molbiol.ru -> Софт для коллекционирования статей

> Все форумы > Тематические форумы > Софт

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Софт для коллекционирования статей -- Mendeley и прочие --
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

страницы (2): 1 2 >

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

27.12.2010 13:07

URL #1

Вот интересно стало, какой способ организации статей предпочитает народ. Применяете ли вы какую-нибудь специальную программу, и если да, то какую и почему? И насколько большая у вас библиотека?
Я пользуюсь Менделеем, статей пока штук 300 где-то. Основное удобство - в том, что не приходится по нескольку раз скачивать одни и те же статьи, чтобы "потом почитать"

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

28.12.2010 09:29

URL #2

Блин, 47 просмотров никто не голосует, никто у себя на диске статьи не хранит что ли? Давайте народ голосуем активнее!

Всех с наступающими праздниками!

kblag
Постоянный участник

28.12.2010 12:27

URL #3

Пользуюсь zotero

Поблагодарили (1): Saveta

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

28.12.2010 12:40

URL #4

спс

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

28.12.2010 12:43

URL #5

Хочу собрать статистику по программам - заранее спасибо всем участникам опроса

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

29.12.2010 15:46

URL #6

Пока получается, что большинство все-таки не использует никаких специальных программок! Но разве так удобно? Мне, например, когда я пытаюсь сортировать по папкам, трудно определить, какая статья в какую папку должна идти, ведь они затрагивают зачастую сразу несколько тематик (если сортировать по темам) и авторов (если сортировать по авторам). А без сортировки - заблудиться в большой коллекции очень легко

Esya
Постоянный участник
PA, USA

30.12.2010 05:07

URL #7

страшную вещь скажу, я их, конечно, скачиваю и храню, но в интернете их найти быстрее

Поблагодарили (7): inview, udalov maksim, Piter-, Danse, mitochondriom, Star, -L-

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

30.12.2010 11:33

URL #8

Ну, когда доступ постоянный, то да

Snaut

31.12.2010 02:06

URL #9

PDF'ы храню в тематических папках, причём вместе с книгами, страничками из Вики, абстрактами нескачиваемых статей и т.д.

Во время работы, конечно, приходиться копаться, но несколько спасают дело списки "нужных" для данной писанины статей в NoteExpress (или 'ReferenceManager', или 'EndNote').

le lapin
Постоянный участник

02.01.2011 23:32

URL #10

Название каждого файла pdf у меня соответствует заглавию статьи. А в интернетах легко искать, там очень нехилая индексация. Если бы не труднодобываемые статьи, которые приходится либо клянчить, либо скачивать со всякими трюками, то, возможно, поступал бы как Esya.

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

03.01.2011 00:20

URL #11

Кстати, насчет трюков - не знаю, соотносится или нет мое сообщение с правилами данного портала, но все-таки

Допустим, надо скачать статью.
Идем по следующему адресу:
https://ezproxy.flinders.edu.au/menu
Вбиваем следующие реквизиты:
schr0038
Clap?t12
После этого дуем сюда:
http://dx.doi.org.ezproxy.flinders.edu.au/
Вбиваем DOI статьи и радуемсо

После окончания работы не забываем закрыть сессию:
https://ezproxy.flinders.edu.au/logout
Такие прокси (точнее, реквизиты к ним) иногда живут всего пару дней, а иногда и целый год, особенно, если пользоваться аккуратно

Поблагодарили (9): Ratte, covigo, le lapin, Sharu, katrinkr, murus, udalov maksim, Danse, WMD

Esya
Постоянный участник
PA, USA

04.01.2011 20:30

URL #12

btw, google desktop helps

Поблагодарили (1): Sharu

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

04.01.2011 21:17

URL #13

не знаю как Вам, а мне этот монстр (google desktop) совсем не по душе

Лошарик

Донецк

05.01.2011 11:59

URL #14

Я себе статьи ищу в hinari, а потом по папкам их сортирую. Если одна статья несколько тем охватывает, дублирую ее в разных папках. Но мне тоже проще заново найти в И-нете )))

Ratte
Постоянный участник

06.01.2011 13:25

URL #15

(ringo-ring @ 29.12.2010 14:46)

когда я пытаюсь сортировать по папкам, трудно определить, какая статья в какую папку должна идти, ведь они затрагивают зачастую сразу несколько тематик (если сортировать по темам) и авторов (если сортировать по авторам). А без сортировки - заблудиться в большой коллекции очень легко

у меня статьи по папкам - там аналогичная проблема с сортировкой

несколько помогает то, что большинство статей, с которыми работаю, забиты в EndNote - по нему можно сориентироваться

ещё я использую XMind, а там в схемах сразу можно и комментарии и гиперлинки к статьям делать... очень удобно, особенно если возвращаешься к какой-то теме после перерыва, но только для тех вопросов и статей, которые более-менее "проработаны"

Mendeley и Zotero ещё не пробовал - надо будет глянуть, может оно стоит того

Поблагодарили (1): bmc

Kostia
Участник
Москва

06.01.2011 17:40

URL #16

Пользуюсь купленой (!) RefMan11 - позволяет делать линки на PDF на собственном диске. Поиск в RefMan позволяет найти то, что надо в данный момент. Основное неудобство - не может загружить автоматически линки на внешние ресурсы, например, № в PubMed, или я это делать не научился

Поблагодарили (1): Ratte

Ratte
Постоянный участник

07.01.2011 17:56

URL #17

опробовал Mendeley

первое впечатление очень хорошее! - если, работая со статьями, всегда прогонять их через него, то потом ориентироваться в своём багаже литературы будет намного легче...

бывает, ищешь всякую инфу, на тебя обрушивается вал статей и по ходу дела встречается разная литература, которую "от же, блин, надо обязательно посмотреть в будущем, т.к. оно касается ...", но на которую "прям щас" времени никак нет... а "в будущем" начинается - "о! а вот о чём-то таком я где-то видел статью... только вот где, блин? и что за статья?"...
сортировка по папкам и всякие пометки, конечно, помогают, но чтобы оно обеспечивало эффективный recall в будущем, нужно тратить время...

когда-то давно я прогу типа Mendeley уже искал... но всё, что тогда нашлось, было не столь удобно - там, опять же, время требовалось на сортировку и т.п. - а тут, если нет времени, то просто кликаешь, пару-другую тэгов и/или комментов добавляешь и всё (прога сразу неплохо заточена на быструю работу)

плюс, оно, кажется, с EndNote совместимо - можно экспортировать литературу...
если ещё найдётся способ совмещать с Mind-Mapping Software, типа XMind, то вообще классно будет

Гест Гестович
Постоянный участник
Россия

24.01.2011 12:06

URL #18

Я тоже пользуюсь Менделеем, но неактивно. Во-первых, он показывает мне какие-то уродские нечитаемые шрифты (оказалось, только на ЖК-мониторе, а на ламповом всё выглядит прилично), а во-вторых, по полчаса обновляет базу и жутко тормозит. Статей на компе порядка 2500.

Сообщение было отредактировано Гест Гестович - 23.05.2011 10:45

Murat
Постоянный участник
RU

24.01.2011 15:43

URL #19

(Kostia @ 06.01.2011 15:40)

Я работаю по той же схеме - в RM линк на сохраненный PDF (а заодно и на все Сапплы, если таковые имеются). Дополнительно удобство RM - автоматическая генерация библиографии. У меня автоматически вместе с рефератом грузится PMID, залинкованный на запись в PubMed-е. Чтобы эта опция работала, нужно поиграть параметрами в Опциях.

Сообщение было отредактировано Murat - 24.01.2011 15:46

Поблагодарили (1): Ratte

Nameless
Постоянный участник
CA

24.01.2011 19:51

URL #20

Что нравится в менделее - можно делать множественный поиск терминов и в результатах поиска будут указаны участки текста с каждым словом в пределах отдельной статьи.
Если бы он ещё умел автоматически менять названия статей по заданному формату на месте, а не при копировании в свою папочку - вообще бы цены не было.
Ну и часто некорректно вытягивает инфу из статьи для хидера, нужно править ручками.

Ratte
Постоянный участник

07.03.2011 17:12

URL #21

(Nameless @ 24.01.2011 18:51)

Если бы он ещё умел автоматически менять названия статей по заданному формату на месте, а не при копировании в свою папочку - вообще бы цены не было.
Ну и часто некорректно вытягивает инфу из статьи для хидера, нужно править ручками.

это да

надеюсь, со временем производитель поправит - они сейчас, вроде, активно работают над прогой

Staslakstar

UA

09.04.2011 19:00

URL #22

А собираю и сохраняю по отдельным текстовым файлам. Все посортовано в папках, так что проблем с поиском не возникало. Просто так привык.

bubnilkin
Участник

18.04.2011 02:15

URL #23

тоже стал совсем запутываться с библиотекой

пробую менделея и зотеру...

и вопрос возник: где эти проги хранят свои базы? чтобы с собой взять/архивировать на всякий случай...

Andrey Chetverikov
гость

22.04.2011 15:33

URL #24

Данные о статьях Mendeley хранит в sql базе на компе (в файлах .sqlite в C:\Users\имя_юзера\AppData\Local\Mendeley Ltd\Mendeley Desktop). Backup можно сделать через меню Help (они также автоматически делаются). Ну и в интернет все выгружается.

Поблагодарили (1): bubnilkin

kblag
Постоянный участник

28.04.2011 11:38

URL #25

(bubnilkin @ 18.04.2011 03:15)

тоже стал совсем запутываться с библиотекой

пробую менделея и зотеру...

и вопрос возник: где эти проги хранят свои базы? чтобы с собой взять/архивировать на всякий случай...

Зотера хранит свои данные по такому же принципу, как и менделей.

Поблагодарили (1): bubnilkin

guest: ringo-ring
гость

17.05.2011 12:21

URL #26

Новый прокси для скачивания статей

http://dx.doi.org.ezproxy2.library.usyd.edu.au/
логин oale4208
пароль Vrubel56

Поблагодарили (2): lexxx, Danse

NaaNa
Постоянный участник
Hamburg

17.05.2011 15:57

URL #27

пользуюсь менделаем на работе, на домашнем лаптопе все просто навалено в кучи, но либо я четко знаю где свалено то что сейчас надо, либо ищу по ключевым словам.

а еще оч люблю самые дорогие сердцу статьи распечатывать, почему-то бумажный вариант мне иногда даже удобнее

lexxx
Участник
Kiev

17.05.2011 17:11

URL #28

(guest: ringo-ring @ 17.05.2011 12:21)

Новый прокси для скачивания статей

Спасибо за номерок.

Может создать отдельную тему с подобными номерами?

Khvoinka

г. Томск

21.05.2011 17:42

URL #29

У меня статьи лежат по папкам, не очень удобно. Попробую менделея

guest: ringo-ring
гость

13.06.2011 18:49

URL #30

еще номерок

http://dx.doi.org.cyber.usask.ca/
dln122
8obzFgbe

Поблагодарили (5): le lapin, VVolkov, katrinkr, Danse, Vladch

guest: ringo-ring
гость

13.06.2011 19:03

URL #31

и еще

http://dx.doi.org.ruby2.uhv.edu/

usertype vc-student
username pmj7147
password ypky2723

после завершения работы не забываем выйти
http://ruby2.uhv.edu/logout

Поблагодарили (5): le lapin, VVolkov, Danse, Kadet, Vladch

guest: ringo-ring
гость

13.06.2011 19:05

URL #32

(lexxx @ 17.05.2011 17:11)

Спасибо за номерок.

Может создать отдельную тему с подобными номерами?

ага... в разделе Fulltext

Danse
Участник
BELARUS, Gomel

01.09.2011 15:56

URL #33

автоматическое название файла меняю на заголовок статьи и храню сортированными в папках, а когда на это времени не хватает просто сваливаю в общую папку..

для поиска нужной статьи пользуюсь архивариусом 3000
залью на FTP как только заработает снова

данная программа индексирует практически любые документы и потом можно производить полнотекстовый поиск.

отображаются подсвеченные поисковые запросы.

просматривается текст из программы или можно открыть оригинал

графические pdf должны быть предварительно распознаны OCR

Иногда пользуюсь встроеным в acrobat поиском

Поблагодарили (2): ringo-ring, Olezhek

annndrey

06.09.2011 01:14

URL #34

А скажите мне пожалуйста, опытные товарищи, есть ли в настоящий момент какая-нибудь программа, в которой можно хранить не только библиографические данные и файл с pdf, но которая при этом умела бы делать полнотекстовый поиск по всем pdf'ам, которые в ней хранятся?
Есть идея написать такую программу, но решил узнать, может не надо изобретать велосипед...

Guest
гость

12.09.2011 20:10

URL #35

(annndrey @ 06.09.2011 01:14)

менделей все это умеет и вааще, типа форева...

annndrey

29.09.2011 00:50

URL #36

и индексировать содержимое всех pdf-файлов, а потом производить по ним полнотекстовый поиск? мне кажется, вы несколько заблуждаетесь. или я ошибаюсь?

plantago
Постоянный участник

29.09.2011 07:27

URL #37

Под Linux хорошая пара Recoll (полнотекстовый индексатор) и JabRef (библиография). Да, и еще cb2bib (вынималка библиографических данных прямо из PDF или сайта). Преимущества: отвязка от конкретного формата (JabRef использует текстовый BibTeХ формат), возможность по-прежнему пользоваться моей строгой системой папок (а не переход на что-то вроде iTunes/Calibre, которая сама за тебя решает, куда что класть), индексация всего чего угодно, если есть фильтры (у меня много всего в DjVu с текстовым слоем). Еще можно написать фильтры самому (тогда можно, например, OCR'ить DjVu файлы на лету при помощи djvuocr).
Минусы: нет "word processor integration", но мне не в лом проработать список литературы руками, не так уж и много тут работы по сравнению с основным текстом статьи, да и помогает сделать статью лучше. А минорные отклонения от принятого формата библиографии поправят в редакции, если статью возьмут. Пока никогда не видел, чтобы статью не взяли из-за неправильного формата библиографии. Хотя бывает, наверное, всякое. Еще Recoll не существует под винды, но там есть аналогичный Archivarius 3000.
Но главный мой софт для коллекции статей -- это файловая система (подпапки по темам + продуманные названия файлов в формате "firstauthoryear_keywords.ext")

Поблагодарили (2): ringo-ring, lexxx

ringo-ring
Постоянный участник
Казахстан

06.10.2011 02:49

URL #38

(annndrey @ 29.09.2011 03:50)

Вот какую-то прогу на соседнем форуме советуют для индексации статей:

http://www.dtsearch.com/

Вообще программ для полнотекстового поиска по pdf - есть, хоть они может и не специализируются именно на статьях, а предназначены для любых файлов. Это, конечно, не значит, что теперь еще одну такую прогу и именно для статей - нельзя делать - можно, конечно, но делать ее придется без дураков - конкурентов много.

fantome

06.12.2011 21:25

URL #39

Endnote. Очень удобно -- и фуллтехт искать и библиографию составлять.

andrey1362010

Казань

27.12.2011 13:27

URL #40

google desktop неплохая програмка...

david
Постоянный участник
Montreal, Canada

01.01.2012 16:48

URL #41

Пробую разобраться с ReadCube

Flyamer
Постоянный участник
Москва

03.01.2012 12:15

URL #42

Zotero, аддон к фаерфоксу, одной кнопкой извлекает библиографию и пдф (если статья открыта). Интегрируется в опен-оффис и МС, чтобы создавать прямо в документах библиографические ссылки, их формат выбирать можно.

Seneka
Постоянный участник
Москва

16.08.2012 17:08

URL #43

Вот что не понравилось.
Если в Mendeley поместить файл с русским названием, в кодировке Windows 1251, то получить этот файл обратно, в Windows 1251, с тем-же названием не получится, т.к. оно оказывается преобразованным в UNICODE, а обратная конвертация не выполняется. Придется вручную каждый файл переименовывать, сразу после скачивания.

angelian
Участник

17.08.2012 13:14

URL #44

Внесу в обсуждение и свою лепту - с некоторой оговоркой.
С десктопными вариантами не сталкивался - все рассортировано по папкам, в крайнем случае поиск по содержанию спасает. А вот о серверных решениях могу кое-что рассказать.
Банальная Wiki. На внутренний сервер выкладывались нормативно-правовые акты по контролю качества, фармакопейные статьи и методики. Шик и блеск - в обсуждении можно дописать свои мысли по сабжу, а писать методики скопом - очень увлекательное мероприятие - коллективная работа сближает, и статьи выходили не сухими и короткими, а с картинками, схемами и диаграммами - каждый хотел добавить что-то от себя

WordPress. Это я использовал дома для обмена сообщениями с семьей. Списки покупок, дни рождения, текущие дела, прикольные истории, рецепты блюд, и прочая, прочая, прочая. Квартира накрыта вайфай, в туалете лежит дежурный планшет

Не особо в тему, но, авось пригодится кому.

antlook

Казахстан, Алматы (Алма-Ата)

17.08.2012 19:45

URL #45

Для борьбы с кодировками существует старая програма Shtirlitz
Программы: библиотекари и не совсем
LibPackDoc
MyHomeLib
FbLibrary......
на первом этапе конечно можно ограничеться папками
позже возникает задача - как с этим всем разобраться т.е. упорядочить
как правило необходимо сформировать - перечень
перечень снабдить ссылками = перечень+ссылка+документ
BookSeer - база=фильтры+групповые операции+файловые операции
Datalog - каталогизатор
FreeFileSync - синхронизация
LibreOffise - многотабличная база с возможностью работы с форматами World и Excel

любимов

13.09.2012 16:31

URL #46

Обычно гуглем пользуюсь. Храню там же, в каталоге закладок.

Анастасия Ловгач

10.02.2014 20:27

URL #47

не пользуюсь спец программами!

-L-
Участник

19.02.2014 19:11

URL #48

Лет 10 назад использовал EndNote разных версий.
Сейчас ничего не использую кроме пабмеда.

antlook

Казахстан, Алматы (Алма-Ата)

25.02.2014 12:45

URL #49

Под Linux имеется
Bibus http://bibus-biblio.sourceforge.net/wiki/index.php/Main_Page - управление ссылками и цитатами в ваших публикациях
(manage references and citations in your publications)
интегрируется с поиском PubMed
поддерживает импорт EndNoteXML

Nastja
Постоянный участник
Новосибирск

13.10.2014 13:53

URL #50

Вот и я перешла на Mendeley. После долгих счастливых лет с Bibus обнаружилось, что бобик скорее сдох. В общем, добавление из пабмеда и других мест в Mendeley происходит легко и приятно, вставка ссылок в документы libreoffice - чуть менее приятно, но тоже неплохо. Вот думаю, как бы сделать себе еще лучше.
Знакомый яблочник очень хвалил Papers, но вроде Mendeley умеет почти то же самое?

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.

преобразовывать смайлики · показать смайлики

Назначение кнопок:

Поблагодарить автора сообщения

— поблагодарить автора
Удалить сообщение

— удалить

— редактировать
Поместить сообщение в колонку новостей

— поместить в колонку новостей

— цитировать сообщение
не входит в цитирование

— цитировать несколько
Отметить СПАМ-сообщение

— обозначить спам
Сообщение для модератора

— связь с модератором
Участник онлайн!

— автор онлайн/оффлайн

— фотография автора

- остальные обозначения -

*	« Предыдущая тема · Софт · Следующая тема »

страницы (2): 1 2 >

· Викимарт - все интернет-магазины в одном месте · Доска объявлений Board.com.ua ·

--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---

--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика

Ваш форум · redactor@molbiol.ru · реклама · Дата и время: 19.04.24 21:41

опрос: Пользуетесь ли Вы?	(Всего голосов: 105)
Использую Mendeley	20 (19%)
Пользуюсь другой программой	22 (21%)
Спец. программы не использую, сортирую статьи по папкам	56 (53%)
Свой вариант	7 (7%)
	Гости не могут участвовать в голосовании