Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
L Участник |
|
Remez Постоянный участник Москва |
|
Fritz Постоянный участник Москва |
|
Дядя ФАКСер Постоянный участник Nothern Maccaronia, Ticinum |
(L @ 22.08.2005 17:30) ljudi protochniki citometrchiki voznik ka u menja vopros vot takoj. kakuju koncentraciju antitel vzjat dlja eksperimenta posle titrovanija? tu kotoraja nasishchaet markerov na kletok (to est dajot maksimalnii signal) ili tu kotoraja prosto otdeljaet pozitivnuju populjaciju ot negativnix? vot v flowjo oni pishut chtob nujno vzjat pervuju, no na praktike takaja koncentracija inogda dajot takje nespecificheskii signal to est pojavljaetsja shift negativnoj populacii (oni stanovjatsja low positive)... zaranee blagodarju... Если антитела от нормального производителя- то читайте TDS |
Дядя ФАКСер Постоянный участник Nothern Maccaronia, Ticinum |
(L @ 22.08.2005 17:30) tu kotoraja nasishchaet markerov na kletok (to est dajot maksimalnii signal) ili tu kotoraja prosto otdeljaet pozitivnuju populjaciju ot negativnix? На практике- приемлемая разница между Means - 10 раз ( разделение сабсетов). На насыщении работать никогда не стоит: 1) не знаешь: какой уровень экспрессии может быть 2) Сложности с компенсацией при многоцветке (особенно, если флуорофор с высоким QYeld)+ паразитная "засветка" 3) Повышается уровень неспецифики. |
L Участник |
(Remez @ 22.08.2005 21:48) но будьте готовы к тому, что небольшие изменения в условиях инкубации (время, температура и т.д.) потенциально могут приводить к заметному варьированию сигнала, которое не будет связано с изменением уровня антигена на клетках. absoljutno s vami soglasen uje bilo takoe sluchai v praktike... Если антитела от нормального производителя- то читайте TDS nu u menja antitela ot pharmingen no ni slova o koncentracijax tolko govorjat sami naidite dlja vas optimalnuju... |
L Участник |
[/quote] da soglasen s vami bilo takoe uje na praktike [quote=]Если антитела от нормального производителя- то читайте TDS[/quote] no ot pharmingena u menja Ab i ni slovo o titracii tolko govorjat sami naidite optimalnuju... spasibo za vashu pomosh... |
Дядя ФАКСер Постоянный участник Nothern Maccaronia, Ticinum |
(L @ 23.08.2005 09:08) absoljutno s vami soglasen uje bilo takoe sluchai v praktike... nu u menja antitela ot pharmingen no ni slova o koncentracijax tolko govorjat sami naidite dlja vas optimalnuju... А вот это странно... Что за антитела? Поподробнее можете рассказать? ( потому что сам постоянно работаю с BD-Pharmingen) |
L Участник |
(Дядя ФАКСер @ 23.08.2005 09:23) А вот это странно... Что за антитела? Поподробнее можете рассказать? ( потому что сам постоянно работаю с BD-Pharmingen) samie obiknovennie... nu u nix vsegda napisano <=1ug/1million cells i potom since application vary each investigator must determine dilutions appropriate for individual use... a eto standartnaja fraza i antitela vsjoravno je nujno titrovat... osobenno esli 96well format ispolzuesh dlja staininga a ne falcon tubes... |
Дядя ФАКСер Постоянный участник Nothern Maccaronia, Ticinum |
Вы ж не ИФА делаете |
L Участник |
(Дядя ФАКСер @ 23.08.2005 14:20) shutite chtoli... |
Дядя ФАКСер Постоянный участник Nothern Maccaronia, Ticinum |
Я понимаю, если у вас кастом-мейд антитело - и требуется посмотреть его афинность (ну и величину сигнала, специфичность и т.д.) на известных маркерах. Тут да- тировка необходима. А с BD-шными антителами...Для того TDS и написан, что б подобной monkey job народ не занимался. К тому же- если вы многоцветку делаете- то используя не стандартизированные концентрации и протоколы може те с калибровками и компенсациями резво наколоться ( особенно при числе цветов больше 3) P.S. И все же: не могли бы поподробнее: что за клетки у вас, какие маркеры смотрие. Вообще, у BD есть очень хорошие киты с разведенными в нужной концентрации антителами для multicolor analysis (T, Treg, DC, Stem etc...) |
L Участник |
(Дядя ФАКСер @ 23.08.2005 18:19) Не шучу- ибо проточкой давно занимаюсь. Я понимаю, если у вас кастом-мейд антитело - и требуется посмотреть его афинность (ну и величину сигнала, специфичность и т.д.) на известных маркерах. Тут да- тировка необходима. А с BD-шными антителами...Для того TDS и написан, что б подобной monkey job народ не занимался. К тому же- если вы многоцветку делаете- то используя не стандартизированные концентрации и протоколы може те с калибровками и компенсациями резво наколоться ( особенно при числе цветов больше 3) P.S. И все же: не могли бы поподробнее: что за клетки у вас, какие маркеры смотрие. Вообще, у BD есть очень хорошие киты с разведенными в нужной концентрации антителами для multicolor analysis (T, Treg, DC, Stem etc...) nu ne bili u menja poka chto podobnie problemi s mnogocvetkoj ni v kompensacijax ni stainingax xotja vsegda koncentraciju menshe chem polojeno ispolzuju (titruju antitela daje ot BD) tak kak naprimer anti mouse Ia/Ie-PE labeled (Cat No 557000) ja ispolzuju 1/6000 diluted v 20ul final volume to est 0.008ug/1million cells i prekrasno rabotaet do etogo ispolzoval dvoe bolshe i nespecificheskii signal bil a eta koncentracija 130raz menshe chem BD rekomenduet. ottuda vopros nujno li titrovat ili net... a vot imenno TDS i govorit chtob vse doljni naiti svoju zolotuju seredinu. v nachale dumal ne titrovat no takie problemi voznikli chtob... osobenno posle togo kak s falkon tubes na 96well format staining perekluchilsja tam prjamo na pellet dobavljaesh antitelo i nujno 10raz menshe chem na falcon... a vot cveta u menja paka chto max 4 tak kak starenkii milenkii FACScalibur u nas i vsjo... i smotrju ja kletki mishinnie... v tumor immunology ja rabotaju... i eti kiti toje znakomi... prosto uvidel v Flowjo chtob nujno ispolzovat saturacionnuju koncentraciju posle titracii i xotel sprosit i pereproverit u znajushix ljudei a mojet nepravilno ja rabotaju... ved sam viuchil j ja FACS bez uchebnikov i mojet kakieta probeli v znanii... poetomu otkril etot post... anyway ogromnoe vam spasibo vsem... i osobenno za vashu zabotu Дядя ФАКСер vi vsegda detalno otvechaete voprosov kasajushixsja FACS ... |
Дядя ФАКСер Постоянный участник Nothern Maccaronia, Ticinum |
На самом деле, для подобных тем есть раздел "Обмен опытом", а в нем - подраздел "Multicolor flow cytometry". Welocme to the club! P.S. Надеюсь, Fc block и сыворотку при стейнинге используете? А то странно, что у вас при работе с конценрациями антител , в 10-100 раз меньше рекомендуемых, вылезает изрядная неспецифика. P.P.S. К тому же, рекомендуемые концентации всегда даются на 10^6 possibly posititve cells. |
Glebber Постоянный участник London, UK |
брать надо ту концентрацию, которая дает лучшее разрешение и меньший фон. иначе говоря, берете и считаете, где лучше соотношение между MFI у positive and negative polulations. |
L Участник |
(Дядя ФАКСер @ 24.08.2005 17:00) да не за что. На самом деле, для подобных тем есть раздел "Обмен опытом", а в нем - подраздел "Multicolor flow cytometry". Welocme to the club! P.S. Надеюсь, Fc block и сыворотку при стейнинге используете? А то странно, что у вас при работе с конценрациями антител , в 10-100 раз меньше рекомендуемых, вылезает изрядная неспецифика. P.P.S. К тому же, рекомендуемые концентации всегда даются на 10^6 possibly posititve cells. da znaju etot klub ja no kakto viprignul iz golovi... poetomu sjuda napisal... da sivorotku ispolzoval (no ne Fc block shef ne pokupaet... uprjamii ) no ne bilo ot etogo tolka... a vot Isotype vsegda ispolzuju... 10^6 possibly positive cells. ja to dumal total cell number 10^6... |
nigoal123 IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
A well-structured |
guest: 123 IP-штамп: frJhOCvSv9ICE гость |
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |