Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Технологии секвенирования следующего поколения. -- Куда двигаться дальше? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Кураторы темы:* genseq
Чёрный список: GMO
     NB! в теме нельзя обсуждать тех, кто внесён в чёрный список
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Васильевна
IP-штамп: frxY.OHlcfa7g
гость



 прочитанное сообщение 07.06.2017 12:59     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     
Вопрос
(LMP @ 31.03.2017 11:02)
Ссылка на исходное сообщение  С точностью у них не очень, тут где-то генсек испытания выкладывал. Соответственно и приложения у них больше скрининговые https://nanoporetech.com/applications
Потом все равно, видимо, "пересеквенировать" по сэнгеру придется. Ну и не надо забывать, что ихнюю стоимость надо на "N" раз умножать, чтобы учесть наценки.

Вопрос про наценки для РФ. Помогите, люди добрые.
Запросили цены на minIon Basic и киты.
Цена для нас("конечника") на MinION в 8 (!восемь) раз превышает цену на сайте. confused.gif
На наборы типа "по-божески" - всего в 2-3 раза.
Поставщика сдавать не буду, но интересно за счет чего может быть 8-кратная наценка? Может всего лишь кто-то ошибся? eek.gif
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 07.06.2017 14:15     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(Васильевна @ 07.06.2017 13:59)
Ссылка на исходное сообщение  
Поставщика сдавать не буду, но интересно за счет чего может быть 8-кратная наценка? Может всего лишь кто-то ошибся? eek.gif

Ну и гуляйте дальше лесом, партизан Васильевна!
У нас тут на молбиоле посторонних нет, выкладывайте все начистоту. umnik.gif
Участник онлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 07.06.2017 23:51     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Все это - глупо и печально. Когда все друг другу врут и друг друга монетизируют.

А могли бы просто тупо взять и разработать всё это на своем белковом инжиниринге.

Но откаты так через оффшоры не заработать, конечно....
Васильевна
IP-штамп: frxY.OHlcfa7g
гость



 прочитанное сообщение 08.06.2017 10:38     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     

(-Ъ- @ 07.06.2017 14:15)
Ссылка на исходное сообщение  Ну и гуляйте дальше лесом, партизан Васильевна!
У нас тут на молбиоле посторонних нет, выкладывайте все начистоту. umnik.gif

Гуляла по сайту госзакупок, та еще темная чаща. Больше не хочу, поэтому и пришла к вам.
Подскажите, пожалуйста, нежадного поставщика. Мы же еще не купили MinION, только планируем.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 08.06.2017 11:28     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Первые поставки пошли через СкайДжин, но они не являются эксклюзивными представителями Oxford Nanopore, а желающих заработать на продаже нанопоровых секвенаторов немало. jump.gif

Стартовый кит MinION (Basic) стоит $1000:
https://store.nanoporetech.com/minion/sets/?___SID=U
Если наценка восьмикратная ($8000), то это многовато. Двукратную вряд ли найдёте из-за "заморочек" с холодовой цепью, но на трёхкратную вполне можно рассчитывать. Так что соберите несколько коммерческих предложений и выберите на свой вкус. Если самой лень, то обращайтесь в личку. Из любопытства сейчас позвонил в одну из компаний и запросил коммерческое предложение. Не сегодня-завтра обещали прислать. shuffle.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): NMR-guy
Участник оффлайн! NMR-guy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 08.06.2017 18:29     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Выложите ПОЖАЛУЙСТА первые батчи сырых данных этого прибора в архивах в текстовом формате. ОЧЕНЬ настоятельно прошу.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.06.2017 09:44     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(NMR-guy @ 08.06.2017 16:29)
Ссылка на исходное сообщение  Выложите ПОЖАЛУЙСТА первые батчи сырых данных этого прибора в архивах в текстовом формате. ОЧЕНЬ настоятельно прошу.


http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERR1898537
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5426553/

Сообщение было отредактировано genseq - 10.06.2017 09:49

Файл/ы:

скачать файл Long_2017.pdf
размер: 3.79мб
кол-во скачиваний: 23


Участник оффлайн! vak
Участник
Мюнхен



 прочитанное сообщение 30.06.2017 11:56     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Народ, повангуйте, когда появится некий "23andme++" или там "23andme NextGen".

(23andme стартовал так задорно, но я разочарован нынешним положением дел спустя 5 лет)

Вообще, ИМХО, нужно было изначально разделять сервисы на две важные составляющие:

1. качественное секвенирование -- деливерить данные и не заниматься в рамках этой компании ничем больше, чтобы не воевать со всякими FDA и прочими мафиями

2. качественный анализ на основе данных, залитых заказчиком

причем анализ делать в странах без е**нутых законов и воинствующих клериканских настроений -- например, в этих ваших скандинавиях, в новых зеландиях, австралиях, даниях, нидерландах и даже прочих уругваях, где рейтинги свобод просто зашкаливают.
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.06.2017 14:06     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

2. качественный анализ на основе данных, залитых заказчиком

причем анализ делать в странах без е**нутых законов и воинствующих клериканских настроений -- например, в этих ваших скандинавиях, в новых зеландиях, австралиях, даниях, нидерландах и даже прочих уругваях, где рейтинги свобод просто зашкаливают.


то есть Вы считаете это нормально, если человек прочитает, что у него предрасположенность к раку и покончит жизнь самоубийством?
Участник оффлайн! vak
Участник
Мюнхен



 прочитанное сообщение 30.06.2017 14:23     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(kblag @ 30.06.2017 12:06)
Ссылка на исходное сообщение  то есть Вы считаете это нормально, если человек прочитает, что у него предрасположенность к раку и покончит жизнь самоубийством?

а вы считаете нормальным, что психически неустойчивые должны определять, к чему иметь доступ психически устойчивым? confused.gif

а что быть с этим, тоже закрыть?
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%D1%80%...%83%D0%BE%D0%BB

а ножи домохозяйкам тоже больше не продавать, потому что у некоторых психически неустойчивых бывают плохие настроения?

Повесьте при входе в сервис жирную объяву, что все результаты являются вероятностными и носят лишь экспериментальный характер, что псих неустойчивым этим сервисом пользоваться КАТЕГОРИЧЕСКИ не рекоммендуется. И что на PubMed'e невероятно высокая квота ошибочных посылов.

Вообще, зачем эти полумеры, лучше запретить все буквы, а то ведь можно что-нибудь такое прочитать, от чего застрелиться захочется, я вам больше того скажу -- уже было и было не одну тысячу раз. Так что, будем последовательны и запретим буквы? shuffle.gif

из-за людей, люто защищающих свои неврозы, остальных делают обслуживателями этих самых неврозов -- huge dislike. wall.gif

P.S. я не буду в этой ветке оффтопить и обсуждать классический патерналистский бред этого типа. можно открыть эту тошнотворную тему отдельно wink.gif

Сообщение было отредактировано vak - 30.06.2017 14:28

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): Bern5, ржу громко, dk
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.07.2017 15:12     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

7 Jul 2017, publ: 17 Jul 2017
A world of opportunities with nanopore sequencing / Richard M. Leggett , Matthew D. Clar

Рекомендую:
https://peerj.com/preprints/3090.pdf

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): sceptique
Участник онлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 21.07.2017 20:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Если хотя бы половина из Вами прикрепленного файла - правда, то весьма скоро, лет через 5-10, большая часть генетических лабораторий будут не нужны. Как сейчас никому не нужны печатные машинки.

И секвенировать проблему будут прямо на месте ее встречи все, кому продадут эти приборчики. А зная китайцев, думаю, "британские ученые" в этой области недолго будут монополистами.
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 02.08.2017 07:44     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

https://geektimes.ru/post/291613/

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): dk, genseq
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 02.08.2017 18:49     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(RYM @ 02.08.2017 05:44)
Ссылка на исходное сообщение  Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

https://geektimes.ru/post/291613/


Немного о предыстории этого проекта:
https://yadi.sk/i/EB3Il4HzkTniz
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 02.08.2017 19:24     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(RYM @ 02.08.2017 08:44)
Ссылка на исходное сообщение  Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

Полностью согласен с мнением одного из участников обсуждения, на все 100%:

Проделанная автором работа впечатляет и заслуживает всяческих похвал. Однако, как это зачастую бывает с работами талантливых инженеров, практический «выхлоп» от этого ре-инжиниринга пока невелик.
Использование, и даже многоразовое использование фирменных картриджей, на руку их производителю. С ходу назову две причины:

1. Как и производители мешков для пылесосов, картриджей для принтеров и Неспрессо-кофе и т.п., даже несанкционированное повторное использование оригинальных картриджей «льёт воду на колесо» продаж производителя. Пускай даже обладатель самодельного анализатора и не купит сам прибор, но при активной работе сколько-то картриджей он всё-равно потребит. Опять же, это косвенный промоушен определённого бренда в пику другим производителям аналогичных товаров и услуг.

2. Потребитель картриджей «сидит на крючке» производителя и не представляет для него ни конкуренции ни угрозы. Так, в своё время, Стив Балмер из Майкрософта публично благодарил пиратов за распространение их ОС, потому как вторую другую ОС на тот же компьютер, за редким исключением, никто не устанавливал. Так и с картриджами. Собственно, с их продаж производители и расчитывают получать главную прибыль. Копируя что-то можно только всё время догонять оригинального производителя, но никогда его не превзойти. Собственно говоря, ре-инжиниринг ценен именно тем, что даёт понимание как сделать по-другому и лучше.

Как бы в такой ситуации действовал Западный предприниматель?
1. Изучил оригинальный патент,
2. сравнил его с результатами ре-инжиниринга,
3. разработал альтернативу «в обход» патента,
4. запатентовал свою разработку,
5. наладил производство с качеством не хуже и по меньшей цене,
6. начал вовсю использовать свой продукт сам, и уже затем
7. предложил пользователям оригинального продукта. Только на этом этапе оригинальный производитель может «увидеть» конкурента. Тут и потребуются «мускулы» стоящей за спиной юридическо-бюрократической системы для защиты интеллектуальной собственности.

Конечно, это не под силу одному, даже очень талантливому человеку. Для этого существуют Инновационные Инкубаторы и т.п. За ними стоят или государство, или большие деньги, или и то и другое. За примерами далеко ходить не нужно имея под боком опыт технологического взлёта Китая. Опять же, существует немало российских хай-тек фирм, разработки которых успешно реализуются Западными корпорациями по вышеописанной схеме.

На этом остается завершить пост и пожелать автору Здоровья и Удачи!

Там еще Kriminalist правильные вещи излагает.


От себя два слова - из пустого в порожнее... no.gif,и вечные догонялки. frown.gif

Генсек, пора делами более космическими заняться. smile.gif

Кстати, там наш kblag тоже репликами пытается что-то выразить.


Сообщение было отредактировано -Ъ- - 02.08.2017 19:26

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): esp
Участник онлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 02.08.2017 20:06     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Полностью согласен с Ъ.

Так напрягаться, даже до развода, чтобы родить никому не нужную альтернативу, которая никогда не пройдёт ни лицензирований, ни регистраций, и которой нужны грязные б/ушные проприетарные чипы устаревших поколений этих пылесосов по заоблачным ценам - сразу фтопку.

Я, начиная читать, подумал что аффтар в итоге отправит готовые шаблоны чипов в Зеленоград и ждет установочную партию для проверки в своей стендовой модели, но ошибся. Он ждёт электровентиль и мечтает о рынке моечных машин для нелицензионной и преследуемой законом о защите патентов в любой стране кроме китая рекуперации проприетарных чипов.

Лучше бы поступил на ФизТех или в Бауманский и воспроизвел поровый секвенатор. Это, в отличие от помоечных (в буквальном смысле) чипов прошлой эпохи секвенирования, вполне может быть его уровень. Если угадает с длиной линкера при белковом инжиниринге поры в мембранах. А также с АЦП егойного USB-шного патч-клямпа.

Сообщение было отредактировано sceptique - 02.08.2017 20:07
guest: ASDF
IP-штамп: fr4I3qoC2Qq4.
гость



 прочитанное сообщение 04.08.2017 08:57     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     

Ъ, вы кажется не совсем понимаете суть ключевого здесь термина DIY )))
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 04.08.2017 10:24     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

Вы такую конкретику шарахнули, а я и не понимаю о чем речь.
О каком термине DIY идет речь, где это было?
Участник онлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 04.08.2017 10:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Пан ASDF шутит. Намекая что в случае описанного "гения"-реконструктора важнее был не результат, а сам процесс. Чем бы дитя не тешилось, типа.
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 07.08.2017 14:35     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(guest: ASDF @ 04.08.2017 09:57)
Ссылка на исходное сообщение  Ъ, вы кажется не совсем понимаете суть ключевого здесь термина DIY )))

К моему стыду, я вообще не знал о существования этого термина.
Сегодня, случайно наткнулся на него...
Век живи, век учись, а дураком помрёшь. no.gif

Всего благодарностей: 8Поблагодарили (8): esp, Bern5, bee3, citypizza, trump2, meteo, Guest1-1, Alex Soldatov
guest: ASDF
IP-штамп: fr4I3qoC2Qq4.
гость



 прочитанное сообщение 10.08.2017 20:33     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     

(sceptique @ 04.08.2017 10:32)
Ссылка на исходное сообщение  Пан ASDF шутит. Намекая что в случае описанного "гения"-реконструктора важнее был  не результат, а сам процесс. Чем бы дитя не тешилось, типа.

Да почему шучу то? DIY - своя вселенная, пересекается с биохакингом, и вообще ...))). У них даже конференции свой проводяться, так что все серьезно.

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 23.08.17 11:20
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft