Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
В клиническом исследовании SRP-9001 приняли участие четыре пациента — мальчики 4–7 лет. Препарат вводился пациентам однократно, внутривенно. Биопсии мышечных тканей пациентов забирали до начала исследования и через 90 дней после введения препарата. Ученые использовали их для гистологического анализа, а также для проверки экспрессии микродистрофина методом иммуноблоттинга. Серьезных побочных эффектов от введения препарата не наблюдалось. После инфузии SRP-9001 в мышцах детектировался микродистрофин. На основе анализа биопсий авторы делают вывод, что введение гена микродистрофина приводит к восстановлению функций белкового комплекса, ассоциированного с дистрофином. Динамику мышечной функции пациентов оценивали по шкале NSAA. Через год после введения препарата у всех мальчиков наблюдались улучшения моторики. У пациентов также детектировалось значительное снижение уровня креатинкиназы в крови. Данная работа послужила основанием для дальнейших испытаний SRP-9001 на большей выборке больных. В настоящее время проходит рандомизированное плацебо-контролируемое исследование препарата с участием 41 пациента. «На данный момент миодистрофия Дюшенна остается смертельной болезнью, и, как правило, пациенты не живут дольше 20–30 лет. Это заболевание сложно лечить, и генная терапия предоставляет нам долгожданные возможности постараться изменить течение этой болезни», — говорит доктор Джерри Мендел, первый автор статьи и главный исследователь Центра генной терапии при Общенациональной детской больнице. Подробнее со ссылкой на статью: |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Вышла статья «The ‘biomineralization toolkit’ and the origin of animal skeletons», которую, как я полагал, Александр Марков осветит в Элементах. В статье рассматривается гипотеза ‘biomineralization toolkit’, согласно которой хотя скелеты во многих группах животных возникли от бесскелетных форм независимо, в их основе лежит общий набор неких генов и некий органический каркас для будущего минерального скелета. В этой статье мне понравилась схема эволюции неорганического скелета, на которой показаны разный минеральный состав. Кремневые скелеты встречаются у низших многоклеточных и, по-видимому, являются одними из древнейших, однако потом полностью утрачивают актуальность. Обогащенные магнием кальциты почти не встречаются в более молодых группах. А вот фосфатные и арагонитовые скелеты – «хиты скелетной эволюции». |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Хотя происхождение митохондрий от альфа-протеобактерий считается общепризнанным, детали филогенетической связи митохондрий и современных альфа-протеобактерий остаются не до конца понятными. В новом исследовании показано, что предки митохондрий являются обособленной ветвью в эволюционном дереве альфа-протеобактерий. Они разделяют общего предка с риккетсиями, а также с пока еще не описанными группами морских альфа-протеобактерий. Чтобы проверить, насколько исключение из анализа быстро эволюционирующих последовательностей исказило результаты предыдущих исследований происхождения митохондрий, ученые применили несколько альтернативных биоинформатических подходов. Чтобы избавиться от «филогенетического шума», неизбежно возникающего при исследовании эволюции далеких групп организмов, авторы систематически исключали из последовательных процедур анализа геномов некоторые таксоны, на каждом этапе сохраняя информацию о выявленных заменах во всех областях. Результаты нового, более глубокого и детального анализа подтвердили, что предки митохондрий относятся к альфа-протеобактериям. Наиболее близки к митохондриальным предшественникам бактерии группы Rickettsiales. Кроме того, включение в анализ метагеномных данных выявило близких родственников митохондрий среди пока еще не описанных морских альфа-протеобактерий, известных по метагеномному анализу. Подробнее и ссылка на оригенальную статью: |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Из плазмы мышей ученые выделили белок, уровень которого повышался при физической активности. Это гликозилфосфатидилинозитол (GPI)-специфическая фосфолипаза Di (Gpld1), фермент, образующийся в печени. В крови тренированных мышей его концентрация была выше, чем в крови нетренированных. Ученые обнаружили корреляцию между концентрацией Gpld1 в плазме мышей и улучшением выполнения тестов на обучение и память. Содержание Gpld1 в плазме старых мышей удалось повысить введением соответствующего гена, это привело к стимуляции нейрогенеза и к улучшению выполнения тестов на обучение и память. Более того, у активных пожилых людей уровень Gpld1 в плазме также оказался выше, чем у пожилых людей, ведущих неактивный образ жизни.
По-видимому, Gpld1— это тот самый циркулирующий в крови фактор, который опосредует эффект физической активности на работу гиппокампа в пожилом мозге. Вместе с тем, его уровень повышался в крови, а не в мозге, так как Gpld1 не проходит через гематоэнцефалический барьер. Биологическая роль Gpld1 не вполне ясна, но было показано, что он участвует в нескольких сигнальных путях, вовлеченных в важные биологические процессы. Ученые считают, что нашли связующее звено между печенью и мозгом, которое передает последнему эффект физических упражнений. Из этой работы возникает очень интересное предположение, что можно имитировать эффект физической активности с помощью лекарства. «Мы всегда убеждаем людей больше заниматься физическими упражнениями, но далеко не каждый способен это делать, — говорит молекулярный биолог из Принстонского университета Колин Мёрфи, изучающий вопросы старения. — Возможность вместо этого принять таблетку выглядит очень заманчиво». |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Ученые из Канады открыли новую функцию РНК-полимеразы II: она участвует в регуляции биогенеза рибосом.
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Редакторы цитозина, созданные путем слияния дезаминазы с никазой Cas9, считаются более точным инструментом для устранения точечных мутаций, чем программируемое редактирование генома с помощью введения двуцепочечных разрывов при помощи Cas9 и последующей репарации. Однако все редакторы такого рода имеют общий существенный недостаток: они модифицируют все остатки цитозина, которые находятся в зоне их действия, а не только один остаток, который требуется. Особенно сложны для изменения с помощью редактора цитозиновых оснований последовательности, в которых таргетный цитозин соседствует с другим цитозином (5’-CC-3’) — все существующие редакторы цитозиновых оснований превратят в тимин оба. В то же время, около 38% патогенных однонуклеотидных полиморфизмов человека связаны с заменой T на C (в результате замены получается последовательность CC), поэтому создание высокоточных редакторов цитозиновых оснований необходимо. В статье, опубликованной в Science Advances, сообщается о создании нового высокоточного редактора цитозиновых оснований, который даже в последовательности 5’-CC-3’ модифицирует не оба цитозина, а лишь тот, который расположен ближе к 3’-концу. Точность редактора повышена за счет использования дезаминазы APOBEC3G. Подробнее: По ссылке возможно обсуждение. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Исследователи из Национальных институтов здравоохранения, США, показали, что белок оболочки человеческого эндогенного ретровируса регулирует дифференцировку стволовых клеток в нейроны.
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Международная группа под руководством вирусолога Терри Джонса из Института вирусологии клинического центра Шарите (Берлин) и палеогенетика Мартина Сикоры из университета Копенгагена вместе с Барбарой Мюлеман из Шарите провела поиск древних геномов вируса оспы. В исследовании приняли участие российские ученые — сотрудники НИИ и музея антропологии МГУ, истфака МГУ и Музея антропологии и этнографии им. Петра Великого (Санкт-Петербург). «Когда мы узнаем, как болезнь мутировала во времени, это дает нам возможность составить каталог мутаций, которые могут появиться в будущем: какие мутации и их комбинации делают такой патоген жизнеспособным и успешным? Если у них были эти мутации в прошлом, они, скорее всего, могут получить их снова. (…) Это один из немногих примеров, когда древние генетические исследования имеют прямое значение для современного и будущего здравоохранения», — говорит Мартин Сикора. Оспа побеждена, но в природе существуют родственные вирусы. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
«Тот факт, что мы наблюдали очень высокий уровень воспроизводимости анатомических половых различий в разных группах мужчин и женщин, а также связь между этими различиями и экспрессией генов половых хромосом, предполагает, что эти различия, вероятно, не являются результатом одних только воздействий окружающей среды», — говорит доктор Армин Разнанан, руководитель отдела нейрогеномики развития NIMH и один из авторов работы. Вклад этих различий в особенности мышления, поведения, психического здоровья у того и другого пола еще предстоит исследовать, отмечается в статье. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
В ходе исследования, проведенного в 2000–2003 гг. было показано, что дети в палестинской популяции почти в 7 раз чаще страдают врожденной или ранней глухотой, чем дети еврейского происхождения в Иерусалиме. При этом в Палестине все еще распространены близкородственные браки (таковыми можно считать 24% от всех браков, заключенных с 2005 по 2009 годы). В новой работе ученые описали генетические факторы наследственной потери слуха и связали их с близкородственными браками.
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Авторы исследования продемонстрировали, что уровень экспрессии гена TLK2 во многих видах раковых клеток человека положительно связан с уровнем хромосомной нестабильности, однако отрицательно связан с активностью сигнальных путей, которые задействованы в работе врожденного и приобретенного иммунитета. Поскольку хромосомная нестабильность и альтернативное удлинение хромосом запускают сигнальные пути иммунной защиты, высокие уровни TLK ослабляют распознавание злокачественных клеток иммунитетом. Таким образом, ингибирование TLK-киназ может быть одним из новых подходов в онкотерапии. Источник Sandra Segura-Bayona et al. // Tousled-Like Kinases Suppress Innate Immune Signaling Triggered by Alternative Lengthening of Telomeres // Cell Reports, Vol. 32, No. 5, 2020. DOI: 10.1016/j.celrep.2020.107983 |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Замечание к данной статье: |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Coral reefs get their genetic revolution Using genetic tools, it's now possible to predict which corals will survive bleaching events. Lucy Marita Jakub Scientists have concocted many schemes to save coral reefs from climate change. Assisted migration. Selective breeding. Manipulating the coral microbiome. Many of these conservation techniques are risky and unproven, but the stakes are high; the United Nations Intergovernmental Panel on Climate Change predicts that with a 2˚C increase in global temperatures, 99 percent of corals will be lost to bleaching. "We are desperate," Mónica Medina, a coral reef biologist at Penn State University, told EHN. There's a glimmer of good news. A new study published yesterday in Science offers a new roadmap for coral conservation using the tools that have revolutionized our understanding of the human genome. With cutting-edge genetics, it's now possible to predict which corals will bleach and which ones won't. "That's a great asset to conservation efforts," Stephen Palumbi, a coral reef biologist at Stanford University who was not involved with the study, told EHN. The effort is a fruitful symbiosis between population geneticists and coral biologists. Marine heatwaves devastate reefs, causing coral polyps to eject the symbiotic algae that live within their tissues. Without their photosynthesizing tenants to make sugars and nutrients, the polyps starve. But some corals can weather the heat, and hold onto their symbionts—a trait that turns out to be largely heritable. By propagating branches from these survivors it's possible to selectively breed heat tolerant individuals, and use them to repopulate reefs. This strategy has an obvious drawback: we only know which corals are hardy after everything else dies. But if you can screen for that adaptation in a coral's genome, "you don't have to wait for mass bleaching events to reveal these tolerant corals," Zachary Fuller, a population geneticist at Columbia University and lead author of the study, told EHN. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Один из привлекательных подходов к генной терапии — использование каталитически неактивного dCas9, слитого с активатором транскрипции (dCas9-VPR); такая конструкция, нацеленная на неактивный ген, «включает» его. У многих генов, ассоциированных с заболеваниями, есть гомологи, которые выполняют сходные функции, но экспрессируются в клетках другого типа. Активация транскрипции такого гена может скомпенсировать заболевание. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Авторы работы показали, что помимо индивидуальных особенностей спермы и слизи, важную роль в успешном оплодотворении играет именно удачная комбинация слизи и спермы. Иными словами, влияние слизи одной и той же женщины на свойства сперматозоидов от разных партнеров существенно различается. В тех случаях, когда варианты HLA у мужчины и женщины совпадают, подвижность сперматозоидов в слизи меньше, чем у сперматозоидов иммуногенетически далекого мужчины. Впрочем, сила выраженности воздействия слизи зависит и от генотипа самого мужчины. В то же время степень генетических различий между партнерами на уровне целых генотипов не связана с подвижностью сперматозоидов в слизи. По этой причине, как полагают ученые, в ходе эволюции механизм посткоитальной регуляции эффективности оплодотворения возник не как способ защиты от инбридинга, а как путь для повышения иммуногенетического разнообразия потомства и, соответственно, для лучшей адаптации к различным патогенам. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Ученые подтвердили возможность детекции РНК-вирусов с помощью ДНК-нанопереключателей на вирусе Зика. Для экспериментов они использовали плазмиду pFLZIKV, содержащую полную последовательность генома вируса. РНК с плазмиды транскрибировалась in vitro. Так как длинная РНК вируса может образовывать вторичные структуры, снижающие вероятность ее связывания с нанопереключателем, авторы расщепили ее на фрагменты короче 200 нуклеотидов. Детекция фрагментированной РНК вируса Зика с помощью одного нанопереключателя прошла успешно. Ученые повысили чувствительность платформы, сконструировав множество нанопереключателей, каждый из которых распознавал свой участок вирусного генома. При использовании комбинации из 18 ДНК-переключателей система детектировала РНК вируса Зика в концентрации 2,1×106 копий в 10 мкл реакционной смеси. Специфичность платформы подтвердили на геномах вирусов Зика и денге. Было показано, что нанопереключатели, распознающие вирус Зика, не реагируют на вирус Денге, и наоборот. Авторы сконструировали нанопереключатели для детекции вирусов Зика и денге таким образом, что при связывании с мишенями они мигрировали в геле с разной скоростью. Это дало возможность одновременно выявлять присутствие РНК двух возбудителей в смеси. Далее ученые показали, что аналогичным образом можно дифференцировать штаммы одного возбудителя, например, штаммы вируса Зика из Камбоджи (FSS13025) и Уганды (MR766). Детекции РНК патогена в биологических жидкостях могут мешать нуклеазная активность и вариабельность вирусной нагрузки у пациентов. Для преодоления этих ограничений авторы предложили два подхода: дополнительная обработка клинических образцов для экстракции РНК или предварительная амплификация. Ученые имитировали инфицированные клинические образцы, смешивая частицы вируса Зика с человеческой мочой. Для проверки первого подхода они использовали коммерческие наборы для выделения РНК и добились чувствительности 1,7×105 копий вирусных геномов в 1 мл. Второй подход предполагает использование техники изотермической амплификации РНК NASBA. Эта техника позволила увеличить чувствительность метода до 102 копий/мл и сократить время анализа до пяти часов. Наконец, ученые показали, что с помощью ДНК-нанопереключателей и стратегии NASBA можно детектировать РНК SARS-CoV-2. Метод позволял обнаружить транскрибированную in vitro РНК нового коронавируса в человеческой слюне в минимальной концентрации 200 копий/мл. Авторы отмечают, что анализ с помощью ДНК-нанопереключателей не требует сложной лабораторной инфраструктуры, а потому имеет относительно низкую стоимость. Они утверждают, что процесс конструирования и очистки нанопереключателей быстрый и несложный: платформу можно адаптировать к новому вирусному патогену в течение одного-двух дней с момента получения последовательности-мишени, что позволит снизить экономический и демографический ущерб от эпидемии. Источник Lifeng Zhou, et al. // Programmable low-cost DNA-based platform for viral RNA detection. // Science Advances 21 Aug 2020: eabc6246; DOI: 10.1126/sciadv.abc6246 Очень интересный подход. Как всегда проблема выбора наиболее консервативного участка вируса, чтобы избежать зависимости от мутаций. Но это и ахиллесова пята метода. Консервативные участки могут совпадать у разных видов и изолятов вируса. Особенно это критично для вируса лихорадки денге. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
В нашей энциклопедии собрана информация о наиболее значимых вариациях человеческого генома, о генах, о связанных с ними признаках и болезнях. Все статьи имеют ссылки на публикации в научных журналах и курируются экспертами. Энциклопедия постоянно пополняется новыми данными. Генетическая энциклопедия "Генокарта" создана экспертами компании ООО "РуДжин", сотрудниками Новосибирского государственного университета, и авторами из научной и медицинской среды России. Редакция приглашает к сотрудничеству новых авторов. Приглашаем в команду проекта Новостного редактора, PR менеджера, Специалиста по продвижению в научном сообществе и Руководителя проекта. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
С помощью кластерного анализа ученые выявили в базе виромов более 33 тысяч вирусных популяций (общностей близкородственных вирусов). Среди них около 97,7% относились к бактериофагам, 2,1% составили вирусы эукариот, 0,1% — вирусы архей. В процессе анализа выяснилось, что метагеномные данные из различных исследований, связанных с одними и теми же болезнями, плохо сопоставимы, так как технические аспекты сильнее влияют на состав вирусных популяций, чем статус пациента. В результате кластеризуются вирусные популяции, полученные в исследованиях со схожей методологией, а не со схожими характеристиками пациентов. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Довольно интересная статья и новость, которая 2 недели назад по крайней мере у меня в ленте прошли незамеченными. Рыночная капитализация относительно небольшой биофармацевтической компании BioMarine Pharmaceuticals упала почти вдвое после того, как FDA отказалось одобрить заявку по препарату генной терапии для лечения гемофилии Valoctocogene Roxaparvovec (BMN 270). Один укол и необходимый фактор свертывания начинает вырабатываться сам. Самое интересное, что результаты-то получены хорошие и регулятор это признал. Но затребовал дополнительных данных по сохранению эффективности в течении еще пары лет. Да, сомнения в сохранении эффективности на долгом сроке определенные появились, но они вполне могли быть решены в ходе пострегистрационных исследований. Современные схемы лечения подразумевают регулярное введение довольно дорогого человеческого или рекомбинантного фактора свертывания VIII. Нет, я не думаю, что Валрокса будет дешевле, но тем не менее. Интересно, что Spark Therapeutics, дочка Roche, разрабатывает аналогичный препарат, но с некоторым опозданием. Вся история ставит по сомнения быстрое одобрение препаратов генной терапии, если препарат не является совсем уж орфанным-орфанным и лечить соответствующее заболевание практически нечем. В общем оптимизм по поводу генной терапии, конечно, никуда не делся, но существенно убавился |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Asgard |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
С ребятами BioMarine Pharmaceuticals я лично знаком. Я работал в обществе больных гемофилией и в курсе сколько тратиться на факторы. Операция по вводу гена фактора окупается за три года. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Откуда такая точность? Ошибка в количестве открытых рамок считывания больше, чем доверительный интервал при таком среднем. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
"Чистый дарвиновский подход, который опирается исключительно на генетические механизмы наследования, не может объяснить результаты наших экспериментов на дрожжах. Они указывают, что нужно объединить и генетические, и эпигенетические механизмы в единую теорию", – рассказал один из авторов работы, доцент Йельского университета (США) Мурат Акар. Гены нужны живым организмам для того, чтобы передавать по наследству важную информацию – в них зашифрованы "инструкции" по воспроизводству необходимых для жизнедеятельности белков. Однако в этом процессе участвуют не только гены с "инструкциями", но и некоторые их соседи. Такие гены сами ничего не производят, но следят за тем, чтобы в нужное время и в нужном месте формировались белки или другие вещества. Совокупность таких генов ученые называют эпигеномом, а науку, которая их изучает – эпигенетикой. Благодаря подобным "менеджерам" организмы быстро адаптируются к новым условиям среды или гибко меняют программу поведения в ответ на определенные факторы. В ходе одного из самых изученных эпигенетических механизмов – метилирования ДНК – к составляющим генетического кода, нуклеотидам, прикрепляются специальные "метки", которые влияют на дальнейшие механизмы производства белков. К примеру, некоторые растения используют эпигенетические метки для того, чтобы "запоминать" засухи, приспосабливаться к ним и передавать эту информацию "потомкам". В последние десять лет биологи-эволюционисты ожесточенно спорят о том, какую роль эпигенетическая память может играть в эволюции животных, растений и микробов. Они не могут пока дать точный ответ на этот вопрос из-за того, что изменения, на которые может повлиять эпигенетика, накапливаются очень медленно. Две стороны эволюции Акар и его коллеги попытались разрешить этот спор. В ходе экспериментов они выращивали дрожжи в особой среде, в которой не было галактозы – одной из разновидностей сахаров, которым могут питаться эти грибки. Для переваривания галактозе у дрожжей есть специализированная цепочка генов, которая не участвует в других жизненных процессах. Ученые предположили, что жизнь в подобной среде может заставить дрожжи "отключить" эту цепочку для экономии ресурсов. Исследователи проверили, так ли это на самом деле. Чтобы эффективнее следить за этим, ученые изменили структуру этой цепочки так, что при ее активации клетки дрожжей начинали светиться. Поместив такие клетки в питательную среду с высокой или низкой концентрацией галактозы, ученые начали "сортировать" дрожжи. Они отбирали только те клетки, которые или светились максимально ярко или же были наиболее незаметны. Такие клетки помещали в ту же среду и наблюдали, как менялся характер их свечения по мере деления и формирования новых поколений дрожжей. Оказалось, что на протяжении как минимум недели у дрожжей сохранялся высокий в первом случае или низкий – во втором – уровень активности ферментов, связанных с расщеплением галактозы, несмотря на то, что внешних стимулов для этого не было. В дальнейшем уровень активности генов изменялся не из-за мутаций в генах, а в связи с эпигенетическими процессами. Результаты этих экспериментов, как считают Акар и его коллеги, говорят в пользу того, что эпигенетические процессы могут влиять на характер эволюции всех живых существ на Земле. Этот фактор нужно учитывать при изучении микроэволюционных и макроэволюционных процессов, заключили специалисты. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
...Оказалось, что у далёких ракообразных предков насекомых в результате эволюции сегменты ног, наиболее близкие к телу, стали частью его внешней оболочки. В дальнейшем эти сегменты переместились на спину и образовали крылья. ...«Ранее, исходя из морфологии, все относили насекомых к надклассу многоножек, куда входят также двупарноногие и губоногие. Однако изучение многоножек не даёт ответа на вопрос о том, как у насекомых сформировались крылья. Поэтому крылья насекомых было принято считать новыми структурами, которые появились у насекомых и не имеют аналогов у их предков. А всё потому, что исследователи искали предков насекомых не там», — отметила Хезер Брюс. Хезер Брюс и её коллеги утверждают, что около 300 млн лет назад дальние ракообразные предки насекомых вышли из моря на сушу, где под воздействием новых условий жизни начали эволюционировать. В результате сегменты ног, наиболее близкие к телу, стали частью внешней оболочки самого тела, вероятно, чтобы существам было проще балансировать. Далее эти сегменты переместились на спину, где позже сформировали крылья. Для доказательства своей теории учёные MBL сравнили сегменты ног небольшого рачка Parhyale с сегментами ног мухи дрозофилы и жука хрущака. В исследовании был использован метод CRISPR-Cas9 — «генетические ножницы». ...В литературных источниках Хезер Брюс нашла выдвинутую ещё в 1893 году гипотезу, что насекомые включили в состав тела свою проксимальную (ближайшую к телу) часть ноги. А затем обнаружила теорию 1980-х годов, по которой эти сегменты ног у насекомых впоследствии переместились на спину и образовали крылья. «Меня поразило, что эти старые теории нашли подтверждение в моих геномных и эмбриональных исследованиях», — подытожила Брюс. По её мнению, давнюю загадку было бы невозможно решить без современных генетических инструментов. |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Новое исследование в очередной раз демонстрирует несовершенство метода CRISPR-Cas9 для редактирования генома человеческих эмбрионов. Метод приводит к нецелевому редактированию и хромосомным аберрациям. Редактирование генома эмбрионов человека на ранних этапах развития с помощью CRISPR-Cas9-системы хоть и выглядит многообещающе, но часто оказывается низкоэффективным и даже вредным. Обеспечить желаемое изменение все еще очень сложно, а нецелевое редактирование может приводить к патологиям. Уже отмечалась невысокая эффективность метода CRISPR-Cas9 для редактирования эмбрионов. Ученые наблюдали мозаицизм: часть бластомеров оставалась неотредактированной, то есть мутантной, или же возникали новые мутации – делеции или вставки. В новом исследовании ученые из Великобритании проанализировали работу CRISPR-Cas9-системы, нацеленной на редактирование гена POU5F1, который кодирует фактор плюрипотентности OCT4 и расположен на коротком плече хромосомы 6. Мутации в этом гене ассоциированы с онкологическими заболеваниями. Ученые исследовали клетки эмбрионов, в которые методом микроинъекций внесли рибонуклеопротеиновый комплекс sgRNA-Cas9, нацеленный на ген POU5F1 (25 образцов), либо только белок Cas9 в качестве контроля (16 образцов). Эти клетки они использовали для цитогенетического, генотипического или транскриптомного анализа, чтобы оценить, насколько часто редактирование человеческих эмбрионов методом CRISPR-Cas9 приводит к повреждению ДНК. Анализ проводили после полногеномной амплификации и секвенирования. Для дополнительного контроля использовали эмбрионы, с которыми не проводили никаких манипуляций (24 образца). В итоге 8 из 25 образцов с sgRNA-Cas9 имели аномалии на хромосоме 6 рядом с локусом POU5F1 или внутри него. В то же время лишь один контрольный образец с Cas9 имел повреждения на q-плече хромосомы 6, то есть далеко от локуса POU5F1. Двадцать четыре нетронутых образца не имели никаких хромосомных аномалий. Примерно в 16% образцов ученые обнаружили выпадение или приобретение лишних сегментов в районе локуса POU5F1 и потерю гетерозиготности, охватывающую участки в 4–20 т.п.н. Полученные данные говорят о том, что для медицинского редактирование клеток зародышевых линий точности CRISPR-Cas9-системы пока недостаточно. Для оценки безопасности редактирования нужны дальнейшие фундаментальные исследования. Источник Alanis-Lobato G., et al. // Frequent loss-of-heterozygosity in CRISPR-Cas9–edited early human embryos // PNAS, published April 9, 2021, DOI: 10.1073/pnas.2004832117 |
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
Группа Евгения Кунина совместно с китайскими коллегами провели сравнительный анализ 162 геномов архей суперфилума Asgard и выделили в нем шесть новых таксонов. Филогенетическое дерево, построенное с учетом этих таксонов, не дает однозначного ответа о происхождении эукариот, но предполагает, что эукариоты — родственники ветви Heimdallarchaeota–Wukongarchaeota суперфилума Asgard. Важно отметить, что сравнительный анализ геномов Asgard позволил установить новые подробности их биологии. Авторы работы выделили ряд новых сигнатурных эукариотических генов в геномах Asgard, большинство из которых оказались связаны с везикулярным транспортом. Есть также гены, относящиеся к системе посттрансляционной модификации, кругооборота белков и шаперонов, компонентам цитоскелета, а также малым ГТФазам разных семейств. Такое обогащение геномов Asgard сигнатурными эукариотическими генами, по мнению авторов, само по себе служит убедительным свидетельством тесной эволюционной связи Asgard и эукариот. Ученые также выяснили, что среди представителей Asgard встречаются анаэробные гетеротрофы, факультативные аэробные гетеротрофы и хемолитотрофы. Последний общий предок Asgard, вероятно, был миксотрофом, а его метаболизм сильно зависел как от потребления, так и от выделения H2. Подробнее: PS Это последняя новость в данной теме. Смотрите информацию на |
« Предыдущая тема · Мусорница · Следующая тема » |