Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Александр Игошин |
Вопрос заключается вот в чем. От чего отсчитывать поправку на множественные сравнения???? От номинального p-значения, или от уже скорректированного по лямбда? Логика подсказывает, что от уже скорректированного, но я не уверен. В литературе почему-то у всех эта лямбда около единицы, и они отмахиваются от нее. А в plinke, в котором я провожу анализ, почему-то все коррекции на множественные сравнения производятся на основе номинального p. И GC-контроль как-то сам по себе. |
bioinformatics |
(Александр Игошин @ 21.11.2017 21:27) Здравствуйте! Если мы имеем структурированную выборку, и ищем ассоциации по геному, то значимость снипов может завышаться, поэтому используется поправка лямбда на стратификацию. При этом также нужно использовать поправку на множественные сравнения для группового контроля вероятности ложноположительных результатов. Вопрос заключается вот в чем. От чего отсчитывать поправку на множественные сравнения???? От номинального p-значения, или от уже скорректированного по лямбда? Логика подсказывает, что от уже скорректированного, но я не уверен. В литературе почему-то у всех эта лямбда около единицы, и они отмахиваются от нее. А в plinke, в котором я провожу анализ, почему-то все коррекции на множественные сравнения производятся на основе номинального p. И GC-контроль как-то сам по себе. ну в принципе можно написать письмо редактору |
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |