molbiol.ru -> При CHIP какой нормальный процент от Input

> Все форумы > Тематические форумы > Молекулярная и клеточная биология

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* При CHIP какой нормальный процент от Input

Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

Пасюк

21.02.2014 13:49

URL #1

Доброго времени

ДНК оцениваю сравнивая по PCR-RTQ, сравниваю искомые участки ДНК с участками в начале транскрипции 18S РНК и в гене актина. И целевая и контрольная ДНК если взять после CHIP на RTQ одинаковые количества ДНК: после имунопреципитации на порядок меньше чем в том же количестве ДНК исходного хроматина, а после иммунопреципитации без антител еще на порядок меньше чем в пробах с антителами.

Не понимаю того, что количества ДНК оказывается боле-менее одинаковыми как при CHIP за ацетилированный гистон, так и при CHIP за SNF2(которого мало).
Что смущает: после IP без антител остается примерно 3-4 процента ДНК по СФ, IP как на белок которого мала, так и просто на ацетилированные гистоны дает 4-5% по СФ. Я понял бы неспецифику, но у меня получается что при прогоне хроматина через смолу без антител выделяется несколько фоновых процентов ДНК с которой амплификация идет заметно хуже чем с того же количества исходной.
Сейчас склоняюсь к мысли что проблемы с каким-то из антител или смолой и пытаюсь понять куда копать.

Nameless
Постоянный участник
CA

24.02.2014 20:19

URL #2

3-4 % ДНК без антител - это очень много. Скорее всего, неспецифическая сорбция ДНК на смоле. Вы забивку salmon sperm DNA делаете?
Что за смола? Если есть возможность, попробуйте protein A/G beads.

watchesbiz
Постоянный участник

03.12.2021 19:22

URL #3

https://app.ex.co/stories/bestreplicawatche...-regime-for-you
https://rolexrelicawatches.hpage.com/replica-watches-uk.html
https://www.cgmimm.com/articles/hints-to-he...lica-watches-uk
https://www.deviantart.com/fakerolexwatches...es-UK-871090193
https://replicawatches24.exposure.co/best-r...eplicawatches24
https://knowyourmeme.com/users/replicawatchesuk
https://www.scoop.it/topic/bestreplicawatch...ica-rolex-watch
https://uberant.com/article/1268140-hints-o...ca-rolex-watch/
https://devpost.com/watcheshutuk
https://www.ted.com/profiles/26540630/about
https://drive.google.com/file/d/1uTx90WraSJ...iew?usp=sharing
https://ibb.co/hgfZwb0
https://writer.zohopublic.com/writer/publis...10192bd4c742ceb
https://replicawatches24.mystrikingly.com/b...ica-rolex-watch
https://my.desktopnexus.com/ReplicawatchesU...a-rolex--31049/
https://sway.office.com/Tqm7mC7s0VWLhKAl

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.