| |||
|
Веб-ссылки » Молекулярная биология » Нуклеотидные последовательности (базы данных, анализ, преобразования) всего: 22 страницы (2): 1 2 > » Биоинформатика и анализ данных Сайт задумывался как ресурс для начинающих разработчиков в биоинформатике. Также выложены обучающие материалы по теории вероятностей, статистике и анализу многомерных данных.На сайте можно размещать собственные материалы, предварительно зарегистрировавшись. Для комментирования статей регистрация не требуется. Возможно размещение объявлений о вакансиях и предложении услуг в соответствующем разделе. NB: статьи публикуются после их утверждения модератором. Буду очень рад помощи в любых аспектах: написание статей, критические замечания/предложения - все это крайне приветствуется и премируется почтой на домене bioinformatics.ru » видеоканал био-НКТ России Российский Национальный Контактный Центр "Биотехнология, сельское, лесное и рыбное хозяйство и пища" в 7-й Рамочной Программе EC Был создан приказом № 62 МИНИСТЕРСТВА ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ от 21 февраля 2007 г и продолжает свою деятельность согласно приказу № 152 Минобрнауки от 2 февраля 2011 г. В рамках ресурса публикуются видеоматериалы конференций, круглых столов и инфодней проводимых НКТ-био Адрес: Ленинский проспект д. 33, стр.1, комн. 241 119071 Москва, Россия ( Phone/Fax: +7 (495) 954-44-74 На сайте Bri-shur.com настроены интернет-сервисы для расчета различных биоинформатических задач, от поиска по гомологии в банке последовательностей до структурного выравнивания моделей белков и поиска по базе Medline. Используются как собственные оригинальные алгоритмы, так и доступные открытые программы. Для удобства использования настроены переходы от результата одного сервиса ко входной форме другого. В частности, в рамках сайта можно построить структуры неизвестного белка, провести филогенетический анализ родственных последовательностей и некоторые другие актуальные исследования in silico.
В этом блоге я постараюсь собирать наиболее полезную и актуальную информацию о трёх направлениях (из названия сайта не сложно догадаться каких:-)).
Будут уроки по работе с различными программами и базами данных в биологии. А также информация о том, как правильно писать патенты, чтобы их получить. Ну и колонка новостей небольшая.
Форум «ФАНТАСТИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ» / 121 /
» и не только фантастическая :-) День добрый, уважаемые.Сайт начал работу 18 дек. 2007г. В общем-то, задумывался как площадка для общения как практикующих учёных (молодых и не очень :-) и просто любознательных граждан. В общем: научное фантазирование и словесное фонтанирование на тему биологии, биохимии, биофизики. Ну а так же: вопросы и проблемы биологии, биохимии, биофизики в суровой научной действительности Может быть кому-то будет интересно... :-) » Больше 600 фотографий окаменелостей Московскому Метрополитену 73 года и более 70 миллионов лет окаменелостям в метро.Сайт Палеометро.ру (www.paleometro.ru) создан в январе 2005 года. В настоящее время на сайте размещены более 6 сотен фотографий различных окаменелостей, расположенных на 50 с лишним станциях Московского метро. В 2007 году на сайте появился новый раздел. Оказалось, что в современном городе увидеть окаменелости можно не только в метрополитене или в архитектурных сооружениях, но и во многих других местах. Фотографии этих окаменелостей тоже размещаются на сайте "Палеометро.ру" Автор идеи, текстов и самого сайта – веб-программист и палеонтолог-любитель Александр Мироненко » Сайт проекта генома. На данном сайте представлен сиквенс генома производителя еритромицина, актиномицета Saccaropolyspora erythraea NRRL23338. Также єсть возможность просмотра его генома програмой Generic Genome Browser и поиска гомологических генов BLAST-ом. В секции download содержатса файли з статтьой и с сиквенсами генома. Сайт статти: Скоро виложу набор софта каторым я ето делал (в основном собственниє разработки) на перле ps: Извинитє за мой русский, но я думаю ето лучше нежели транслит или молдаванка. сайт: >введён неверный web-адрес — либо введите правильный, либо оставьте поле пустым Ета ссилка рабочая, почему он возмущаєтса? А єта может не работать с России: База данных содержит информацию по периодическим последовательностям из банка данных GenBank, полученным методом Информационного разложения, разработанным авторами. Содержащиеся в базе последовательности являются потенциальными микро- и минисателлитами и могут использоваться при ПЦР анализе и при проведении эволюционных исследований. Многие из них обладают высокой степенью полиморфизма.
Большинство последовательностей не обнаруживаются другими методами поиска периодичности, в том числе основанными на преобразовании Фурье и динамическом програмировании. Общее число последовательностей - более 700 тысяч. Длина периода от 2 до 10, не кратная 3. Поиск осуществляется по параметрам, задаваемым пользователем на веб-странице (группа организмов, длина периода, функциональная значимость, положение в локусе и т.д.) На сайте также представлено краткое описание метода и приведена инструкция по пользованию базой. Использование базы бесплатно для некоммерческих пользователей.
Портал "Вся Биология" / 244 /
» Открылся новый портал по Биологии Открылся новый портал посвящённый биологии - » Информационный сайт Неформально о судебной медицине. Новости, события, факты. Коллекция книг, статей, реферативных материалов и конспектов. Информационно-тематические каталоги. Форум. Фотогалерея.
новый биологический ресурс / 181 /
Сайт Cellbiol.ru - это новый биологический ресурс, целью которого является попытаться перевести с сухого научного языка биологические статьи на понятный обычному человеку уровень.
AddGene / 37 /
» Plasmid Repository База данных последовательностей и карт плазмид. Может предсказывать элементы и строить карту на основании не аннотированной последовательности.» Новый журнал в сети Этот американский журнал давно существует на бумаге, но в сети появился недавно. Журнал публикует оригинальные статьи и обзоры по широкому кругу вопросов биофизики, биохимии и клеточной физиологии. Приветствуются сообщения о прикладном значении данных фундаментальных исследований. Исключительной особенностью журнала является то особое внимание, с которым в нем относятся к нестандартным исследованиям, идущим вразрез с общепринятыми представлениями. В настоящее время существуют сотни Web-сайтов, которые доступны для обзора и поиска данных по молекулярной биологии и другим смежным дисциплинам. Каждая из них имеет свой формат хранения данных, различную степень избыточности, взаимосвязи с родственными или аналогичными базами данных.
..... Список аннотированных ссылок на молекулярно-биологические базы данных, представленный на нашем сайте, обновляется постоянно и отражает положение вещей на сегодняшний день. Over the past several years, the journal Nucleic Acids Research has documented the availability and features of the growing number of molecular biology databases, an exercise that is becoming increasingly important given the astonishing growth of biological information. To access free on-line list of databases, see http://nar.oxfordjournals.org/content/vol3...ppl_1/index.dtl. The website contains a list of databases and comprehensive information about them.
» Data analysis, manipulation and view Blast Parser - The Excel style viewerРазбор (Parsing) результата Blast состоит в извлекании всей главной информации, которая содержатся в файле, и представлении ее в новом образе, в стиле типа Excel. Каждый ряд в представлении Excel содержит все выравнивания, включая статистические информации, как: E-Value, Score, % Идентичность, и т.д. плюс несколько новых добавленных средств обслуживания, полученных предварительным автоматизированным анализом. Такая компактная структура позволяет лучше и быстрее увидеть разницу между выравниваниями с возможностью фильтровать, сортировать и группировать выравнивания по статистическим значениям. Весь Software производен при GeneProject, оно бесплатное и регулировано по лицензии Freeware. » bioinformatics and systems biology The Center for Biological Sequence Analysis at the Technical University of Denmark was formed in 1993, and conducts basic research in the field of bioinformatics and systems biology. The group of +45 scientists, working in seven specialist research groups, has a highly multi-disciplinary profile (molecular biologists, biochemists, medical doctors, physicists and computer scientists) with a ratio of 2:1 of bio-to-nonbio backgrounds. CBS represents one of the large bioinformatics groups in academia in Europe. Bioinformatics is the term used to refer to the combination of methods in biology, computation, and information management, which are necessary to advance research relating to all aspects of living systems - from individual molecules, cells, and organs to entire organisms. In the last decade, the Center for Biological Sequence Analysis has produced a large number of computational methods, which are offered to others via WWW servers. Any2djvu - веб-сервис, осуществляющий преобразование практически любого графического формата в DjVu. Документы для преобразования можно не только закачивать с вашего компьютера, но и указывать url интересующего вас документа в сети.
Коммерческая биотехнология / 68 /
» интернет-журнал Главная цель интернет-журнала «Коммерческая биотехнология» – содействовать развитию и коммерциализации российской биотехнологии. Мы организовали в виртуальном пространстве постоянно действующий фуршет для всех участников этого процесса: • ученых, чьи разработки можно и нужно превратить в коммерческий продукт; • инвесторов, которые могут оценить практичность хорошей теории; • экономистов, юристов, бизнес-консультантов, патентоведов и всех остальных, кто доводит идею до готового продукта; • производителей и продавцов оборудования, реактивов и всего остального, необходимого для работы биотехнологов; • производителей и продавцов конечной биотехнологической продукции; • покупателей этой продукции – и профессионалов в десятках отраслей науки и промышленности, и индивидуальных потребителей всего, что относится к понятию «биотехнология»: от антибиотиков и вакцин до пива и колбасы из генетически модифицированной сои. Каждый из вас может найти на сайте новости и статьи на интересующие его темы – от серьезных научно-практических до увлекательных научно-популярных и юмористических. Мы пытаемся сделать журнал и доступным любому образованному человеку, и интересным для профессионалов. Мы будем рады, если вы станете не пассивным потребителем информации, а активным участником творческого процесса – это сделает наш сайт еще интереснее и полезнее. Главный редактор Александр Чубенко (chub@combiotech.ru) Администратор сайта Роман Веров (admin@combiotech.ru) Тел.: (812) 596-67-75, -79, 81 Факс: (812) 596-67-80 Почтовый адрес: 197110, С-Петербург, а/я 243 Коммерческая биотехнология cbio.ru » наглядный рисунок Tree of LifeФилогенетическое древо, наглядно показывающее эволюционную взаимосвязь основных групп бактерий, архей и эукариот. |
Основные разделы
Молекулярная биология · Классическая биология · Биомедицина · Химия · Орг-ресурсы · Литература · Русификация, перевод, кодировки · Институты
Выбор по заголовку
Фильтр
|