Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Результаты поиска -- Найденные сообщения --

страницы (7):  1 2 3 > » 

pNOM123 и pMCB32
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 24.02.2010 01:02  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1015596  |  Ответов: 0  |  Просмотров: 1 581
Уважаемые коллеги!

Кто-нибудь использует pNOM123 и/или pMCB32? Не найдется ли карты и последовательности.

Благодарю! smile.gif

Как сделать липкие концы - тупыми?
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 18.07.2008 14:17  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #708902  |  Ответов: 28  |  Просмотров: 7 527
Возьмите PFU полимеразу. 30 минут на 72.

Sequence-specific amplification polymorphism
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 08.02.2007 14:57  |  Научный языкНаучный язык  |  link: #461675  |  Ответов: 2  |  Просмотров: 3 172
:) Мысль хорошая, но это надо было для проекта на трех листах - больно-то не разбежишься :) Написала в прямом переводе, авось прокатит.

Исчесзновение праймер-димеров
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 08.02.2007 14:21  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #461647  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 2 413
Мне кажется это не тот случай, ДНК работает в другими праймерами. Трудно представить, что именно с этой парой реакция каким-то образом ингибирована, ведь все реактивы те же, за исключением собственно праймеров.

Может все можно объяснить тем, что в образцах, которые не дают положительный сигнал, все же есть некие участки на которые отжигаются праймеры - это препятствует образованию димеров? С другой стороны, димеров не было бы и в положительных реакциях...

Бррр!

Исчесзновение праймер-димеров
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 08.02.2007 14:14  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #461640  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 2 413
Все правильно! По логике димер должен быть везде. Ставила уже дополнительно два раза! :| Даже взяла совсем левую ДНК на которой не должно ничего получаться - та же картина, в воде и положительных реакциях есть банд, на других ДНК - нет...

Самая дурота, что не обратила на это внимания с самого начала, теперь не знаю как отмазываться... :/ Почему димер? Я не уверена, но так утверждает тот, кто требует объяснений. Можно предположить, что это остатки праймеров, но суть дела от этого не меняется. Куда-то делись праймеры... Куда?

Исчесзновение праймер-димеров
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 08.02.2007 13:55  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #461629  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 2 413
Что значит "реакия польностью ингибирована"? Образование димеровтоже каким-то образом ингибировано или что? И как это может быть?

Кроме того с других праймеров абсолютно ВСЯ ДНК работает.

Исчесзновение праймер-димеров
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 08.02.2007 13:26  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #461606  |  Ответов: 6  |  Просмотров: 2 413
Ситуация такова. После ПЦР реакции на электрофорезе видны праймер-димеры в реакциях, которые дали положительный результат, и в негативном контроле (вода). Однако, там, где не прошла реакция, праймер-димеров нет. Даже самих праймеров не видно :|. Ну, в некоторых дорожках есть слабый намек на присутствие димера. Нанесен одинаковый объем реакций.

Как это можно объяснить? Помогите!

Sequence-specific amplification polymorphism
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 25.01.2007 08:34  |  Научный языкНаучный язык  |  link: #454433  |  Ответов: 2  |  Просмотров: 3 172
Помогите, пожалуйста, с переводом: sequence-specific amplification polymorphism, в русскоязычной литературе не встречается :|

Можно ли в лоб, что-нибудь типа - сиквенс-специфичный амплификационный полиморфизм, или все-таки как-то помягче надо...

Заранее, СПАСИБО!

Выделение плазмидной ДНК
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 10.01.2007 08:40  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #447323  |  Ответов: 12  |  Просмотров: 2 773
С Промегой у меня такие же проблемы были, причем и с китом для чистки плазмиды, и с китом для чистки ПЦР продуктов. Попробуйте киаджиновский кит smile.gif

Обязательно читать с плазмиды? Я обычно получаю пцр-ный продукт с универсальных праймеров, который потом и читаю. Почти всегда получается на ура.

семейства Bombycidae
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 19.09.2006 07:03  |  Оборудование и материалОборудование и материал  |  link: #396673  |  Ответов: 4  |  Просмотров: 3 240
Спасибо smile.gif

семейства Bombycidae
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 18.09.2006 09:36  |  Оборудование и материалОборудование и материал  |  link: #396330  |  Ответов: 4  |  Просмотров: 3 240
нет, я из Новосибирска smile.gif

семейства Bombycidae
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 15.09.2006 11:07  |  Оборудование и материалОборудование и материал  |  link: #395435  |  Ответов: 4  |  Просмотров: 3 240
Уважаемые коллеги!

Очень нужен материал (ДНК или кусочек для выделения ДНК - лапка, голова) бабочек семейства Bombycidae и/или представителей надсемейства Bombycoidea.

Помогите, если есть возможность.
Заранее спасибо! mol.gif

Время расхождения
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 22.06.2006 05:21  |  Классификация насекомыхКлассификация насекомых  |  link: #346668  |  Ответов: 2  |  Просмотров: 2 863
Спасибо большое, попробую найти... smile.gif

Опрос: билет без визы
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 21.06.2006 10:39  |  США и КанадаСША и Канада  |  link: #346001  |  Ответов: 10  |  Просмотров: 4 347
Купить можно, в некоторых случаях для оформления визы его даже НУЖНО купить и предоставить со всеми документами. Да, маленький нюанс - надо чтобы паспорт был на руках...

Где лучше купить? Там, где продают smile.gif На счет - подешевле, не знаю, мне кажется они, по большому счету, везде одинаково стоят.

Время расхождения
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 21.06.2006 10:16  |  Классификация насекомыхКлассификация насекомых  |  link: #345991  |  Ответов: 2  |  Просмотров: 2 863
Уважаемые коллеги!

mol.gif

Помогите, пожалуйста, найти хоть какую-нибудь информацию о времени расхождения бабочек Papilionoidea и Bombycoidea.

Заранее спасибо за помощь!

ПЦР
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 15.06.2006 14:12  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #343257  |  Ответов: 24  |  Просмотров: 4 469
Делала single cell RT-PCR с рендом праймерами китом от Invitrogen все работало отлично.

Reverse transcription
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 21.12.2005 15:21  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #253928  |  Ответов: 2  |  Просмотров: 1 970
всегда делаю кДНК для qPCR с рендом праймеров

Reactome - a knowledgebase of biological processes
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 05.11.2005 13:45  |  Web-ресурсыWeb-ресурсы  |  link: #234219  |  Ответов: 1  |  Просмотров: 11 320
Reactome is a curated database of biological processes in humans. It covers biological pathways ranging from the basic processes of metabolism to high-level processes such as hormonal signalling. While Reactome is targeted at human pathways, it also includes many individual biochemical reactions from non-human systems such as rat, mouse, fugu fish and zebra fish. This makes the database relevant to the large number of researchers who work on model organisms. All the information in Reactome is backed up by its provenance: either a literature citation or an electronic inference based on sequence similarity. Our ontology ensures that the various events are linked in an appropriate spatial and temporal context.

The basic information in Reactome is provided by bench biologists who are experts in that domain of biology. The information is then managed and edited by the Reactome staff at CSHL and the EBI, and entered into a relational database. They are then reviewed by other biological researchers for consistency and accuracy. Following peer-review, the information is published to the web.

Reactome supersedes an earlier project called The Genome Knowledgebase and incorporates all the information previously available in its predecessor. Reactome sports a radically redesigned user interface in which the entire set of human pathways known to the database are represented as a series of constellations in a "starry sky." The starry sky can be used to navigate through the universe of human reactions and is invaluable to visualize connections between pathways, some of which will be surprising to biologists who are not familiar with pathways outside their domain of research.
/ Web-ресурсы,  #54178  /
Область: Свойства ферментов, Справочная информация, поиск, Другое (мол. биология), Химия
Язык и уровень: Специальный (анг)

Переосаждение
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 22.09.2005 19:44  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #214704  |  Ответов: 19  |  Просмотров: 4 697
значится так:

1. гель не грела, размораживала при комнатной температуре
2. продукт - не повтор

растворы готовы, продукт тоже, завтра будет часть номер два smile.gif

хотя необходимость отпала, так как купили кучу GelOut.... :D

руки оторвала, так что теперь в институте на одного безрукого больше стало
mad.gif

Переосаждение
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 22.09.2005 12:08  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #214418  |  Ответов: 19  |  Просмотров: 4 697
в общем дело ясное, что дело темное smile.gif))

to AVP спасибо за Вашу отзывчивость,

специально для Вас повторю форез еще раз как только найду того, кто электрод выдернул и оторву руки :D

растворы готовлю...
прогоню еще в крутой агарозе...

продолжение следует wink.gif

Переосаждение
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 22.09.2005 10:39  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #214382  |  Ответов: 19  |  Просмотров: 4 697
давайте попробуем поговорить без млинов....

1. да, МНЕ трудно было прогнать нормальный форез - и даже не буду пытаться объяснить в чем причина, если бы было нетрудно, то был бы нормальным... маркер фих174 DNA/BsuRI, фрагмент должен быть чуть больше 700 bp

2. метод заключается в следующем - кусочек агарозы замораживается, оттаивается, фугуется раз, супернатант отбирается в другую пробирку, фугуется два - готово....

3. после переосаждения был небольшой белый осадок, который полностью растворился в воде

хотите сказать, что дело в остатках агарозы???

интересное влияние остатков агарозы smile.gif

Переосаждение
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 22.09.2005 09:57  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #214363  |  Ответов: 19  |  Просмотров: 4 697
да-да, что за эндонуклеаза так клево поработала???

8/

реагенты сменю .... попробую....

Переосаждение
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 21.09.2005 19:36  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #214154  |  Ответов: 19  |  Просмотров: 4 697
Уважаемые, коллеги. Помогите разобраться со следующим странным явлением - ПЦР-ный продукт длиной около 700 bp был выделен из геля несколькими способами:
1. выделение из геля китом GelOut - 1-5 старты
2. замарозка-разморозка геля + переосаждение - 6-8 старты
3. размарозка-размарозка - 9, 10 старты

[0 - маркер длины]

После первых двух методов картинка осталась прежней - один продукт 700 bp.
Однако при очистке с переосаждением появился еще один банд

Pogovorim s Bogom....
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 21.09.2005 15:13  |  БеседаБеседа  |  link: #213996  |  Ответов: 20  |  Просмотров: 4 370
........и поет..........

Найти в сиквенсе plac и lacz
Egil
Постоянный участник


Отправлено: 21.09.2005 15:10  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #213993  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 2 797
найдите сиквенс плазмиды в базе данных - их куча всяких разных, где эти гены указаны.... Что за плазмида-то???
страницы (7):  1 2 3 > »  

Новые сообщения  Есть новые сообщения
Нет новых сообщений  Нет новых сообщений
Нет новых сообщений*  Тема с вашим участием
Горячая тема - новые сообщения  Горячая тема (есть новые сообщений)
Горячая тема - нет новых сообщений  Горячая тема (нет новых сообщений)
Важно - нет новых сообщений  Важная тема
Опрос - есть новые голоса  Опрос — есть новые голоса
Опрос - нет новых голосов  Опрос — нет новых голосов
Опрос -нет новых голосов  Опрос с вашим участием
Объявление  Объявление
Тема закрыта  Закрытая тема
Тема перемещена  Перемещённая тема


Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 29.02.20 00:38
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft