Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Поправки в GWAS
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Александр Игошин




 прочитанное сообщение 21.11.2017 20:27     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Здравствуйте! Если мы имеем структурированную выборку, и ищем ассоциации по геному, то значимость снипов может завышаться, поэтому используется поправка лямбда на стратификацию. При этом также нужно использовать поправку на множественные сравнения для группового контроля вероятности ложноположительных результатов.
Вопрос заключается вот в чем. От чего отсчитывать поправку на множественные сравнения???? От номинального p-значения, или от уже скорректированного по лямбда? Логика подсказывает, что от уже скорректированного, но я не уверен. В литературе почему-то у всех эта лямбда около единицы, и они отмахиваются от нее. А в plinke, в котором я провожу анализ, почему-то все коррекции на множественные сравнения производятся на основе номинального p. И GC-контроль как-то сам по себе.
Участник оффлайн! bioinformatics




 прочитанное сообщение 23.11.2017 14:05     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

(Александр Игошин @ 21.11.2017 21:27)
Ссылка на исходное сообщение  Здравствуйте! Если мы имеем структурированную выборку, и ищем ассоциации по геному, то значимость снипов может завышаться, поэтому используется поправка лямбда на стратификацию. При этом также нужно использовать поправку на множественные сравнения для группового контроля вероятности ложноположительных результатов.
Вопрос заключается вот в чем. От чего отсчитывать поправку на множественные сравнения???? От номинального p-значения, или от уже скорректированного по лямбда? Логика подсказывает, что от уже скорректированного, но я не уверен. В литературе почему-то у всех эта лямбда около единицы, и они отмахиваются от нее. А в plinke, в котором я провожу анализ, почему-то все коррекции на множественные сравнения производятся на основе номинального p. И GC-контроль как-то сам по себе.



ну в принципе можно написать письмо редактору

eek.gif confused.gif

https://academic.oup.com/bioinformatics
Участник оффлайн! watchesbiz
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  20.11.2021 18:21     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

https://wanelo.co/replicarolexwatches
https://musescore.com/fakerolexwatches
https://www.racked.com/users/Replicarolexwatches
https://sketchfab.com/Rolexrelicawatches
http://www.video-bookmark.com/bookmark/433...eplica-watches/
https://www.slideserve.com/ReplicawatchesUK...pt-presentation
https://www.theverge.com/users/Replicarolexwatches
https://www.yumpu.com/en/document/read/6532...lica-watches-uk
https://online.flippingbook.com/view/152275247/
https://www.instapaper.com/p/8767342
https://www.bigblueview.com/users/Replicarolexwatches
https://weheartit.com/watcheshutuk
https://sites.google.com/view/replicarolexwatches24/home
https://www.indiehackers.com/post/hints-on-...atch-113aef73a9
http://replicawatchesuk.esportsify.com/for...ica-rolex-watch

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 19.03.24 06:44
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft