Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* праймеры по фундуку -- подбор праймеров --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Анастейша




 прочитанное сообщение 16.10.2017 12:07     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Здравствуйте)не подскажите какие можно использовать праймеры для пцр диагностики дерева фундук?и у каких фирм производителей можно их приобрести?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 16.10.2017 13:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Приобрести праймеры (заказать синтез) можно в нескольких местах. Но сначала нужно рассчитать их последовательности. Задача не сложная, но её нужно конкретизировать. Вам это зачем? Для анализа аллергенов или для видового определения похожих деревьев (или кустарников)?
Участник оффлайн! Анастейша




 прочитанное сообщение 16.10.2017 13:42     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

для определения патогенов, а также на гомо-гетерозиготность
Участник оффлайн! Анастейша




 прочитанное сообщение 16.10.2017 14:07     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

может быть подскажите,где можно найти готовую нуклеотидную последовательность для анализа?для того,чтобы сразу отправить ее для изготовления праймера?
Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 16.10.2017 14:47     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Можно поискать по статьям последовательности праймеров. Можно взять несколько родственных видов и смоделировать для фундука. Можно взять универсальные праймеры, отсеквенировать последовательность на фундуке и "сдвинув" рамку "вовнутрь" локуса - получить уникальные. В случае идентификации проще взять что-то из мтДНК или пластид (не знаю, что для баркодинга растений используется чаще). Для гетерозигот надо что-то ядерное - но не факт, что прямым секвенированием Вы сможете прочитать гетерозиготы. В данном случае я бы присмотрелся к белкам или к построению рестрикных карт, можно ещё поглядеть на микросателлиты.
А вообще - начните с поиска публикаций, хотя бы с NCBI.
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 16.10.2017 14:55     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

Ищите в pubmed статьи по ПЦР идентификации Córylus avellána или вообще рода Córylus
Что касается гетерозиготности. Вы какой ген, аллель, локус имеете ввиду?
Участник оффлайн! Анастейша




 прочитанное сообщение 16.10.2017 15:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

точности анализа ещё не сказали,я пока просто предположила,что скорее всего пцр с этой целью будем ставить.ничего не нашла на этом сайте.уже даже не знаю,где искать.
Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 16.10.2017 16:46     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Анастейша, не пугайте нас так. Есть в NCBI целых 19 сиквенсов именно для лещины, там ссылки на статьи, где и праймеры, и условия ПЦР прописаны. Даны как пластидные локусы, так и ядерные. А уж просто по роду Corylus чего только нет, включая микросателлиты и рибосомальные локусы.
Участник оффлайн! Анастейша




 прочитанное сообщение 16.10.2017 17:05     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

я нашла,что используют праймеры UBC824(510),UBC824(1250),UBC843(1550),UBC814(1800),UBC813(11250).может кто то работал с этими праймерами?и знает нуклеотидную последовательность.мне нужно сделать характеристику ядерных микросателлитных локусов для видов лещины.
Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 16.10.2017 19:36     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Я не особо специалист - но вроде как UBC - это праймеры для ISSR? Вы же вроде хотели микросателлиты делать. Микросателлиты будут определяться числом тандемных повторов, а ISSR - это межмикросателлитные последовательности.
оффтоп: Уважаемая Анастейша, надеюсь Вашь никнэйм не связан с глав.героиней романа "50 оттенков серого" и вы таким мол.-биол. мазохизмом не получаете удовлетворение?
Участник оффлайн! Vorona
Постоянный участник
Мурманск



 прочитанное сообщение 16.10.2017 21:21     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

Объясните, пожалуйста, чайнику — а патогены-то тут каким боком?

Всего благодарностей: 5Поблагодарили (5): vb, dk, Nastja, Fanat MMM, sceptique
Участник оффлайн! Анастейша




 прочитанное сообщение 17.10.2017 09:10     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

надейтесь)
Участник оффлайн! ksm
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 17.10.2017 16:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

(Vorona @ 16.10.2017 22:21)
Ссылка на исходное сообщение  Объясните, пожалуйста, чайнику — а патогены-то тут каким боком?

ну элементарно же!
один праймер - на патоген, другой - на орешник. если ПЦР идет, то лещина больная!

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): kblag, sceptique
Участник оффлайн! vb
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 17.10.2017 19:30     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

(ksm @ 17.10.2017 14:48)
Ссылка на исходное сообщение  ну элементарно же!
один праймер - на патоген, другой - на орешник. если ПЦР идет, то лещина больная!

Эээээ.... как то.... спорно я бы сказал.
Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 18.10.2017 09:41     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

Уважаемый ksm, думаю Ваше сообщение - сарказм? А то ведь девушка так и будет делать и будет много "открытий чудных".
Анастейша, не верьте всему, что Вам наговорят тут. Мужики они такие - только и ждут, как бы обмануть и надругаться над невинным созданием.
Участник оффлайн! Fanat MMM

СПб



 прочитанное сообщение 18.10.2017 19:25     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

Зачем вам гомо/гетеро зиготы определять? Вы инцухт линии хотите маркировать? И при чем тут патогены? Эти маркеры которые написали для ISSR. Складывается впечатление что вы сами не знаете чего хотите.
Участник оффлайн! Fanat MMM

СПб



 прочитанное сообщение 18.10.2017 19:26     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

(ksm @ 17.10.2017 17:48)
Ссылка на исходное сообщение  ну элементарно же!
один праймер - на патоген, другой - на орешник. если ПЦР идет, то лещина больная!

Хорошая шутка)))
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 19.10.2017 02:01     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

(Fanat MMM @ 18.10.2017 17:26)
Хорошая шутка)))

Вы таки будете смеяться, но я действительно так делал - с маркерами антибиотикоустойчивости. Один праймер - на ген резистентности, а второй - на плазмидный бэкбон. ПЦР идёт только когда плазмида несёт встроенный транспозон с геном.
Участник оффлайн! Анастейша




 прочитанное сообщение 19.10.2017 15:28     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

я хотела найти различные праймеры для различных целей)))и написала,что нашла только такие
Участник оффлайн! scihub




 прочитанное сообщение 20.10.2017 11:01     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

(Carbon Copy @ 19.10.2017 03:01)
Ссылка на исходное сообщение  Вы таки будете смеяться, но я действительно так делал - с маркерами антибиотикоустойчивости. Один праймер - на ген резистентности, а второй - на плазмидный бэкбон. ПЦР идёт только когда плазмида несёт встроенный транспозон с геном.

карбоныч я таки не буду смеятся smile.gif
Участник оффлайн! scihub




 прочитанное сообщение 20.10.2017 11:02     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

(Carbon Copy @ 19.10.2017 03:01)
Ссылка на исходное сообщение  Вы таки будете смеяться, но я действительно так делал - с маркерами антибиотикоустойчивости. Один праймер - на ген резистентности, а второй - на плазмидный бэкбон. ПЦР идёт только когда плазмида несёт встроенный транспозон с геном.

- с маркерами антибиотикоустойчивости.
smile.gif
Участник оффлайн! scihub




 прочитанное сообщение 20.10.2017 11:05     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #22 множественное цитирование

(Carbon Copy @ 19.10.2017 03:01)
Ссылка на исходное сообщение  Вы таки будете смеяться, но я действительно так делал - с маркерами антибиотикоустойчивости. Один праймер - на ген резистентности, а второй - на плазмидный бэкбон. ПЦР идёт только когда плазмида несёт встроенный транспозон с геном.

карбоныч что такое праймеры с маркерами анткарбонычаустойчивости smile.gif
Участник оффлайн! Fanat MMM

СПб



 прочитанное сообщение 20.10.2017 13:48     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #23 множественное цитирование

(Carbon Copy @ 19.10.2017 03:01)
Ссылка на исходное сообщение  Вы таки будете смеяться, но я действительно так делал - с маркерами антибиотикоустойчивости. Один праймер - на ген резистентности, а второй - на плазмидный бэкбон. ПЦР идёт только когда плазмида несёт встроенный транспозон с геном.

Наверно какой-то редкий антибиотик был? По идее можно было высадить на селективную среду.
в этом ничего удивительного, что пцр идёт, но то про что говорил ksm не пройдёт
Участник оффлайн! ksm
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 20.10.2017 17:06     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #24 множественное цитирование

Тут строго говоря, если транспозоны считать патогеном, то глубокоуважаемый dk неправ и сарказма нет.
Участник оффлайн! dk
Постоянный участник
Россия



 прочитанное сообщение 20.10.2017 19:51     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #25 множественное цитирование

Да, признаю - можно по-разному! Но милой барышне это всё вряд ли поможет в её задачах, т.к. она просила: "для определения патогенов, а также на гомо-гетерозиготность" и "характеристику ядерных микросателлитных локусов для видов лещины".
А вообще как всегда форумчане - такие затейники! Сам узнал такие "хитрости" - спасибо!
Участник оффлайн! borigv
Постоянный участник
г. Саратов



 прочитанное сообщение 23.10.2017 07:01     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #26 множественное цитирование

Мне одному кажется что уважаемой топикстартеру самой не вполне ясно чего она хочет? Ключевое слово - фундук, и все что можно с ним приготовить используя амплификатор. Может дать время девушке определиться а потом уже засыпать её пластидами?
Участник оффлайн! watchesbiz
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  23.11.2021 14:54     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #27 множественное цитирование

https://archives.profsurv.com/forum/Profess...ert/-67881.aspx
https://atlanta.bubblelife.com/community/an...ex_Watch_Online
https://gumroad.com/rolexrelicawatches/p/di...replica-watches
https://onmogul.com/stories/guide-on-how-to...ex-watch-online
https://list.ly/i/5704105
https://www.behance.net/gallery/114237003/Replica-Rolex
https://www.mlbdailydish.com/users/Replicarolexwatches
http://replicawatches24.simplesite.com/
https://watcheshutuk.cabanova.com/
https://www.pinterest.com/watcheshutuk/_saved/
https://www.linkedin.com/pulse/guide-how-pu...online-hei-bai/
https://justpaste.it/8t11q
https://padlet.com/watcheshutuk/in2opwnfmnmclce8
https://www.allforxi.com/users/Replicarolexwatches
https://profile.hatena.ne.jp/Rolexrelicawatches/profile
Участник оффлайн! molavi




 прочитанное сообщение Сообщение на английском  29.09.2023 07:39     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #28 множественное цитирование

قالیشویی در اصفهان
فرش شویی در اصفهان
قاایشوئی در اصفهان
قاایشوئی در اصفهان
قاایشوئی در اصفهان
نرم افزار قالیشویی
سامانه پیامک
بهترین قالیشویی در اصفهان
قالیشویی در بهارستان
قالیشویی در سپاهان شهر
Участник оффлайн! molavi




 прочитанное сообщение Сообщение на английском  29.09.2023 07:39     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #29 множественное цитирование

قالیشویی در اصفهان
فرش شویی در اصفهان
قاایشوئی در اصفهان
قاایشوئی در اصفهان
قاایشوئی در اصفهان
نرم افزار قالیشویی
سامانه پیامک
بهترین قالیشویی در اصفهان
قالیشویی در بهارستان
قالیشویی در سپاهان شهر
Участник оффлайн! jaipurescorts0010
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  29.09.2023 13:45     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #30 множественное цитирование

Chhata Escort
Chhatargarh Escort
Chhatarpur Escort
Chhatna Escort
Chhatroo Escort
Chhattarpur Escort
Chhaygaon Escort
Chhibramau Escort
Chhindgarh Escort
Chhindwara Escort
Chhorahi Escort
Chhota Udaipur Escort
Chhuikhadan Escort
Chhura Escort
Chhuriya Escort
Chicholi Escort
Chidambaram Escort
Chiephobozou Escort
Chikhaldara Escort
Chikhli Escort
Chikkaballapura Escort
Chikmagalur Escort
Chiknayakanhalli Escort
Chikodi Escort
Chilakaluripet Escort
Chimur Escort
Chincholi Escort
Chingmei Escort
Chingmeirong Escort
Chinhat Escort

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 19.04.24 02:11
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft