Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
Vadim Sharov moderator Россия |
Группа ученых из Университета Рутгерса и Городского колледжа Нью-Йорка в США идентифицировала белок, который, возможно, сыграл решающую роль в возникновении жизни, какой мы ее знаем. Этот простой пептид был назван Nickelback. Исследование о белке опубликовано в журнале Science Advances. Всю жизнь был Ратгерс, но молодые журналисты надругались! Название громкое, но описание белка, минимальной железо-никелевой редуктазы. Название статьи просто высосано из пальца Олесей Маевской. Конечно намеки в статье есть, но спонтанная абиотическая комбинаторика 13 членных олигомерных пептидов, из классических, а главное непростых аминокислот, включая аспарагин и аргинин? Трудно поверить. Создали минимально работающий ферментативный центр - хорошо, бредятина же про происхождение жизни чрезмерная. Ранний этап развития жизни при восстановительной биосфере - можно говорить. Но не о абиотической стадии. -ВШ |
Vadim Sharov moderator Россия |
Нити F-пилей — довольно длинные и тонкие, поэтому считается, что конъюгацию можно затруднить или вовсе нарушить внешним воздействием, например интенсивным перемешиванием. Однако новая работа ученых из Имперского колледжа Лондона показала, что такие условия ничуть не мешают конъюгации и переносу генов. F-пили оказались неожиданно прочными и устойчивыми, выдерживая и высокие температуры, и химически агрессивную среду. Об этом сообщается в статье, опубликованной в журнале Nature Communications. |
Vadim Sharov moderator Россия |
Чтобы не повторять уже не раз повторенное о том, что за архейный Асгард такой, просто направим вас на обзор двухлетней давности, продолжением которого является сия заметка. На тот момент, когда он писался, помимо упомянутых в нем групп архей Асгарда уже были открыты еще две, нами упущенные. Сейчас исправимся. Из глубины осадочных отложений морского дна у Коста-Рики ученые извлекли сифархей (Sifarchaeia) — название дано в честь Сиф, златовласой богини плодородия, супруги Тора (первоначальный анализ показал близкое родство сифархей с торархеями, хотя на более поздних схемах они разнесены между собой). А в ископаемых остатках эпиорниса (!) с Мадагаскара обнаружились ёрдархеи (Jordarchaeia) — в честь великанши Ёрд, богини земли, матери Тора. Два новых женских персонажа в пантеоне архейного Асгарда — это прекрасно (жаль, их пока никто не нарисовал), особенно если принять во внимание таксономическое «разжалование» архей имени Хель и Герд. Дело в том, что таксономию архей Асгарда в последние годы подвели под обновленные стандарты, и большую часть ранее описанных филумов (с окончанием -archaeota) теперь рассматривают в качестве классов (с окончанием -archaeia). Однако некоторые из них были еще сильнее понижены в ранге по результатам новых филогенетических анализов. Так, хельархей следует скорее считать разновидностью локиархей — порядком Helarchaeales в классе Lokiarchaeia (с точки зрения скандинавской мифологии это даже логичнее, ведь Хель — дочь Локи). Ну а гердархеи — это теперь порядок Gerdarchaeales в классе Heimdallarchaeia. Хеймдалльархеями также признаны недавно описанные ньёрдархеи (Njordarchaeales), названные в честь морского бога Ньёрда, и уже знакомые нам хёдархеи (Hodarchaeales) и кариархеи (Kariarchaeaceae) — последние вообще разжалованы до семейства в порядке Heimdallarchaeales. Борархеи же оказались разновидностью сифархей, предположительно в ранге порядка, а может, и семейства. Асгардархеи в широком смысле прежде объединялись в суперфилум Asgard, теперь же это филум Asgardarchaeota (в таксономии бактерий и архей филум — аналог типа у животных или отдела у растений и грибов). И чтобы окончательно всех запутать, международная научная группа под руководством шведа Тийса Эттемы месяц назад добавила в архейный Асгард новый класс Asgardarchaeia — асгардархеи в узком смысле (на втором слайде видны). Зачем такое творить, непонятно. Как будто в мифическом коллективном Асгарде не осталось индивидуальных божеств, чтобы дать свое имя таксону. Эта группа представлена пока единственным геномом с неясным положением на древе асгардархеот, ее формальное описание в процессе подготовки — возможно, в нем Эттема объяснит свои мотивы. Пожалуй, главным достижением нового исследования является более-менее четкое определение истоков эукариотической жизни самыми продвинутыми методами филогеномики. Хотя еще с открытия хеймдалльархей в прошлом десятилетии пестовалась гипотеза, что именно они являются ближайшими родственниками архей, через симбиоз с бактериями породивших эукариот полтора-два миллиарда лет назад, все-таки некоторые сомнения до сих пор оставались, и даже в публикациях последних лет не исключалась возможность, что эукариоты — лишь сестринская ветвь по отношению к группе Asgard. Теперь же можно уверенно говорить: наш архейный предок был хеймдалльархеей, больше всего похожей на хёдархею («лысого из Асгарда», как мы в редакции прозвали этого микроба в образе слепого бога Хёда). Примечательно, что у асгардархеот в принципе относительно крупные геномы, а у хёдархей одни из самых крупных среди них (у локиархей тоже очень крупные) — результат многочисленных дупликаций и не слишком частых утрат генов на протяжении эволюции. Общий предок всех архей Асгарда, согласно выводам Эттемы и коллег, был предположительно термофильным хемолитотрофом, однако хеймдалльархеи в целом промышляют гетеротрофией, а хёдархеи к тому же еще и предпочитают умеренные температуры: оптимум для них — 36,7 °C (наименьший во всем Асгарде). Схожими качествами, вероятно, обладали и предки эукариот. Как видно, они развивались в весьма человеческих условиях. Рисунок: Статья: |
Vadim Sharov moderator Россия |
Сравнение геномов современных видов пчел показало, что эти насекомые возникли на западе древнего суперконтинента Гондвана еще 120 миллионов лет назад, до разделения Африки и Южной Америки. Подробнее: |
Vadim Sharov moderator Россия |
Современные рептилии не способны фильтровать воду, чтобы вылавливать мелкую добычу. Однако их некоторые древние предки питались именно так. До сих пор был известен лишь один подобный пример, а недавно ученые обнаружили второго морского ящера-фильтратора. Китозавр или улыбка эволюции - ВШ |
Vadim Sharov moderator Россия |
Ксенотрансплантация — пересадка человеку органов от животных — может помочь многим пациентам, которым не хватает донорского материала или которым он не подходит. Во время нового эксперимента ученые пересадили человеку со смертью мозга свиную почку с «выключенным» геном альфа-1,3-галактозилтрансферазы. Теперь можно констатировать, что операция увенчалась успехом: спустя месяц после нее орган продолжает бесперебойно работать. |
Vadim Sharov moderator Россия |
Циклиды — группа вымерших ракообразных, остающаяся загадочной из-за редкости их ископаемых остатков. Они существовали как в бассейнах с различной соленостью, так и в пресных водоемах. Циклиды были компонентами рифов и селились на морском дне, бедном жизнью. Не известны ни их предки, ни причины их вымирания. Морфотип циклид позволяет рассматривать их происхождение по аналогии с процессом появления крабов от омароподобных предков и на этом основании предположить, как могла выглядеть их предковая форма. Циклиды полны тайн: до сих пор невозможно найти им точное место в системе членистоногих; неизвестно, кто мог быть их предком и почему они исчезли. Описано лишь 54 вида этих древних животных — «капля в море» видового разнообразия членистоногих. Долгое время циклиды мало интересовали палеонтологов. Сегодня же накопилось достаточно материала, чтобы его обобщить, провести таксономическую ревизию и сделать осторожные предположения об их происхождении и эволюции. Подробнее в статьях: Мычко Э.В. (2022) Удивительные циклиды—свидетели Великого пермского вымирания: Часть II. Природа. №. 10, С. 26-35. DOI:10.7868/S0032874X22100039 Мычко Э.В. (2022) Удивительные циклиды—свидетели Великого пермского вымирания: Часть I. Природа. №. 9, С. 12-23. DOI:10.7868/S0032874X22090022 |
Vadim Sharov moderator Россия |
Это не коснулось только африканцев |
Vadim Sharov moderator Россия |
Недавно была выдвинута новая любопытная теория филогенеза - «гипотеза внешнего брожения». Её суть заключается в том, что эволюционно увеличению объема головного мозга у предков людей способствовало регулярное употребления ферментированной пищи, т.е. полученной с помощью микробного (внешнего) брожения. В основе концепции (https://www.nature.com/articles/s42003-023-05517-3) заложены 2 неочевидных различия между людьми и приматами - у людей объем головного мозга больше, а протяженность толстой кишки - меньше (примерно на 70%). Предположительно, эти особенности могут иметь общий механизм возникновения. Сама возможность «внешней» ферментации очевидна - ранние гоминины (филогенетическое подсемейство, к которому относится человек) могли переносить и хранить пищу, непреднамеренно приводя к её ферментации. Со временем эта практика, возможно, превратилась в культурно закрепленный феномен, что повлияло на развитие человека как вида. Предполагается, что уменьшение длины толстой кишки является следствием снижения потребности в расщеплении растительной пищи, в результате адаптации к ферментированной внешним способом еде. Увеличение объема головного мозга имеет более неочевидное объяснение. Само по себе развитие тканей и структур мозга (как и любого другого органа) возможно лишь при перераспределении и увеличении доли ресурсов на его энергоснабжение. Теоретически, при меньшем размере толстой кишки, но при сохранной возможности получать достаточно калорий за счет ферментированной пищи, развитие головного мозга таким образом становится возможным. Данная концепция имеет некоторые теоретические преимущества над другими ныне существующими гипотезами об эволюции головного мозга человека. Например, употребление ферментированной пищи требует гораздо меньше когнитивных способностей, в отличии от сбора клубней, добычи мяса или приготовления пищи на огне. К тому же, в отличии от приготовления пищи на огне, брожение — пассивный процесс, который облегчал обработку пищи гомининам с изначально низким уровнем интеллекта. Чтобы проверить гипотезу исследователи инициировали изучение генетических сдвигов, связанных с метаболическими, пищеварительными и иммунными процессами, на которые бы повлияла внешняя ферментация (включая анализ генов обонятельных рецепторов, воспринимающих ферментированную пищу). Также среди задач данного исследования - сравнительный анализ микробиома человека и генетически ближайших видов приматов. Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 01.12.2023 12:27 |
Vadim Sharov moderator Россия |
То есть еще большой вопрос, а есть ли эти самые генетические механизмы, «ускоряющие старение», но теорию происхождения этих механизмов уже предложили. Куда же без динозавров, их то не спросишь, генетический анализ не проведешь. Британские ученые! |
Vadim Sharov moderator Россия |
Спор времен, когда спама было мало (тм) |
Vadim Sharov moderator Россия |
✒Автор Д.В. Богданов Книга знакомит с животным миром, который существовал в пермском периоде на территории современной России. Множество уникальных находок свидетельствуют о том, что на протяжении перми здесь жили терапсиды (в том числе предки млекопитающих), а также другие удивительные создания, их современники. Рассказу об их биологических особенностях, образе жизни, взаимоотношениях и природных условиях, в которых они обитали, посвящена эта книга. Читатель узнает также об учёных-палеонтологах, изучавших и открывших нам эту давно ушедшую эпоху. Отличительная особенность и несомненное достоинство данного издания — красочные авторские иллюстрации, воссоздающие облик древних животных и картины их жизни. Автор книги, Д.В. Богданов, по профессии врач-кардиолог, доктор медицинских наук, однако он с детства интересовался палеонтологией, рисовать вымерших животных начал с десяти лет. Публиковал свои рисунки в журнале «Палеомир», в ряде статей отечественных и зарубежных палеонтологов. В 2014 г. прошла его персональная выставка в Палеонтологическом музее им. Ю. А. Орлова в Москве. По рисункам автора выполнены металлические статуи звероящеров для Очёрского краеведческого музея им. А.В. Нецветаева. Книга предназначена всем, кто интересуется палеонтологией, вопросами происхождения и развития жизни на Земле и историей науки. 📚КУПИТЬ печатную книгу можно по ссылке: |
Vadim Sharov moderator Россия |
Известный российский палеонтолог, ведущий научный сотрудник Палеонтологического института РАН, Дмитрий Евгеньевич Щербаков, на днях опубликовал результаты очень важного исследования, посвященные изучению эволюции членистоногих. Далее приводится текст его же заметки об этом исследовании на сайте ПИН РАН: Cто лет назад было принято считать, что насекомые произошли от многоножек, а членистоногие в целом – от многощетинковых червей. За последние полвека было выдвинуто несколько гипотез, переворачивавших привычные взгляды. Популярным стало мнение о полифилии артропод. Молекулярные кладограммы подтвердили полузабытую идею о близости насекомых к ракообразным, но при этом объединили артропод не с кольчецами (в составе Articulata), а с круглыми червями (в составе Ecdysozoa). На основе синтеза данных морфологии, палеонтологии и генетики развития энтомологом Палеонтологического института им. А.А. Борисяка РАН предложен эволюционный сценарий, согласно которому высшие раки дали начало насекомым, многоножки возникли от шестиногих предков, первые панартроподы (динокариды) произошли от полихет, а не-артроподные группы экдизозоев (нематоды и прочие) испытали вторичное упрощение с утратой сегментации. Для тех, кто в качестве отображения филогенетического родства между организмами приемлет только кладограмму, утверждение «насекомые родственны ракообразным» означает, что это две сестринские группы, произошедшие от неизвестных общих предков (не являющихся ни раками, ни насекомыми). На самом деле все гораздо интереснее. На самых примитивных насекомых – прыгающих щетинохвосток Archaeognatha (махилид и других) – больше всего похожи Syncarida (такие как тасманийские горные креветки), то есть достаточно продвинутые высшие раки. Это многостороннее сходство простирается вплоть до клеточных структур и характера экспрессии генов. Объяснить столь глубокое сходство конвергенцией невозможно, тем более что среда обитания у археогнат наземная, а у синкарид водная. Значит, насекомые – потомки высших раков (как предполагал еще в XIX в. немецкий зоолог Фриц Мюллер), и их предкам, прежде чем перейти на более высокий эволюционный уровень, пришлось преодолеть предыдущий, рачий. Щетинохвосткам для прыжка за счет удара брюшком по субстрату на суше необходим больший объем брюшных мышц, чем креветкам для гребка хвостовым веером в воде. Поэтому при превращении раков в насекомых пять задних сегментов рачьей груди перестроились по образцу брюшных, так что брюшко стало длиннее, а число ног сократилось до трех пар. Подобные перестройки называют гомеотическими, как и гены, контролирующие рост и дифференцировку. Кроме того, насекомые унаследовали некоторые эмбриональные или личиночные черты синкаридных предков (такие изменения называют неотенией). Забытая идея Эрнста Геккеля о том, что многоножки возникли от шестиногих предков, получила подтверждение со стороны генетики развития. У раков и насекомых подразделение туловища на грудь и брюшко регулируется одной и той же системой генов. Независимое приобретение двумя этими группами одинакового генетического механизма почти невероятно, зато его отключение могло происходить не один раз, приводя к превращению всех сегментов в грудные (снабженные ногами) и возникновению Myriapoda и подобных им форм (в том числе рачков Remipedia). Брюшко раков и примитивных насекомых обеспечивает экстренную локомоцию (гребок или прыжок). При скрытом образе жизни такая реакция бегства теряет смысл, поэтому многоножки и ремипедии утратили подразделение на грудь и брюшко и другие черты рачьих предков. Ногохвостки и их близкие родичи моделируют начальные этапы данного процесса («мириаподизации») у примитивных насекомых. Читайте по ссылке Итак, кладистическая идеология неприложима к макроэволюции. Новые (дочерние) группы высокого ранга возникают от продвинутых, специализированных представителей предковой (материнской) группы в связи с проникновением в новую адаптивную зону и повышением уровня организации. Дочерние группы могут далее эволюционировать как путем прогрессивного совершенствования нового плана строения, так и путем его регрессивного упрощения. © Д.Е. Щербаков © ПИН РАН текст Публикация: Shcherbakov D.E. The main line of the evolution of Articulata – from polychaetes to insects // Paleontological Journal 2023. V. 57. № 11. P. 1286–1297. DOI: 10.1134/S0031030123110126 Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология" 20.02.2024 22:56 |
thewalterwhite11 |
|
« Предыдущая тема · Конференции · Следующая тема » |