Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Результаты поиска -- Найденные сообщения --

страницы (46):  1 2 3 > » 

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: сегодня, 14:47  |  БеседаБеседа  |  link: #1823231  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
да зачем скрещивать .. клонировать , они же млеки.. Года за три управимся с первой колонией клонов. А далее уже можно и обычным образом разводить.


куда их там 40 лет держать , они небось еще и капризные с размножением, кстати ... интереснейшая работка могла бы получиться ... но конечно финансирование надо минимум на 25 лет получить. Иначе смысла нет. Если конечно результат интересует, а не распил.

Вообще можно начать с фруктоядных , тех же летучих лициц ... Они там на плантациях в Азии уже практически сами одомашнились , еду из рук берут у рабочих , пьют из их стаканов.. Всем прикольно такое наблюдать. .. Они такие милые зверушки.

Уже кое-где поговаривают что следующим таким эпидемическим вирусом из рукокрылых будет именно их вирус , Нипах.. Примерно через 2-3 года он наиболее вероятно запрыгнет в людей , на тех плантациях и начнет потихоньку осваивать нового хозяина .

И никакой лабораторной утечки и не понадобится , сам запрыгнет. Вернее он может и запрыгивает но пока непродуктивно.

Можно в принципе уже начинать работать на этот вирус в стол , не публикуя ничего .. И вот когда вирус пойдет в народ .. вот тут на хайпе и опубликовать свои наработки. То есть надо уже наготове держать статьи для публикации.

Риск того стоит. Хирша поднимет неимоверно.

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: сегодня, 13:58  |  БеседаБеседа  |  link: #1823216  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
А не закатать ли мне в банки под инертным газом , ну азотом там или аргоном дерьмо больных Ковидом? Желательно вот тех кто при смерти уже , ну чтоб точно было известно что он там есть.
Естественно не анонимно , это в некотором роде как портрет , памятник такой художественный донору. Бесплатно для донора.

Я так думаю лет через 50 или даже 100 .. эти мои баночки приобретут весьма неплохую ценность в мире искусства .

Арт-Консервы Пандора , в собственном соку , лиофилизированная , под инертным газом. Срок хранения - 2000 лет. Инструкция для оживления содержимого - Только добавь дистилированной воды.
//////////////////

Ну я совершенно согласен с такой постановкой вопроса , очень похоже на реальность , исходя из моих познаний в иммунологии.. Плазмаферез прекрасно помогает при тяжелой аллергии например .. когда имунный ответ тоже самый главный враг организма. Мы даже производили антитела на [IgE] для этих колонок плазмафереза . .. Ну я так уже смытно помню , может там в колонке просто сорбент какой был , но солидные такие колоночки именно для клиники. Я сам там рядом диссер делал свой.

Нормально имунный ответ идет фазами и на пике запускается ингибирование и все проходит. С этим корона вирусом у некоторых людей похоже ингибирование не запускается , очень похоже на аллергиков , у них тоже дефицит этого механизма регуляции имунного ответа .

Вот может посмотреть на Ил4 там ... может действительно связь есть между аллергиками и тяжелым течением инфекции. Ну что-то в этом направлении , какой-то дефект ингибирования имунного ответа в системе. .. Ведь вообщем-то и целом в популяции наша имунная система вполне справляется с этим вирусом и с его родственниками . Сама , без вакцин и без химии. То есть может же. Это явно не Эбола.

Ну а пранк с мадам Ши - да , хорошая идея .. но играть с китайцами в их игру .. хмм ... обуют же . Тут лучше выдуманное интервью с ней опубликовать и туда вставить какие-то ключевые развед-вопросы-ответы и посмотреть как она отреагирует.

Так вот , делись с нами информацией-то .. там мне народ интереснейшие вещи оттуда пишет .. Они до нас просто не доходят. А там есть что заценить и не только по ковиду .. Там уже следующий вирус из рукокрылых обозначили , НИПАХ.. который наиболее вероятно скоро запрыгнет в людей .. И тому есть основательные причины , даже и безо всякой лабораторной утечки.

речь идет о времени 2-3 года. Можно уже начинать вакцину делать и статьи писать , но держать неопубликованными .. чтоб ровно под новую эпидемию подгадать и прям в самый хайп и опубликовать. Риск конечно , но вполне оправданный.

Ну я тут тебе не Посол Европы , а коллега .. мне -то можно доводить до сведения ... я же тебе вот рассказываю всяко-разно... Доверять сейчас нельзя никому , кроме меня естесвенно, мне - можно.

Вот что ты думаешь по-поводу механизма патологии этого вируса? почему только некоторые люди страдают ,а остальным пофигу этот вирус? Что такого особенного могло бы быть в имунном ответе этих тяжелых пациентов?.. Мне вот почему-то вспоминается аллергические дела , давно еще когда я дисссер делал с этим работал. Так плазмаферез у этих больных чудеса творил да и творит.. Может и с этим вирусом тоже попробовать плазмаферез крови и удаление из нее антител ? как у аллергиков.

Что-то у тебя эмоции разигрались> неужели я попал в какую-то точку с этим Нипах вирусом? Я не специально , мне действительно это нашептали на уши. Вот хотел второе мнение услышать. Ты уж извини если что..

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: сегодня, 12:40  |  БеседаБеседа  |  link: #1823208  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
Ну тогда можно в Китае заказывать , там мощности на зеленых мартышках есть. А в России только качество проверять да разливать по флакончикам и денежку из бюджета получать за богоугодное дело по спасению трудового населения от напасти чужеземной.

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: сегодня, 00:41  |  БеседаБеседа  |  link: #1823138  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
В летучемышах будем нарабатывать , их там в одной пещере до миллиона особей живет..

Запускаем туда газ циклон Б ... и собираем трупы в большую ммыше-давилку ... и из выдавленной из них жидкости концентрируем Пэгом и вакцинируем ..

Прямо не отходя от пещеры ...

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: сегодня, 00:19  |  БеседаБеседа  |  link: #1823135  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
Про вакцину из убитого ковида (поливалентную и быструю) пока не слышно.
Ослабленная вакцина- дело темное, вирус может и восстановиться, т.е. «быструю» вакцину так сделать легко, но доказывать ее безопасность - долго.

"Не ослабленная живая вакцина" (введение активного вируса) – казалось дело давно минувших эпох.
Оказывается, в американской армии non-attenuated live vaccine применяется в наше время от аденовируса вызывающего ОРВИ (Febrile Acute Respiratory Disease). Живой активный вирус дают людям не в виде аэрозоля ( как при заражении) а в виде таблетки.

https://www.fda.gov/media/80211/download

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 17:14  |  БеседаБеседа  |  link: #1823095  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
Certifiably immune

Those shocks sometimes run deep. Unrelenting outbreaks of infectious disease can modify an existing social order or even help to bring it down, historians have found.

Consider yellow fever. The mosquito-borne viral disease aided a successful rebellion of black slaves in Haiti against French colonial rule. Yale University historian of science and medicine Frank Snowden describes that event in his 2019 book Epidemics and Society: From the Black Death to the Present.

Haiti’s slave uprising lasted from 1791 to 1804. When Napoleon sent more than 60,000 soldiers to put down the rebellion, many European newcomers quickly succumbed to yellow fever because they lacked immunity that black Haitians had already acquired. Yellow fever ended up helping Haiti’s slaves win their freedom.
Haitian rebellionPrevious exposure to yellow fever helped surviving Haitians launch a successful slave rebellion against French soldiers who lacked immunity to the infection. An 1802 battle in that struggle is illustrated here.Auguste Raffet/Wikimedia Commons

The disease also thwarted Napoleon’s ambitions to expand his empire into the Americas, Snowden says. In 1803, as a humiliating military defeat fast approached in Haiti and prospects of war with Britain increased, the cash-strapped French ruler sold Louisiana to the United States. That transaction, which expanded slavery’s reach in the U.S. South, set the stage for yellow fever to instigate entirely different social changes in 19th century New Orleans.

Yellow fever killed more than 150,000 people there between 1803 and the Civil War’s start in 1860. No cure or vaccination existed for a disease that killed about half of those it infected. Yellow fever deaths were painful and horrifying. Many victims vomited thick, black blood before succumbing after several days. Those who survived the infection became immune, or what people at the time called “acclimated.”

In a city with stark divisions between rich and poor, men and women and within racial groups — whites, “free people of color” and slaves — acclimated citizens held special status, says Stanford University historian Kathryn Olivarius. That immunity-based social system produced New Orleans’ most powerful and wealthy families, many of which are still prominent, Olivarius concluded in the April 2019 American Historical Review. Her analysis included written accounts, official documents and medical articles from the pre–Civil War era.

White people who survived yellow fever could receive a certificate of acclimation, ensuring them access to good jobs, bank loans and houses in the best neighborhoods. Many immigrants arriving in New Orleans in the 1840s, especially Irish and Germans, saw infection as a path to success and were willing to risk death to become acclimated.
Yellow fever patient progressonGetting yellow fever, depicted in this 1819 painting, could result in bleeding and vomiting of thick, black blood. Because yellow fever was often fatal, some survivors of the disease achieved special status in New Orleans during the 19th century.Wellcome Collection (CC BY 4.0)

Black people received no such benefits. Not only did the slave economy withstand repeated epidemics, but resistance to yellow fever and the likelihood of a long working life increased a slave’s monetary value to an owner by 25 to 50 percent, Olivarius estimates.

It’s not yet clear if someone who recovers from COVID-19 gains immunity (SN: 4/28/20), as with yellow fever. Even so, possibly immune individuals are drawing attention in this year of the coronavirus. Countries such as Chile, Germany and the United Kingdom are considering issuing “immunity passports” — documents certifying that a person has recovered from COVID-19 — that would let these individuals go back to work early. Immunity passports might become an increasingly attractive strategy as it takes a year or more to develop a coronavirus vaccine. “If so, we should heed lessons from the past and beware of potential social perils,” Olivarius says.

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 16:11  |  БеседаБеседа  |  link: #1823085  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
Мы живем в деликатном балансе с микроорганизмами, и эпидемии - это часть этого баланса природы.. Мы от них эволюционно зависим как вид.

Это естественная часть жизни , зачем пугать людей этим?

У медиков просто экспозиция выше вот и все.. а именно она определяет исход заражения ... , до определенной дозы инфекции организм справляетя а после нее уже нет ... Это со всеми патогенами так.

Совершенно ничего удивительного в повышенной смертности медиков особенно переброшенных в инфекционку из других областей нет. это как раз нормально., так и должно было быть.

Если наприметр взять внутрибольничные инфекции, так весь персонал их имеет в стертой форме и не болеет особо , и тогда уже мрут пациенты, а не медики. Другая сторона медали.

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 15:06  |  БеседаБеседа  |  link: #1823078  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
Да почитал , ну солидная такая история с этими собачьими вирусами и их насыщенной событиями семейной жизнью..
Даже подумалось а может и АЧС тоже каким-то в каких-то домашних любимцах персистирует? И все дело в международной торговле этими любимцами? когда заводят-завозят кошек например редких из другой страны.

Раз уж такaя связь между свиными-собачьими-кошачьими корона вирусами есть.

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 14:36  |  БеседаБеседа  |  link: #1823074  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
We have identified CCoVs with a potential double-recombinant origin through partial S-gene exchange with TGEV. Recombination involving the S gene has been previously described for FCoV (15) and CCoV (12, 27). A TGEV-like CCoV, strain UCD1, has been previously reported, but only partial S-gene sequences were determined, thus preventing a complete genomic characterization (27). In contrast, we have determined and analyzed the 3′ end of four TGEV-like CCoVs and the nearly full-length genome of two of those strains. In addition, strain UCD1 was detected in the feces of a dog with diarrhea, whereas we detected the recombinant viruses in the feces/intestinal contents and in the internal organs as well.

A major mechanism driving CoV genetic evolution is represented by the high frequency of homologous RNA recombination, which is frequently mediated by a copy choice mechanism based on sequence homology flanking the recombination sites (20, 28). In addition, the necessary discontinuous RNA synthesis required during RNA transcription to generate the subgenomic mRNAs in CoVs is associated with highly conserved sequences preceding each gene and representing a slow-down or stop signal for RNA synthesis (25). This sequence, in the case of group 1a CoVs, is CTAAAC (26, 28). Therefore, in the sequence domains where recombination has taken place, it is likely to be small segments of sequence identity between the donor and the acceptor sequences. In fact, observation of the sequence domains involved in the recombination event revealed the presence of segments of sequence homology (Fig. ​(Fig.2b),2b), although single well-defined crossover points could not be definitively determined.

Although the TGEV-like CCoVs were detected in the internal organs of naturally infected dogs, experimental infection failed to cause systemic involvement or virus dissemination through the blood. Thus, the CPV coinfection observed in the natural outbreaks could have played a certain role in TGEV-like CCoV spreading to internal organs. In addition, the antigenic differences observed between reference and recombinant CCoVs may have some implications for prophylaxis programs, as dogs administered classical CCoV vaccines may be susceptible to infection (disease?) caused by TGEV-like CCoVs. The detection of these viruses in different time periods (at least 4 years) and geographic areas (at least Italy and Hungary) has let us to presume that TGEV-like CCoVs are effectively circulating in the dog population.


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2620906/

аферисты от медицины
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 14:33  |  БеседаБеседа  |  link: #1823073  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 125
Конечно странно было узнать что зоологи которые энтузиасты-рукокрыльники .. они же из этих пещер не вылезают , практически без средств защиты по-колено в этом рукокрылом гуано вечно ... А вирусы то как раз с фекалиями выделаются

И как-то до сих пор ничего в народ из этих пещер так и не вынесли в себе.. Ну был говорят один случай пневмонии, так там особенный был человек , иммуникомпрометированный , хрен знает чем он там заразился , может плесеня какие его убили... И тоже от него никуда не вышло.

То есть не так-то просто корона вирусу мышиному на человека перепрыгнуть в природе .. Иначе мы бы целый список загадочных смертей этих ученых-рукокрыльников наблюдали бы.

Ну это учебник ,что профиль имунного ответа определается генотипом ..

Есть запрещенные антитела и Т-клетки и они разные у разных генотипов.

Поэтому вот верблюдов используют для разработки антител к антигенам которые человеческая имунная система не видит или не так как надо видит.
Ну то есть отказывается на эти антигенные детерминанты антитела делать и все тут .. мол это этого вреда будет больше чем пользы.

Ну и вакцины все это же самое .. кто-то отвечает на них как надо, а кто-то совсем не так как ожидается в среднем по-популяции.

аферисты от медицины
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 13:42  |  БеседаБеседа  |  link: #1823066  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 125
ну я согласен с текстом , единственно хочу отметить что в геноме К19 есть совершенно уникальная для всего корона вирусного семейства вставка в 12 нуклеотидов в которой находится сайт рестрикции [FauI].. Все битвы по-поводу искуственного лабораторного происхождения именно вокруг нее идут. Она реально нужна для высокой инфекционности вируса.

Поэтому определить наличие генома К19, именно его самого , можно практически 100%.

Просто амплифицировав фрагмент вокруг этой вставки с самыми универсальными консервативными праймерами которые видят все корона вирусы человека и порезав породукт ПЦР этой рестриктазой элементарно увидеть наличие сайта [FauI] в ПЦР -продукте

даже если у вас смесь всех корона вирусов в образце .. это работает прекрасно. Но это конечно сложнее чем обычные тесты, Больше времени требует и другого протокола клинического. Вообщем дороже .

И таким образоом можно при разработке теста использовать обычные безопасные корона вирусы в качестве контроля на качество теста . Можно в конце концов аспиранта какого-нибудь заразить и использовать в качестве стандарта его биообразцы.

аферисты от медицины
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 13:27  |  БеседаБеседа  |  link: #1823061  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 125
вы можете как-то объяснить сообщения СМИ о высокой смертности от К-19 среди медперсонала?

Alexandra Novoselova

В двух словах:

во-первых, врачи находятся в самом эпицентре внутрибольничной инфекции, больницы - это очаги ВБИ, оосбенно при массовом свозе. Т.е. там не только ковид, там еще перечень бактериальных возбудителей. Плюс не все вирусные, которые свезены - ковидные.

Итого имеем ассортимент возбудителей, да еще в неинфекционных больницах, не приспособленных к приему таких пациентов.

Во-вторых, есть понятие вирусной нагрузки: это количество вируса, которое попало в организм. Понятно, что у врачей, который постоянно близко контактируют с разными пациентами, и они кашляют и дышат на врача, такая вирусная нагрузка будет намного больше, чем даже у одного пациента в той же больнице.

Таким образом, врач в самом опасном положении: большая вирусная нагрузка ( плюс часто неумение носить СИЗ или вообще их отсутствие) + длительное нахождение в очаге ВБИ.

аферисты от медицины
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 12:25  |  БеседаБеседа  |  link: #1823052  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 125
Разработчикам теста вместо выделенного изолята вируса от пациента предложена формула : расшифрованный в январе китайцами самый первый геном covid-19 — он выложен в бесплатную сеть GenBank ( это проект NCBI - Центрального института обработки и хранения данных молекулярной биологии США).
И хотя уже в феврале 2020 года стало известно , что геномов covid-19 с учетом мутаций более тридцати типов ( на сегодняшний день известно более 3,5 тысяч типов генома covid-19), тем не менее, все остальные, кроме самого первого, находятся под эмбарго в GISAID ( организация созданная в 2006 году - Global Initiative on Sharing All Influenza Data «Глобальная инициатива по обмену всеми данными по гриппу»). GISAID обеспечивает публичный доступ к полной коллекции данных генетических последовательностей вирусов гриппа и связанных с ними клинических и эпидемиологических данных через свою базу. Эта организация создавалась в целях обеспечения самого широкого доступа исследователей к научным данным , полученным учеными всего мира. Инициатива была предложена , чтобы обойти ограничения правообладателей, которые ранее специально препятствовали обмену информацией о птичьем гриппе. Декларировалась надежда, что широкий доступ к данным поможет исследователям быстрее и на благо всех понять, как вирусы распространяются, развиваются и потенциально могут стать пандемией.

Однако, на деле GISAID стала монополистом и продавцом доступа к научной информации, объясняя свои действия «защитой интеллектуальной собственности ». А также — защитой интересов биологической безопасности, т. к. требовала подтвердить статус и легальность покупки ( речь идет о юридическом подтверждении права лаборатории заниматься такого рода исследованиями) - у желающих приобрести информацию.
5 мая 2020 года информационный проект Nextstrain, который объединил на одном сайте информацию о распространении и эволюции не только SARS-CoV-2, но и вирусов гриппа, лихорадок Эбола, Зика и многих других патогенов, - прекратил распространение таблицы с географическим местоположением образцов генома COVID-19. Это произошло потому, что GISAID потребовал, чтобы проект Nextstrain прекратил предоставлять доступ к этому файлу, поскольку он нарушил условия использования, которые требуют не распространять данные какой-либо третьей стороне.

Таким образом, асболютное большинство разработчиков тест-систем ПЦР не только работали с абстракцией, без тестирования систем на вирусном изоляте, но и не имели доступа к новейшим данным о геноме covid-19.
( продолжение следует).

аферисты от медицины
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 12:25  |  БеседаБеседа  |  link: #1823051  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 125
Называется эта система контроля «Унифицированный вирусологический мониторинг», осуществляется отдельно по каждой из известных вирусных инфекций. Для примера можно заглянуть в одну из работ по мониторингу за энтеровирусными инфекциями и убедиться, что за период 2013-2015 года специалистами одной Свердловской области, вне вспышек взято для исследования более 3000 проб от пациентов.
https://cyberleninka.ru/…/unifitsirovannaya-sistema…/viewer…
Такое количество проб можно получить только на потоке, при систематическом отборе биологического материала.
Клиицисты также подзабыли то, что при всех очевидных симптомах того же гриппа, диагноз «грипп» в эпидемию выносится только после объявления эпидемии Роспотребнадзором. Таким образом, именно Роспотребнадзор формально удостоверяет, что симптомы текущей респираторной инфекции массово вызваны именно этим вирусом, причем конкретным его штаммом.

Так что для клиницистов для постановки диагноза культуральный метод может и не нужен, а для эпиднадзора остается актуальным по сию пору.
Культуральный метод исследования не зря назван «золотым стандартом» вирусологической диагностики: он незаменим не только для отслеживания мутаций в т.ч. для актуализации производства вакцин и создания банка данных по штаммам патогенов.
Он необходим для наблюдений за патогенными свойствами вируса : ведь только с использованием культуры клеток и заражением лабораторных животных можно изучать тропизм вируса к определенным тканям ( какой орган вирус выбирает своей мишенью), от чего зависит патогенность и наблюдать за изменениями зараженных клеток - соответственно выявлять разные формы одной и той же инфекции. Это дает врачам информацию о том, как изменяется симптоматика заболевания, какие новые органы и системы будут вовлечены в патологический процесс, особенно при мутациях вируса, и помогает поставить диагноз когда симптомы болезни изменяются.

А еще выделение вируса небходимо для создания ПЦР-тестов лабораторной диагностики инфекции, точнее их верификации и стандартизации.
Разработчику теста ПЦР-диагностики любой инфекции необходим биологический материал для создания так называемого контрольного образца, по которому тестируется система. Контрольные образцы содержат изоляты вируса — выделенные и выращенные отдельно от организма больного, т.е. необходимо убедиться в том, что наличие конкретного возбудителя в этом биоматериале подтверждено не только косвенно, но и прямым культуральным методом.
Окончательным доказательством этиологической роли выделенного вируса в заболевании является положительная биопроба: заражение выделенным вирусом лабораторного животного, восприимчивого к данной инфекции. Заражение животных происходит ввиду перекрестной восприимчивости к вирусам одного вида у некоторых животных и у человека. Однако, животное — тупиковый для вируса путь, и стать элементом эпидемической цепочки, заражать дальше человека и других животных — не может. Именно животные становятся моделью как для изучения свойств вируса, так и при разработке вакцин.
Вирусам свойственна видовая специфичность, т. е. каждый биологический вид в природе болеет своим типом вируса одно и того же семейства.

Особенно актуальным становится требование выделения самого вируса при создании лабораторных тестов по совершенно новой, ранее не исследованной инфекции.
Но почему-то в «Инструкции по проведению этиологической лабораторной диагностики» в версии от 28.04.2020 Временных методических рекомендаций Минздрава по covid-19 нет ни одного слова о выделении вируса SARS CoV-2 как доказательства его существования у пациента.
Казалось бы, все лаборатории Роспотребнадзора должны были броситься искать вирус, выяснять и доказывать, что именно им вызваны все похожие пневмонии у пациентов, которым поставлен диагноз covid-19. Ведь у нас нет недостатка в заболевших — материала от больных бери-не хочу.
А на деле получилось, что отдан приказ - НЕ ИСКАТЬ.

И к этому приказу есть железное обоснование: вирус SARS CoV-2 отнесен к группе I-II патогенности микроорганизмов, т. е. к группе особо опасных и высококонтагиозных эпидемических заболеваний. Работа по выделению таких возбудителей разрешена только Центрам специальной лабораторной диагностики особо опасных инфекционных заболеваний, к коим отнесен новосибирский «Вектор», НИИ Минобороны в Загорске (ныне Сергиевом Посаде) и его филиалы.
Всем остальным лабораториям разрешены тесты ПЦР и серология, т. е. работать с материалом от больных можно, а выделять вирус — нельзя.
Логика, не поддающаяся разумному объяснению с эпидемической точки зрения.
Кстати, как и требование всем одеть маски, накашлять в них — и выбросить куда угодно, вплоть до мусорной урны, откуда порывами ветра особо опасный биоматериал на бумажном листочке разнесется по городу куда дальше, чем на 1,5 метра т. н. «социальной дистанции».

Поразительно, что ковид продолжает оставаться в этом списке инфекций, особо опасных для лабораторной работы, несмотря на подтвержденное абсолютное число бессимптомных и легко болеющих этим заболеванием.

Однако, его родственник SARS CoV-1 в 2002-2003 г.г. на самом деле уносил жизни каждого десятого заболевшего. Давайте сравним требования к лабораторной диагностике этой инфекции в 2004 году от Минздрава РФ с нынешней диагностикой covid-19.
Департамент Госсанэпиднадзора Минздрава РФ в документе от 03.05.2003 «Временные методические рекомендации по лабораторной диагностике "атипичной пневмонии" (SARS) методом ПЦР" и в документе от 04.03.2004 г. в Методических указаниях 1.3.1877-04 о «Порядке сбора и проведения лабораторного анализа биологического материала от больных (и умерших) пациентов с подозрением на тяжелый острый респираторный синдром (ТОРС)» - рассказывает о том, что пробы от больных нужно исследовать методом ПЦР.
Однако, не просто одним мазком из носоглотки, как нынче по ковиду - отправляя всех по одному и тому же результату в «заболевшие», а рекомендует использовать как минимум ТРИ ВИДА клинического материала: мазок из носоглотки (или смыв из носоглотки), мокроту и фекалии. Дополнительно также может быть исследована плазма крови. Каждую пробу клинического материала тестируют ТРЕХКРАТНО. Т.е. всего 9 тестов ПЦР на одного исследуемого.
Далее, рекомендации содержат указания о серологических методах обнаружения в крови пациента антител к вирусу: исследование методом ИФА с тестированием сывороток, взятых на 10, 20 и 30 дни заболевания. Результат считают положительным при выявлении СЕРОКОНВЕРСИИ ( смена отрицательного результата на положительный) или УВЕЛИЧЕНИИ ТИТРА антител в фазе реконвалесценции не менее чем в 4 раза по сравнению с острой фазой.
А отнюдь не однократное получение IgG на коронавирус у исследуемого, как это предлагается сейчас.

И если какое-то из исследований дало положительный результат на этапе верификации — пробы отправляют в ЦСДЛ для проведения ВИРУСОЛОГИЧЕСКОГО исследования.
Потому что (цитата): « полученный методом ПЦР положительный результат с одной или с двумя парами праймеров не является безусловным доказательством наличия вируса SARS, а проба от данного больного подлежит направлению в специализированный центр для проведения подтверждающего анализа».

Можно сказать — образцовые научно-практические рекомендации. То что очевидно следует делать при диагностике новой инфекции.

Почему же они не повторились дословно в случае с covid-19 - ?
Ответ очень прост.

Для изучения ТОРС ( он же SARS CoV-1) были привлечены 13 лабораторий из 9 стран для проведения объединённых исследований этого заболевания. В качестве приоритетных задач ставилось определение этиологического агента, и затем на основании этого – разработка диагностических тест-систем.
16 апреля 2003 года ВОЗ было объявлено, что этиологическим агентом "атипичной пневмонии" является новый патоген, вирус SARS относящийся к семейству коронавирусов, но не родственный ни одному из известных штаммов этого вируса .
В результате тесного сотрудничества ученых из лабораторий разных стран , начатые работы по диагностике возбудителя очень быстро выявили НЕСООТВЕТСТВИЯ между результатами, полученными Канадской национальной микробиологической лабораторией и Гонконгской группой исследователей.
Так, по данным китайских ученых в 90 % вероятных случаев ТОРС (SARS) присутствовал SARS-связанный коронавирус, при отсутствии его следов у здоровых лиц контрольной группы. Ни одна из проб секрета дыхательных путей, взятых от пациентов с другими респираторными заболеваниями, не содержала РНК коронавируса, и ни один из 200 образцов сывороток, взятых от доноров крови, не содержал сывороточных антител к этому новому коронавирусу.
Напротив, по данным канадской группы SARS-связанный коронавирус выявлялся приблизительно у 20 % из 250 человек без подозрения на ТОРС (SARS), которые были протестированы, так как они приехали в Канаду из зараженных областей Азии или имели незначительные симптомы, которые не считались симптомами ТОРС (SARS).
И у чуть менее чем половины заболевших в 4 госпиталях Торонто SARS-связанный коронавирус НЕ выявлялся, при очевидных клинических признаках атипичной пневмонии http://20.rospotrebnadzor.ru/documents/ros/ukaz/152/print/

Возникла необходимость срочно объяснить это несоответствие, так как оно ставило под сомнение чувствительность, специфичность и уместность применяемых диагностических ПЦР тестов. Потому что вирусов, вызывающих острую пневмонию, известно не так уж мало: это и РСВ, и хантавирусы, и аденовирусы и др. Возбудителями пневмонии могут быть также грибы и бактерии, а, кроме того, в разных странах роль этих возбудителей в этиологии ТОРС может быть разной.

При доказательстве этиологической роли коронавируса SARS как возбудителя "атипичной пневмонии" - все исследования в 13 лабораториях проводились с учетом модифицированных для вирусных инфекций постулатов Коха: возбудитель должен обнаруживаться у всех больных с данным заболеванием; он должен быть выделен у пациента и культивирован в чистой культуре, и инфекционный материал должен воспроизводить болезнь у других организмов, с подъемом уровня специфических антител после заражения.

И на этом этапе исследование забуксовало.
Грубо говоря, независимые исследователи сообщили о том, что коронавирус выявляется тогда, когда человек клинически ничем не болен.
И наоборот, не выявляется в пробах от клинически больных атипичной пневмонией. И что в материале от пациентов был такой набор разных патогенов, что вообще трудно было понять — какой из них послужил причиной пневмонии, которую считают «атипичной».
Удивительно похожая ситуация в настоящее время с covid-2019, не находите?

ВОЗ вынуждена была заявить, что до тех пор, пока эти тесты не пройдут соответствующие полевые испытания, и их надежность не будет доказана, диагностика ТОРС (SARS) будет продолжать зависеть от клинических данных, подтверждающих, что атипичная пневмония не вызвана какой-либо другой причиной и контактом с пациентом, больным SARS.
Для улучшения процесса тестирования ТОРС (SARS) ВОЗ рекомендовало клиницистам проводить последовательный сбор образцов материала от пациентов с ТОРС (SARS) и сохранять их для тестирования до того момента, «когда станут доступными надежные диагностические тесты».
ВОЗ также отмечала, что имеется ряд лабораторных тестов, с помощью которых можно выявить, какой вирус является причиной заболевания у человека. Однако все эти тесты имеют «определенные ограничения для использования в случае необходимости ДОСТОВЕРНОГО контроля ситуации с ТОРС (SARS)».https://www.who.int/csr/sars/testing2003_04_18/en/ Т.е. семейство вируса обнаружить можем, а тип и штамм — увы, нет.

Именно с проблемой выделения вируса и секвенирования его генома были связаны такие долгие попытки создать ПЦР-тесты для SARS, хотя согласно официальному отчету института Beijing Genomics Китайской академии наук, SARS вирус «очень быстро мутирует», и потому так трудно создать точные диагностические тесты http://www.biomedcentral.com/news/20030416/04
Таким образом, уже по опыту работы с атипичной пневмонией, вызванной SARS CoV-1 в 2003 году стало понятно, что диагностика методом ПЦР не является универсальным достоверным методом. Потому что помимо стандартных требований к материалу от больного и условиям работы с ним в лаборатории, проблема вызвана серьезными трудностями работы молекулярных биологов по поиску того самого заветного участка генома изменчивого вируса, который будет положен в основу метода ПЦР.

В материалах доклада о разработке и апробации российской тест-системы для выявления РНК коронавируса, вызывающего ТОРС, опубликованного в «Терапевтическом архиве» №4 2004 г. говорится, что биоматериал с выделенным вирусом от ЕДИНСТВЕННОГО пациента из лечебного учреждения Пекина был любезно предоставлен Военно-медицинской академией Министерства обороны Китая. Своих пациентов Россия тогда не имела, за исключением единственного Дениса Сойникова, диагноз SARS которому был поставлен распоряжением Главного санитарного врача РФ Г. Онищенко. Диагноз был поставлен под нажимом г-жи Т. Голиковой, в ту пору зам министра финансов, и вроде как на первый взгляд не имевшей никакого отношения к таким узким вопросам медицины. Однако, выделение МВФ валютных кредитов в т.ч. для нашей страны, напрямую было связано с поддержанием политики ВОЗ и ООН в отношении актуальной темы — борьбы с новой коронавирусной инфекцией.
Тем не менее, более пациентов с ТОРС в России на ту пору 2002-2003 г.г. не наскреблось, по всей видимости ввиду отлаженного лабораторного дела и еще пока существующей на ту пору независимой санэпидслужбой , еще до ее кончины и преобразования в Роспотребнадзор.
В этой же работе настойчиво отмечался приоритет метода ПЦР, как метода с меньшим риском заражения персонала, чем при культуральных методах исследования для особо опасных инфекций. Мысль развивалась до того, что можно вообще обойтись без выделения вируса на культуре , если точно определить уникальную последовательность участка генома, характерную для конкретного вируса и подходящей для дальнейшей синтетической работы в тесте.

Испытания российской тест-системы ПЦР SARS в 2004 г. на пациентах с ПРЕДПОЛАГАЕМЫМ диагнозом ТОРС также прошли на базе Пекинского института микробиологии и эпидемиологии, который предоставил ВОЗ результаты исследований, категорически расходящиеся с результатами ученых Канады, США и Сингапура.
Специфичность устанавливали по сравнению с вирусами ОРВИ (включая иные штаммы коронавирусов) и ОКИ ( острыми кишечными инфекциями).
Т.е. говоря простыми словами, специфики диагностики именно вируса SARS CoV-1 по сравнению с другими известными коронавирусами добиться не удалось, хотя авторы методики утверждали обратное.

Поразительным является тот факт, что еще 25 марта с.г. специалисты ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора сообщили, что они разработали «высокоточный тест» для диагностики коронавируса COVID-19. И что этот тест якобы позволяет как выявить новый коронавирус, так и дифференцировать его от других родственных вирусов, и что тест якобы «успешно прошел клинические испытания».
Каким образом это удалось сделать специалистам Роспотребнадзора в отсутствии необходимых исследований на пациентах с SARS СoV-1 и МERS — остается загадкой, т. к. помимо того, что у российских пациентов вирус COVID-19 не выделялся культуральным методом, вся работа во всех странах создателей тест-систем методом ПЦР впервые в истории лабораторного дела — ведется абстрактно НА ФАНТОМЕ.

аферисты от медицины
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: вчера, 12:25  |  БеседаБеседа  |  link: #1823050  |  Ответов: 5  |  Просмотров: 125
О тестировании на Ковид19

аферисты от медицины

Alexandra Novoselova

#коронавирус Глядя на то, какими бешеными темпами растут цифры тестируемых на covid-19 в нашей стране, я хотела бы обсудить с уважаемыми читателями вопрос, который может быть покажется вначале неожиданным:

А на что НА САМОМ ДЕЛЕ мы тестируем наших граждан? И почему результаты тестирования на covid-19 так идеально совпадают с давно известными сведениями из учебника о широкой распространенности обычной коронавирусной инфекции в структуре всех ОРВИ ( от 4 до 9%), о чем я уже несколько раз писала в своих предыдущих публикациях.

Ни одна инфекция ранее, даже внесенная в тот же список болезней, что и covid -19 ( опасных для общественного здоровья) -,не удостаивалась такого внимания. В этом можно убедиться, заглянув в перечень http://docs.cntd.ru/document/901916651
Тестирование на предмет инфицирования или заболевания ( что не одно и то же) проводилось ранее только по факту самостоятельного обращения человека за медицинской помощью, и чаще всего - на госпитальном этапе. На догоспитальном этапе никто за пациентами не бегал и принудительно без повода не принуждал провериться ни на гельминтозы, ни на ВИЧ.

Достоверно известно, что количество обследованных на коронавирус в наше время многократно превышает количество обследованных на любую из инфекций когда-то в прошлые годы. При этом подход к обследованию беспрецедентный - тестируют массово не только заболевших и контактных, но и тех, кто вообще не имеет никакого отношения как к первым, так и ко вторым. Некоторые работодатели требуют от сотрудников прохождения тестирования под угрозой увольнения, тестируются хирургические пациенты, тестируются закрытые социальные группы, в т.ч. пациенты психоневрологических интернатов, тестируются курсанты военных учебных заведений, тестируются насельники монастырей, идут подомовые обходы с целью тестирования жителей в сельской местности и т. д. При этом рост числа положительных по ковиду - прямо пропорционален росту числа обследованных, несмотря на то что качество тест-систем неоднократно подвергалось специалистами сомнению.
Тестирование происходит под лозунгом спасения всех остальных пока еще здоровых - путем выявления и изоляции максимального количества инфицированных, которым немедленно присваивается статус заболевших. Доктора знают, что слияние смыслов «инфицированный» и «заболевший» есть абсолютная ложь: далеко не у всех инфицированных развивается заболевание, у некоторых лиц вирусные инфекции приобретают форму персистенции ( постоянного присутствия без достаточного для развития болезни размножения и атаки на органы) или иммунная система человека справляется и элиминирует проникший в клетки вирус без всяких последствий.

Обнаружение у 80% и более из числа протестированных лиц бессимптомного носительства или легких форм заболевания covid-19, заканчивающихся самостоятельным выздоровлением - это СРАЗУ характеристика инфекции, которая никак не может находиться в списке опасных. Потому, что опасность инфекции — это ее способность вызывать явные, тяжелые поражения органов и тканей у АБСОЛЮТНОГО БОЛЬШИНСТВА инфицированных. Т.е. при опасной инфекции 80% и более инфицированных не могут оказать сопротивление болезни и тяжело заболевают, а не живут обычной жизнью, без выраженной реакции на инфекцию со стороны организма.

Клиническая же картина легких случаев covid-19 и давно известной коронавирусной инфекции тогда и сейчас различий не имеет: обычная простуда, иногда с поражениями желудочно-кишечного тракта в виде легкого расстройства стула. Лечение у большинства острых респираторных вирусных инфекций также одинаковое, т. е. симптоматическое.
И потому с экономической точки зрения ранее не было никакой целесообразности вдаваться в детальные подробности состава группы ОРВИ и целенаправленно проводить поиск той группы возбудителей , о которых было известно что они существуют и находятся в подгруппе «другие».

До тех пор, пока ВОЗ не закричал на весь мир, что появился новый вирус, угрожающий всему человечеству, вызывающий некие особенные тяжелые поражения легких.

Первый раз это произошло в 2003 году, и тогда не случилось аферы в мировом масштабе и мирового экономического коллапса. В первую очередь потому, что национальные системы здравоохранения многих государств тогда были еще достаточно независимы. Это обеспечивало получение объективной информации о новом возбудителе, т. к. в алгоритме исследования использовали давно отработанные, гарантирующие объективный результат, трехступенчатые методы лабораторной диагностики. Подробнее о событиях 2003 года я напишу в следующий раз, настоящая публикация посвящена методам диагностики covid-2019.

Семейство Coronaviridae широко распространены в природе, это более 40 видов РНК-вирусов, они поражают животных, насекомых, растения и даже грибы.
У коронавирусов существует семь основных типов, которые патогенны для человека. Из них четыре — обычные респираторные вирусы, заканчивающиеся легкими симптомами простуды. И три выделенных недавно, известный SARS-CoV 2002 года (ТОРС-тяжелый острый респираторный синдром), MERS ( ближневосточный респираторный синдром), и SARS-CoV-2 ( ковид), с которым мы имеем дело сейчас.

Коронавирусную инфекцию открыли в 1960-х годах прошлого века как респираторный вирус. С тех пор ни для кого не секрет, что четыре штамма этого вируса все прошлые годы вызывали сезонную острую респираторную инфекцию. Очевидно, что очень многие люди когда-нибудь заражались и переболевали одним из них. Также очевидно, что и как для большинства возбудителей ОРВИ, коронавирусной инфекции присуща латентная персистенция в носоглотке у некоторого % населения. Роль персистенции у носителей респираторных вирусов в эпидемиологическом смысле всегда считалась крайне небольшой и недоказанной в отношении сезонных вспышек. Значительно бОльшую роль играли благоприятные для респираторных вирусов климатические условия в холодное время года и ослабление иммунитета человека в соответствующий период.

Какая же особенность ковидной инфекции вызвала переполох?

В своих рекомендациях ВОЗ ( и переписанные с нее калькой рекомендации нашего Минздрава) вплоть до середины марта с.г. упирали на то, что ковид вызывает «типичные изменения в легких». До такой степени типичные, что даже отсутствие лабораторного подтверждения ввиду несовершенства систем тестирования дает основания клинической комиссии выносить диагноз « COVID».
О несовершенстве тестирования пишет сама ВОЗ и ее транслируют наши СМИ https://www.spb.kp.ru/daily/27115/4194129/ ).
Все пневмонии ( не только вирусные, но и бактериальные, осложнившие вирусные) полетели в ковидную статистику. Главные рентгенологи и пульмонологи немедленно создали методические образовательные программы, обучающие врачей распознавать ковид по КТ-снимкам.
Однако, начались высказывания специалистов в соцсетях, и публикации в западной прессе о том, что те изменения, которые считались «типичными» для ковида, на самом деле обнаруживаются при целом ряде других заболеваний. О чем также за последние тройку десятилетий написана не одна и не две диссертации.

Радиологическое общество Северной Америки (RSNA) опубликовало статью о корреляции КТ грудной клетки и ПЦР при covid-19, в результате чего Центр по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) вынес резюме: «...Ни одно исследование ещё не подтвердило точность и дискриминационную ценность компьютерных томографий, чтобы отличить COVID от других вирусных пневмоний. Поэтому CDC не рекомендует КТ для первоначального скрининга, как подчёркивалось ранее. Лица с подозрением на COVID должны проходить ПЦР-тест, который является наиболее специфическим тестом ...»
ВОЗ , ничтоже сумняшись, что немалое количество пациентов с нековидными пневмониями были расценены по их же рекомендации как ковидные, а соответственно — к таким пациентам были применены и ранняя ИВЛ, и активная стероидная и иммунодепрессивная терапия ( что с моей точки зрения и являлось причиной высокой летальности, т. к. любой студент 4-5 курса мединститута знает исход стероидной и иммунодепрессивной фармакотерапии острых вирусных респираторных заболеваний) — спустя полтора месяца переписывает рекомендации.
Вслед за ним обновляет рекомендации и наш Минздрав.
КТ-диагностика больше не является ведущим методом, на арену выходит «наше все» — метод ПЦР.

Но ВОЗ точно знает нюансы метода ПЦР, которым она рекомендует диагностировать коивдную инфекцию, т. к. отдельно разъясняет: « ...Поскольку существует много типов коронавирусов, рекомендуется не использовать термин «коронавирус» вместо COVID-19. Это помогает уменьшить неопределенность для классификации или кодирования заболевания...»
Другими словами ВОЗ как бы говорит : мы знаем какой результат вам даст ПЦР, поэтому давайте заранее договоримся считать этот результат — подтверждением ковидной инфекции.

Так что же на самом деле имел ввиду ВОЗ, упреждая вопросы по результатам тестирования?

Давайте вспомним об акутальных на сегодняшний день методах диагностики огромного количества вирусных инфекций, которые десятилетиями пользовались и продолжают пользоваться все лаборатории для известных нам кори, краснухи, ветряной оспы, гриппа, полиомиелита, гепатитов В и С, ВИЧ-инфекции и других вирусных болезней - и которыми ВОЗ и наш Минздрав почему-то прямо НЕ РЕКОМЕНДОВАЛИ пользоваться при лабораторной диагностике COVID-19.

С чем связана такая исключительность?
Совершенно точно что «Методические рекомендации для лабораторной диагностики covid-19» удивительно сильно урезаны даже в сравнении с аналогичными рекомендациями по диагностике его ближайшего родственника SARS 2003 года. Хотя мы постоянно слышим от официальных медицинских чиновников и ученых - как похожи эти инфекции и как нам повезло, что патогенность и летальность ковида намного ниже, чем у его родственника.

Более того, нынешние рекомендации по ковиду создают такие условия работы с клиническим материалом, полученным от пациента, что провести лабораторную диагностику ковидной инфекции по стандартной схеме, в том числе дифференцировать возбудитель covid-19 с другими бактериальными инфекциями, которые чаще всего по статистике вызывают тяжелые пневмонии, становится крайне затруднительно или вообще невозможно.
В частности, у большинства пациентов с внебольничными пневмониями (ВБП) наиболее частыми возбудителями являются - Streptococcus pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae ( микоплазменная пневмония давно гуляет по разным регионам РФ, вызывая вспышки с 2012 года ), Chlamydia pneumoniae, Haemophilus influenzae ( пневмония курильщиков и больных ХОБЛ) и другие возбудители. Также есть категории больных с микозами легких, получающие иммуносупрессивную терапию.
Можно ли их обнаружить, следуя рекомендациям Минздрава по дифдиагностике ВБП , если биологический материал от пациента, пригодный к проведению иследования методом бактериологического посева, в Приложении № 3 «Временных методических рекомендаций по covid-19» предлагается при отборе помещать в среду, содержащую противогрибковые и антибактериальные препараты - ?
Можно ли что-то высеять и обнаружить рост микроорганизмов после такой предварительной обработки - вопрос, полагаю, риторический...
А ведь многие вышеперечисленные возбудители дают чрезвычайно похожую клиническую и рентгенологическую картину заболевания пневмонией, отличить их помогают только методы лабораторной диагностики.

Итак, порядок диагностики любой инфекционной патологии определен СанПином — санитарно-эпидемиологическими правилами.
Это нормативный акт, обязательный к исполнению в т.ч. лабораторной службой. Он определяет способы и методы диагностики конкретной инфекции, а также как отличить ее от других инфекций - так называемый дифференциальный диагноз.
Ни одна, даже давно известная инфекция, не ограничивалась в своей диагностике только одним СКРИНИНГОВЫМ методом ПЦР.
Речь не только о верификации диагноза, но и об установлении периода болезни. Ведь каждый из этапов заболевания имеет свои особенности и нередко при отрицательном ПЦР - в крови пациента обнаруживаются антитела, когда вирус из организма элиминировался, а следы иммунного ответа — остались.

Стандартные требования лабораторной диагностики инфекции включают кроме ПЦР еще обязательное серологическое и вирусологическое подтверждение.
Т.е. есть метод обнаружения генетического материала возбудителя ( ПЦР), есть метод исследования ответа организма на инфекцию ( обнаружение в крови антител, синтезируемых иммунной системой в ответ на заражение) и есть крайне важный метод — ВЫДЕЛЕНИЕ САМОГО ВИРУСА.
Только на самом деле убедившись в реальном существовании патогена , образно говоря — увидав его в микроскоп и «пощупав руками» - заразив им культуру клеток и лабораторных животных, можно ответит на вопрос : КТО ЭТО, т. е. произвести ИДЕНТИФИКАЦИЮ возбудителя.
Никакие из любых других методов лабораторной диагностики такой возможности не дают.

Тут уместно вспомнить нашумевший конфуз исследователей смывов с кают лайнера Diamond Princess «Бриллиантовая принцесса», первого международного обсерватора по covid-19. Тогда методом ПЦР в смывах с поверхностей помещений, где проживали зараженные, были обнаружены «осколки» вирусного генома, из чего был сделан вывод о живучести вируса на поверхностях до 28 дней. Однако, довольно быстро микробиологи уточнили, что речь идет не об обнаружении вируса как полноценного живого агента, способного заражать и размножаться, а лишь о генетическом материале, кусочках генома, отражающим следы пребывания вируса в помещении.

В комментариях к моей прошлой публикации многие клиницисты спорили с тем, что культуральные методы выделения вируса якобы давно канули в прошлое, не являются рутинными и для постановки диагноза врачам не нужно дожидаться, чтобы лаборатория из материала пациента выделила вирус.

Однако, такая точка зрения клиницистов отражает лишь их незнание ЭПИДЕМИЧЕСКИХ нормативов наблюдения за инфекциями.

ВСЕ пробы от пациентов должны поступать в лаборатории Роспотребнадзора в порядке эпиднадзора.
Причем не только от медицинской, но и от ветеринарной служб, если речь идет о зооантропонозах ( болезнях, которыми человек заражается от животных).
Для ветеринарной службы вообще имеется сезонный календарь наблюдений и график отправки проб на ту или иную инфекцию вне всяких вспышек.
Также пробы параллельно отбираются не только от пациентов, но и из окружающей среды, если распространение инфекции связано с водой, почвой, пищевыми продуктами и т. д. Желающие могут ознакомиться с презентацией на эту тему по ссылке https://present5.com/sanitarnaya-virusologiya-virusy-v-obe…/

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 23:17  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822994  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
(guest: petr @ 19.05.2020 21:35)
Ссылка на исходное сообщение  А в самой плазмиде вставка Цас9 какого размера? правильного?



вот дошел уже и то такой точки , там есть сайты [EcoRI] и [StuI] на концах этого [ Cas9] , причем онио везде есть во всех этих плазмидах.

В понедельник порежу.. гляну на то что в Плазмиде сидит. А вдруг там таки 4.1кб ... вот удивление то мое как вырастет. Совсем запутаюсь в результатах.

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 23:05  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822992  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
Я много что говорю , нельзя же всему верить... Это искусство такое , врать так чтоб было похоже на правду. И никогда не знаешь где я правду говорю , а где нет.

Неужели вы и взаравду думаете что человеку открыто пишушему в сети про биотерроризм платят социал , а не отправили уже давно бы куда подальше с государственных харчей .. ну В Россию например ... Там биотеррористы наверное нужнее чем в Бельгии. Ну если логически рассудить-то. Зачем Бельгии кормить русского биотеррориста?

Коммерческий биотерроризм
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 22:33  |  БеседаБеседа  |  link: #1822987  |  Ответов: 681  |  Просмотров: 25 690
-1) "Биореакторность " рукокрылых состоит не в насекомоядности,взятой самой по себе,
а в особой системе метаболизма -это единственные млекопитающие, освоившие полёт, требующий огромных нагрузок. Они могут легко уходить от оксидативного стресса.
Именно так учёные- китайцы формулируют суть.
Отсюда и особая иммуная система ( опять сошлюсь на китайцев).
2)
У птиц конечно, метаболизм тоже особый. Но известные на сегодня коронавирусы их поражают гораздо сильнее чем даже млекопитающих.
На вскрытиях соловъёв и кур находят поражения всех органов без исключения, включая мозг.
Вот по этой разнице можно вычислить угрожающие жизни свойства вируса, определив, например,
чем так хороша имммунная и метаболическая
система рукокрылых, по сравнению с птицами.

- А вот интересно как хищники питающиеся рукокрылыми разбираются с этими вирусами?

Нет ли у них какой особой системы имунной защиты от такого био-оружия этих летучемышей?

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 22:18  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822984  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
Я тут под видом вопроса , рассказываю молодежи как оно вот бывает , опытом делюсь.

Иногда бывает тяжело смотреть как они , молодые , мучаются вот на таких подставах старших коллег и шишки набивают.. Хотя оно и полезно ... естесвенный олтбор на настоящего ученого естесвоиспытателя таким образом идет .. если сможет пройти через такие подставы и научиться вовремя все заметить .. будет из него толк .

Хотя это конечно добавит ему пару годиков на диссертационную работу. Но а как без этого ... можно сказать экзамент на зрелось научную.

Никому нельзя доверять в научной тусовке . Мне можно.

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 18:08  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822942  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
Надо же как оно бывает ... вот студентам что надо преподавать-то. Это ж каким недоверием надо обладать чтоб это все заметить

Оказывается есть 3 [pDE-Cas] с разными нуклеазами и все синтетические и оптимизированные под растения, 4.1, 3.4 , 3.2 кб размером. У Аддгена есть в наличии только один вариант , самый распространеный. вот тот что 4.1. Сами они плазмиду эту не пересиквенировали , просто 3 коротких рида сделали что мол похоже что вектор [backbone ] именно тот что заявлен.

Но разница эта хитрая , на карбокси -конце у всех стоит одинаковый сигнал ядерной локалицации с спейсером, Именно к нему у меня праймер с дополнительным сайтом рестрикции. Хотя на самом конце есть неспаренны 2 нуклеотида , но самый последний комплементарный .. Что-то я таки вышел на одну аминокислоту за пределы этого сигнала , а она уже разная у всех .

На другом конце они довольно разные , но с 7-примерно аминокислоты одинаковые там идут сиквенсы на какое-то растояние , и мой другой супердлинный праймер как раз заканчивается там на 10 нуклеотидов полной гомологии между всеми тремя генами.

В такой ситуации ПЦР должна идти плохо , но вот как-то таки идет и с пруф-ридинговой и с обычной [Taq] Только размер продукта что-то не тот что ожидается.

Ну что ж , будем выяснять .. что у нас там , таки другой [Cas9] скорее всего из стафилокка золотистого , судя по размеру вставки.. или же таки делеция в 1кб в [Cas9] из Стафиллококка пиогенного...

Вполне могли авторы схитрить и послать в Аддген другую свою плазмиду .. там сложно что-то заметить так навскудку , огромная плазмида же. но зато те кто купились будут проверять их новую конструкцию на своем опыте .

В принципе меня оно устраивает , но однако ... лучше бы это все знать . Хотя я бы тогда наверное предпочел начать с проверенной версии [Cas9]. А вдруг они не работает или плохо работает? и что тогда ?

У китайцев есть подобная оптимизировання под арабидопсис версия обычного [Cas9], но они ее никому не дают. Я вот решил повторить ту китайскую конструкцию просто быстренько модифицировав то что в легком доступе есть , чисто для себя сделать ... и вот на тебе ... все не так просто оказалось.

Подвох пришел откуда и не ждали.

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 16:04  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822923  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
ATGTGCAGCG AATTCGGCGC GCCATGAAGA GGAACTACAT CCTCGGACTC
7741 G
ATATCGGAA TCACCTCTGT GGGATACGGA ATCATCGATT ACGAGACTAG GGATGTGATC
7801 GATGCTGGTG TGAGACTCTT CAAAGAGGCT AACGTTGAGA ACAACGAGGG AAGAAGGTCT
7861 AAGAGGGGAG CTAGAAGGCT CAAGAGAAGA AGAAGGCACA GAATCCAGAG GGTGAAGAAG
7921 CTCCTCTTCG ATTACAACCT CCTCACCGAT CACTCTGAGC TTTCTGGAAT CAACCCTTAC
7981 GAGGCAAGAG TGAAGGGACT CTCTCAGAAG TTGTCTGAGG AAGAGTTCTC TGCTGCTTTG
8041 CTCCACCTTG CTAAGAGAAG GGGTGTGCAT AACGTGAACG AGGTGGAAGA GGATACCGGA
8101 AACGAGCTTT CTACCAAAGA GCAGATCTCT AGGAACTCTA AGGCTCTCGA AGAGAAGTAC
8161 GTGGCAGAGC TTCAGCTTGA GAGACTCAAG AAAGATGGTG AGGTGAGGGG ATCTATCAAC
8221 AGGTTCAAGA CCTCTGATTA CGTGAAAGAA GCTAAGCAGC TCCTCAAGGT GCAGAAGGCT
8281 TACCATCAGC TCGATCAGTC TTTCATCGAT ACCTACATCG ATCTTCTCGA GACTAGAAGG
8341 ACCTACTACG AGGGACCTGG TGAAGGATCT CCATTCGGAT GGAAGGATAT CAAAGAATGG
8401 TACGAGATGC TCATGGGACA CTGCACTTAC TTCCCTGAAG AACTCAGATC TGTGAAGTAC
8461 GCTTACAACG CTGATCTCTA CAACGCTCTT AACGATCTCA ACAACCTCGT GATCACCAGG
8521 GATGAGAACG AGAAGCTTGA GTACTACGAG AAGTTCCAGA TCATCGAGAA CGTGTTCAAG
8581 CAAAAGAAGA AGCCTACCCT CAAGCAGATC GCTAAAGAGA TCCTTGTTAA CGAGGAAGAT
8641 ATCAAGGGAT ACAGGGTGAC CTCTACCGGA AAGCCTGAGT TCACTAACCT CAAGGTTTAC
8701 CACGATATTA AGGATATTAC CGCTAGAAAA GAGATTATTG AGAACGCTGA GCTTCTCGAT
8761 CAAATCGCTA AGATCCTTAC CATCTACCAG TCATCTGAGG ATATCCAAGA GGAATTGACC
8821 AACCTCAACT CAGAGCTTAC CCAAGAAGAG ATCGAGCAGA TCAGTAACTT GAAGGGTTAC
8881 ACCGGAACCC ACAACCTCTC ACTCAAGGCT ATCAACCTCA TCCTCGATGA GCTTTGGCAC
8941 ACCAACGATA ACCAGATCGC AATCTTCAAC AGACTCAAGC TCGTGCCTAA GAAAGTGGAT
9001 CTCTCTCAGC AGAAAGAGAT TCCTACCACC CTCGTGGATG ATTTCATCCT CTCACCTGTT
9061 GTGAAGAGAT CTTTCATCCA GTCTATCAAG GTGATCAACG CTATTATCAA GAAATACGGA
9121 CTCCCTAACG ATATCATCAT CGAGTTGGCT AGGGAAAAGA ACTCAAAGGA TGCTCAAAAG
9181 ATGATCAACG AGATGCAGAA GAGAAACAGG CAGACCAACG AGAGGATCGA AGAGATCATC
9241 AGGACCACCG GAAAAGAGAA CGCTAAGTAC CTCATTGAGA AGATCAAGCT CCACGATATG
9301 CAAGAGGGAA AGTGCCTCTA CTCTCTCGAG GCTATCCCTC TTGAGGATCT CCTTAACAAC
9361 CCTTTCAACT ACGAAGTGGA TCACATCATC CCTAGATCTG TGTCTTTCGA TAACTCTTTC
9421 AACAACAAGG TGCTCGTGAA GCAAGAGGAA AACTCTAAGA AGGGTAACAG GACCCCTTTC
9481 CAGTACCTCT CTTCATCTGA TTCTAAGATC TCATACGAGA CTTTCAAGAA GCACATCCTC
9541 AACCTCGCTA AGGGAAAGGG TAGGATCTCT AAGACAAAGA AAGAGTACCT TCTCGAGGAA
9601 AGGGATATCA ACAGATTCTC TGTTCAGAAG GATTTCATCA ACAGAAACCT TGTGGATACC
9661 AGGTACGCTA CCAGGGGTCT TATGAACCTT CTCAGGTCTT ACTTCAGGGT GAACAACCTT
9721 GATGTGAAGG TGAAGTCAAT CAACGGTGGA TTCACCTCAT TCCTTAGAAG AAAATGGAAG
9781 TTTAAGAAAG AGAGGAACAA GGGTTATAAG CACCACGCTG AGGATGCTCT CATTATCGCT
9841 AACGCAGATT TCATTTTCAA AGAGTGGAAG AAGTTGGATA AGGCTAAAAA GGTGATGGAA
9901 AACCAGATGT TCGAGGAAAA GCAGGCTGAG TCTATGCCTG AGATCGAGAC TGAGCAAGAG
9961 TACAAAGAAA TCTTCATCAC CCCTCACCAG ATCAAGCACA TCAAAGATTT CAAGGATTAC
10021 AAGTACTCTC ACAGAGTGGA TAAGAAGCCA AACAGAGAGC TTATCAACGA TACCCTCTAC
10081 TCAACCAGAA AGGATGATAA GGGAAACACC CTCATCGTGA ACAATCTCAA CGGACTCTAC
10141 GATAAGGATA ACGATAAGCT CAAGAAGCTC ATTAACAAGT CTCCAGAGAA GTTGCTCATG
10201 TACCACCACG ATCCTCAGAC CTACCAAAAG CTCAAGCTCA TCATGGAACA GTACGGTGAT
10261 GAGAAGAACC CTCTCTACAA GTATTACGAG GAAACCGGTA ACTACCTCAC CAAGTACTCA
10321 AAAAAGGATA ATGGACCTGT GATCAAGAAG ATTAAGTACT ACGGAAACAA GCTCAACGCA
10381 CACCTCGATA TCACCGATGA TTACCCTAAC AGTAGAAACA AGGTGGTGAA GCTTTCACTC
10441 AAGCCTTACA GGTTCGATGT GTACCTCGAT AACGGTGTGT ACAAGTTCGT GACCGTGAAG
10501 AACCTCGATG TTATCAAAAA AGAAAACTAC TATGAGGTTA ACTCTAAGTG CTACGAGGAA
10561 GCTAAGAAGT TGAAGAAGAT CTCTAACCAG GCAGAGTTCA TTGCTTCATT CTACAACAAC
10621 GATCTTATCA AGATTAACGG TGAGCTTTAC AGGGTTATCG GAGTGAACAA CGATTTGCTC
10681 AACAGGATCG AGGTGAACAT GATTGATATC ACCTACAGGG AATACCTCGA GAATATGAAC
10741 GATAAGAGGC CTCCTAGAAT CATCAAGACT ATCGCTTCTA AGACCCAGAG TATCAAGAAG
10801 TACTCTACCG ATATCCTCGG AAACCTCTAC GAGGTTAAGT CAAAGAAGCA CCCTCAGATC
10861 ATTAAGAAGG GATCAAGGGC TGATCCTAAG AAGAAGAGGA AGGTTTGA

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 15:48  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822920  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
T‐DNA constructs

The vectors used in this study were based on our previously described CRISPR/Cas system (Fauser et al ., 2014; Schiml et al ., 2014). These Gateway® compatible vectors contain either a destination cassette (pDe‐St1_Cas9, pDe‐Sa_Cas9) or an entry cassette (pEn‐St1_Chimera, pEn‐Sa_Chimera). Therefore, orthologous Cas9 ORFs from S. thermophilus and S. aureus were codon‐optimised for A. thaliana, synthesized by GeneArt® (Life Technologies Corporation, www.lifetechnologies.com) and flanked by Asc I recognition sites. These ORFs were transferred into the pDe‐Cas9‐D10A vector by exchanging the S. pyogenes Cas9 ORF with St1Cas9 or St1Cas9 using Asc I to create pDe‐St1_Cas9 and pDe‐Sa_Cas9, respectively. The destination vectors harbour a kanamycin resistance cassette (npt II) as previously described for pDe‐Cas9‐D10A (Fauser et al ., 2014).

The entry vectors were also assembled by GeneArt® and harboured species‐specific sgRNAs. Spacers can be introduced via Bbs I as previously described (Fauser et al ., 2014).

For analysis of β‐glucuronidase activity with SaCas9 constructs, the oligonucleotides JS 233 and JS 234 were used for oligo‐annealing and subsequent cloning into pEn‐Sa_Chimera (all oligonucleotides used in this study are listed in Table S1). Cross‐species constructs for β‐glucuronidase activity assays were assembled by pairing destination vectors of one species with entry vectors of another species, for example pDe‐Sa_Cas9 with pEn_Chimera or pDe_Cas9 with pEn‐Sa_Chimera vectors.

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 15:36  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822915  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
An interesting question to consider is the extent of the off‐target effects of the St1 and SaCas9 orthologues. Both orthologues require longer PAMs than the SpCas9; six nucleotides (‘NNAGAA’ or ‘NNGGAA’) are required for St1Cas9, and five to six nucleotides (‘NNGGGT’ or ‘NNGAA’) are required for SaCas9, whereas only three nucleotides (‘NGG’) are required for SpCas9 target recognition, which should significantly reduce the frequency of off‐target cutting compared with SpCas9. The downside to this higher specificity is the resulting decrease in potential target sites. To exclude off‐target effects beforehand, one could also apply the paired nickase approach to the orthologous Cas9 proteins, as we were able to do in plants using the SpCas9 CRISPR/Cas system (Schiml et al ., 2014).

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 15:31  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822910  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
похоже я нашел где собака .. ну как обычно аспиранты перепутали пробирки или не обратили внимание на разницу [Sp - Sa]... хотя может и неслучайно это все

как раз похоже на то, но странно что никто у них там на это внимание не обратил до сих пор ... видимо работает и ладно ... а то что там другой [Cas9] в векторе .. никто и не видит.

Или хотят таким образом узнать у меня .. а таки работает оно или нет ? им самим проверять лень или некогда .

..............
The orthologous CRISPR/Cas systems described here were able to mediate efficient editing in A. thaliana plants and could also be applied to induce targeted DSBs at any desired locus. Applications for which these orthologues will be useful include target genes in which SpCas9 PAM sequences are not present and approaches in which vector sizes are limited. Both orthologues described here are 1 kb smaller than the commonly used SpCas9 (3.4 kb for St1Cas9 and 3.2 kb for SaCas9 compared with 4.2 kb for SpCas9). The use of these orthologues in complex genetic approaches, such as simultaneous applications of different CRISPR/Cas‐associated or ‐fused enzyme activities, will be of special importance in the future.

Пруф-ридинг полимераза вопрос
Asterix
Постоянный участник


Отправлено: 23.05.2020 00:16  |  Молекулярная и клеточная биологияМолекулярная и клеточная биология  |  link: #1822831  |  Ответов: 29  |  Просмотров: 642
Ну картина проясняется похоже , смена полимеразы ничегошеньки не изменила в результате

кусок в почти 1кб отсуствует , причем именно из вставки , то есть из [Cas9]. Все дело похоже в матрице , там делеция .

Таки не подвело меня мое чутье .. подсунули нам с широкой дружеской улыбкой и задаром другой вектор, видимо нерабочий , а не тот с которым они реально работают.. Вот ведь коллеги то по-университету ... змеи какие бывают, но я и это раскусил , не впервой чай.

у нас тут подобные подлянки очень в ходу...

Но однако же 2 месяца понадобилось на все это , чтоб понять что это не случайный сдвиг .. Ну не могу же я все что мне дают пересиквенировать заново, надо же и доверять людям

Другой-то вектор они вроде нормальный дали , хотя кто занет , кто знает

А представье себе аспирант бы какой это делал вместо меня ? у него же чутья подобного нет, и выяснил бы через год, что странно как-то что ничего не работает. Ну и все.

Вообще нам везет на подобные дружеские шуточки , из Новой Зеландии тоже прислали вектор для трансформации плесени .. все опубликовано , но ничего не работает ..
страницы (46):  1 2 3 > »  

Новые сообщения  Есть новые сообщения
Нет новых сообщений  Нет новых сообщений
Нет новых сообщений*  Тема с вашим участием
Горячая тема - новые сообщения  Горячая тема (есть новые сообщений)
Горячая тема - нет новых сообщений  Горячая тема (нет новых сообщений)
Важно - нет новых сообщений  Важная тема
Опрос - есть новые голоса  Опрос — есть новые голоса
Опрос - нет новых голосов  Опрос — нет новых голосов
Опрос -нет новых голосов  Опрос с вашим участием
Объявление  Объявление
Тема закрыта  Закрытая тема
Тема перемещена  Перемещённая тема


Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 25.05.20 18:51
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft