Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Результаты поиска -- Найденные сообщения --

страницы (8):  1 2 3 > » 

Программа для 3D изображения аминокислот и других соединений
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 31.08.2017 09:39  |  СофтСофт  |  link: #1681749  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 5 086

Гетерологичная работа(экспрессия) рибосом и их составляющих у прокариот
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 10.03.2017 14:49  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1659701  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 1 791
Могу сказать, что замены отдельных действительно существенных для функционирования рибосом рибосомных же белков из других бактерий не влияет (заметно) на работу рибосом.

Синтез модифицированных олигов
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 01.03.2017 12:12  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1658756  |  Ответов: 16  |  Просмотров: 5 584
Спасибо за инфу.
В апреле (когда деньги появятся) будем пробовать заказывать. Нам нужно пару хороших RNA beacon сотворить.

Синтез модифицированных олигов
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 15.02.2017 16:58  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1657557  |  Ответов: 16  |  Просмотров: 5 584
Синтол тоже так себе делает, но делает. Альтернатив пока не нашли... Присоединяюсь к поиску.

Российский фонд фундаментальных исследований
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 23.01.2017 09:30  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1654691  |  Ответов: 893  |  Просмотров: 262 308
Кто-нибудь в курсе, чего там с оценкой новых грантов? Время течет...

Сколько времени и сил надо на ЯМР стуктуру?
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 30.12.2016 10:45  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1652027  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 3 648
Именно "если"... РНК такая гибкая "сволочь" для кристаллизации. Там даже разница в один нуклеотид на концах может играть роль.

Сколько времени и сил надо на ЯМР стуктуру?
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 28.12.2016 17:51  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1651891  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 3 648
Не обязательно в комплексе, можно и так. Вот достойная лаборатория - http://serganovlab.com/index.html
Наберите в PubMed Serganov A. - и почувствуйте их силу smile.gif в деле кристаллизации РНК.

Российский научный фонд
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 28.04.2015 09:09  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1550092  |  Ответов: 68  |  Просмотров: 30 706
Появились
Российский научный фонд определил победителей конкурса на финансирование научных исследований по приоритетным тематическим направлениям (результаты).
Российский научный фонд определил победителей конкурса на финансирование исследований с привлечением молодых кандидатов наук (результаты).

Российский научный фонд
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 27.04.2015 23:39  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1550061  |  Ответов: 68  |  Просмотров: 30 706
Кто подавал на "целевые" гранты РНФ по направлениям - появились результаты в личном кабинете. Общей информации пока нет. Двум моим знакомым дали jump.gif

Учебный центр Института белка РАН приглашает
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 02.04.2015 09:21  |  ВакансииВакансии  |  link: #1544527  |  Ответов: 0  |  Просмотров: 1 056
Лаборатория структурных исследований аппарата трансляции и Группа структурных исследований рибосомных белков приглашает студентов (бакалавры 3-4 курсы, магистранты, специалисты 4-5 курсы на 2015/16 гг) для работы и учебы в НОЦ Института белка РАН.

Некоторые предлагаемые темы:
- Исследование РНК-связывающих свойств архейных белков Lsm
- Кристаллографические исследования процессов фотосинтеза
- Выделение и кристаллизация различных форм фактора инициации трансляции 2 из архей и эукариот
- Получение комплексов рибосомного белка L1 Halobacterium marismortiu с РНК с целью уточнения модели архейной рибосомы
- Изучение роли эволюционно-консервативного белка L30 в формировании функционально-активной рибосомы in vivo

Мы гарантируем: расширение научного кругозора, интересную работу, освоение современных методов исследований, дружный коллектив, финансовую поддержку.
Ждем от Вас: увлеченность наукой и желание учиться.

Условия поступления в Учебный центр - http://www.mbec.protres.ru/

Принятые в студенты обеспечиваются общежитием и получают доплату к стипендии за участие в выполнении исследовательских проектов (1 грант РНФ, 1 грант МКБ, 7 грантов РФФИ).
/ Вакансии,  #556820  /
Алексей
Институт белка РАН
Россия, Пущино
E-mail: Отправить e-mail
Веб-адрес: http://www.protres.ru/
Требуется: Студент
Место работы: Пущино
Область деятельности: Молекулярная биология (биохимия, генная инженерия), Компьютерное моделирование и Биоинформатика

Учебный центр Института белка РАН приглашает
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 25.03.2015 16:43  |  Колонка новостейКолонка новостей  |  link: #1542850  |  Ответов: 11  |  Просмотров: 16 555
Учебный центр молекулярной биологии Института белка РАН проводят очередной
конкурсный набор студентов-старшекурсников для обучения и специализации по молекулярной биологии.
Прошедшие конкурс студенты будут прикомандированы к Учебному центру для
специализации по молекулярной биологии с продолжением обучения в своем основном вузе по индивидуальному учебному плану. Оканчивающие в 2015 году обучение в бакалавриате будут рекомендованы к поступлению в магистратуру биотехнологического факультета МГУ с выполнением магистерской диссертации в Институте белка РАН.
Проходя специализацию и выполняя квалификационные работы в лабораториях Института белка РАН, студенты приобретут знания и практические навыки по исследованию биосинтеза белка, генетической и белковой инженерии, физическим и химическим методам, используемым в молекулярной биологии.
Предварительный отбор участников конкурса будет проведен заочно на основании данных, содержащихся в заявке. Отобранные участники будут приглашены на очный конкурс, который будет проводиться c 29 июня по 10 июля 2015 года в городе Пущино. Конкурс проходит в два тура:
первый – в форме собеседования по общему курсу молекулярной биологии (базовый учебник – Дж. Уотсон: "Молекулярная биология гена"), а второй – в форме учебно- практических занятий по некоторым современным методам молекулярной биологии. По результатам конкурса будет сформирован окончательный состав студентов Учебного центра. Принятые в Учебный центр студенты обеспечиваются общежитием и получают доплату к стипендии за участие в выполнении исследовательских проектов в лабораториях Института белка РАН.
Дополнительно - проспект от одного из коллективов Института.

В связи с большим количеством запросов об участии в школе, прием заявок в электронном виде продлевается до 18 мая включительно.

Гранты Президента РФ на 2013 год
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 12.03.2015 12:16  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1539839  |  Ответов: 53  |  Просмотров: 19 368
Да уж, посмешище... wall.gif

Вопросы Felix Stenio
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 10.03.2015 09:46  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1539251  |  Ответов: 44  |  Просмотров: 4 225
Неправильные ротамеры лучше править в программе COOT.

Российский фонд фундаментальных исследований
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 10.03.2015 09:31  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1539249  |  Ответов: 893  |  Просмотров: 262 308
Кто в курсе, когда итоговое заседание по отчетам?

Российский фонд фундаментальных исследований
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 19.02.2015 09:34  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1535250  |  Ответов: 893  |  Просмотров: 262 308
Шлют по желанию (если больше нечем отчитаться).
По умолчанию промежуточный отчет по ГОСТу в ЦИТИС является добровольным делом. Обязательным является только итоговый отчет за все время выполнения работы.
Ссылку - хотите ищите http://www.rosrid.ru/#/FOND/Page_fond_pravo_basa.xaml

Российский фонд фундаментальных исследований
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 29.01.2015 10:00  |  Организация работы группы/лабораторииОрганизация работы группы/лаборатории  |  link: #1530574  |  Ответов: 893  |  Просмотров: 262 308
Ха. а у нас все сорвались после сообщения из КИАС "В системе КИАС с карточки вашей организации снят статус «достоверность подтверждена». Это связано с тем, что организационно-правовая форма организации, которая указана в КИАС, не соответствует ни одной из форм, предусмотренных действующим ГК РФ.
В настоящее время получатели грантов, у которых организацией, предоставляющей условия для выполнения проекта, является ваша организация, не могут создавать договоры для финансирования поддержанных проектов. По уже созданным договорам не могут осуществляться выплаты..."
Хотя это РФФИ каждый год требует делать. В этот раз это "последнее китайское предупреждение" было выслано не только координатору, но и всем грантодержателям wink.gif

Вычисление частотот встречаемости аминокислот
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 02.10.2014 22:42  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1507931  |  Ответов: 3  |  Просмотров: 4 386
Hidden Markov Model?

Полужесткий докинг
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 19.09.2014 08:20  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1506035  |  Ответов: 10  |  Просмотров: 2 389
Да уж. МД требует много ресурсов. А комп мы тоже как промежуточный этап используем. Хотя тут по некоей программе развития биотехнологического кластера в Подмосковье деньги огребли, возможно купят под это комп с 4-мя теслами. Не знаю уж, насколько это будет действительно полезно...
Rigaku дышит пока. Вот только механизмы подизносились и требуют ТО. Сейчас этим занимаемся. Запускаем обычно раз в месяц дней на 10. К нам уж и с фибриллами ходят (вот мода еще одна).

Полужесткий докинг
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 18.09.2014 14:30  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1505934  |  Ответов: 10  |  Просмотров: 2 389
Наши энтузиасты AMBER на CUDA подняли. Плата на Nvidia 680 дает ощутимую прибавку в скорости, на порядок примерно, по сравнению с i7. Правдв, пришлось им неделю повоевать с установкой программы и подключении всех необходимых библиотек.
А вообще, они пишут заявки в суперкомпьютерный центр РАН и там считают.

SDS-PAGE -- белок пошел волнами
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 18.09.2014 13:50  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1505930  |  Ответов: 17  |  Просмотров: 2 345
Можно попробовать осадить ТХУ, промыть и нанести далее как обычно.

Полужесткий докинг
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 17.09.2014 11:50  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1505712  |  Ответов: 10  |  Просмотров: 2 389
Это хорошо, что есть намек на место посадки.
Программы... Наши МДишники, по-моему, AMBER любят.
Но лучше кто бы еще проконсультировал - я не спец в МД.

Макро-эргическое + фермент: что это?
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 15.09.2014 22:33  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1505454  |  Ответов: 15  |  Просмотров: 2 869
Последние мои ответы:

1. djvu читается большим количеством читалок, например WinDjVu
2. рибосома по своей сути рибозим
3. посмотрите теорию происхождения жизни, в которой первоначальной био-молекулой была РНК. Надеюсь, что Вы обладаете знанием компьютера и книг достаточной, чтобы найти статьи на эту тему. Кстати, А. С. Спирин там тоже есть.
4. Ищите литературу сами, pls.

Все, в данной теме умолкаю.

Полужесткий докинг
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 15.09.2014 14:55  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1505348  |  Ответов: 10  |  Просмотров: 2 389
А может лучше молдинамику попробовать? Пептид с последовательностью есть, последовательно его укорачивать и запускать. Энергию связывания точно можно будет оценить, конформация пептида подгоняться будет и т.п.
Тут только бы подобрать место связывания... А гомологов с похожим пептидом нет для стартовой точки?

Полужесткий докинг
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 15.09.2014 07:58  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1505294  |  Ответов: 10  |  Просмотров: 2 389
ИМХО: докинг - эта такая дрянь...

Макро-эргическое + фермент: что это?
Nik-AD
Постоянный участник


Отправлено: 15.09.2014 07:56  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1505293  |  Ответов: 15  |  Просмотров: 2 869
Уважаемый Мистер Изобретатель.
Природных аминокислот 20, двадцать первая (селеноцистеин) встречается очень редко. Больше для построения природных белков природа (пока) не нуждается. Аминокислот, как класс органических соединений, в принципе может быть очень много. Кстати, капрон тоже как бы из аминокислот получается. Добавлять еще аминокислоты к природным белкам = менять генетический код. Можно, но зачем?
wikiТрансляция - процесс перевода зашифрованного кода в последовательность аминокислот белка (корректнее: процесс синтеза белка из аминокислот на матрице информационной (матричной) РНК, осуществляемый рибосомой). Соответственно, аминокислоты уже должны быть наработаны и присоединены к соответствующим тРНК посредством аминоацил-тРНК-синтетаз. Считается, что именно вот этот этап и является декодированием генетической информации.
А вообще, читайте книжку Спирина.
страницы (8):  1 2 3 > »  

Новые сообщения  Есть новые сообщения
Нет новых сообщений  Нет новых сообщений
Нет новых сообщений*  Тема с вашим участием
Горячая тема - новые сообщения  Горячая тема (есть новые сообщений)
Горячая тема - нет новых сообщений  Горячая тема (нет новых сообщений)
Важно - нет новых сообщений  Важная тема
Опрос - есть новые голоса  Опрос — есть новые голоса
Опрос - нет новых голосов  Опрос — нет новых голосов
Опрос -нет новых голосов  Опрос с вашим участием
Объявление  Объявление
Тема закрыта  Закрытая тема
Тема перемещена  Перемещённая тема


Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 20.01.20 21:16
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft