Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
progenes |
Нашла весьма интересный белок и сравниваю с одним кандидатом, у которого нуль хитов в BLASTX. Между белками мало общего, но кое-что есть. Они сравнительно небольшие (до 200 АА), содержат судя по сигнал-предикшн С-терминальный сигнальный пептид. Общее также наличие большого количества цистеинов. Я сравнила по алгоритму Lipman-Pearson и вот что получилось (в прикрепленном рисунке) Поскольку в белках я ровным счетом ничего не смыслю, то не понимаю, насколько серьезной можно считать консервативную позиции этих цистеинов. Картинки: Protein_alignment2.jpg — (57.77к) 05.10.2009 — 19.10.2009 |
Armenchik |
|
progenes |
|
frNFBHcL2JSwo Постоянный участник IP-штамп: frNFBHcL2JSwo |
кто вам сказал, что если связь в первом белке между цистеинами 1 и 4, скажем, то во втором не будет 2 и 4? попробуйте запустить [fold recognition (Phyre)]. причем тут форез, Арменчик? Ну "резанули" вы, ну побежали они по разному. So what? |
progenes |
|
progenes |
|
frNFBHcL2JSwo Постоянный участник IP-штамп: frNFBHcL2JSwo |
насчет цистеинов, в матрицах у них очень высокий score, поэтому алгоритм сдвигает все остальное. Но этого недостаточно. попробуйте выкинуть сигнальный пептид, и запустить псай-бласт. также, воспользуйтесь Interproscan-ом - может найдет чего. |
guest: progenes IP-штамп: frud.sVFMZQCE гость |
|
nigoal123 IP-штамп: frpYd0YygcNIA гость |
However, you will also |
Luca Coleman Постоянный участник |
|
carlos Постоянный участник |
|
carlos Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Guest IP-штамп: frbya23htJifE гость |
|
Guest IP-штамп: frbya23htJifE гость |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
alekseenkoM Екатеринбург |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
carlos Постоянный участник |
|
Guest IP-штамп: frJ29JTBlItMA гость |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Guest IP-штамп: frJ29JTBlItMA гость |
|
Guest IP-штамп: frJ29JTBlItMA гость |
|
Guest IP-штамп: frJ29JTBlItMA гость |
|
Guest IP-штамп: frJ29JTBlItMA гость |
|
Guest IP-штамп: frJ29JTBlItMA гость |
|
Guest IP-штамп: frXXxth8NPJCQ гость |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Guest IP-штамп: frXXxth8NPJCQ гость |
|
Guest IP-штамп: frXXxth8NPJCQ гость |
|
Guest IP-штамп: frXXxth8NPJCQ гость |
|
Guest IP-штамп: frXXxth8NPJCQ гость |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Guest IP-штамп: frXXxth8NPJCQ гость |
|
Luca Coleman Постоянный участник |
|
Guest IP-штамп: frXXxth8NPJCQ гость |
|
Guest IP-штамп: frXXxth8NPJCQ гость |
|
starvip789 Постоянный участник |
|
starvip789 Постоянный участник |
|
starvip789 Постоянный участник |
|
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |