 * |   |
|
Molbiol.ru | Project | Protocols | Programs | Literature Web | Companies | Marketplace | Labor exchange Today's active topics [ Log In* | Register* ] Forum: |
|
Rules
* Как сделать простейший магнитный штатив? -- В поисках идеала. --
Topic Curators:* genseq
Black list: RJ Dio, R.J.Dio, zlatopramen1, R-J-Dio, ХерОпсис, Guest314
NB! members included in the Black list cannot be discussed in the topic
Options: I want to be curator* · Track this topic* · Email this topic · Print this topic*
Topic view:* Outline · [ Standard ] · Linear+
   |
 genseqAdvanced Member  |
 18.08.2020 21:41
Attached File(s)
|
_________________________MTTS_PCR.pdf|
genseq Advanced Member |
08.01.2021 18:58
 metrim: а енто уже тут выкладывали ? По прошествии почти четырёх лет решил, что пора вернуться к этому сообщению - о штативах на 96 лунок для ручной экстракции ДНК. Эти штативы вполне способны заменить роботизированные станции, стоимость которых измеряется миллионами рублей: Если не ошибаюсь, пандемия сделала актуальным и этот вариант. Правда, копировать "экстрактор" от V&P Scientific не хочется. Хочется попробовать сделать варианты на 24, 48 и 96 лунок. Причём не на специальных магнитах, а на магнитных шариках. И сделать их как можно дешевле и проще - на 3D-принтере.  This post has been edited by genseq: 13.01.2021 15:46 |
|
-Ъ- Advanced Member Москва |
14.01.2021 13:15
(genseq @ 08.01.2021 19:58) По прошествии почти четырёх лет решил, что пора вернуться к этому сообщению - о штативах на 96 лунок для ручной экстракции ДНК. Эти штативы вполне способны заменить роботизированные станции, стоимость которых измеряется миллионами рублей. Сомневаюсь что на это надо тратиться, тем более на рынке их такое разнообразие. Ты лучше свои магнитные шарики доводи до совершенства. А на сегодняшний день актуально "direct RT-PCR", т.е. без всяких выделений образец попадает прямо в реакционную смесь. Лучшие умы сейчас над этим работают!  А штативы не твоё, Генсек, бросай это дело, направь свой гениальный разум на великие цели!  
|
|
genseq Advanced Member |
14.01.2021 17:02
Их неплохо передирают отечественные конкуренты. Да и покупатели не иссякают. Сделать ещё одну серию под планшеты (на 24, 48 и 96 лунок) сейчас уже несложно. Заодно и мозги отдохнут. Хотя в последнее время они что-то не перенапрягаются.  This post has been edited by genseq: 14.01.2021 17:06 |
|
genseq Advanced Member |
23.01.2021 09:14
(-Ъ- @ 14.01.2021 11:15) Сомневаюсь что на это надо тратиться, тем более на рынке их такое разнообразие. Ты лучше свои магнитные шарики доводи до совершенства. А на сегодняшний день актуально "direct RT-PCR", т.е. без всяких выделений образец попадает прямо в реакционную смесь. Лучшие умы сейчас над этим работают! А штативы не твоё, Генсек, бросай это дело, направь свой гениальный разум на великие цели! Штативы и шарики - это для расслабления. И зарабатывания денег. Для настоящих ценителей я пытаюсь сделать секвенатор. |
|
auh |
11.02.2021 21:09
(genseq @ 23.01.2021 10:14) Штативы и шарики - это для расслабления. И зарабатывания денег. Для настоящих ценителей я пытаюсь сделать секвенатор. гинсекач тыж сначала собирался Фреон Торрент потом Нанопору  
|
|
genseq Advanced Member |
14.03.2021 17:19
|
|
AstraZeneca |
17.03.2021 14:56
(genseq @ 14.03.2021 18:19) Работа с нанопорой хоть и не течёт, но капает. Генсек Пущино Белоярцев и голубая кровь Профессор остается один. Утром его найдут в петле. Причина самоубийства 44-летнего ученого остается загадкой по сей день. Почти все 20 томов следствия либо надежно укрыты в архивах, либо уничтожены. |
|
genseq Advanced Member |
22.03.2021 19:46
(metrim @ 30.05.2020 13:13) Кстати говоря, а не посоветуете какой то простенький 3Д принтер с алиэкспресс, что бы "без глубокого погружения в тему" задешево можно было всяческие лабораторные приспособы типа кронштейнов, штативов и т.д. при необходимости печатать?Сделал чертёж для 3D-печати магнитного штатива под 96-луночные плашки. На этой неделе обещали "отпечатать". Так что скоро смогу поверить эту идею. И поделиться чертежом с любителями 3D-печати. Её лучше не осваивать, а заказывать. Выйдет дешевле.
|
|
methanol |
23.03.2021 02:26
(genseq @ 22.03.2021 20:46) Сделал чертёж для 3D-печати магнитного штатива под 96-луночные плашки. На этой неделе обещали "отпечатать". Так что скоро смогу поверить эту идею. И поделиться чертежом с любителями 3D-печати. Её лучше не осваивать, а заказывать. Выйдет дешевле. гинсекыч сделай один чертеж на один Эппер на одну пробирку на один магнит 
|
|
genseq Advanced Member |
29.03.2021 13:56
(methanol @ 23.03.2021 00:26) гинсекыч сделай один чертеж на один Эппер на одну пробирку на один магнит Однопробирочные штативы (точнее двухпробирочные - 1х2) неустойчивы. Сделаю, но, как минимум, двухпробирочные (2х2). И начну всё-таки с плашечного. Что-то его пробные распечатки задерживаются.
|
|
genseq Advanced Member |
21.04.2021 17:53
Форум не просто загаживается, а ещё и портится! Перестали загружаться картинки! |
|
Tin Shenk |
22.04.2021 00:53
(genseq @ 21.04.2021 18:53) Пробная распечатка. Не ожидал, что всё получится так хорошо. По всем параметрам не хуже фрезерованных!Форум не просто загаживается, а ещё и портится! Перестали загружаться картинки! По всем параметрам не хуже фрезерованных!
|
|
genseq Advanced Member |
23.04.2021 08:26
|
|
dk Advanced Member Россия |
23.04.2021 19:17
 This post has been edited by dk: 25.04.2021 17:21
|
|
genseq Advanced Member |
 23.04.2021 19:39
   This post has been edited by genseq: 23.04.2021 20:01
|
|
dk Advanced Member Россия |
23.04.2021 20:50
|
|
genseq Advanced Member |
01.06.2021 17:41
(dk @ 23.04.2021 18:50) Можно начинать торговать STL для 3D-принтеров и неодимовыми магнитами с Али - эконом-вариант вариант для очень бедных/жадных.Так и сделаю. Для желающих помучиться буду продавать по-дешёвке STL, а для тех, кому лень связываться с 3D-печатью - готовые штативы. |
|
genseq Advanced Member |
29.08.2021 14:56
Рабочее название - 3D-Mag. В каталоге: |
|
Asterix Advanced Member |
03.09.2021 01:34
Насколько реальна идея? а то меня эта генная биолистика от БиоРада дико разочаровывает.. эффективность слишком низкая ,. мне надо раз в 100 - 1000 ее поднять. То что у них - это только детям и студентам фокусы показывать ... типа да смотрите как работает , ох и пушка ... Ну золотые микрочастицы увы , не магнитные ... надо вот какой-то легко доступный магнитный материал использовать и все равно непонятно какое же магнитное поле понадобится чтоб частица прошла пару миллиметров за час скажем, ну с поверхности растительного образца в глубь ткани например через клеточную стенку и мембрану? Идея вообще будет востребована .. я так думаю если заработает, то таких устройств с китами можно продать в мире примерно 1000 штук. Сейчас просто появилась реальная необходимость в этом. В связи с Криспером-Касом. |
|
genseq Advanced Member |
03.09.2021 07:17
Другие методы трансфекции клеток (электропорация, липосомы и т.п.) могут быть и более эффективными, но они не столь универсальны. И погружаться с головой в решение этой проблемы что-то не хочется. Головной боли слишком много, а коммерческие перспективы слишком туманны. Если целю является не продажа препаратов с целью личного обогащения, а решение каких-нибудь глобальных проблем (типа спасения человечества), то совершенствование биолистики для этого не подходит. Задачка мелковата. This post has been edited by genseq: 03.09.2021 07:18 |
|
Asterix Advanced Member |
03.09.2021 15:32
А если просто мутацию криспером внести то и спроса нет, просто регистрация нового сорта и все ... это недорого и несложно. Так вот для получения таких растений в силу специфики и прочее и прочее ... нужна высокая эффективность трансформации причем надо направленно вводить ген в определенный участок растения в надежде на возникновение нужной химеры. И участок этот имеет микроскопические размеры , ну квадратный миллиметр примерно ... из пушки, с расстояния 10 см туда попасть можно только чудом . Ядовитость этих частиц роли особо не играет , достаточно сделать их медленно ядовитыми , ну чтоб , после первого деления частица остается в одной из клеток которая потом может и погибнуть , но потомство ее будет жить с модифицированным геномом и так далее ... Плотность частиц имеет значение только для баллистики , если их двигать магнитным полем то зачем им плотность ? главное размер чтоб был до 1 микрометра , не более. И пусть оно медленно двигается , да хоть всю ночь. Там надо пройти несколько слоев клеток , чтоб попасть в нужный слой. Ну и важно чтоб механического повреждения ткани было минимальное а лучше и вообще без повреждения , медленно но верно ... а то баллистика эта там рушит клетки очень солидно. |
|
genseq Advanced Member |
03.09.2021 15:55
|
|
Asterix Advanced Member |
03.09.2021 16:24
Будут ли они залезать в клетку? Меня тоже интересует этот же вопрос , проверить несложно. На первый взгляд если баллистически они прекрасно залезают в клетку то почему их туда не затолкает магнитное поле? Ну я пока ничего не изучал , вот наивно рассуждаю. Неужели сопротивление клеточной стенки и внешней мембраны с цитоплазмой и ядерной мембраной будет такое огромное что понадобится супермагнитная установка за 100К баксов? 100нм - прекрасный размер ... баллистика такую мелочь даже и не возьмет. |
|
Asterix Advanced Member |
03.09.2021 16:33
Я закажу все и начну химичить потихоньку.. а там постепенно и опыт образуется .. Магнит вот насколько надо мощный заказывать? Удобно было бы чтоб чашку Петри с образцами на него поставил и пусть тянет на себя частицы заталкивая их вглубь растительных образцов. |
|
genseq Advanced Member |
03.09.2021 20:58
|
|
Asterix Advanced Member |
03.09.2021 23:11
Может переменное магнитное поле подойдет? типа шаг назад два шага вперед.. как-то так... Почему магнитные частицы не смогут проникнуть в клетку влекомые магнитным полем? Может конечно там такая напряженность этого поля нужна что просто дико дорого получится ... я пока не знаю еще.... вот спрашиваю у специалистов их соображения . Электропаратор у меня есть и прекрасно работает .. кстати Био-Радовский, старинный еще , к нему у меня претензий нет, отлично бактерии трансформирует . Но мне надо нечто совершенно другое. |
|
Asterix Advanced Member |
03.09.2021 23:46
вот думаю заказать что ли такие частицы на опыты. ? [Meet the newest addition to our family of magnetic particles–Magnefy™ ~1µm carboxylated superparamagnetic microspheres. As high surface area / high surface titer microparticles with a rapid separation profile, Magnefy offer an additional performance-driven solid phase for magnetic particle-based assays and isolations, particularly SPRI-based total DNA isolation. (Available for carboxyl pack only.) BioMag Plus are ~1.5µm high-performance superparamagnetic microparticles widely used in assays and for the efficient separation of cells and purification of proteins or other biomolecules. Their irregular morphology provides much greater surface area than similarly-sized spherical particles, resulting in high binding capacities and efficient capture of target with conservative use of particles. The high iron oxide content allows for rapid and efficient magnetic separations, even from difficult, e.g. highly viscous, samples.] Черт подери , вот смотрyu в книгу, а вижу фигу .. так и не поднимаю как рассчитать необходимую силу магнита для мелких железосодержащих частиц своих... Я уже примерно оценил их размер порядка 1 фемтограмм там железа в одном кубическом микрометре обьема одной частицы, но какая на них сила будет действовать ? , ну там расстояние от частиц до поверхности магнита примерно 1 см будет , если образец ткани растения в чашке Петри скажем будет лежать. Ну и там же может и эпидермис чем-то сухим быть покрыт, воском например , но это уже детали , это можно и снять и проколоть шкурку в месте где надо ввести трансген. Вот вижу расчеты, а не соображаю как это для себя посчитать-то. Ну и у меня не воздух, а вязкая среда имеющая сопротивление , клеточная стенка , Ну пусть даже предположим 1% агарозный гель ... сколько надо силы у магнита и времени воздехствия чтобы продвинуть в нем эту фемтограмовую магнитную частицу на 30 микрометров например? Engineers make solenoids – electromagnets – by twisting lengths of metal in a spiral fashion around a cylindrical template. You can determine the magnitude of that force by plugging the dimensions and other properties of the magnet based into a simple equation: F = (n X i)2 X magnetic constant X a / (2 X g2). Passing an electrical current through the solenoid results in a magnetic field that exerts force on nearby ferromagnetic objects, such as pieces of iron or steel. The joining together of magnetic and electric forces on a charged item is called the Lorentz force. Calculate the force by writing the equation: F = (n x i)2 x magnetic constant x a / (2 x g2) Brought to you by Sciencing Where, F = force, i = current, g = length of the gap between the solenoid and a piece of metal, a = Area, n = number of turns in the solenoid, and the magnetic constant = 4 x PI x 10-7. Analyze your electromagnet to determine its dimensions and the amount of current you will be running through it. For example, imagine you have a magnet with 1,000 turns and a cross-sectional area of 0.5 neters that you will operate with 10 amperes of current, 1.5 meters from a piece of metal. Therefore: N = 1,000, I = 10, A = 0.5 meters, g = 1.5 m Plug the numbers into the equation to compute the force that will act on the piece of metal. Force = ((1,000 x 10)2 x 4 x pi x 10-7 x 0.5) / (2 x 1.52) = 14 Newtons 👎 Repelling Grapes Stick two grapes on the end of a straw and balance the straw on a pin stuck through a plastic jar top. Move a neodymium magnet near one of the grapes, and it will move away from the magnet. Then, turn the magnet over. Although you expect grape to be attracted, it is repelled again. This happens because the water in the grape is dimagnetic and is repelled by both poles of a magnet. This post has been edited by Asterix: 05.09.2021 01:38 |
|
genseq Advanced Member |
05.09.2021 16:29
|
|
Asterix Advanced Member |
05.09.2021 16:55
Мне нужно рассчитать , вернее просто прикинуть насколько нижтожны эти силы магнитные и сколько надо магнитного поля чтоб получить искомый результат? В конце концов я сам сделаю достаточно мощный магнит , там намотал катушку на сердечник и ток посильнее включил ... электричество у меня есть и в достатке , да хоть 20 ампер могу туда дать. Вот эти магнитные частицы микрометровые , они же могут связыватрь ДНК на поверхности и потом эффективно осаждаться при помощи обычного неодимового магнитика из весьма вязкой среды.. То есть потенциал есть .. надо прикинуть только необходимую силу магнитного движущего момента необходимого для преодоления сопротивления клеточной стенки и плазматической мембраны. |
|
genseq Advanced Member |
07.09.2021 13:01
|
|
Asterix Advanced Member |
07.09.2021 15:44
(genseq @ 07.09.2021 14:01) Ну с животными клетками в культуре проблем естесвенно нет , даже с простой липофектаминовой трансформацией , там под 90% эффективность.. а эти товарищи просто механически улучшают немного эффективность притягивая частицы покрытые комплексами ДНК-липид поближе к клеточной поверхности , но их частицы и главным образом комплексы ДНК-липид с поверхости этих частиц внутрь клеток попадают не механической силой тяги, а посредством эндоцитоза. С растительными клетками такой фокус не пройдет, там другая физиология. Вот поэтому надо рассчиттаь примерно силу магнитного движущего момента действующего на частицы и сколько надо магнитного поиля чтоб этот фемтограмм оксида железа в шарике диаметром 1 микрометр протащить через клеточную стенку с мембраной , причем не один раз ... обычно нужен не эпидермис, а более нижние слои. Вот жалко что они не ставили опыты с дрожжами хотя бы , это уже неплохое приближение к растительной клетке. /// Ideal for Primary & Hard-to-Transfect Cells More information on www.ozbiosciences.com MAGNETOFECTION TECHNOLOGY Magnetofection™ is a simple and highly efficient method to transfect cells. This technology was developed to gather in one convenient system the advantages of the popular biochemical (cationic lipids or polymers) and physical transfection methods (electroporation, gene gun) while overcoming their respective limitations. Magnetofection Benefits • High transfection efficiency with any nucleic acids - increase efficiency from 30 to 500% • Powerful on hard-to-transfect and primary cells • High performance even with low dose of nucleic acids (enables to use 10 to 100 times less nucleic acids) • Concentration of genetic material onto cells / acceleration of kinetics • Biodegradable iron oxyde nanoparticles, safe and universal Magnetic Plates for Magnetofection How does it work? • Magnetic nanoparticles are associated with nucleic acids (naked or pre-complexed with a transfection reagent or viruses) by salt-induced aggregation and electrostatic interactions • Magnetic force drives these complexes towards the target cells, allowing a rapid concentration of the vector dose onto cells • The cellular uptake of the genetic materials is accomplished by endocytosis and pinocytosis • Nucleic acids are released in the cytoplasm by flip-flop mechanism or proton sponge effect* |
|
Asterix Advanced Member |
07.09.2021 16:09
Но кстати а действительно, а что если взять не шарики, а трубки диаметром 1 микрометр? будут ли они правильно ориентироваться в магнитном поле и пролезать в клетку острым концом? Ведь тогда и сила магнитная на них больше будет действовать чем на шарики из-за геометрии. Звучит вполне заманчиво. The magnets used in vivo are: 1 extra small cylinder (ø 2 mm), 1 small cylinder (ø 5 mm), 1 cylinder (ø 10 mm) or 1 square (18x18 mm) magnet. You can also order only square magnets (packaged by 4) or only disc magnets (packaged by 4 of each). Each kit contains a complete magnet set (with 4 sizes of magnet), you can also order an extra magnet set. Depending on your application, the animal, the location of the targeting you can use any of the previous magnets. Nevertheless, for small animals we recommend either the extra small cylinder (2mm) or the small cylinder (5mm). The last one works very well to target embryo rat cortex for example. |
|
genseq Advanced Member |
25.10.2021 09:41
Да , похоже надо будет подкинуть идейку свою этим товарищам , они неплохо там развернулись с магнитно-улучщенной трансфекцией. Может смогут обсчитать и мою идею для растений тоже .., а я займусь проверкой на практике их расчетов, там конечно обычный магнит не потянет , нужен сверхмощный какой-то или импульсный .. но вот вопрос исключительно в достижимости подобной мощности за разумные деньги. |
|
genseq Advanced Member |
29.12.2021 20:54
|
| « Next Oldest · Molecular and cellular biology · Next Newest » |
 |
· Викимарт - все интернет-магазины в одном месте · Доска объявлений Board.com.ua ·
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---
Helicon · Dia-m · InterLabService · Beckman Coulter · SkyGen · OPTEC · BIOCAD · Evrogen · Syntol · Bioline · Sartorius · Khimexpert · SibEnzyme · Tecan · Danies · NPP «TRIS» · Bialexa · FizLabPribor · Genotek · ATG Service Gene · Biogen-Analitika
Your forum · editor@zbio.net · Time is now: 19.04.24 07:20
Powered by Invision Power Board(Trial) v2.0.0 © 2024 IPS, Inc.