Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Рендалл |
Загнал в него пробную матрицу: 0 0,3 0,5 0,4 0,3 0 0,4 0,35 0,5 0,4 0 0,6 0,4 0,35 0,6 0 Вы рал модуль tree clustering, переменные все 4 (ALL), input file - матрица расстояний. ОК... и получаю "This is not a matrix file (see the matrix file format description in the manual)". Чтение мануала мало помогло. В кучу ссыпают корреляционные, ковариационные матрицы с матрицей расстояний. В рекомендациях чёрт ногу сломит - то ли файл сохранить надо под определённым расширением, то ли лишние столбцы, то ли (непонятно зачем) добавить ряд дополнительных характеристик. Если кто работал, подскажите как правильно ввести данные матрицы. |
Den-N Постоянный участник |
|
Рендалл |
|
Рендалл |
|
Den-N Постоянный участник |
"Matrix. This required number represents the type of matrix file; 1 = Correlation, 2 = Similarities, 3 = Dissimilarities, and 4 = Covariance." Там в примерах везде 1, а выходит в последней строке надо 3 ставить чтобы он ее как матрицу расстояний понял. В хэлпе все есть...
|
Рендалл |
(Den-N @ 27.03.2008 04:37) Лучше всего - сделать кластеризацию на реальных данных, зайти на вкладку Advanced, нажать на кнопку Matrix с дискеткой и посмотреть что за матрица там. А там двойственная ей матрица. Программа же любую матрицу пересчитывает по формуле (1-r Пирсона). Но исходя из того что ниже сказано, то понятно.Единственное еще - написал, что "Нужно сделать в точности как в Examples", а там парой строк выше написано: О! Вот теперь вроде как надо. Я понял свою ошибку. Спасибо!
"Matrix. This required number represents the type of matrix file; 1 = Correlation, 2 = Similarities, 3 = Dissimilarities, and 4 = Covariance." Там в примерах везде 1, а выходит в последней строке надо 3 ставить чтобы он ее как матрицу расстояний понял. В хэлпе все есть... |
nushra4 Постоянный участник |
|
nushra4 Постоянный участник |
|
nushra4 Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
seomind Постоянный участник |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpXPq5TOmUHs гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: fr4iy3.kHUw02 гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpXPq5TOmUHs гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: fr4iy3.kHUw02 гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frY/5Vmfd77P. гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frAWeMdOsBSXM гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: fr/zSMfAf4ms. гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: fr/1ZkUsuBQOE гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
|
guest: 123vega IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
|
guest: 123 IP-штамп: frAWeMdOsBSXM гость |
|
guest: 123 IP-штамп: frJhOCvSv9ICE гость |
|
« Предыдущая тема · Биофизика и матметоды в биологии · Следующая тема » |