Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
GOG8 Постоянный участник |
Как же заполнить оставшиеся пробелы? Если не увеличить скорость, с которой биологи описывают новые виды, а она составляет 20.000 новых видов в год, то человечеству понадобится еще тысячелетие для того, чтобы закончить классификацию всех живущих на земле организмов. Это, разумеется, при условии, что они все к тому времени не вымрут. Понятно, что работать нужно больше и лучше. Но как? На помощь таксономистам должны придти современные информационные технологии, - считает Симон Тийе, профессор национального музея естественной истории в Париже. За два последних века человечество истратило на создание библиотек и коллекций биологических образцов наверное столько же денег, сколько ушло на освоение космоса. Эти деньги должны работать, поэтому нужно обеспечить доступ широкой научной общественности к наиболее важным библиотекам и коллекциям. Такой опыт уже имеется у программы Synthesis, стартовавшей в 2004 году. Программа, финансируемая Европейским союзом, объединяет 20 музеев естественной истории и ботанических садов Европы и предоставляет на конкурсной основе гранты ученым, желающим посетить библиотеки и коллекции ведущих научных центров. Есть и другой путь. Доступ к библиотекам и коллекциям может быть открыт через интернет. Например, компьютерная система GBIF (Global Biodiversity Information Facility) объединяющая институты из 26 стран, позволяет вам выбрать интересующий вид из списка и отсылает на сайт института, в котором данный вид был описан и где можно получить подробную информацию. Системы Synthesis и GBIF хороши, но они страдают отсутствием унификации. Для того, чтобы сделать качественный рывок вперед, необходимо создать стандартизованную систему кибертаксономии. Для этого, во-первых, необходимо иметь единый протокол сбора информации о живом организме. "Личное дело" каждого вида на планете должно содержать последовательность ДНК, что позволило бы идентифицировать организм на молекулярном уровне. Прообразом такой системы идентификации является проект "Barcode of Life". Во-вторых, необходимо создать единую информационную систему, позволяющую исследователям по всему миру взаимодействовать в реальном времени для описания и анализа видов живых существ - новых и ранее известных. Такое сотрудничество ускорит доступ научного сообщества к информации. Именно эти задачи ставит перед собой организация EDIT (European Distributed Institute of Taxonomy). Организация, объединяющая 18 лидирующих музеев и ботанических садов Европы, Северной Америки и России была недавно создана под эгидой Европейской комиссии. Пока на сайте программы, открытом в июне 2006 года, лишь перечисление проектов. Но, судя по объему финансирования, которое в течение 5 лет составит 11.9 миллионов евро, создание "кибертаксономической матрицы" не за горами. По материалам статьи Симона Тийе - профессора национального музея естественной истории в Париже и директора EDIT. Ссылки по теме:Рис. с сайта barcoding.si.edu
Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 09.08.2006 07:49 |
BRC Постоянный участник |
|
mlog Постоянный участник |
Личное дело" каждого вида на планете должно содержать последовательность ДНК, что позволило бы идентифицировать организм на молекулярном уровне. Прообразом такой системы идентификации является проект "Barcode of Life". Штрихкодирование, по крайней мере в отношении растений --- скорее всего несбыточная мечта. Ни один из предложенных к настоящему времени маркеров (в том числе и широко разрекламированный спейсер psbA-trnH) не подходит для этой цели --- известны случаи, когда он не отличается у видов, которые морфологически различимы даже с закрытыми глазами, но сильно отличается у очень близких видов. |
Saveta Краснодар |
PS Работаю с Просянкой, мечтаю накормить этим сеном корову!!! Сообщение было отредактировано Saveta - 10.08.2006 11:10 |
plantago Постоянный участник |
|
mlog Постоянный участник |
(plantago @ 10.08.2006 22:21) 18 огранизаций на 11 млн евро -- это немного. Чтобы работать в biodiversity hotspots (как экологических, так и географических), нужны участники из Африки, Азии и Южной Америки. Что до barcoding, то кое-что все же дает результаты (иногда PCR-based методы работают значительно лучше, чем секвенирование, только что вот слышал доклад человека из Florida State). К тому же, грибы и многие протисты не так богаты мультикопийными генами, как наземные растения. PCR-based --- надеюсь, Вы не RAPD имеете в виду? Потому как про него, по-моему, давно уже известно, что он трудоёмок и слабовоспроизводим. И ДНК нужно не столько и не такой, какую можно выделить из гербарного материала. В AFLP/RFLP, насколько я понимаю, с ДНК те же проблемы + работа с радиоактивной меткой... словом, о быстрой идентификации, о которой громко кричат адепты штрихкодирования, речи не идёт. |
plantago Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
watchesbiz Постоянный участник |
|
kriz Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
watchesonline89 Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
vrida2 Постоянный участник |
|
« Предыдущая тема · Колонка новостей · Следующая тема » |