Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
genseq Постоянный участник |
Буду признателен за любые замечания и предложения: Сообщение было отредактировано genseq - 13.11.2014 15:33 |
Dima11 Участник |
с удовольствием напишу комменты, много скепсиса, но это не от негативног отношения донорами гемопоэтических стволовых клеток, пересадка которых способна вылечить СПИД донорского регистра нормального - нет, региональные кроме Росплазмы - слабы Гистотипирование секвенированием ДНК давно есть и пересадка ККМ осуществляется после типирования с высоким разрешением. в большинстве случаев Сэнгером На прошлом EFI были анонсы и от Illumina и от LifeTech. Регистр ВИЧ-толерантных доноров не ранее национального регистра. Но пока что низы не могут, а верхи не хотят Из них 371- в Карельском регистре (Петрозаводск) /34/ с низким разоешением , более тысячи - в Институте детской онкологии, гематологии и трансплантологии (Санкт-Петербург), более 3 тысяч – в НИИ гематологии и трансфузиологии (Пушкин), низкое разрешение более 5 тысяч – в НП «Регистр доноров» (Самара) /35/ низкое разрешение, более 13 тысяч – в ГБУ «Росплазма» (Киров) /36/ высокое разрешение (к концу 2013 года). сам терапевтический метод - пересадка ККМ в обоих случаях - просто пересадка фракции стволовых клеток ничего не даст. Нужны именно прогениторные кроветворные. в данном случае ИМХО Лимитирующим фактором остается развитие трансплантологии как таковой. Как только РФ будет проводиться более 2-3 тыс. трансплантаций в год, то об этом можно будет дискутировать. Для этого количества трансплантаций необходим регистр с ~1 500 000 и более потенциальных доноров. NGS принципиально типирование не удешевит , но ускорит
|
AlexRez Постоянный участник Екатеринбург |
|
Dima11 Участник |
при огромной спорности этого подхода терапии надо понимать, что на данный момент есть принятые стандарты и препараты. Развитие альтернативных методов рассматривается как 1) потеря доли рынка существующими производителями (это очень большой и вкусный рынок - см. "калетра" и суммы закупок за 5 лет) 2) методы потребующие создания новых схем применения и испытаний, а это долго и дорого. кстати запад - нифига не образец для подражания Сообщение было отредактировано Dima11 - 02.03.2014 16:53
|
Агроном Постоянный участник |
|
genseq Постоянный участник |
Читайте внимательнее. В обзоре всё это рассматривается. Если считаете, что сформулировано недостаточно чётко, то прошу указывать абзацы, которые требуют переработки. |
Агроном Постоянный участник |
|
LMP Постоянный участник |
(genseq @ 03.03.2014 06:40) Читайте внимательнее. В обзоре всё это рассматривается. Если считаете, что сформулировано недостаточно чётко, то прошу указывать абзацы, которые требуют переработки. "В результате расчётная стоимость таргетного секвенирования HLA-генов на обоих приборах получается примерно одинаковой (~1000 руб.)." Вы эту цену считаете с учетом стоимости секвенирования за рубежом? Вы не пересчитываете эту цену с учетом цен на киты в России? |
genseq Постоянный участник |
(LMP @ 03.03.2014 08:47) "В результате расчётная стоимость таргетного секвенирования HLA-генов на обоих приборах получается примерно одинаковой (~1000 руб.)." Вы эту цену считаете с учетом стоимости секвенирования за рубежом? Вы не пересчитываете эту цену с учетом цен на киты в России? Все цены указаны для США. В России будут в 2...3 раза выше. |
бутанол Постоянный участник Новосибирск |
донорам костного мозга с CCR5 ∆32/∆32 было бы выгодно продавать свой костный мозг вич-инфицированным т.е. за деньги достаточно накопить банк таких алчущих граждан и допустить нелегальную мотивацию этих граждан самими вич-инфицированными чтобы рынок заработал а когда это станет массовым то и государство подтянется? 2. интересно было бы поработать с гетерозиготными донорами по CCR5 ∆32 например если сделать соматические гибридизации и добиться случайного выщепления части хромосом с получением пулов гомозиготных по CCR5 ∆32 клеток костного мозга и уже потом проводить трансплантацию или соматическую гибридизацию стволовых клеток костного мозга донора и реципиента для получения пула совместимых клеток 3. у меня была мысль методами белковой инженерии получить эритроциты с CCR5 на поверхности дабы использовать их в качестве ложной мишени для вируса 4. я так понимаю нужды в уничтожении собственного костного мозга реципиента при такой трансплантации нет?
|
genseq Постоянный участник |
(бутанол @ 26.03.2014 07:46) 1. а если пойти по нелегальному пути? донорам костного мозга с CCR5 ∆32/∆32 было бы выгодно продавать свой костный мозг вич-инфицированным т.е. за деньги достаточно накопить банк таких алчущих граждан и допустить нелегальную мотивацию этих граждан самими вич-инфицированными чтобы рынок заработал а когда это станет массовым то и государство подтянется? 2. интересно было бы поработать с гетерозиготными донорами по CCR5 ∆32 например если сделать соматические гибридизации и добиться случайного выщепления части хромосом с получением пулов гомозиготных по CCR5 ∆32 клеток костного мозга и уже потом проводить трансплантацию или соматическую гибридизацию стволовых клеток костного мозга донора и реципиента для получения пула совместимых клеток 3. у меня была мысль методами белковой инженерии получить эритроциты с CCR5 на поверхности дабы использовать их в качестве ложной мишени для вируса 4. я так понимаю нужды в уничтожении собственного костного мозга реципиента при такой трансплантации нет? 1. "Нелегальный" путь - это основа для вполне легального коммерческого проекта. 2. Вариант с гетерозиготными донорами и выщеплением части хромосом слишком мудрёный. Если уж экспериментировать с гетерозиготными мутантами, то не с донорами, а с реципиентами. Для них должна хорошо подходить низкодозовая антиретровирусная терапия с маравироком. Поэтому носителей ВИЧ желательно проверять на наличие CCR5 d32. 3. "Ложные" мишени для ВИЧ - идея хорошая. Но сложная. 4. При СПИДе ничего уничтожать (проводить химиотерапию) не нужно. Всё уже уничтожено.
|
бутанол Постоянный участник Новосибирск |
3. как показывают наши наблюдения в реальной жизни эритроциты и являются ложными мишеними для ряда вирусов т.е. если эритроциты будут адсорбировать на себе еще и ВИЧ то это скорее всего будет работать другой вопрос как этого добиться сделать фьюжн какого-нибудь лектина с рецептором, или нацепить на вирус гриппа/болени ньюкасла ... или in vitro заставить эритробласты экспрессировать CCR5 и ввести их обратно в костный мозг? Нам на реализацию таких исследований грант не дадут т.к. рылом не вышли может кто-нибудь займется? Пока мы безуспешно пытались получить денег у РФФИ некий американец уже высказал аналогичную идею и она вошла в топ-10 какого-то рейтинга научных идей. |
genseq Постоянный участник |
Сообщение было отредактировано genseq - 15.10.2014 18:58 |
genseq Постоянный участник |
Файл/ы:
|
-Vald- Постоянный участник Питер.. |
|
genseq Постоянный участник |
(-Vald- @ 30.10.2014 07:44) Насколько я знаю - еще никто не выполнял аллоТКМ при радиационных поражениях. Опыты на приматах показывают, что для лечения костномозговой формы ОЛБ достаточно интенсивной терапии и факторов роста - результаты не хуже, чем при аутоТКМ. В Санкт-Петербурге ТКМ при радиационных поражениях проводят в ФГБУ ВЦЭРМ им.А.М.Никифорова МЧС России: ВЦЭРМ был образован на основании распоряжения правительства Российской Федерации от 14 марта 1997 года № 352-р и стал правопреемником созданного в 1991 году Всероссийского центра экологической медицины - головной организации по оказанию медицинской помощи участникам ликвидации последствий аварии на Чернобыльской АЭС и лицам, переселенным из радиоактивно загрязненных районов России. |
-Vald- Постоянный участник Питер.. |
|
genseq Постоянный участник |
Сообщение было отредактировано genseq - 07.11.2014 21:11 Файл/ы:
|
genseq Постоянный участник |
Сообщение было отредактировано genseq - 13.11.2014 15:45 |
genseq Постоянный участник |
Файл/ы:
|
LMP Постоянный участник |
Файл/ы:
|
genseq Постоянный участник |
(LMP @ 10.02.2015 10:56) Судя по данным, приведённым в диссертации, на популяционном уровне защитное влияние CCR5del32 на ВИЧ-инфекцию отсутствует. Гомозиготных носителей маловато, а восприимчивость у гетерозиготных носителей понижена незначительно. Спасибо за аттач. Содержит неплохую подборку ссылок. Правда, собственная выборка протестированных на CCR5del32 слишком мала для того, чтобы делать какие-либо заключения. И почему-то не упоминается И.А. Кофиади, защитивший в 2008 году кандидатскую диссертацию на тему "ГЕНЕТИЧЕСКАЯ УСТОЙЧИВОСТЬ К ЗАРАЖЕНИЮ ВИЧ И РАЗВИТИЮ СПИД В ПОПУЛЯЦИЯХ РОССИИ И СОПРЕДЕЛЬНЫХ ГОСУДАРСТВ". Кстати, о Кофиади. С помощью разработанной им тест-системы на прошлой неделе в регистре доноров ГСК Челябинской станции переливания крови проверили 89 доноров. Нашли 8 гетерозиготных и одного гомозиготного по CCR5del32. Пустячок, а приятно. Лёд тронулся! Сообщение было отредактировано genseq - 10.02.2015 19:40
|
genseq Постоянный участник |
Наверное, осенью процесс пойдёт веселее. ЗАО "ДНК Технология" начнёт проводить NGS HLA-типирование.
|
avial Постоянный участник |
|
genseq Постоянный участник |
(avial @ 01.06.2015 12:26) Вы правы. Освоили они эту тест-систему давно. Давно и зарегистрировали, причём с самого начала я ввёл в неё праймеры на CCRd32 для контроля ПЦР. Недавно они написали инструкцию, в которой упор делается не столько на CMV, сколько на ВИЧ-резистентность. Предлагал в прошлом году А.Н.Тороповскому провести регистрацию Вашей тест-системы на CCR5d32 (Real-time PCR). Если не сделает, то "ДНК Технология" его опередит. Челябинцы уже работают на их незарегистрированной тест-системе. |
avial Постоянный участник |
|
vladimirchi Постоянный участник |
|
genseq Постоянный участник |
(vladimirchi @ 17.07.2015 13:05) Через 10 лет после пересадки ГСК (гемопоэтических стволовых клеток) умирают около 40% реципиентов. Это примерно соответствует смертности от СПИДа носителей ВИЧ после инфицирования. После этого периода смертность у реципиентов трансплантации ГСК не отличается от среднестатистической для здоровых людей, причём при хорошем подборе доноров выживаемость может быть и выше. Что касается ВИЧ-инфицированных, то у них шансов выздороветь нет и в отдалённой перспективе. Статистические данные по трансптлантации ГСК можете найти здесь:
|
genseq Постоянный участник |
Вероятность смертельного исхода в течение первых 100 дней после трансплантации от совместимого неродственного донора составляет 15-20%. |
-Ъ- Постоянный участник Москва |
(genseq @ 29.05.2015 09:07) Тем временем ООО "ГенЛаб" освоило производство тест-системы для обнаружения цитомегаловируса с одновременным определением ВИЧ-резистентности (CCR5d32). Неуемная страсть "твоих девушек" к мультикам доведет тебя до творческого бессилия. Нельзя пихать в одну пробирку системы с исходно неопределенной копийностью, т.е. CMV может оказаться в реакции на порядки выше и может подавить другую основную реакцию. В образце с обнаруженным CMV, кстати, нет доказательства того что это гетерозигота, тем паче что легкая полоса выглядит сопливо . |
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
(-Ъ- @ 20.07.2015 14:06) Неуемная страсть "твоих девушек" к мультикам доведет тебя до творческого бессилия. Нельзя пихать в одну пробирку системы с исходно неопределенной копийностью, т.е. CMV может оказаться в реакции на порядки выше и может подавить другую основную реакцию. В образце с обнаруженным CMV, кстати, нет доказательства того что это гетерозигота, тем паче что легкая полоса выглядит сопливо . Тогда нижняя полоска просто исчезнет с геля, и никакой лжи не выявиццо. К тому же, что-то мне подсказывает, что наблюдаемая разница в копийности в этом простом мультиплексе учтена уже. К фиолетовой ремарке вообще лучше воздержусь от комментов. С обнаруженным CMV полоса предельно ясна любому неслепому человеку. Поздравляю камрада генсека с популяризацией такого простого и полезного кита и желаю всяческих успехов в его внедрении в скрининге.
|
genseq Постоянный участник |
(-Ъ- @ 20.07.2015 12:06) Неуемная страсть "твоих девушек" к мультикам доведет тебя до творческого бессилия. Нельзя пихать в одну пробирку системы с исходно неопределенной копийностью, т.е. CMV может оказаться в реакции на порядки выше и может подавить другую основную реакцию. В образце с обнаруженным CMV, кстати, нет доказательства того что это гетерозигота, тем паче что легкая полоса выглядит сопливо . Подавление амплификации одних фрагментов другими в "мультиках" устраняется ограничением количества праймеров. Такое ограничение полезно и для устранения деградации ампликонов при избыточном термоциклировании. Лёгкая полоса выглядит сопливо из-за того, что гетерозиготы (как установил ещё Мендель) при гибридизации ампликонов "расщепляются" не на два фрагмента, а на три (AA+2AB+BB). При этом подвижность гибридных ампликонов (2AB) примерно совпадает с подвижностью крупных фрагментов (AA). Это повышает жирность полосы с крупными ампликонами (AA+2AB) и придаёт "сопливый" вид мелкому фрагменту (BB). Но у гомозиготных носителей CCR5d32 (ВИЧ-резистентных) мелкий фрагмент выглядит довольно упитанно.
|
genseq Постоянный участник |
Файл/ы:
|
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
Но однако Вы все равно попытались, а то что летальность 100% при жизни 5-15 лет на антиретровирусных ингибиторах - хуже чем 40% при пожизненном приеме цитостатиков (последнее и есть очевидная причина отказа - придется переделивать рынок отдавая доход антиретровирусной фармы в пользу цитостатической фармы, и то и другое - крайне дорогие препараты при протаскивании на рынок, отсюда и непонимание Вашего письма в контексте всего происходящего) - то не Ваша вина. |
genseq Постоянный участник |
************************************************************ Пнд, 26 Окт 2015 10:30 Обращение в интернет-приёмную От: Официальный сайт министерства здравоохранения РФ <noreply@rosminzdrav.ru> Здравствуйте. 26 октября 2015 г. в 07:30 Вы подали обращение в Министерство здравоохранения России через официальный сайт Министерства. Текст обращения: На последнем заседании Правительственной комиссии по вопросам охраны здоровья граждан (23.10.2015 г.) Председатель Правительства Д.А.Медведев дал поручение Минздраву подготовить к ноябрю следующего года государственную стратегию противодействия распространению ВИЧ-инфекции. На состоявшемся после заседания брифинге В.И.Скворцова упомянула о некоторых пионерских направлениях лечения ВИЧ, которые развиваются в нескольких наших институтах. В связи с этим хочу обратить внимание руководства Минздрава и лично В.И.Скворцовой на хорошо известный вариант лечения ВИЧ, которым не занимаются ни в одном из наших институтов – на трансплантацию ВИЧ-резистентных гемопоэтических стволовых клеток. Для внедрения такого лечения необходимо создать регистр ВИЧ-резистентных доноров и организовать проведение клинических испытаний. Широкомасштабный поиск ВИЧ-резистентных доноров ГСК налажен в Германии. В этом году HLA-типирование с тестированием ВИЧ-резистентности начали проводить в Великобритании. Клинические испытания трансплантационного лечения ВИЧ в этом году начаты в США. Прошу рассмотреть возможность включения трансплантационного лечения ВИЧ в разрабатываемую Минздравом государственную стратегию противодействия распространению ВИЧ-инфекции. Приложение: 1. Обзор «Перспективы создания регистра ВИЧ-резистентных доноров» (Биомика, 2014, Т.6, № 1, с.52-63): 2. Переписка с Главным внештатным специалистом Минздрава по проблемам диагностики и лечения ВИЧ-инфекции: 3. Переписка с руководителем ФМБА: Ваше обращение принято и будет рассмотрено. Благодарим Вас за использование официального сайта Министерства здравоохранения России! ________________________________________ Сообщение было отредактировано genseq - 26.10.2015 20:09
|
АстСергей Участник Уфа |
(genseq @ 01.03.2014 20:54) Трансплантация ВИЧ-резистентности - это вариант лечения СПИДа, имеющий пока единственное подтверждение ("Берлинский пациент"). Для внедрения такого лечения в России необходимо создать регистр ВИЧ-резистентных доноров гемопоэтических клеток. В обзоре рассматриваются возможности создания в России регистра ВИЧ-резистентных доноров, необходимого для трансплантационного лечения СПИДа. Буду признателен за любые замечания и предложения: --Дело хорошее, эту технологию я разработал ещё в 2006 году.. в 2010 - был случай смены (Австралия) резус-фактора при пересадки печени у ребёнка. Дело в том,что можно лечить множество генетических аббераций и ВИЧ -это просто хорошая - проходная тема. если бы наше правительство выделило процентов 10 к той сумме что сейчас выделяется на ВИЧ лекарства - мы могли бы иметь уникальные генетические клиники.. о которых я мечтаю уже 5 лет .. |
АстСергей Участник Уфа |
(Агроном @ 03.03.2014 10:37) А еще, если не ошибаюсь, будут "сюрпризы" в виде необходимости убить все кроветворные клетки реципиента высокодозной лучевой и/или химиотерапией перед ТГСК, неслабая вероятность развития РТПХ (реакция трансплантат против хозяина), необходимость пожизненной иммуносупрессорной терапии... большой вопрос, дольше ли проживут пациенты с ВИЧ, если их не трогать и если им провести трансплантацию. Отвечая на вопрос в заголовке темы, наверное таки ещё рано! вы правильно думаете ,но,тут есть выход без этого эшафотного варианта.... |
KCN Постоянный участник Київ. Україна понад усе! / DELETED |
P.S. Свиньи с главным комплексом гистосовместимости от человека, получены путем генной инженерии, в Польше. Живут, размножаются, и являются донорами органов. Почему бы не сделать их донорами лимфоидного ростка? |
АстСергей Участник Уфа |
(genseq @ 29.05.2015 11:07) Тем временем ООО "ГенЛаб" освоило производство тест-системы для обнаружения цитомегаловируса с одновременным определением ВИЧ-резистентности (CCR5d32). думаю там могут быть и более тонкие различия в секвенсе.. посему, это - потенциальные на %% -80-90 доноры.. |
АстСергей Участник Уфа |
(vladimirchi @ 17.07.2015 18:05) в случае ВИЧ инфицированных, при удачном исходе чуть хуже чем у обычных реципиентов - а в случае неудачи - гораздо хуже.. |
NMR-guy Постоянный участник временной жизни |
|
genseq Постоянный участник |
|
АстСергей Участник Уфа |
(genseq @ 29.10.2015 16:21) может не появиться резистентность ..вот что.. или вы действительно хотите уничтожить собственный КМ пациента ? Сообщение было отредактировано АстСергей - 29.10.2015 15:05 |
LMP Постоянный участник |
(KCN @ 28.10.2015 12:25) Свиньи ВИЧ не болеют. Свиньи с главным комплексом гистосовместимости от человека, получены путем генной инженерии, в Польше. Живут, размножаются, и являются донорами органов. наверное потому, что не полностью изучены на предмет потенциально опасных инфекций для человека. Вот пример. Почему бы не сделать их донорами лимфоидного ростка? Файл/ы:
|
АстСергей Участник Уфа |
|
Erzgebirge |
(genseq @ 01.03.2014 18:54) Трансплантация ВИЧ-резистентности - это вариант лечения СПИДа, имеющий пока единственное подтверждение ("Берлинский пациент"). Для внедрения такого лечения в России необходимо создать регистр ВИЧ-резистентных доноров гемопоэтических клеток. В обзоре рассматриваются возможности создания в России регистра ВИЧ-резистентных доноров, необходимого для трансплантационного лечения СПИДа. Буду признателен за любые замечания и предложения: |
бутанол Постоянный участник Новосибирск |
(KCN @ 28.10.2015 12:25) Свиньи ВИЧ не болеют. Вопрос в том, можно ли человеку , после обработки радиацией или иммуносупрессорами, пересадить лимфоидный росток от свиньи? Органы ведь пересаживают. Не будет ли реакции ТПХ? P.S. Свиньи с главным комплексом гистосовместимости от человека, получены путем генной инженерии, в Польше. Живут, размножаются, и являются донорами органов. Почему бы не сделать их донорами лимфоидного ростка? как мило. помню мы с одним ИЦИГовцем написали статейку насчет возможности формирования гибридных вирусных частиц человеческих и свинных ретровирусов...Потом англичане это дело подтвердили.... Зато ветеринарам начнут давать деньги на профилактику ВИЧ у свиней..Я за |
genseq Постоянный участник |
Опять отписка. Вместе с этой набралось уже шесть отписок: 1. Минобороны - 2 шт. 2. Главный внештатный специалист Минздрава по ВИЧ - 1 шт. 3. ФМБА - 2 шт.
4. КНИИГиПК - 1 шт.
Это не считая отрицательного отзыва на обзор, который я пытался в прошлом году пристроить в журнал "Трансфузиология": Кого бы ещё "пободать", прежде чем выходить на Госдуму, Правительство и ВВП? Сообщение было отредактировано genseq - 26.11.2015 23:02 |
пацанчег IP-штамп: fr/2vgaPctBqw гость |
это при социализме помогало. а сейчас - если рынки поделены, то никто против сил бигфармы не попрет кроме самой бигфармы. но так как бигфарма вся заклеена своими и чужими патентами, то у Вас либо это тихо отожмут за 1-2% прибыли роялти по своему (НЕ Вашему) патенту, либо просто сделают вид что это неперспективно и отмахнутся как от комара. |
genseq Постоянный участник |
Москву в честь праздника подсветят красным цветом: За прошедшие годы СПИД стал намного демократичнее. Он больше не считается болезнью наркоманов, проституток и гомосексуалистов: Одновременно с этим отмечает свой день рождения партия "Единая Россия". С праздником!
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |