Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Рекрут |
(Asterix @ 04.06.2019 01:02) Вот зачем он поставил лейцину самый редкий кодон из 6-то возможных ? А у всех других аминокислот все нормально с этим. ожидаемо. Поскольку лейцин кодируется двумя семействами кодонов - CT семейством (кодоны синонимы) и TT семейством (сиом кодоны), то выбор его не прост и определяется аналогично выбору цистеина и селеноцистеина, как показано в работе: Turanov A.A. et al., 2009, Genetic Code Supports Targeted Insertion of Two Amino Acids by One Codon. Published 9 January 2009, Science 323, 259 (2009). DOI: 10.1126/science.1164748. Возможно, это и есть причина, что лейцин выступает у Вас как "зараза". |
hopfen Участник |
(Asterix @ 08.06.2019 21:58) . что ж такое-то , оптимизируем оптимизируем, а результат одинаковый как и не было никакой оптимизации... а вот он Лейцин какой , закладочка оказалась в коде , шутка программиста, .. теперь все понятно. астерикс когда я слышу про оптимизаций кодонов это ппг |
Рекрут |
(Asterix @ 08.06.2019 23:08) Ну мы оба био-художники ... я его понимаю отчасти. И вполне уважаю за настойчивость и веру в себя. Но в данном случае это просто ошибка программиста которую надо хотя бы в виде предупреждения там поставить.. мол пользуйтесь бесплатно нашей программой, но обратите внимание на лейцин. Он может вам всю малину подпортить. Эту же "ошибку" Природы почувствовали Ф.Крик и М.Ниренберг в 1964г., когда, к их удивлению, оказалось, что UUU кодирует одновременно фенилаланин и "клятый" лейцин. Много позже Туранов и др. в 2009г. обнаружили такой же феномен для кодона UGA реснитчатой инфузории, кодирующий одновременно цистеин и селеноцистеин. За счет палиндромной вставки шпильки на мРНК. |
Рекрут |
(Asterix @ 09.06.2019 02:39) вот поэтому собственно оптимизация кодонов и работает иногда .. за счет разрушения этих шпилек и прочих сигналов для рибосомы .. В растениях - ЭТО ОСОБЕННО ЗАМЕТНО Оптимизация кодонов - существенно более сложный процесс, поскольку основан на некой логике. Процессинг затрагивает не только и не столько син кодоны, но и остальные 32 не син кодонов. Что за логика - пока мало известно. |
Bern8 Участник |
(Рекрут @ 09.06.2019 11:24) Оптимизация кодонов - существенно более сложный процесс, поскольку основан на некой логике. Процессинг затрагивает не только и не столько син кодоны, но и остальные 32 не син кодонов. Что за логика - пока мало известно. иа что танм разбиратсйяан Инй и Ян Син и Пян |
Bern8 Участник |
(Рекрут @ 09.06.2019 11:24) Оптимизация кодонов - существенно более сложный процесс, поскольку основан на некой логике. Процессинг затрагивает не только и не столько син кодоны, но и остальные 32 не син кодонов. Что за логика - пока мало известно. ццылку моно |
Bern8 Участник |
(Рекрут @ 09.06.2019 00:19) Эту же "ошибку" Природы почувствовали Ф.Крик и М.Ниренберг в 1964г., когда, к их удивлению, оказалось, что UUU кодирует одновременно фенилаланин и "клятый" лейцин. Много позже Туранов и др. в 2009г. обнаружили такой же феномен для кодона UGA реснитчатой инфузории, кодирующий одновременно цистеин и селеноцистеин. За счет палиндромной вставки шпильки на мРНК. dk v rnkovyh virusah eto standart ne bolejte grippöm i krasnuhoj |
Рекрут |
(Bern8 @ 09.06.2019 11:40) моно. Только не хотелось бы крика тут. Не Френсиса. |
Bern8 Участник |
(Рекрут @ 09.06.2019 11:52) |
Рекрут |
|
Рекрут |
Не разобрался в сиомии кода? Стыдно? |
avor moderator |
(Рекрут @ 09.06.2019 14:11) Да, он временно ограничен в доступе. Но думаю он быстро поменяет обличие и вернётся, если конечно сочтет достойным своего развлечения поливание вас помоями.
|
Рекрут |
|
vb Постоянный участник |
|
Daemonarchestratygos Постоянный участник |
|
Рекрут |
|
Asterix Постоянный участник |
Собственно это будет обычный молбиол кит для школьных экспериментов на уроках Науки. Там Науку в средней школе не делят на подвиды , типа биология , химия , физика ... там это все одна хренотень. Ну надо-то придумать пяток экспериментов в русле Волновой Генетики и указку лазерную туда положить.. Пусть переносят устойчивость к ампициллину например с одной плазмиды на другую при помощи лазера.. И главное пусть отчеты публикуют .. а мы статистику сделаем сколь раз получалось а сколько раз нет ... В каком нибудь архиве запросто опубликуем данные народного эсперимента . Я вас уверяю результаты будут самые разные ... можно обсуждать тонкости будет ... Ну можно и подмухлевать слегка с этим китом ... но это уже деловой разговор ... это не бесплатно. |
Рекрут |
(Asterix @ 09.06.2019 22:39) Ну а что ППГ? жил бы в Штатах давно бы уже скооперировался с Зайнером и продавал бы ДНК-Кит Волновая Генетика , для школьников и всех домашних ученых-любителей. Собственно это будет обычный молбиол кит для школьных экспериментов на уроках Науки. Там Науку в средней школе не делят на подвиды , типа биология , химия , физика ... там это все одна хренотень. Ну надо-то придумать пяток экспериментов в русле Волновой Генетики и указку лазерную туда положить.. Пусть переносят устойчивость к ампициллину например с одной плазмиды на другую при помощи лазера.. И главное пусть отчеты публикуют .. а мы статистику сделаем сколь раз получалось а сколько раз нет ... В каком нибудь архиве запросто опубликуем данные народного эсперимента . Я вас уверяю результаты будут самые разные ... можно обсуждать тонкости будет ... Ну можно и подмухлевать слегка с этим китом ... но это уже деловой разговор ... это не бесплатно. ПГ: ну да, хочется юморнуть и юркнуть в сторону от фундаментальной проблемы, которую не понял. Но лучше самим разобраться, чем ждать, когда нас носом ткнут в нашу безграмотность. |
Asterix Постоянный участник |
Во время коллективизации отец Ивана Плотникова был раскулачен, сестра покончила с собой, а сам Плотников лишился ряда прав и гражданских свобод. Его изобретение принесло стране экономическую выгоду более чем в 30 миллионов рублей, он написал 300 с лишним научных работ и был удостоен, помимо Сталинской премии, нескольких наград. Но вплоть до 1977 года (а родился он в 1902-м) Плотников жил в крошечной комнатушке коммунальной квартиры и, по сути, за свою работу не получил ничего, кроме «спасибо». |
Рекрут |
|
vb Постоянный участник |
(Asterix @ 09.06.2019 21:23) К слову о судьбе изобретателя в СССР. Во время коллективизации отец Ивана Плотникова был раскулачен, сестра покончила с собой, а сам Плотников лишился ряда прав и гражданских свобод. Его изобретение принесло стране экономическую выгоду более чем в 30 миллионов рублей, он написал 300 с лишним научных работ и был удостоен, помимо Сталинской премии, нескольких наград. Но вплоть до 1977 года (а родился он в 1902-м) Плотников жил в крошечной комнатушке коммунальной квартиры и, по сути, за свою работу не получил ничего, кроме «спасибо». Логика? Нет, не слышал. почитай на досуге. так получил или не получил? |
vb Постоянный участник |
(Рекрут @ 09.06.2019 21:04) ПГ: ну да, хочется юморнуть и юркнуть в сторону от фундаментальной проблемы, которую не понял. Но лучше самим разобраться, чем ждать, когда нас носом ткнут в нашу безграмотность. Согласен, жадность и беспринципность - это фундаментальная проблема. я думаю, что без вмешательства в биологю решить ее не получится. |
Рекрут |
Понимаете, от проблемы сиомии белкового кода не уйти. Сиомия - объективная реальность. Придется таки решать. Тут умных голов достаточно, но что-то стесняются. В Штатах уже нащупали нерв - статья Туранова и др. (об UGA кодоне) в Science 2009г. тому свидетельство. Но тоже в научной литературе молчок. Двойные технологии светят? |
Рекрут |
|
LMP Постоянный участник |
(Asterix @ 09.06.2019 19:39) дикий он, хронически не поддается одомашниванию, оттого его пребывание в резервациях и заповедниках вечно пролонгируется
|
Рекрут |
(LMP @ 10.06.2019 18:15) дикий он, хронически не поддается одомашниванию, оттого его пребывание в резервациях и заповедниках вечно пролонгируется Сей господин уже однажды признался, написав мне в "Беседе" - "вы победили". Это после тщетных многолетних попыток что-то опровергнуть у меня с позиций науки касательно работы ген. кода в отношении его сиомии. Признался и тут же стёр. Это уж года три назад, а то и по боле, было. Давайте, опровергайте еще. Небось поумнели. Или напряженка с этим? Сообщение было отредактировано Рекрут - 10.06.2019 18:31 |
спин Участник |
Она же сводится все к тому же - не стационарности значений кодонов, особенно четко выраженной для сиом-кодонов, т.е. гибридов кодонов синонимов и омонимов. Это то, что Хесин назвал термином "непостоянство генома" Он говорил о геноме как целом. Но геном фрактален, что распространяется и на кодоновый континуум. До этого уровня он не дошел, но был близок. Эта фрактальность имеет бесконечные размерности в направлении от кодонов и выше. И соответственно, бесконечную смысловую наполненность. Этого господа оппоненты не хотят или не могут понять. Что и приводит к непониманию, в частности, того - что делать с коронавирусом и пр. злобными вирусами. И патогенными бактериями тоже. |
каксек Участник |
(спин @ 03.02.2020 21:10) Ну и зачем вернули тему? Она же сводится все к тому же - не стационарности значений кодонов, особенно четко выраженной для сиом-кодонов, т.е. гибридов кодонов синонимов и омонимов. Это то, что Хесин назвал термином "непостоянство генома" Он говорил о геноме как целом. Но геном фрактален, что распространяется и на кодоновый континуум. До этого уровня он не дошел, но был близок. Эта фрактальность имеет бесконечные размерности в направлении от кодонов и выше. И соответственно, бесконечную смысловую наполненность. Этого господа оппоненты не хотят или не могут понять. Что и приводит к непониманию, в частности, того - что делать с коронавирусом и пр. злобными вирусами. И патогенными бактериями тоже. |
каксек Участник |
(спин @ 03.02.2020 21:10) Ну и зачем вернули тему? Она же сводится все к тому же - не стационарности значений кодонов, особенно четко выраженной для сиом-кодонов, т.е. гибридов кодонов синонимов и омонимов. Это то, что Хесин назвал термином "непостоянство генома" Он говорил о геноме как целом. Но геном фрактален, что распространяется и на кодоновый континуум. До этого уровня он не дошел, но был близок. Эта фрактальность имеет бесконечные размерности в направлении от кодонов и выше. И соответственно, бесконечную смысловую наполненность. Этого господа оппоненты не хотят или не могут понять. Что и приводит к непониманию, в частности, того - что делать с коронавирусом и пр. злобными вирусами. И патогенными бактериями тоже. |
каксек Участник |
(avor @ 09.06.2019 17:44) Да, он временно ограничен в доступе. Но думаю он быстро поменяет обличие и вернётся, если конечно сочтет достойным своего развлечения поливание вас помоями. аворыч лжнеауку в России только за особенно цнлительнацы инстаграмм |
каксек Участник |
(Рекрут @ 08.06.2019 20:21) Поскольку лейцин кодируется двумя семействами кодонов - CT семейством (кодоны синонимы) и TT семейством (сиом кодоны), то выбор его не прост и определяется аналогично выбору цистеина и селеноцистеина, как показано в работе: Turanov A.A. et al., 2009, Genetic Code Supports Targeted Insertion of Two Amino Acids by One Codon. Published 9 January 2009, Science 323, 259 (2009). DOI: 10.1126/science.1164748. Возможно, это и есть причина, что лейцин выступает у Вас как "зараза". |
каксек Участник |
(каксек @ 03.02.2020 21:25) где комиссия РАН по лженауки где Гинзбург |
каксек Участник |
|
каксек Участник |
(каксек @ 03.02.2020 21:37) ну в крайнем случае расстрел |
каксек Участник |
(каксек @ 03.02.2020 21:37) |
каксек Участник |
(Рекрут @ 09.06.2019 11:24) Оптимизация кодонов - существенно более сложный процесс, поскольку основан на некой логике. Процессинг затрагивает не только и не столько син кодоны, но и остальные 32 не син кодонов. Что за логика - пока мало известно. рекрут |
спин Участник |
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |