Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток -- ...от компании Helicon --
Компания Biocommerce - официальный дистрибьютер продукции компаний Miltenyi Biotec GmbH (Германия) и RanD S.r.l. (Италия).
Тема связана с: 5 мифов о сортировке клеток
Кураторы темы:* Дядя ФАКСер
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum



 прочитанное сообщение 19.09.2017 13:17     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование
Информация
Вдумчиво и серьезно заниматься сортерами клеток «Компания Хеликон» начала в 2014 году. За эти годы специалисты компании столкнулись с целым ворохом всевозможных мифов и легенд, связанных с выбором оборудования для сортировки, и теперь готовы со всей серьезностью их развенчать.

Миф №1: Сортировка клеток – лучший способ выделения целевых клеток из гетерогенных популяций.

Сегодня есть три основные задачи, которые пользователи ставят перед клеточными сортерами: обогащение, выделение редких популяций и сортировка единичных клеток. И хотя сортер в этом отношении, действительно, и швец, и жнец, и на дуде игрец, далеко не всегда его использование является оптимальным решением. Вы же не будете покупать Порше, чтобы кататься на нем в соседний магазин?
Например, обогащение клеточной популяции – задача несложная, и решается простыми клеточными сепараторами и специальными реагентными наборами. А если говорить о таком тонком и деликатном деле, как работа с единичными клетками, то существует целый отдельный класс приборов, заточенный на эффективное решение именно таких задач.
Если вы не уверены в том, какой метод лучше всего подойдет для вашей работы, всегда можно написать специалистам Компании Хеликон. Вам подберут решение, которое действительно необходимо: не больше и не меньше.

Миф №2: Чем больше лазеров, тем больше флуоресцентных каналов.

Классическое заблуждение, культивируемое производителями в самых разных областях: от мобильных телефонов до научных приборов (пример: обзор о том, как на самом деле связано количество пикселей с качеством изображения в гель-документирующих системах). Интерес производителя здесь очевиден: чем больше, тем дороже.
На самом деле, зачастую у сортеров с одними и теми же лазерами количество флуоресцентных каналов драматически различается. Все потому, что число каналов напрямую зависит от того, как физически расположены лазеры в приборе. В сортерах с коллинеарными лазерами количество флуоресцентных каналов гораздо меньше, чем в сортерах с лазерами, разделенными в пространстве, т.к. во втором случае сигнал от каждого лазера детектируется отдельно.


Рис.1 Оптическая схема с коллинеарными лазерами – 4 флуоресцентных канала.
картинка: schema_1_1_small.jpg

Рис.2 Оптическая схема с пространственно разделенными лазерами – 7 флуоресцентных каналов.
картинка: schema_2_small.jpg

Миф №3: Максимальная скорость сортировки – это та скорость, с которой вы будете сортировать.

Реальность куда прозаичнее: максимальная скорость сортировки клеток – это та скорость, на которой можно сортировать калибровочные частицы при настройке сортера. Сортировка реальных клеток на таких скоростях приведет к значительному росту коэффициента вариации (CV) и падению чистоты сорта.
Такой расклад приемлем, когда стоит задача обогащения, но для обогащения есть более простые и гуманные способы (см. Миф №1). Во всех остальных случаях действительно важным является параметр чистоты сорта на заданной скорости. И вот здесь идет война за каждый лишний процент, особенно когда речь идет о редких популяциях – кто знает, не попадет ли ваша драгоценная клетка в тот самый 1%?

Миф №4: Одноразовые элементы жидкостного тракта – перспектива для клинического использования сортера клеток.

Один из самых активно распространяемых мифов, связанный с давней мечтой ученых и клиницистов использовать сортировку клеток для лечения пациентов, которую подогрел недавно вышедший Закон N 180-ФЗ "О биомедицинских клеточных продуктах".
К сожалению, этой мечте пока не суждено стать реальностью. Подавляющее большинство клеточных сортеров мирового рынка работают на технологиях, основанных на фокусировании клеток в потоке жидкости через систему капилляров. Это значит, что для гарантии стерильности и отсутствия кросс-контаминации весь жидкостной тракт сортера, от пробозаборника до системы сбора образца, должен быть сменным и одноразовым.
Некоторыми производителями оборудования, действительно, предпринимались попытки внедрения отдельных одноразовых элементов (например, использование сменного чипа вместо сопла), но в большинстве своем жидкостной тракт сортера до сих пор остается стационарными и требует стандартных процедур очистки. Это исключает возможность получения такими сортерами IVD сертификата за рубежом и регистрации в Минздраве РФ.
Продолжаем ждать и надеяться!


Миф №5: Чем выше чувствительность в эквивалентах (MESF), тем лучше качество сигнала.
Чувствительность в эквивалентах – это важно и хорошо. Но нужно иметь в виду, что не только MESF влияет на качество сигнала. Откровенно говоря, реальная разница между 115 и 125 MESF не так уж велика, так как большинство эпитопов содержатся в клетке в достаточном количестве, чтобы не замечать этой разницы. Кроме того, на одном антителе, как правило, связано больше одной молекулы флуорохрома, что позволяет успешно детектировать эпитопы в низких концентрациях.
Не менее важным параметром является разрешение сигнала. А разрешение зависит не только от чувствительности детекторов, но и от самой метки, от уровня автофлуоресценции объекта, от мощности лазера (чем мощнее лазер, тем больше сигнал с флуорохрома) и т.д. Как правило, в технических описаниях сортеров разрешение никак не цифруется, и единственный способ оценить этот параметр – по графикам сортировки флуоресцентных калибровочных частиц, которые часто приводят в рекламных материалах к приборам.

Рис.3 Пример детектирования флуоресцентных микросфер на сортере клеток. CV <2.5. Восемь пиков видны во всех 4-х флуоресцентных каналах.
картинка: detektirovanie_fluorescentnyh_mikrosfer_small.jpg


Ссылка на статью на сайте - http://helicon.ru/support/methodological/r...tirovke-kletok/

Файл/ы:

скачать файл Cell_sorting_myths.pdf
размер: 378.19к
кол-во скачиваний: 10




Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Bear


  Тема ассоциирована со страницей: Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток  
Участник оффлайн! Annabel
Участник
Бостон, США



 прочитанное сообщение 20.09.2017 04:09     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Слушайте, только мне кажется, что с каждым пунктом этой статьи что-то не так (иногда многократно)? Общее впечатление - как от сортинга на Калибуре smile.gif

  Тема ассоциирована со страницей: Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток  
Guest
IP-штамп: frBp13I6uCA8o
гость



 прочитанное сообщение 22.09.2017 00:25     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

(Annabel @ 20.09.2017 04:09)
Ссылка на исходное сообщение  Слушайте, только мне кажется, что с каждым пунктом этой статьи что-то не так (иногда многократно)? Общее впечатление - как от сортинга на Калибуре smile.gif

просто, когда “Вдумчиво и серьезно заниматься сортерами клеток «Компания Хеликон» начала в 2014 году.“
Поэтому стиль изложения сыроват, а примеры несколько абстрактны, но в целом — нормально, с учетом того, что не совсем понятно на кого рассчитан документ (за сортировкой везде в міре приглядывает ответственный за платформу (core facility), это анализ может вырваться из-под ока смотрящего). А ответственный за сервис должен, по идее, не быть в плену подобных мифов.

  Тема ассоциирована со страницей: Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток  
Участник оффлайн! Annabel
Участник
Бостон, США



 прочитанное сообщение 22.09.2017 07:22     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

да там вообще вдумчивые волшебники работают. Судя по каталогу, они собираются "тонко и деликатно" выделять единичные клетки масс-цитометрией... jump.gif

  Тема ассоциирована со страницей: Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток  
Участник оффлайн! tus




 прочитанное сообщение 23.09.2017 10:55     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

(Annabel @ 22.09.2017 08:22)
Ссылка на исходное сообщение  да там вообще вдумчивые волшебники работают. Судя по каталогу, они собираются "тонко и деликатно" выделять единичные клетки масс-цитометрией... jump.gif


Так в каталоге же про изучение единичных клеток, а не про выделение umnik.gif

Сообщение было отредактировано tus - 23.09.2017 11:08

  Тема ассоциирована со страницей: Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток  
Участник оффлайн! Annabel
Участник
Бостон, США



 прочитанное сообщение 23.09.2017 18:19     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

Ну в этом смысле любая цитометрия - про изучение единичных клеток smile.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Дядя ФАКСер


  Тема ассоциирована со страницей: Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток  
Участник оффлайн! Дядя ФАКСер
moderator
Nothern Maccaronia, Ticinum



 прочитанное сообщение 30.09.2017 19:41     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

Есть много гитик...ZellKraftwerk, напримерsmile.gif

  Тема ассоциирована со страницей: Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток  
Участник оффлайн! dgustica

Серпухов



 прочитанное сообщение 02.10.2017 15:09     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Мир это так и естьsmile.gif) Волшебники правятsmile.gif) А Феи отдыхаютsmile.gif) Если что то нужное и важное есть, то оно в каталог явно не попадет, потому что кто то вдруг станет умнее и мудрееsmile.gif

  Тема ассоциирована со страницей: Разделяй и властвуй: 5 мифов о сортировке клеток  

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Клеточные технологии · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 23.10.17 14:51
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft