Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
slavak4609 Участник |
Геномы раковых клеток несут не только мутации, связанные с прогрессией опухоли, но и накапливают так называемые мутации-”пассажиры”. Считается, что ”пассажиры” не могут прямо влиять на фенотип опухоли. Обширные данные по секвенированию раковых геномов, полученные в последнее время, позволяют подойти к решению проблемы как отличить мутации-драйверы, участвющие в онкогенезе, от нейтральных “пассажиров”. Синонимические или “молчащие” мутации (СМ) изменяют нуклеотидные последовательности генов, но не последовательности аминокислот в кодируемых ими белках. Однако, есть данные, что СМ могут влиять на скорость и точность трансляции мРНК, на ее сплайсинг и укладку, на некоторые другие процессы реализации генетической информации. Имеются также данные и предположения, что СМ могут быть связаны с патогенезом некоторых заболеваний. Работа опубликована в разделе “Теории”. Авторы предположили, что СМ могут принимать участие в онкогенезе. Они проанализировали данные по структуре экзомов >3000 генов, связанных с раком, и >300 полных геномов раковых клеток различных типов. Гены, связанные с раком, могут мутировать по различным механизмам. Для онкогенов свойственны активирующие их миссенс-мутации – точечные замены аминокислот, амплификация и транслокация генов. В отличие от них гены-супрессоры обычно инактивируются вследствие локальных или протяженных делеций, мутаций, досрочно терминирующих трансляцию (образование стоп-кодонов, сдвиг рамки трансляции), или мутаций в интронах, блокирующих сплайсинг пре-мРНК. Авторы проанализировали 292.405 миссенс-мутаций и 123.193 СМ, найденные в экзомах 3.581 опухоли 11 различных типов рака. Онкогены оказались обогащены СМ. В генах-супрессорах их доля была существенно меньше. Частота мутаций в одних и тех же онкогенах различна в зависимости от ткани и типа рака. Так, онкогенные миссенс-мутации при меланоме часто происходят в гене BRAF, а при колоректальном раке – в KRAS. Оказалось, что частота СМ в онкогенах имеет ту же тенденцию. В случае генов-супрессоров такой тенденции не наблюдалось. СМ могут быть локализованы в определенных участках генов. Так, в онкогенах, усиление активности которых связано с их амплификацией, СМ часто локализованы в 3'-нетранслируемой области. Механизмы воздействия СМ на функцию гена могут быть различными. Не найдено указаний на то, что СМ могут влиять на оптимальное использование кодонов при трансляции, на вторичную структуру мРНК, на взаимодействие мРНК с микроРНК. Но СМ могут нарушать последовательности нуклеотидов в экзонах, которые влияют на эффективность сплайсинга. Такие СМ часто наблюдаются в гене онкосупрессора ТР53, в котором они нарушают правильный сплайсинг и таким образом инактивируют ген. Кроме того, СМ способны нарушать фолдинг белков, что также может быть связано с онкогенезом. Подходы, примененные авторами, могут быть полезны для идентификации новых классов онкогенных мутаций и более полного понимания того, как изменения в геноме при раке влияют на прогрессию опухолей у индивидуальных пациентов. Источник: Supek F, Miñana B, Valcárcel J, Gabaldón T, Lehner B. Подпись к рисунку: Оценка доли потенциальных драйверов рака среди синонимических мутаций.
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 24.04.2014 11:38 |
Агроном Постоянный участник |
|
Сухова Наталья IP-штамп: frVoMBIXqsiyE гость |
|
Васо IP-штамп: frVLSkb92VEpk гость |
Специально для вас продаю шапочки из фольги Подробности в лс |
Сухова Наталья IP-штамп: frVoMBIXqsiyE гость |
Итак - у меня тот же самый вопрос - вам сколько лет и какой уровень квалификации? |
Сухова Наталья IP-штамп: frVoMBIXqsiyE гость |
|
Васо IP-штамп: frVLSkb92VEpk гость |
А вы? Все публикации в Вестниках Успехов Биологических Наук Зарайского Университета им Иванова? И 100500 монографий? 8) |
Guest IP-штамп: frJ.Pzqirbr62 гость |
|
Guest IP-штамп: frJ.Pzqirbr62 гость |
|
A.I.Mukhankin Участник |
(Сухова Наталья @ 28.04.2014 03:30) У меня всегда при чтении таких статей возникает один вопрос - а кроме этого они других драйверов рака не обнаружили? Самое последнее дело искать их в генетике, которая просто обеспечивает предпосылки для той или иной физиологии, и тех или иных особенностей строения без патологий. Изучите поподробней клеточное деление... Какие цели они преследуют такой вывернутой логикой - предостеречь людей от "дурной" генетики, которой в принципе не существует? Пора закрывать такое развитие тем с потугой на высокую наукоемкость. А может лучше людей предостерегать от дурных привычек, дурных врачей, дурной необразованности и легкомыслия? Вы еще скажите, что у отца с дипломом ребенок обязательно генетически умнее, чем у отца без диплома, как это пропагандируют некоторые. Спасибо, Наталья! Не часто встретишь в толпе снобов molbiol.ru здравомыслящего человека. Строго говоря, исследование генома опухолевых клеток ни к биологии, ни к науке отношения не имеет. Основная цель подобных работ - опубликоваться в Nature, повысить рейтинг цитируемости, привлечь к себе внимание общественности, чтобы получить очередной грант на продолжение своего дальнейшего столь же бесплодного существования. Можно ли решить проблему онкологических заболеваний, следуя нынешней моде забираться в молекулярные дебри клеточных структур? Очевидно, что - нет! Никто из молекулярных биологов задачи решить проблему онкологических заболеваний перед собой даже и не ставит, поскольку знаниями о том, как решаются проблемы вообще и как должна решаться онкологическая проблема в частности, "молекулярщики" не владеют. Сообщение было отредактировано A.I.Mukhankin - 17.05.2014 22:33 |
대출드림 IP-штамп: fraK0s5ehzFug гость |
|
먹튀검증 IP-штамп: fraK0s5ehzFug гость |
|
Guest IP-штамп: frwJoL6ntQsM2 гость |
|
Guest IP-штамп: frwJoL6ntQsM2 гость |
|
Rock |
|
watchesbiz Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
kriz Постоянный участник |
|
jad12 IP-штамп: frWoyLp/FCXKE гость |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
merckseo Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
merckseo Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
guest: pppp IP-штамп: frJ29JTBlItMA гость |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
xigel19038 Постоянный участник |
|
« Предыдущая тема · Колонка новостей · Следующая тема » |