molbiol.ru -> ATAc-seq

> Все форумы > Тематические форумы > Молекулярная и клеточная биология

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* ATAc-seq -- Tn5 transposase --

Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

снегиричка

07.09.2020 10:51

URL #1

добрый день,
давно не была на сайте, хочу спросить - кто-нибудь в россии проводил atac-seq? Где и почем? Мы планируем отправить зарубеж для секвенирования, но библиотеку сделать на месте. Однако тагментаза (Tn5 transposase) с буфером от Иллюмина стоит более 1 млн. Если кто готовил библиотеку посоветуйте с какими ферментами и каких производителей работали?

genseq
Постоянный участник

08.09.2020 08:39

URL #2

При таких ценах есть смысл сделать собственную транспозазу. Тем более что все её параметры известны с начала 90-х годов. Исходно она была разработана в лаборатории Ланцова Игорем Юрьевичем Горышиным (Санкт-Петербург). Потом Горышин дорабатывал её в США в компании Эпицентр, приобретённой Иллюминой. Сейчас он работает в Иллюмине.

Для повышения активности транспозазы Tn5 нужно ввести в неё 4 мутации (Tn5-059):
K212R/P214R/G251R/A338V

Tn5_Goryshin_2017.pdf
размер: 1.02мб
кол-во скачиваний: 101

Tn5_goryshin1998.pdf
размер: 279.91к
кол-во скачиваний: 111

Сейчас уже описаны и другие варианты, причём с доступными на Addgene плазмидами. Например: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P...5368/pdf/79.pdf

Сообщение было отредактировано genseq - 10.09.2020 21:23

Поблагодарили (1): вареник

вареник

10.09.2020 20:59

URL #3

(genseq @ 08.09.2020 09:39)

При таких ценах есть смысл сделать собственную транспозазу. Тем более что все её параметры известны с начала 90-х годов. Исходно она была разработана в лаборатории Ланцова Игорем Юрьевичем Горышиным (Санкт-Петербург). Потом Горышин доабатывал её в США в компании Эпицентр, приобретённой Иллюминой. Сейчас он работает в Иллюмине.

Для повышения активности транспозазы Tn5 нужно ввести в неё 4 мутации (Tn5-059):
K212R/P214R/G251R/A338V

Tn5_Goryshin_2017.pdf
размер: 1.02мб
кол-во скачиваний: 101

Tn5_goryshin1998.pdf
размер: 279.91к
кол-во скачиваний: 111

Сейчас уже описаны и другие варианты, причём с доступными на Addgene плазмидами. Например: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/P...5368/pdf/79.pdf

Исходно она была разработана в лаборатории Ланцова Игорем Юрьевичем Горышиным (Санкт-Петербург)

не в питере а в гатчине

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D0%B5%...%BE%D0%B2%D0%B0

вареник

10.09.2020 21:00

URL #4

(genseq @ 08.09.2020 09:39)

При таких ценах есть смысл сделать собственную транспозазу. Тем более что все её параметры известны с начала 90-х годов. Исходно она была разработана в лаборатории Ланцова Игорем Юрьевичем Горышиным (Санкт-Петербург). Потом Горышин доабатывал её в США в компании Эпицентр, приобретённой Иллюминой. Сейчас он работает в Иллюмине.

Для повышения активности транспозазы Tn5 нужно ввести в неё 4 мутации (Tn5-059):
K212R/P214R/G251R/A338V

Tn5_Goryshin_2017.pdf
размер: 1.02мб
кол-во скачиваний: 101

Tn5_goryshin1998.pdf
размер: 279.91к
кол-во скачиваний: 111

лаборатории Ланцова Игорем Юрьевичем Горышиным (Санкт-Петербург)

не питер а Ленинград

вареник

10.09.2020 21:06

URL #5

(genseq @ 08.09.2020 09:39)

При таких ценах есть смысл сделать собственную транспозазу. Тем более что все её параметры известны с начала 90-х годов. Исходно она была разработана в лаборатории Ланцова Игорем Юрьевичем Горышиным (Санкт-Петербург). Потом Горышин доабатывал её в США в компании Эпицентр, приобретённой Иллюминой. Сейчас он работает в Иллюмине.

Для повышения активности транспозазы Tn5 нужно ввести в неё 4 мутации (Tn5-059):
K212R/P214R/G251R/A338V

Tn5_Goryshin_2017.pdf
размер: 1.02мб
кол-во скачиваний: 101

Tn5_goryshin1998.pdf
размер: 279.91к
кол-во скачиваний: 111

лаба Ланцова была в Гатчине
ты спутал батя

вареник

10.09.2020 21:25

URL #6

(вареник @ 10.09.2020 22:06)

лаба Ланцова была в Гатчине
ты спутал батя

сейчас Курчатник

вареник

10.09.2020 21:37

URL #7

(вареник @ 10.09.2020 22:25)

сейчас Курчатник

http://www.pnpi.spb.ru/press-center/novost...ya-replikatsiya

вареник

10.09.2020 21:59

URL #8

(genseq @ 08.09.2020 09:39)

Tn5_Goryshin_2017.pdf
размер: 1.02мб
кол-во скачиваний: 101

Tn5_goryshin1998.pdf
размер: 279.91к
кол-во скачиваний: 111

80 ых
ты спутал батя

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/6290161/

вареник

10.09.2020 22:06

URL #9

(вареник @ 10.09.2020 22:59)

80 ых
ты спутал батя

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/6290161/

недеюсь русский язык знаете
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/6290161/

вареник

10.09.2020 22:28

URL #10

(вареник @ 10.09.2020 21:59)

в 80 е работал у Ланцова

кому

Игорем Юрьевичем Горышиным (Санкт-Петербург)

кому игорек

вареник

10.09.2020 22:45

URL #11

(снегиричка @ 07.09.2020 11:51)

извините эта куня не отличается от другой куни про ОТКРЫТЫЙ ХРОМАТИН

вареник

10.09.2020 22:48

URL #12

(вареник @ 10.09.2020 23:45)

извините эта куня не отличается от другой куни про ОТКРЫТЫЙ ХРОМАТИН

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29101361/

вареник

10.09.2020 23:00

URL #13

(снегиричка @ 07.09.2020 11:51)

на открытый храматин куева туча методов

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32321567/

вареник

10.09.2020 23:10

URL #14

(снегиричка @ 07.09.2020 11:51)

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25679813/

вареник

10.09.2020 23:18

URL #15

(снегиричка @ 07.09.2020 11:51)

снегурочка возьмите FAIRE-seq и будет ва щастье

вареник

11.09.2020 13:45

URL #16

(genseq @ 08.09.2020 09:39)

Tn5_Goryshin_2017.pdf
размер: 1.02мб
кол-во скачиваний: 101

Tn5_goryshin1998.pdf
размер: 279.91к
кол-во скачиваний: 111

генсек не зноби мои подковы ланцова и горышина я знал лично

вареник

11.09.2020 13:50

URL #17

(вареник @ 11.09.2020 14:45)

генсек не зноби мои подковы ланцова и горышина я знал лично

из лабы бреслера в гатчине

вареник

11.09.2020 13:58

URL #18

(вареник @ 11.09.2020 14:50)

из лабы бреслера в гатчине

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%91%D1%80%...%B2%D0%B8%D1%87

вареник

11.09.2020 14:23

URL #19

(вареник @ 11.09.2020 14:58)

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%91%D1%80%...%B2%D0%B8%D1%87

рассказую байку бреслер не любил физфак лгу ландау завидовал
прихожу к нему в 1978 хачу в лабу взял

вареник

11.09.2020 14:33

URL #20

(вареник @ 11.09.2020 15:23)

рассказую байку бреслер не любил физфак лгу ландау завидовал
прихожу к нему в 1978 хачу в лабу взял

Порочишь нацию

Правил, созданных людьми, не бывает без исключений. Один из весьма
известных завлавбов ( а может быть, даже и заведующий отделом ), напротив,
любил садиться в заднем ряду, умело извлекая все стратегические выгоды из
этой позиции.
Доклад, о котором пойдет речь, делал москвич. Тема доклада до обидного
близко перекликалась с работой одного из аспирантов лаборатории. Будучи
человеком заинтересованным и не очень умным, этот аспирант начал придираться
к докладчику, едва тот раскрыл рот. Будучи евреем, т.е. человеком южным и
страстным, он делал свои замечания тоном отнюдь не академическим.
Докладчик держался с достоинством, и не без юмора парировал выпады
аспиранта, чем горячил того все больше и больше. Наконец ситуация сделалась
уже неприличной.
Заведующий лабораторией (а может быть и отделом), человек роста
высокого и движений неторопливых, поднялся со своего места в последнем ряду
и, не торопясь, шаркающей кавалерийской походкой побрел по проходу к первому
ряду. Проходя мимо аспиранта, сидевшего у прохода, он слегка наклонил голову
и негромко, но отчетливо произнес: " Порочишь нацию". После чего прошел
дальше и сел в первом ряду.
Семинар продолжился без каких-либо дальнейших помех и происшествий

watchesbiz
Постоянный участник

12.10.2021 10:06

URL #21

https://app.ex.co/stories/bestreplicawatche...-regime-for-you
https://rolexrelicawatches.hpage.com/replica-watches-uk.html
https://www.cgmimm.com/articles/hints-to-he...lica-watches-uk
https://www.deviantart.com/fakerolexwatches...es-UK-871090193
https://replicawatches24.exposure.co/best-r...eplicawatches24
https://knowyourmeme.com/users/replicawatchesuk
https://www.scoop.it/topic/bestreplicawatch...ica-rolex-watch
https://uberant.com/article/1268140-hints-o...ca-rolex-watch/
https://devpost.com/watcheshutuk
https://www.ted.com/profiles/26540630/about
https://drive.google.com/file/d/1uTx90WraSJ...iew?usp=sharing
https://ibb.co/hgfZwb0
https://writer.zohopublic.com/writer/publis...10192bd4c742ceb
https://replicawatches24.mystrikingly.com/b...ica-rolex-watch
https://my.desktopnexus.com/ReplicawatchesU...a-rolex--31049/
https://sway.office.com/Tqm7mC7s0VWLhKAl

kriz
Постоянный участник

17.10.2021 11:42

URL #22

watchesonline89
Постоянный участник

25.12.2022 09:05

URL #23

https://medium.com/@omegawatches89/exciting...ne-17c41f48bce4
https://telegra.ph/Tips-For-Buying-Replica-Watches-08-03
https://disqus.com/by/omegawatches89/about/
https://plaza.rakuten.co.jp/omegawatches89/...y/202208040004/
https://omegawatches89.bigcartel.com/product/replica-watches
https://teletype.in/@omegawatches89/p6FG7kdedpw
https://dailygram.com/index.php/blog/116219...eplica-watches/
https://www.craftsforum.co.uk/member/209770-omegawatches89
https://forum.amando.it/members/omegawatches89-165008.html
https://www.academia.edu/88309718/https_www_watchesbiz_co_
https://codepen.io/omegawatches89/pen/KKRbyKj
https://musescore.com/user/54310503/sets/5621730
https://form.jotform.com/223253838439059
https://62e8da780bf7c.site123.me/blog/amazi...-watches-online
https://teletype.in/@omegawatches89/FclnTDwlkB1

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.