Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
leyshmanioz Участник |
как потом осаждать ДНК, 96% этанолом или изопропанолом и ацетатом натрия, ДНК 36кб, что посаветуете, что лучше? |
RJ Dio Постоянный участник |
По сути. ИПС или зтиловый-разницы нет, если объемы результирующей смеси позволяют, используйте этиловый, осадок будет лучше виден, и не скользкий при том. Если осаждаете из большИх объемов водного раствора, предпочтительнее брать ИПС, но поаккуратнее с осадком при деконтировании жидкости Сообщение было отредактировано RJ Dio - 13.09.2011 12:16 |
basil2 Постоянный участник |
(leyshmanioz @ 13.09.2011 13:12) Мне нужно очистить вирусную ДНК после рестрикции, специального кита для этого у нас нет, я использовала пцр пюрификейшн кит от киагена, но так как там колонка только может 10мкг связывать, и не более 10кб, приходиться обратиться к фенол хлороформу, как потом осаждать ДНК, 96% этанолом или изопропанолом и ацетатом натрия, ДНК 36кб, что посаветуете, что лучше? интересно, чем это вы резали, если размер 36 кб? |
leyshmanioz Участник |
|
-Ъ- Постоянный участник Москва |
(leyshmanioz @ 13.09.2011 13:12) Мне нужно очистить вирусную ДНК после рестрикции, специального кита для этого у нас нет, я использовала пцр пюрификейшн кит от киагена, но так как там колонка только может 10мкг связывать, и не более 10кб, приходиться обратиться к фенол хлороформу, как потом осаждать ДНК, 96% этанолом или изопропанолом и ацетатом натрия, ДНК 36кб, что посаветуете, что лучше? Разьбавьте объем после рестрикции ИПС до конечной конц. ИПС - 50%, и наносите на колонку порциями по 800 мкл хоть целый литр - мембрана на колонке в этом случае выступает в качестве банального "фильтра", а не сорбента. Удержит хоть кг. Кстати на эту тему есть киты у Инвитека, кажется, ну и сами понимаете у кого ... |
RJ Dio Постоянный участник |
|
-Ъ- Постоянный участник Москва |
(RJ Dio @ 14.09.2011 18:42) При сорбции в объеме и послед. встряхивании - да, но на колонке, тем более в спиртовом растворе... не более чем при простом осаждении. |
RJ Dio Постоянный участник |
|
basil2 Постоянный участник |
(-Ъ- @ 14.09.2011 18:47) При сорбции в объеме и послед. встряхивании - да, но на колонке, тем более в спиртовом растворе... не более чем при простом осаждении. ну, если разбавить пропанолом, то наверно да, ничего не порвется и намертво не залипнет. Но я бы так делать все-равно не стал: а) какая-то часть ДНК таки застрянет, б) а нафига собс-но колонки переводить, если осаждением прекрасно можно обойтись. |
-Ъ- Постоянный участник Москва |
(basil2 @ 14.09.2011 18:51) ну, если разбавить пропанолом, то наверно да, ничего не порвется и намертво не залипнет. Но я бы так делать все-равно не стал: а) какая-то часть ДНК таки застрянет, б) а нафига собс-но колонки переводить, если осаждением прекрасно можно обойтись. Дк, народ хочет работать на китах, ну а если киты эти с микроколонками - это то же ващеее...супер..., поэтому я так расшибаюсь. А потом, я этих колонок столько понаделал... |
leyshmanioz Участник |
|
RJ Dio Постоянный участник |
|
basil2 Постоянный участник |
(RJ Dio @ 15.09.2011 12:15) колонки всяко лучше, чем не-колонки. везде, где можно, надо так и делать. По времени- вообще сравнивать нельзя. По потерям, к сожалению, ситуация хуже, но приемлемо как всегда офигенно продуманное и глубокое заявление! |
RJ Dio Постоянный участник |
|
basil2 Постоянный участник |
|
RJ Dio Постоянный участник |
|
nigoal123 IP-штамп: frpXPq5TOmUHs гость |
|
Guest IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |