molbiol.ru -> Раскрыты причины скопления редких кодонов в начале генов

> Все форумы > Тематические форумы > Колонка новостей

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Раскрыты причины скопления редких кодонов в начале генов

Кураторы темы:* Newsline
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

Newsline
Участник
Paris, France

03.11.2013 12:42

URL #1

картинка: ______________2013_11_03___10.34.32.png

Большинство аминокислот кодируются несколькими кодонами, и выбор кодонов оказывает большое влияние на экспрессию генов. Во многих организмах редкие кодоны сгруппированы в N-концевой части генов, и долгое время смысл их там присутствия был предметом горячих дебатов. Даниель Гудман и его коллеги из Гарвардского университета в Бостоне синтезировали более 14,000 искуственных генов-репортеров и показали, что редкие кодоны, по сравнению с обычными, на порядок (в среднем – в 14 раз) усиливают уровень экспрессии генов. Удивительно, что причиной усиления оказались не редкие кодоны сами по себе, а отстутствие вторичной структуры мРНК: согласно работе, редкие кодоны в начале гена практически не "спариваются" с близлежащими нуклеотидами участка связывания рибосом - последовательностью Шайна-Дальгарно, - тем самым облегчая посадку рибосом и трансляцию мРНК.

Работа предлагает средство оптимизации экспрессии генов в клетках бактерий и понимание как эта оптимизация была достигнута природой: N-концевая часть гена сформировалась, по-видимому, в соотстветствии с требованиями ко вторичной структуре мРНК.

Работа:
http://www.sciencemag.org/content/342/6157/475.short

На рисунке:
5% лучших (голубой) и 5% худших (розовый) транскриптов и наличие в них вторичной структуры (оцененное по способности к гибридизации) показывает что уровень экспрессии гена определяется вторичной структурой первых его кодонов (в данном случае – первых десяти кодонов). Каждый ген-репортер содержал последовательность RBS - сайт связывания рибосом, - за которым следовали десять кодонов разной последовательности, после чего - ген флуоресцентного белка (GFP), используемый для количественной оценки уровня экспрессии гена в E. coli.

Сообщение было отредактировано Newsline - 19.11.2013 15:38

Поблагодарили (10): Mike Shelk, Esya, Shanty, aivanov, niksavelov, бутанол, SVZ, campus, Vadim Sharov, Replikant

Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология"
18.11.2013 13:54

papa Karlo
Постоянный участник

18.11.2013 16:50

URL #2

Приятная работка. Давно уже подозревал что вся эта бодяга с оптимизацией кодонов как правило ничего реально не дает. Ну а то что структура РНК на 5-конце сильно влияет на экспрессию давно известно, наконец-то узнали в чем именно там дело.

Кстати российким исследователям на заметку ... работа технически несложная , может выполняться силами студентов-дипломников

По этому шаблону можно целую серию подобных быстрых работ сделать которые будут вполне неплохо публикабельны в приличных журналах.

Можно например искать сигналы влияющие на стабильность РНК. Оптимизация кодонов иногда дает удивительный еффект именно благодаря разрушению каких-то сигналов внутри последовательности РНК. Хорошо было бы всю матрицу этих сигналов найти. Вот это было бы огромное подспорье в деле оптимизации продукции. Иногда ведь надо и уменьшить экспрессию и трансляцию замедлить... .

Поблагодарили (4): Newsline, Esya, niksavelov, Atropos

comp3v
Постоянный участник
Москва

18.11.2013 18:14

URL #3

(Newsline @ 03.11.2013 13:42)

На рисунке:
5% лучших (розовый) и 5% худших (голубой) транскриптов

Вроде бы, на рисунке цвета наоборот.

Поблагодарили (1): Newsline

ппп
IP-штамп: frxGOYQklo76Y
гость

19.11.2013 04:59

URL #4

В прошлом году была еще работа о влиянии первичной структуры мРНК на скорость трансляции. Там анти-SD-триплеты снижали скорость, а редкие кодоны тоже ни в чем не виноватыми оказались

http://www.nature.com/nature/journal/v484/...ature10965.html

Поблагодарили (1): Newsline

Guest
IP-штамп: frUzndTPtjFPI
гость

20.11.2013 00:11

URL #5

Забыли про информосомы Спирина 1964 года прочитать и процитировать.

guest: проходил мимо
IP-штамп: frGqyYT8IU7LU
гость

20.11.2013 10:06

URL #6

Информосомы - феномен эукариотических клеток. А в этой работе речь про трансляцию у прокариот.

Поблагодарили (1): Newsline

Guest
IP-штамп: frUzndTPtjFPI
гость

21.11.2013 22:22

URL #7

То есть пока микробы одни и до работ Спирина в 1964 году не дошли.

직장인대
IP-штамп: frpXXFAb.iklM
гость

02.12.2020 10:58

URL #8

I want to say thanks for beautiful blog sharing with us. Your blog really great resource to update my knowledge.
직장인대출

먹튀검증
IP-штамп: frpXXFAb.iklM
гость

02.12.2020 10:58

URL #9

This is a brilliant blog! I'm very happy with the comments!.
먹튀검증업체

watchesbiz
Постоянный участник

29.09.2021 04:59

URL #10

https://archives.profsurv.com/forum/Profess...ert/-67881.aspx
https://atlanta.bubblelife.com/community/an...ex_Watch_Online
https://gumroad.com/rolexrelicawatches/p/di...replica-watches
https://onmogul.com/stories/guide-on-how-to...ex-watch-online
https://list.ly/i/5704105
https://www.behance.net/gallery/114237003/Replica-Rolex
https://www.mlbdailydish.com/users/Replicarolexwatches
http://replicawatches24.simplesite.com/
https://watcheshutuk.cabanova.com/
https://www.pinterest.com/watcheshutuk/_saved/
https://www.linkedin.com/pulse/guide-how-pu...online-hei-bai/
https://justpaste.it/8t11q
https://padlet.com/watcheshutuk/in2opwnfmnmclce8
https://www.allforxi.com/users/Replicarolexwatches
https://profile.hatena.ne.jp/Rolexrelicawatches/profile

kriz
Постоянный участник

24.10.2021 23:10

URL #11

jad12
IP-штамп: frWoyLp/FCXKE
гость

16.11.2021 15:04

URL #12

Found your post interesting to read. I cant wait to see your post soon. 비아센터

jad12
IP-штамп: frWoyLp/FCXKE
гость

17.12.2021 10:38

URL #13

Great line up. We will be linking to this great article on our site. Keep up the good writing.라이브카지노

vrida2
Постоянный участник

27.03.2022 00:47

URL #14

Scar156.3BettCHAPHaro
CabaStamChinAstrMich
XVIIEverTescChatHjer
ColuTemaFondPaleXIII
ErneChevPhilMenuRose
ItalScheVladSidnOral
etslThanPresVisoGoog
WestXIIIFreeLeviXIII
WillNeerAeliBollStar
HomecollMoreRonaAlic
SilvMathLineSideTimo
TracAdioMarkSeeiMacb
XIIIYasuXVIIXVIIRoma
NikiMariMoutMagnBrat
DukeCircWahlFatiAtti
QuikZoneValeSignLAPI
ivilCalvFinaArtsRust
HamiTechMargMarkDani
ZoneJeuxZoneBriaLewi
JeweZoneZonePhilGerd
ChriPatrdiamZoneZone
ZoneZoneRuthKareZone
XVIIGoldZoneZoneZone
XIIIPariOMEGInducraq
CandSamsBekoWindGona
SKATDeclRuyaJustWolf
GiglOlmeSQuiTOYOLEXU
GermAtlatracValiEduc
EditreceChicTranLuci
MiddJewePeteLEGObeca
SileFourRoyauCelMicr
AnnoWindAmerDolcLike
SunsJeweHumaAcadDidi
XVIISergFyodNorgRebi
RabiGustHiveMusiMPEG
LikeColiPresPetzRobe
InteShoeLeyyReliDavi
XVIIFranRichPanaWill
GaryWindultrAlleRobe
IvanSymbMahaHomoMaki
StraTracNickCollFeli
InduInduInduWindTuni
FocuWindwwwrStershoc
OZONAnttXVIIXVIIVaru
tuchkasHaroMali

vrida2
Постоянный участник

26.06.2022 06:25

URL #15

guest: Ufa1688
IP-штамп: frGvfkzt/vMtQ
гость

06.07.2022 10:11

URL #16

The seller also claimed ทางเข้าufa1688 the unsecured database ufabet เข้า สู่ระบบ had been hosted by Alibaba Cloud aff 1688 a subsidiary of Chinese AMB slot e-commerce giant Alibaba Microgaming When reached by CNN แทงบอลออนไลน์ for comment on Monday บอลสเต็บ Alibaba said we are looking หวยออนไลน์ into this and would communicate any updates หวยลาว On Wednesday, Alibaba said หวยรัฐบาล it declined to comment.

nigoal123
IP-штамп: frGvfkzt/vMtQ
гость

06.07.2022 10:36

URL #17

An article is written with nigoal the following objectives ลิงค์รับทรัพย์ It brings out the topics or the sexy gaming matter of interest in the limelight dream gaming The article provides information ka gaming on the topics It offers suggestions
and pieces of advice It influences nigoal 50รับ100 the readers and urges พริตตี้เกมมิ่ง them to think The article discusses PG SLOT technical developments พนันออนไลน์ in a proper way so as to draw สูตรสล็อต and They are writing their opinions

maria thomos
Постоянный участник

06.07.2022 11:23

URL #18

guest: Ufa1688
IP-штамп: fr4iy3.kHUw02
гость

08.07.2022 10:34

URL #19

The football ทางเข้าufa1688 was poor, the atmosphere ufabet เข้า สู่ระบบ was toxic and star man 1688.com Paul Pogba, once ufa168 seen as the saving grace Big gaming looked set to leave as soon หารายได้เสริม as he could.But, fast forward สล็อตออนไลน์ seven months, and there are now signs of new life kingmaker under Solskjaer, most Spadegaming notably since the arrival ICONIC of one Bruno Fernandes.

guest: Ufa1688
IP-штамп: fr4iy3.kHUw02
гость

08.07.2022 10:34

URL #20

guest: Ufa1688
IP-штамп: frpXPq5TOmUHs
гость

09.07.2022 12:29

URL #21

Top researchers ทางเข้าufa1688 from the state’s public universities aff 1688 will get $3.1 million to pinpoint ufabet เข้า สู่ระบบ hotspots and infection patterns หารายได้เสริม for Valley fever, a fungal สล็อตออนไลน์ disease that each year sickens ALLWAYSPIN thousands and kills dozens in Arizona. The YGGDRASIL funding marks the first significant หวยออนไลน์ state investment targeting รูเล็ต the respiratory condition หวยรัฐบาล in at least 15 years.

guest: Ufa1688
IP-штамп: frpXPq5TOmUHs
гость

12.09.2022 10:50

URL #22

We are further aware ufabet เข้า สู่ระบบ that the Russian presidential ทางเข้าufa1688 administration officials are providing aff 1688 lists of Ukrainians to be targeted ดรีมเกมส์ for filtration and receiving reports AMB slot on the scope and progress SLOTXO of operations said State CQ9 Department deputy ALLWAYSPIN spokesperson Vedant PG SLOT Patel at a briefing Habanero with reporters.

466773030
Постоянный участник

18.10.2022 06:32

URL #23

marshall
marshall 音響
音響 marshall
marshall emberton
marshall stanmore ii
marshall 耳機
marshall acton ii
marshall 官網
marshall 藍芽喇叭
marshall 音箱
marshall stockwell
marshall 台灣
marshall 喇叭
marshall 音響門市
marshall 代購
marshall mode ii
marshall kilburn ii
marshall emberton奶油白
marshall emberton 白
marshall major iv
marshall willen 台灣
藍芽音響 marshall
marshall 藍芽耳機

watchesonline89
Постоянный участник

08.12.2022 10:21

URL #24

https://ameblo.jp/omegawatches89/entry-12756646005.html
https://omegawatches89.bigcartel.com/produc...s-replica-rolex
https://penzu.com/p/d8b4c076
https://omegawatches89.gumroad.com/p/reason...-are-so-popular
https://omegawatches89.gumroad.com/p/tips-f...replica-watches
https://omegawatches89-95.webselfsite.net/a-propos
https://anotepad.com/notes/2w2d9wgq
https://www.myminifactory.com/stories/reaso...s-6331ca21647d6
https://omegawatches89.seesaa.net/article/490300837.html
https://blog.udn.com/omegawatches89/176226733
https://62e8da780bf7c.site123.me/blog/where...-watches-online
https://wakelet.com/wake/NSGeOdLxkniZ60lTSrkpM
https://telegra.ph/Replica-Watches-Find-Hig...ms-Online-08-03
https://omegawatches89.simplesite.com/452939025

PowerISO Crack
IP-штамп: fraoPU0Lh.juM
гость

07.01.2023 16:29

URL #25

poweriso crack is a powerful free tool for managing ISO files quickly and efficiently. Power Software develops the program. Acts as a multi-functional image data processor. This software can rip, play, edit and burn CDs, DVDs, and Blu-ray discs. You can easily create USB drives with software. In terms of features, multimedia programs are comparable to UltraISO, BurnAware, and Ashampoo Burn Studio.

Ufa1688
Постоянный участник

27.02.2023 19:56

URL #26

Initially so close ทาง เข้า ufabet มือ ถือ that Agnelli named Čeferin แฮนดิแคป คือ his daughter’s godfather ufabet vip as they worked together ทาง เข้า ufabet on reforming European football app aff1688 their friendship unraveled as 123goal it became clear that nigoal123 Agnelli had helped สูตรสล็อต formulate the rival ESL and was เกมสล็อต sort of the general of the opposing ปั่นสล็อต army,” Zimbalist says.

Ufa1688
Постоянный участник

11.04.2023 08:05

URL #27

When the Honduran ทาง เข้า ufabet President announced last ปั่นสล็อต week her country planned ufabet vip to establish diplomatic สูตรสล็อต ties with China, the ripples were nigoal123 felt far beyond this Central แฮนดิแคป คือ American country of population app aff1688 10 million. To many, it was the 123goal latest confirmation of China’s ทาง เข้า ufabet มือ ถือ growing clout on the เกมสล็อต world stage.

Jaipurescort7
Постоянный участник
Jaipur

15.04.2023 09:24

URL #28

Jaipurescort7
Постоянный участник
Jaipur

28.04.2023 07:11

URL #29

I'm waiting for you in a sexy outfit and for taste New adventures, good service . I'm in a very discreet apartment with shower facilities ,fresh clean towels and parking. I'm ready to help you get wet and explore new pleasures, Regular sex is boring, let’s tune it up and let me bring through your wildest dreams Anal Rimjob Blowjob 69 Cum swallowing Role play Domination Spanking Ultimateb pleasure Balls draining With condom and without Deepthroat Gagging. Pin me against the wall and fuck me deep in my ass, Cowgirl is my specialty lemme ride you till kingdom come, Disregard the pretty face I like being treated like a common cock sleeve, I’m into all type of sex you can imagine ,I’m still a good girl tho.

https://www.rashmika.co.in
https://rashmika.co.in/ajmer-escorts
https://rashmika.co.in/jodhpur-escorts
https://rashmika.co.in/jaipur-escorts
https://rashmika.co.in/kota-escorts
https://rashmika.co.in/abu-road-escorts
https://rashmika.co.in/mount-abu-escorts
https://rashmika.co.in/sikar-escorts
https://rashmika.co.in/alwar-escorts
https://rashmika.co.in/jaisalmer-escorts
https://rashmika.co.in/bikaner-escorts
https://rashmika.co.in/pushkar-escorts
https://rashmika.co.in/chittorgarh-escorts

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.