molbiol.ru -> Праймеры и зонды для британского SARS-CoV-2

> Все форумы > Тематические форумы > Молекулярная и клеточная биология

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Праймеры и зонды для британского SARS-CoV-2 -- на суд общественности --

Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

genseq
Постоянный участник

25.01.2021 14:07

URL #1

Не хотел ввязываться в борьбу с этой пандемией, но СМИ уже достали.

Особенно британским вариантом. Да и делать было нечего. Поэтому попытался рассчитать праймеры и зонды для определения SARS-CoV-2 и идентификации его британской разновидности. Причём с зондами типа molecular beacons, с которыми ещё не работал.

Поэтому буду признателен за любые замечания и предложения по поводу их улучшения и проверки работоспособности.

Сообщение было отредактировано genseq - 25.01.2021 14:18

Файл/ы:

UK_SARS_CoV_2.doc
размер: 146к
кол-во скачиваний: 69

kb1
Участник

26.01.2021 15:24

URL #2

ну, это к Ъ

siyaol2

29.01.2021 09:25

URL #3

Kravitz's comment has received more than 1,360 likes while her Instagram post overall has received more than 396,840 likes as of Sunday evening.

eCommerce directories and sponsored links

genseq
Постоянный участник

31.01.2021 18:49

URL #4

auh

11.02.2021 21:13

URL #5

(genseq @ 25.01.2021 15:07)

Не хотел ввязываться в борьбу с этой пандемией, но СМИ уже достали.

проще под Пакман

auh

11.02.2021 21:20

URL #6

(genseq @ 25.01.2021 15:07)

Не хотел ввязываться в борьбу с этой пандемией, но СМИ уже достали.

molecular beacons

малякулярныне биканы гафно

auh

11.02.2021 21:22

URL #7

(genseq @ 25.01.2021 15:07)

Не хотел ввязываться в борьбу с этой пандемией, но СМИ уже достали.

прогони на синтетической матрице и выложи народу

auh

11.02.2021 21:28

URL #8

(genseq @ 25.01.2021 15:07)

Не хотел ввязываться в борьбу с этой пандемией, но СМИ уже достали.

в Британии говорят что это Кентсский вирус

auh

11.02.2021 21:44

URL #9

(genseq @ 25.01.2021 15:07)

Не хотел ввязываться в борьбу с этой пандемией, но СМИ уже достали.

я думаю после бразильских южноафриканских кентских вариантов проще пцр шипа и сиквенс

auh

11.02.2021 22:28

URL #10

(genseq @ 25.01.2021 15:07)

Не хотел ввязываться в борьбу с этой пандемией, но СМИ уже достали.

"Поэтому попытался рассчитать праймеры и зонды" ©

на какой проге

Guest
IP-штамп: frA7jTqv8Z/4.
гость

16.02.2021 09:39

URL #11

https://telegra.ph/biz-news-2-02-13
https://telegra.ph/BRAKING-news-02-13
http://anes.staff.ipb.ac.id/2014/04/03/cyb...#comment-184704
http://anes.staff.ipb.ac.id/2014/04/03/cyb...#comment-184705
http://archives.lametropole.com/blog/carol...rite-recherchee
http://betaleks.blog.free.fr/index.php?pag...9-le-TF1-Bis#pr
http://blog.cnyes.com/My/tragevdy/article2456282
http://blog.ilc.edu.tw/blog/blog/21/post/277/770449
http://blog.ilc.edu.tw/blog/blog/21/post/277/770449
http://blog.ilc.edu.tw/blog/blog/21/post/277/770449
http://blog.ilc.edu.tw/blog/blog/21/post/277/770449
http://blog.ilc.edu.tw/blog/booksindex.php...=244&linkId=247
http://blog.wirtualnemedia.pl/agencja-mome...#comment-665012
http://blogs.bootsnall.com/tahoejohnson/pi...#comment-775818
http://blogs.dickinson.edu/copenhagen/2010.../#comment-65958
http://cliquestudios04.businesscatalyst.co...oTemplate=True#
http://cliquestudios04.businesscatalyst.co...NoTemplate=True
http://community.gtarcade.com/forum.php?mo...ra=#pid16726208
http://criticalliteracy.freehostia.com/ind...path%5B%5D=4815
http://dailyuknewspost.manifo.com/
http://eba-www.yokohama-cu.ac.jp/~kook/cgi...k%20news%20post
http://fatcow.com/blog/?p=1255#comment-2309979
http://fortest.ykt.ru/8-nuzhnyy-sertifikat.html
http://forum.erickimphotography.com/thread...h/2#reply_17348
http://foswiki.oris.mephi.ru/Main/Uknewspost
http://gestiondelriesgo.gov.co/Foros/yaf_p....aspx#post52393
http://gforge.wits.ac.za/gf/project/vre/fo...Message+replied.
http://gitlab.asap.um.maine.edu/newsdailybindings
http://groupspaces.com/EpsonPrinterSupport...lbum/89350#wall
http://hello.ouishare.net/2015/hi-this-looks-amazing-
http://ideal.thesoftking.com/dizcuz/forum/...ompanies-in-uae
http://isa-universities-in-crisis.isa-soci...0#comment-19845
http://itinerantbizarrium.indiemade.com/bl...ns#comment-1371
http://jacks-van.224715.n8.nabble.com/unab...tt197.html#a247
http://kentasdiverse.dinstudio.se/11/4/1/din-rubrik/
http://lms.ctl.cyut.edu.tw/1999043/doc/988...og_reply_editor
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=621382
http://nakigao.sitemix.jp/nakiwiki/?uk%20news%20postnews
http://ojs.lib.teithe.gr/index.php/perisco...108/69698/73032
http://onlinemanuals.txdot.gov/help/urlsta...%2F&ok=+++ok+++
http://profs.if.uff.br/tjpp/blog/entradas/...83edf7b18a7b74d
http://rivr.sulekha.com/newsdailybindings_49688129
http://rosalind.info/users/newsdailybindings/
http://s668169980.onlinehome.us/?q=blog/cm...s#comment-64472
http://sagasimono.squares.net/posts/view/31#comment_217992
http://sheffield2013.blogs.latrobe.edu.au/...362059550193469
http://sites.utexas.edu/learningtuscany/20...#comment-664684
http://sonicsquirrel.net/detail/user/newsdailybindings/
http://tbirdnow.mee.nu/barbarossa#c373
http://tenislapangan.ukm.unair.ac.id/?x=en...nt210207-211300
http://wells-status.gsu.edu/2012/08/email-...074616101023102
http://wikifisc.uqtr.ca/index.php/user/newsdailybindings
http://www.authorstream.com/newsdailybindings/
http://www.blogs.mundo-r.com/weblog/gl/fot...1356d598c03072a
http://www.cafepedagogique.net/lexpresso/P...6942543096.aspx
http://www.divephotoguide.com/user/dailyuknewspost
http://www.engellaender.de.rs/b
http://www.freewebsite-service.com/2910lei....php?id=1526591
http://www.golden-guard.de.rs/b
http://www.golden-guard.de.rs/b
http://www.golden-guard.de.rs/b
http://www.golden-guard.de.rs/b
http://www.heromachine.com/forums/users/todayusnewspost/
http://www.icoph.org/connections/user_prof...dings-news.html
http://www.ie.thu.edu.tw/blog/index.php?PID=31&Sn=132
http://www.ie.thu.edu.tw/blog/index.php?PID=31&Sn=132
http://www.ie.thu.edu.tw/blog/index.php?PID=31&Sn=132
http://www.ie.thu.edu.tw/blog/index.php?PID=31&Sn=132
http://www.lawrence.com/users/newsdailybindings/
http://www.radiollanuradecolon.icrt.cu/cal...comment-4092613
http://www.radiollanuradecolon.icrt.cu/por...comment-4161247
http://www.radiollanuradecolon.icrt.cu/por...comment-4161317
http://www.rohitab.com/discuss/user/123253-newsdaily/
http://www.rospisatel.ru/conference2/index...d=1612837461041
http://www.s1032556-24311.pa.infobox.ru/f1...re=2&c_start=50
http://www.smithmag.net/nextdoorneighbor/2...comment-1170371
http://www.socsc.hku.hk/icp21/chi/nunc-qui.../#comment-75243
http://www4.ac-nancy-metz.fr/ptit-momes-ac...le35#forum95691
http://xinn.mydns.jp/snapnote/idea/20200506_01.htm#wb
https://academy.autodesk.com/users/usnewstoday9
https://androidforums.com/members/newsdailybindings.2136421/
https://angiemakes.com/use-clipping-mask-ph...#comment-331155
https://b2b.partcommunity.com/community/eve...45/post_id/8896
https://bbs.now.qq.com/home.php?mod=space&uid=643491
https://blocs.xtec.cat/elblocdelafrancina/2...3/#comment-9473
https://blocs.xtec.cat/elblocdelafrancina/2...3/#comment-9475
https://blog.edu.turku.fi/nattinummenphy/20...isia-hunajatuva
https://blog.edu.turku.fi/nattinummenphy/20.../#comment-63588
https://blog.goo.ne.jp/driver_dowload_updat...=0#comment-form
https://blog.sivanaspirit.com/author/usnewstoday02/
https://blog.williams-sonoma.com/how-to-cut...comment-4461257
https://blog.williams-sonoma.com/how-to-cut...comment-4461264
https://blogs.elon.edu/hawaii/2014/01/09/le...#comment-381313
https://blogs.sap.com/2020/10/08/coffee-cor...#comment-553693
https://bordeaux.onvasortir.com/profil_read...Dailyuknewspost
https://bugs.php.net/bug.php?id=28633&thanks=3
https://cafebabel.com/en/profile/anonymous-...23b337705a066b/
https://career.habr.com/ustoday-news
https://ccm.net/profile/user/newsdailybindings
https://chantreltiffanyvaldemarne.paroledem...oo-de-vincennes
https://cinecrowd.com/en/stretch-goals?page=1#comment-398514
https://clyp.it/user/5fujcecw
https://compass.valuescentre.com/members/us...day02gmail-com/
https://connect.dona.org/network/members/pr...ec-3c9e8ec651f3
https://cunymathblog.commons.gc.cuny.edu/20...#comment-154168
https://cunymathblog.commons.gc.cuny.edu/20...#comment-154169
https://digitalmarketing.temple.edu/jaltman.../#comment-40495
https://digitalmarketing.temple.edu/jaltman.../#comment-40498
https://edspace.american.edu/sis628/2014/02.../#comment-86428
https://edspace.american.edu/sis628/2014/04.../#comment-87252
https://edspace.american.edu/sis628/2014/04.../#comment-87255
https://ello.co/dailyuknewspost
https://elok.ugm.ac.id/user/profile.php?id=92219
https://emu.edu/now/crossroads/2013/05/14/t...#comment-215522
https://emu.edu/now/crossroads/2013/05/14/t...#comment-215523
https://es.radiocut.fm/user/newsdailybindings/
https://espaciodca.fedace.org/content/uk-news-post
https://evenement-hes.hesge.ch/660/#comment-295608
https://evenement-hes.hesge.ch/660/#comment-295610
https://fairygodboss.com/users/profile/LHSv...tlO/us-now-news
https://fgforum.fashionguide.com.tw/post_li...opic_id=1393297
https://findery.com/newsdailybindings
https://fjb.kaskus.co.id/post/600d8a989a972...a972e797b128b9a
https://foro.zendalibros.com/forums/users/dailyuknewspost/
https://forum.edugorilla.com/forums/topic/m...nstall-smuby-4/
https://forum.smartcanucks.ca/members/daily...#vmessage321553
https://forumannou.cirad.fr/viewtopic.php?f=4&t=1296900
https://forums.factorio.com/memberlist.php?...rofile&u=141920
https://forums.hirezstudios.com/paladins/us...wsdailybindings
https://forums.prosportsdaily.com/member.ph...9-dailynewsbind
https://forums.stardock.com/503558/uk-news-post
https://forums.ubisoft.com/showthread.php/5...=1#post15336993
https://gassus.polri.go.id/index.php/home/detail_berita/53
https://globalhealthtrials.tghn.org/communi...members/367036/
https://godotengine.org/qa/user/newsdailybindings
https://goobjoog.com/interesting-issues-for...#comment-685253
https://grabcad.com/newsdailybindings.news-1
https://gumroad.com/dailyuknewspost
https://hire.careerbliss.com/company/uknewspost/
https://hypothes.is/users/newsdailybindings
https://ideaspace.versionone.com/default/Idea/Detail/1275
https://iq.worldcrunch.com/profile/28252
https://katefindlay.vpweb.co.uk/blog/2014/0...th-January.aspx
https://keepcalms.com/p/i-can-t-keep-calm-b...etting-engaged/
https://letterboxd.com/todayusnewspost/
https://list.ly/usnewstoday06/activity
https://mangadex.org/user/2678967/newsdailybindings
https://meadd.com/dailyuknews/69826092
https://minecraft-mp.com/profile/dailyuknewspost/
https://myclc.clcillinois.edu/web/jeff_test...03101/maximized
https://newsroom.mastercard.com/2018/10/25/...#comment-698892
https://newsroom.mastercard.com/2018/10/25/...#comment-698893
https://newsroom.mastercard.com/2018/10/25/...#comment-698894
https://newsroom.mastercard.com/2018/10/25/...#comment-698895
https://omastadi.hel.fi/profiles/bindings/activity?locale=en
https://onedio.com/profil/newsdailybindings
https://online.unisc.br/seer/index.php/cadp.../13012/0/359854
https://participer.loire-atlantique.fr/prof...ndings/activity
https://pastelink.net/2mnp6
https://permies.com/u/327710/dailyuknewspost-news
https://pinshape.com/users/1125455-ustoday-...esigns-tab-open

Guest
IP-штамп: frA7jTqv8Z/4.
гость

16.02.2021 09:40

URL #12

-Ъ-
Постоянный участник
Москва

16.02.2021 17:07

URL #13

(kb1 @ 26.01.2021 16:24)

ну, это к Ъ

Биканами не увлекаюсь на данный момент, они мне не понравились в свое время. Они любят инд.подход.
Я простыми ТакМанами с контактным тушением, чтобы на простом флуориметре тоже можно было регистрировать сигнал, с минимальным фоном.

genseq
Постоянный участник

17.02.2021 14:03

URL #14

(-Ъ- @ 16.02.2021 15:07)

Ты, как всегда, прав. С ТакМанами было бы проще. Но меня в них смущает необходимость ограничиваться короткими последовательностями(~20N), из-за чего приходится добавлять MGB. У биконов длина не столь принципиальна, зато из-за инд. подхода их подбор может обойтись в копеечку. Но если появилась копеечка, то можно и поэкспериментировать. При этом главное - научиться их подбирать. А для этого сначала придётся поошибаться. И мне показалось, что на дифференциации британского варианта поучиться (и даже поошибаться) было бы неплохо (и не стыдно). Нужно только найти контрольные препраты его РНК или кДНК для таких экспериментов.

Сообщение было отредактировано genseq - 17.02.2021 17:50

watchesbiz
Постоянный участник

28.09.2021 05:28

URL #15

http://www.authorstream.com/Replicawatches24/
https://about.me/Replicawatches24
https://moz.com/community/users/17050093
https://trello.com/rolexrelicawatches/activity
https://replicarolexwatches.dreamwidth.org/365.html
https://visual.ly/users/watcheshutuk/portfolio
https://www.viki.com/users/watcheshutuk_549/about
https://www.academia.edu/s/14bdb7d4fe?source=link
https://www.slideshare.net/Nowseore/guide-o...ex-watch-online
https://audiomack.com/rolexrelicawatches
https://soundcloud.com/replicarolexwatches
https://www.bagtheweb.com/u/fakerolexwatches/profile
https://www.flipsnack.com/ReplicawatchesUK/...ca-watches.html
https://www.4shared.com/office/zA4L7Rmzea/G...hase_a_Fak.html?
https://codepen.io/Rolexrelicawatches/full/abBEzaQ

watchesonline89
Постоянный участник

24.12.2022 11:59

URL #16

https://omegawatches89.mystrikingly.com/
https://www.deviantart.com/omegawatches89/j...pular-930508248
https://eatsleepride.com/c/383270
https://fortunetelleroracle.com/fashion/ama...s-online-737627
https://www.intensedebate.com/people/omegawatches89
https://fortunetelleroracle.com/fashion-acc...-popular-737613
https://anotepad.com/notes/ykiydhnj
https://medium.com/@omegawatches89/amazing-...ne-b4863ed55af0
https://omegawatches90.mystrikingly.com/
https://62e8ce2ae5d50.site123.me/blog/repli...ve-items-online
https://62e8da780bf7c.site123.me/
https://padlet.com/omegawatches89/9ibenzfwbcer7k71
https://omegawatches89.simplesite.com/452939012
https://62e8da780bf7c.site123.me/blog/excit...-replica-online
https://62e8ce2ae5d50.site123.me/blog/advan...replica-watches

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.