Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Результаты поиска -- Найденные сообщения --

страницы (27):  1 2 3 > » 

origin firing
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 25.06.2017 17:16  |  Научный языкНаучный язык  |  link: #1672614  |  Ответов: 4  |  Просмотров: 5 117
Ориджин по-русски и говорят (ориджин репликации). Firing это, кажется, просто срабатывание называют.
Как принято переводить dormant origin не уверен, думаю, спящий, или неактивный...

X и Y хромосомы
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 18.04.2017 11:02  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1664084  |  Ответов: 27  |  Просмотров: 3 909
Как мне кажется, золотой стандарт в таких хромосомных вопросах это FISH... Еще можно отсеквенировать с небольшой глубиной, можно много образцов замультиплексить на каком-нибудь маленьком секвенаторе, будет недорого.

Опрос: Субкультивирование клеток
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 14.01.2017 23:41  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1653637  |  Ответов: 1  |  Просмотров: 1 619
Потому что эти ионы нужны для прикрепления клеток к пластику и друг другу. Если их не убрать, будет гораздо сложнее клетки снять с поверхности и превратить с суспензию с отдельными клетками.

программы для определения длины фрагментов ДНК в геле
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 30.11.2016 18:47  |  СофтСофт  |  link: #1648532  |  Ответов: 14  |  Просмотров: 7 504
Примерно так, я давно не пользовался: создаете дорожку из вашего маркера, детектируете полосы, подписываете к ним длины, сохраняете как MW standard.

программы для определения длины фрагментов ДНК в геле
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 25.11.2016 19:37  |  СофтСофт  |  link: #1647911  |  Ответов: 14  |  Просмотров: 7 504

Отодрать биотин от стрептовидина - как?
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 23.11.2016 17:59  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1647734  |  Ответов: 13  |  Просмотров: 7 461
Проще и надежнее всего, думаю, протеиназой просто. Нагрев в чистой воде, вроде, тоже должен работать, но эффективность неясно какая будет...

Обсчет данных ПЦР в реальном времени
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 10.11.2016 19:02  |  Сайт и форумСайт и форум  |  link: #1646121  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 7 248
Нууу даже если графически, сделайте график только нужного участка...

Обсчет данных ПЦР в реальном времени
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 09.11.2016 17:49  |  Сайт и форумСайт и форум  |  link: #1645949  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 7 248
A5&A6 явно отличаются по наклону на глаз же. Да и выше тоже есть различия, хотя менее очевидные. Найдите, как сделать регрессию, и увидите, что коэффициент будет разный (как это сделать в Экселе без понятия).

Достройка 1 цеп. ДНК до 2-цеп
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 02.11.2016 20:21  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1644989  |  Ответов: 12  |  Просмотров: 2 662
Можно навесить поли-А терминальной трансферазой (https://www.neb.com/products/m0315-terminal-transferase), а потом поли-Т праймером сделать вторую цепь.

Регулируемая димеризация белков
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 28.10.2016 04:00  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1644300  |  Ответов: 21  |  Просмотров: 3 428

секвенирование ПЦР фрагментов
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 24.10.2016 16:57  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1643809  |  Ответов: 9  |  Просмотров: 2 540
В моем опыте это в принципе работает, но ненадежно - иногда сиквенс не очень чистый, а иногда вообще не срабатывает. При этом если взять праймеры внутри ПЦР продукта, то работает 100%.

CRISPR-Cas9
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 22.10.2016 11:30  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1643503  |  Ответов: 15  |  Просмотров: 2 611
А в G2 в клетке хоть все 4 копи могут по-разному починиться, это совсем непойми что будет.

Конечно, может, этот TIDE все разберет, тогда это не нужно.

CRISPR-Cas9
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 22.10.2016 10:49  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1643500  |  Ответов: 15  |  Просмотров: 2 611
(Flyamer @ 22.10.2016 02:31)
Ссылка на исходное сообщение А то если в двух аллелях по-разному починился разрыв, опять же будет мешанина в сиквенсе.

CRISPR-Cas9
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 22.10.2016 01:31  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1643489  |  Ответов: 15  |  Просмотров: 2 611
Да, они там пишут на сайте где-то, что бывают проблемы с доступом из-за фаерволов...

Да это я понимаю, что универсальное. Но ведь клонировать ПЦР-продукт из человеческих клонов надо будет в е коли, чтобы потом секвенировать. А то если в двух аллелях по-разному починился разрыв, опять же будет мешанина в сиквенсе.

CRISPR-Cas9
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 21.10.2016 12:18  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1643417  |  Ответов: 15  |  Просмотров: 2 611
Какой еще ценник? Это бесплатная штука (онлайн которая).

Причем здесь 293? Е. коли быстро делятся smile.gif

CRISPR-Cas9
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 20.10.2016 14:59  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1643264  |  Ответов: 15  |  Просмотров: 2 611
Если не вестерн и не next gen seq, то только клонирование ПЦР-продукта и секвенирование клонов, ИМХО. А вот если делать не просто разрез, а еще и делать HDR, то можно просто секвенировать ПЦР продукт, потому что тогда в случае разреза и починки на обоих хромосомах последовательность будет одинаковая.

Плюс есть вот эта штука, которая может решить все проблемы, но я не пробовал.
https://tide.nki.nl/

Закладка сайта рестрикции в праймер
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 11.10.2016 13:08  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1642171  |  Ответов: 31  |  Просмотров: 3 674
Я добавляю 3. Для некоторых рестриктаз написано, что необходимо больше, тогда больше.

Анализ данных полногеномного секвенирования
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 08.10.2016 20:59  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1641875  |  Ответов: 9  |  Просмотров: 1 894
Я бы ПЦРом и Сэнгером проверил топовые потенциальные оффтаргеты и забил на полногеномное секвенирование...

ДНК не осаждается
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 06.09.2016 17:53  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1637812  |  Ответов: 22  |  Просмотров: 2 574
(Lenochgge @ 06.09.2016 08:47)
Ссылка на исходное сообщение 
Flyamer: а ограничения по длине ДНК у нее есть? а то в наличии колонки для очистки, так у них до 15000 пн у всех почти, не берут никакие

У AMPure? Да нет, я фосмиды (как раз в районе 40 Кб) чистил, да и геномку тоже, кажется.

ДНК не осаждается
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 06.09.2016 01:33  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1637728  |  Ответов: 22  |  Просмотров: 2 574
На AMPure XP можно почистить еще вместо переосаждения. Я все на них чищу...

Линейная регрессия Кокса
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 25.08.2016 14:21  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1636101  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 6 662
Это, вроде, первый член в ряде Тейлора в точке 0, то есть дает приближенные значения близко к 0.
https://en.wikipedia.org/wiki/Taylor_series

NextSeq500: poly-G после секвенирования
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 18.08.2016 21:54  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1635212  |  Ответов: 18  |  Просмотров: 2 864
Заклонируйте библиотеку и отсеквенируйте сэнгером клоны, станет понятно.

NextSeq500: poly-G после секвенирования
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 17.08.2016 13:25  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1635000  |  Ответов: 18  |  Просмотров: 2 864
Почитайте, что по ссылке написано, там так устроено, что отсутствие сигнала означает G, так что чем сигнал хуже, тем выше качество G.

Вопрос из истории молекулярной биологии
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 12.08.2016 12:25  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1634248  |  Ответов: 2  |  Просмотров: 1 217
Неуспех - попытка воспроизвести опыты Менделя на ястребинке smile.gif

Картирование плазмид
Flyamer
Постоянный участник
Москва


Отправлено: 13.07.2016 14:19  |  Биофизика и матметоды в биологииБиофизика и матметоды в биологии  |  link: #1630072  |  Ответов: 9  |  Просмотров: 4 430
Ctrl+F
страницы (27):  1 2 3 > »  

Новые сообщения  Есть новые сообщения
Нет новых сообщений  Нет новых сообщений
Нет новых сообщений*  Тема с вашим участием
Горячая тема - новые сообщения  Горячая тема (есть новые сообщений)
Горячая тема - нет новых сообщений  Горячая тема (нет новых сообщений)
Важно - нет новых сообщений  Важная тема
Опрос - есть новые голоса  Опрос — есть новые голоса
Опрос - нет новых голосов  Опрос — нет новых голосов
Опрос -нет новых голосов  Опрос с вашим участием
Объявление  Объявление
Тема закрыта  Закрытая тема
Тема перемещена  Перемещённая тема


Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 23.01.20 19:55
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft