Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
slavak4609 Участник |
Медуллобластомы (МБ) представляют собой группу злокачественных опухолей мозга различных по молекулярным аномалиям, гистологии и клиническим характеристикам. Они сравнительно часто встречаются у малолетних детей и редко у взрослых. По молекулярным признакам различают четыре главных подгруппы МБ: 1 – WNT с моносомией по хромосоме 6 и мутациями гена CTNNB1, 2 - SHH с мутациями генов PTCH/SMO/SUFU и амплификацией GLI2, 3 - с амплификацией MYC и аномалиями в 5q и 10q, 4 - часто с изохромосомой 17q и делециями хромосом 8 и Х. Исследования МБ в основном сконцентрированы на опухолях детей, а о биологии и генетике МБ у взрослых известно очень мало. SHH-МБ наиболее часто встречается у детей возраста 3 лет и менее, а также у взрослых, но опухоли в этих возрастных группах весьма различаются по набору генетических аномалий. Для лучшего понимания биологии SHH-МБ и разработки методов терапии с применением антагонистов SMO и комбинированной терапии требуются детальные исследования опухолей пациентов различного возраста. Спектры мутаций при SHH-МБ у 50 детей 3 лет и меньше, 33 детей 4-17 лет и 50 взрослых старше 18 лет были проанализированы с помощью методов секвенирования нового поколения. Обнаружены мутации в 1156 генах, из которых в 215 они неоднократно повторялись. В 87% случаев наблюдались мутации в генах сигнального пути SHH, что подтверждает их роль как драйверов онкогенеза. У взрослых пациентов доминировали мутации SMО, а мутации SUFU наблюдались практически исключительно у детей возраста 3 лет и менее. Мутации этих двух генов были очень редки у 4-17-летних детей. Вместо этого у них часто присутствовали мутации ТР53 практически никогда совместно с мутациями РТСН1, но часто совместно с амплификацией GLI2 и MYCN. В этой группе были также случаи мутаций ТР53 совместно с амплификацией SHH. Полученные результаты показали, что активирующие мутации пути SHH обнаруживаются практически во всех случаях SHH-МБ, но тип мутаций и пораженные гены очень сильно различаются в различных возрастных группах. Практически все опухоли взрослых пациентов имели мутации в промоторе TERT, кодирующем обратную транскриптазу теломеразы. В других группах они встречались гораздо реже. Ген РНК-хеликазы DDX3X мутировал более чем у половины взрослых, но сравнительно редко у детей. У взрослых чаще чем в других группах наблюдались мутации генов модификации хроматина. Были также обнаружены повторные мутации генов сигнального пути PI3K/AKT/mTOR, встречавшиеся чаще всего у взрослых. Они достоверно ассоциировались с негативным прогнозом заболевания. В таких случаях наилучшие результаты должно давать комбинированное лечение ингибиторами SMO и пути PI3K/AKT/mTOR. Авторы предположили, что опухоли с мутациями генов пути SHH следующих за геном SMO могут быть исходно устойчивыми к ингибиторам SMO. Культуры клеток, полученные их ксенографтных SHH-МБ, обрабатывали соединением NVP-LDE225 – ингибитором SMO, проходящим III фазу клинических испытаний как средство для лечения рецидивов SHH-МБ у детей и взрослых. NVP-LDE225 эффективно подавляло рост клеток, мутантных по РТСН1, но не клеток с амплифицированным MYCN или с делецией SUFU. Эти результаты были подтверждены экспериментами на мышах с соответствующими ксенографтными опухолями. Полученные результаты показывают, что разработка и применение новых средств терапии SHH-МБ должны основываться на данных по генетике опухолей. Многие SHH-МБ могут быть устойчивыми к ингибиторам SMO. В качестве дополнительной терапии возможно использование, например, триоксида мышьяка, подавляющего факторы транскрипции GLI. Возможно также применение других комбинаций для предотвращения или задержки развития резистентности с препаратами, воздействующими на сигнальные пути PI3K/AKT/mTOR или РКА. Источник: Kool M et al. ICGC PedBrain Tumor Project. Подпись к рисунку: Сигнальные пути, связанные с SHH-М и ингибиторы, которые могут быть использованы для лечения. Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 23.06.2014 16:48 |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
))) |
Guest IP-штамп: frdaoauaUv4NM гость |
(Guest @ 25.06.2014 09:18) кстати уникальная технолгия изобритенная в России если после УФ Лазаря подчистить ДНК брейки ин витро на магнитнах шариках работает как часы трансфак садится куда надо а не американсский фармалинофеый ЕНКОД Прожект Чичлафека и где можно такой уф лазер найти? (или в страталинкере тоже работает?) а димеры пиримидиновые вам (полимеразе) не мешают? |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 25.06.2014 15:51) и где можно такой уф лазер найти? (или в страталинкере тоже работает?) а димеры пиримидиновые вам (полимеразе) не мешают? 266 нанометроф наносекундный лазарь мона купить в сосднем шопе лазарь не делает димеры а ДНК брейки учи матчасть |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 25.06.2014 19:09) 266 нанометроф наносекундный лазарь мона купить в сосднем шопе лазарь не делает димеры а ДНК брейки учи матчасть в контроль ставишь Инпут а не IgG |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 25.06.2014 15:51) и где можно такой уф лазер найти? (или в страталинкере тоже работает?) а димеры пиримидиновые вам (полимеразе) не мешают? на Страхалинкере при мощности 4 миливата на сантиметру квадратную будешь облучать клетки один час на 75 милиджоулей палсед детсском Уф лазаре одну две секунды |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 25.06.2014 19:09) 266 нанометроф наносекундный лазарь мона купить в сосднем шопе лазарь не делает димеры а ДНК брейки учи матчасть лазарй делает димеры но потом другие фотоны его толпой изничтожают в ДНК брейк что потом на ультразвук хроматина ПСР и Чип-Сек не влияет на протоколах Иллумины |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 25.06.2014 15:51) и где можно такой уф лазер найти? (или в страталинкере тоже работает?) а димеры пиримидиновые вам (полимеразе) не мешают? на лазаре чиловековые трансфаки картируются на геном примерно при 10-20 джоулей на сантиметру квадратную за пару секунд на Страхалинкере енту дозу мона наскрести за Час без гарантии |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 25.06.2014 15:51) и где можно такой уф лазер найти? (или в страталинкере тоже работает?) а димеры пиримидиновые вам (полимеразе) не мешают? |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 25.06.2014 21:41) работает как часы тянет гены которые фармалином не выцтянешь |
Guest IP-штамп: fr3vQDp6M5Z3I гость |
(Guest @ 25.06.2014 19:27) лазарй делает димеры но потом другие фотоны его толпой изничтожают в ДНК брейк что потом на ультразвук хроматина ПСР и Чип-Сек не влияет на протоколах Иллумины так надо ДНК потом чинить все-таки или и так работает? лигазой например можно же однонитевые ники сшить |
Guest IP-штамп: fr3vQDp6M5Z3I гость |
(Guest @ 25.06.2014 21:41) а такой пойдет? |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 25.06.2014 23:25) не пойдет хилый и мелкий диаметр луча - диаметр долген быть 8 мм чтоб 250 миклов клеточных суспензий целиком облучались в Еппендорфе 10 герц наносекундный с 50-75 милидёулей 266 нм в пульсе оптимал ин витро репарировать не нужно 150 бп ПЦРятца без потери еффективности |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 25.06.2014 23:25) |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 25.06.2014 23:25) |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 25.06.2014 15:51) и где можно такой уф лазер найти? (или в страталинкере тоже работает?) а димеры пиримидиновые вам (полимеразе) не мешают? Страталинкером можно полнотранскриптомно карктировать РНКбелок Интенсивность УФ очень низкая 4 mw cm 2 и дозы 0.4 - 1.2 J cm 2 - HITS-CLIP, iCLIP Для ДНКбелок полногеномно плюс на Геном Человека трюк не пройдет Низкоинтенсивный УФ очень плохо пришивает белки к двунитивой ДНК |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
|
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
|
Guest IP-штамп: frdaoauaUv4NM гость |
(Guest @ 27.06.2014 07:40) не пойдет хилый и мелкий диаметр луча - диаметр долген быть 8 мм чтоб 250 миклов клеточных суспензий целиком облучались в Еппендорфе 10 герц наносекундный с 50-75 милидёулей 266 нм в пульсе оптимал ин витро репарировать не нужно 150 бп ПЦРятца без потери еффективности а как их облучать, кстати? неужели просто Эппендорф ставить под луч и все? |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 28.06.2014 14:19) да ручками Еппер держишь 5 секунд на скорость не влияет Еппер со льда в ПБС не более 20 лимонов клеток на 250 миклов воды |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 28.06.2014 14:19) обычно в луч ставлю квартцевую призму 45 чтоб повернуть лучь вниз |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 28.06.2014 14:19) пробовал с магнитным ротором на скорость не влияет пошуршил пипеткой и на 5 секунд в УФ Лазарь |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 29.06.2014 13:16) ессессно контроли на Иллумину без лазаря чтоб был полный нуль |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 28.06.2014 14:19) облучаешь аликвотами 5 раз по 20 лимонофф клетков чичлафекоф со льда в ПБС потом всех вкучу в тритон ингибиторы протеаз сразу потом стандартно зоникатор АЙ ПИ магнитные шарики хай соль вашинг иллумина |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 28.06.2014 14:19) еще один нюанс За Пабликухи В Нейче с Американосов за НЕФОРМАЛИНОВЫЕ КОНТРОЛИ СТРОГО НЕ СПРАШИВАЮТ СВОЯ ШАЙКАЛЕЙКА ЗА УФ КРОСЛИНК СПРОСЯТ ПОПОЛНОЙ НА НЕОБЛУЧЕННЫХ |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 28.06.2014 14:19) учтите у американосов своя формалиновая ENCODE мафия и УФ кросслинк они просто так не отдадут |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 29.06.2014 13:37) заставили переделовыть контроль с необлученнами клетками ну в итоге финальный Хай Салт Вашинг магнитных шаритов самопонятно никаких пиков не дал в контроле |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 28.06.2014 14:19) ессесно Еппер через открытую крышку прямс на клетки |
Guest IP-штамп: frqIB3XGsOevM гость |
(Guest @ 28.06.2014 14:19) биоконтроль УФ дозы 150 бп фрагменты должны отставать 3-5 циклов на реалтайм ПЦР по сравнению не с УФ |
Guest IP-штамп: frdaoauaUv4NM гость |
Наверное потому что они CsCl делали? |
Guest IP-штамп: fr45uHVgO7WZ2 гость |
(Guest @ 30.06.2014 11:13) Прикольно. А как интересно у этих товарищей без лазера получилось? Наверное потому что они ЦсЦл делали? облучат клетки страхалинкером 30 минут - стока трансфаки не сидят ДНК ин виво |
Guest IP-штамп: frT7jaVjpPwCY гость |
|
Guest IP-штамп: frT7jaVjpPwCY гость |
|
dorcasmelda Участник |
|
dorcassmith IP-штамп: frFIQoaSdZ2kU гость |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
JackOliver |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
kriz Постоянный участник |
|
kriz Постоянный участник |
Сайт Сайт Сайт Сайт Сайт Сайт Сайт Сайт |
bov12 IP-штамп: frWoyLp/FCXKE гость |
|
jad12 IP-штамп: frWoyLp/FCXKE гость |
|
superslotv9 IP-штамп: frXkFtWqamLPg гость |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
superslot gaming IP-штамп: frXkFtWqamLPg гость |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: frJhOCvSv9ICE гость |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
guest: Ufa1688 IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
« Предыдущая тема · Колонка новостей · Следующая тема » |