - это возможно? сколько это стоит? к кому обращаться? какая сейчас предельная длина полипептида, которую можно синтезировать искусственно? чтобы на выходе получалось достаточное количество требуемого белка (десятки грамм)? есть ли гарантии точного синтеза? Буду благодарен всем, кто откликнется. Вопрос, конечно, интересный. Но химический синтез слишком сложен. А биотехнологический - через получение штаммов-продуцентов - для многих пептидов и белков часто невозможен из-за их плохой растворимости, токсичности для клетки и/или протеолиза. Компромиссный вариант - бесклеточный синтез в сопряжённой системе транскрипции-трансляции. Даёт несколько миллиграмм целевого белка на миллилитр экстракта, т.е. на грамм белка нужно несколько сотен миллилитров. Если удешевить исходные компоненты, то стоимость продукта будет вполне терпимой. А если нужны микрограммы, то бесклеточный синтез - это самый лучший вариант. Бесклеточный синтез отлично подходит, например, для получения мембранных белков, формирующих нанопоры в липидных бислойных мембранах. Один из таких белков (модифицированный CsgG, вариант 9.5) сейчас используется в нанопоровых секвенаторах компании Oxford Nanopore (MinION, GridION, PromethION). Скорее всего, эта нанопора - не более чем вершина айсберга. Надеюсь, найдутся и получше . И их применение позволит довести точность нанопорового секвенирования до Q20. Сообщение было отредактировано genseq - 11.09.2017 18:47
|
Neo 777 Участник |
Обидно, конечно, что сегодня куда ни кинь взгляд - ничего-то мы толком не умеем в биологии и химии. Касаемо обсуждаемой проблемы - хотелось бы, конечно, чтоб в наличии была "протеиноварка" - закинул в ее 20 отделений 20 аминокислот в виде порошка по 100 - 200 грамм каждая, загрузил через ноутбук в протеиноварку требуемую аминокислотную последовательность, нажал Enter - и через полчасика у тебя десятки грамм нужного белка. Эх, средневековье, средневековье... |
Neo 777 Участник |
Думаю скоро, помимо гонки "секвенаторов" будет происходить аналогичная гонка "протеиносинтезаторов" (PS) @ и "нуклеиновокислотных синтезаторов" (NAS) @. Поскольку дешевый, точный и быстрый бесклеточный (реагентный) синтез полипептидов и нуклеиновых кислот заданной последовательности в биологии и медицине является такой же необходимостью, как и дешевый, быстрый и точный способ секвенирования заданных участков генома (в т.ч. генома полностью) конкретной особи данного вида организмов. |
Neo 777 Участник |
Еще вчера на этом подфоруме была тема "Проблемы генетики, молекулярной биологии" под моим кураторством (Neo 777). Сейчас я ее не наблюдаю нигде. Что с ней? |
yack moderator Москва, Россия |
|
Neo 777 Участник |
В "Беседе" ее не наблюдаю, лишь часть из реплик в ней почему-то соединены с "Безумными идеями". Можете, хотя бы пусть и в "Беседе", разместить ее полностью, с наличием всех реплик за все время и с сохранением оригинального названия? И отцепить от "Безумных идей" прикрепленные с нее реплики? Это важно. Заранее благодарен. Был бы вдвойне благодарен, если бы вернули ее на прежнее место, в форум "Молекулярная и клеточная биология". В ней я был куратором, собирался вычищать спам. Спасибо. |
watchesonline89 Постоянный участник |
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |