Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Зачем нужны интеины?
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! Pedro77
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 04.01.2005 12:39     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

С праздниками, друзья мои! Желаю всего и всем. а чтоб жизнь малиной не казалось, выношу на публику свой вопрос:
- Интеины (белковый сплайсинг) - полипептидные участки, способные к автосплайсингу (без кофакторов) и обладающие эндонуклеазной активностью (!), способны обеспечивать собственный хоуминг (!!) по тому же принципу, что и интроны 1-го типа. Зачем такое усложнение. Нельзя ли их назвать какой-то невероятной формой условно живого, потому что обеспечение двух функций - собственное дозревание + мобильность кодирующих последовательностей - напоминает упрощенный способ существования простых вирусов. Не настаиваю на этом, но хотелось бы знать - кто-то встречал хоть прикидочные описания биологической целесообразности данного феномена?
Участник оффлайн! afanasev-max
Постоянный участник
Irkutsk-Moscow-Irkutsk



 прочитанное сообщение 04.01.2005 18:24     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Нельзя ли их назвать какой-то невероятной формой условно живого

Такой же вопрос у меня и про прионные белки
Участник оффлайн! Dimych
Постоянный участник
Kr-sk - Puschino - NYS - Calgary... Круг замкнулся



 прочитанное сообщение 04.01.2005 20:23     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Да называйте на здоровье, только не вслух. "Люди вас не поймут, смеяться будут".

[Текст переведён с транслита]
Участник оффлайн! Pedro77
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 06.01.2005 14:00     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

Автор - Dimych:
Да называйте на здоровье, только не вслух. \"Люди вас не поймут, смеяться будут\".

[Текст переведён с транслита]
Да нет. если людям сказать "Вы что, это гениально!", то они как бараны побегут и начнут кричать "Это гениально...Это гениально..."

Важно другое - все привыкли, что вирусы стоят между живым и не живым! Почему ж не предположить. что интеины и прионы - это нечто между вирусами и не живым? Потому что если перефразировать кто-то из умных,: "...если интеины существуют, то значит кому-то (для чего-то) это нужно!". А вот для чего?
Участник оффлайн! Dimych
Постоянный участник
Kr-sk - Puschino - NYS - Calgary... Круг замкнулся



 прочитанное сообщение 06.01.2005 20:36     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

Про "вирусы стоят" это из научно-популярных баек. Вирусы по сути не отличаются от плазмид. А прионы - довольно обычные белки. Если Вы - страстный поклонник Энгельса, тады да. "А так - нэт!" Лично мне совершенно не понятно, почему автопроцессинг вызывает такой ажиотаж. А [GFP] у тех же людей ажиотажа не вызывает. Нет, я не спорю с тем, что интересная фишка, но даже не очень удивительная: это можно было предположить, если немного пофантазировать. Вот ежели бы белочек на 7 кДа занялся автопроцессингом (внутримолекулярно, разумеется), я бы удивился. А так, ну какая, к лешему, разница, чего один домен делает с другим? Сделайте достаточно длинный фьюжн с какой-нить протеазой и с некоторой вероятностью он будет грызть сам себя. Вас это взволнует? Меня - нет.

[Текст переведён с транслита]

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Atropos
Участник оффлайн! gostya
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 07.01.2005 04:21     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

зуб даю, что GFP в свое время вызвал ажиотаж, да интеины уж тоже давно нашли, по-моему вокруг них тоже никакого ажиотажа нет
Участник оффлайн! Dimych
Постоянный участник
Kr-sk - Puschino - NYS - Calgary... Круг замкнулся



 прочитанное сообщение 07.01.2005 07:36     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

Ну я ж не всех имею ввиду. Про [GFP] помню. Согласитесь, есть разница между здоровым любопытством (как оно так устроено, что так происходит?) и провозглашением переходной стадией к живому и т.д. и т.п. Под ажиотажем я имею ввиду второе. А уж от вопроса "зачем это нужно" меня и вовсе колбасит. Оно так работает, елы палы. А о прионах и вовсе......... Ну нет там никакой метафизики. Все довольно просто и без затей. Банальный переход из метастабильного состояния в стабильное. Вот рост кристаллов на центрах кристаллизации в перенасыщеных растворах их не удивляет, а очень похожая ситуация с белками (тут не полная аналогия) отчего-то приводит в крайнее изумление.
Участник оффлайн! Pedro77
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 07.01.2005 16:29     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Нет, с метафизикой мы, научное общество, расстались давно и надеюсь на всегда (кстати при чем здесь Энгельс???). С прионами также - бог с ними, точно описано - переход из метастабильного в стабильное. Новые переходные стадии живого пока тоже никто не провозглашал - это придумано Вами для того, чтоб покрасивше выступить против. Что есть:
1. Есть явление автосплайсинга, при котором образуются из одного белка два с разными функциями, при чем оба - рабочие. Как сплайсинг идет - понятно, для чего - слабо понятно. При чем это отличает их от любого искуственно созданного "...достаточно длинный фьюжн с какой-нить протеазой и с некоторой вероятностью он будет грызть сам себя...". Себя грызть он разумеется будет, но что в итоге мы получим, кроме набора пептидов. Они смогут вообще хоть как-то с ДНК взаимодействовать, хоть залипать на нее? Я думаю. ряд ли.
2. Есть явление хоуминга интеинов (аналогично - хоуминг интронов 1 типа). Как он идет - понятно, для чего - слабо понятно. При чем связывание с ДНК идет офигенно специфично.
В результате этих и других фактов возникает (вполне логично) вопрос - а зачем! Зачем нужны такие усложнения. Поясню на примере - есть альтернатив. сплайс генов антител. Пока не задаешь себе вопрос - зачем (заметьте - это отнюдь не метафизический вопрос), выглядит как не нужное осложнение - куча экзонов, они тассуются, соединяются и т.п. Разгадав зачем это необходимо - понимаешь сам принцип устройства. Намного проще систематизировать и понять все существующие данные. По интеинам таких данных я не смог найти. И спрашиваю - НИКТО НЕ ВСТРЕЧАЛ ПОХОЖИХ ДАННЫХ, НИКТО ЛИ НЕ ВСТРЕЧАЛ ХОТЯ БЫ ГИПОТЕЗ (БОЛЕЕ МЕНЕЕ РАЗУМНО НАПИСАННЫХ И ПОДТВЕРЖДЕННЫХ) - ЗАЧЕМ НУЖЕН ИНТЕИН И ЧТО ОН ДАЕТ КЛЕТКЕ (ОРГАНИЗМУ). Ведь не может такого не быть - интеины уже давно мусолят то.
Участник оффлайн! Dimych
Постоянный участник
Kr-sk - Puschino - NYS - Calgary... Круг замкнулся



 прочитанное сообщение 07.01.2005 19:33     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

Автор - Pedro77:
  Нельзя ли их назвать какой-то невероятной формой условно живого, ........ ?
???
Участник оффлайн! Dimych
Постоянный участник
Kr-sk - Puschino - NYS - Calgary... Круг замкнулся



 прочитанное сообщение 07.01.2005 20:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

Ну значицца так: сперва ставим функциональный белок с плотненькой структурой, потом достаточно длинный спейсер а за ним - протеазу, даже не очень специфичную. На выходе мы будем иметь два функциональных белка. Смею Вас уверить: в природе существует некоторое количество белков, устойчивых к протеазам именно в силу высокой плотности упаковки.

"Зачем" - вопрос странный. Такая система получилась и оказалась работоспособной. Этого вполне достаточно для ее существования. А вот вопрос "Какие закономерности самоорганизации белков делают возможным возникновение и существование такой фенечки" кажется мне вполне приемлемым. На самом деле, в плане затрат на поддержание она не хуже всего прочего. Ну а что до вероятности ее возникновения, то вполне очевидно, что она оказалась не нулевой. Поскольку мнение, что реализация очень низкой вероятности требует обязательно большого времени, является совершенно ошибочным, то остается только понять, почему вероятность не нулевая. А вопрос "зачем", равно как и вопрос "за что" следует задавать в несколько ином месте.
Участник оффлайн! Pedro77
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.01.2005 12:10     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #11 множественное цитирование

ОК. Едем дальше. Опять же наивный вопрос - почему большинство интеин-содержащих предшественников являются белками, функционально связанными с нуклеиновыми кислотами - ДНК, РНК, АТФ и проч. При чем у одних видов эти белки изачально экспрессируются в готовом виде, а у некоторых - в виде белка предшественника.
Участник оффлайн! Pedro77
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.01.2005 12:16     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #12 множественное цитирование

Автор - Dimych:

\"Зачем\" - вопрос странный... вопрос \"зачем\", равно как и вопрос \"за что\" следует задавать в несколько ином месте.
Уважаемый коллега, мне кажеться что мы не можем понять, о чем говорим друг другу. На мой взгляд именно с таким вопросом надо подходить к решению любой проблеммы. Зачем, как именно, для чего - основа познания, уж простите за прописные истины.
И увы, в случае интеинов (да и еще тысяч фактов), на эти вопросы ответов не видно. Или где-то кто-то их видел?
Участник оффлайн!




 прочитанное сообщение 11.01.2005 19:59     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #13 множественное цитирование

Т.е. Вы полагаете существование целесообразности? Тогда действительно не можем.

Кстати, а какой процент всех клеточных белков связан функционально с нуклеиновыми кислотами? У меня цифр под рукой нет, поэтому я не могу оценить степень удивительности предложенного вами явления.
Участник оффлайн! Pedro77
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.01.2005 13:13     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #14 множественное цитирование

Увы, не встречал подобных цифр. Грубо говоря, это все АТФазы, и ядерные ферменты - полимеразы, лигазы, топоизомеразы, гиразы, хеликазы и т.д. На сайте http://www.neb.com/inteins/int_motifs_endo.html
есть наиболее полный список интеин-содержащих белков.

[Текст переведён с транслита]
Участник оффлайн! DmitriM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.01.2005 02:49     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #15 множественное цитирование

Нафиг народ городит огород? Как сказал Димыч, йето все возникало отбором случайных изменений. Работает - осталось. А Вы - зачем...

[Текст переведён с транслита]
Участник оффлайн! Pedro77
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.01.2005 16:50     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #16 множественное цитирование

Отбор случайных изменений привел к тому, что абсолютно случайно кусок белка сумел вырезаться , а потом еще более случайно разрезал две цепи ДНК в безинтеиновой аллели... Допустим. А что это дало (белку, клетке, организму, популяции микроорганизмов). Оно осталось, потому что формы, имеющие это, имели какие-то преимущества? Какие? Почему "это" осталось? Этот вопрос я как раз с начала и задаю. DmitriM, благодарю что помогли мне сконкретизировать вопрос smile.gif
Участник оффлайн! Dimych
Постоянный участник
Kr-sk - Puschino - NYS - Calgary... Круг замкнулся



 прочитанное сообщение 13.01.2005 21:33     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #17 множественное цитирование

Это примерно из той же области, что и возникновение многодоменных белков, как мне представляется. Почему осталось? Потому что не противоречило ничему. Работает? Ну и замечательно. Поцему оно должно исчезнуть? Могло не дать вовсе никаких преимуществ, но и не принести ровно никакого вреда. Этакий оперон, из которого выброшены излишества.

[Текст переведён с транслита]
Участник оффлайн! Pedro77
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 14.03.2018 02:59     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #18 множественное цитирование

Эх, Педро Педро, вот заскочил сюда десять лет спустя чтоб по-быстрому помочь:
1. 13 лет назад ты задал очень правильный вопрос. Только в то время ты еще не мог его ухватить как надо.
2. Ты сам ответишь на свои вопросы, включая смысл и интеинов, и вирусов, и это опубликуют несколько раз. Последняя статья по теме на сегодняшний день - вот эта https://www.sciencedirect.com/science/artic...369848616300103.
3. Кстати, сегодня ты продолжаешь работать с подобными вопросами. И ты больше не надоедаешь глобальными вопросами технарям на форумах, это не то место для подобных дискуссий. Тут необходим гораздо более высокий кругозор, и таких людей найти уже сложно, но они сами на тебя выйдут лет через 10.

P.S. Кстати, ты защитишься через год.
P.S.S. Если ты меня прочитаешь - в 2011 продай велосипед и кеды, и купи пару биткойнов, а продай в феврале 2017.

Сообщение было отредактировано Pedro77 - 14.03.2018 03:01
Участник оффлайн! Tom1
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 14.03.2018 17:37     Сообщение для модератора         Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #19 множественное цитирование

теоретики они такие все по принципу " сам себя не похвалишь как оплеванныий ходишь"
))))))
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 18.03.2018 12:39     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #20 множественное цитирование

"Если ты меня прочитаешь - в 2011 продай велосипед и кеды, и купи пару биткойнов, а продай в феврале 2017."

Видно, что у теоретика за 10 лет возникла тяга к спекулятивным заработкам (когда деньги дают, а зарабатывать их не надо), за что при коммуняках сразу 2 года давали. lol.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Atropos
Участник оффлайн! watchesbiz
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  20.11.2021 18:08     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #21 множественное цитирование

http://www.authorstream.com/Replicawatches24/
https://about.me/Replicawatches24
https://moz.com/community/users/17050093
https://trello.com/rolexrelicawatches/activity
https://replicarolexwatches.dreamwidth.org/365.html
https://visual.ly/users/watcheshutuk/portfolio
https://www.viki.com/users/watcheshutuk_549/about
https://www.academia.edu/s/14bdb7d4fe?source=link
https://www.slideshare.net/Nowseore/guide-o...ex-watch-online
https://audiomack.com/rolexrelicawatches
https://soundcloud.com/replicarolexwatches
https://www.bagtheweb.com/u/fakerolexwatches/profile
https://www.flipsnack.com/ReplicawatchesUK/...ca-watches.html
https://www.4shared.com/office/zA4L7Rmzea/G...hase_a_Fak.html?
https://codepen.io/Rolexrelicawatches/full/abBEzaQ
Участник оффлайн! watchesonline89
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  26.12.2022 11:32     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #22 множественное цитирование

https://telegra.ph/Advantages-Of-Replica-Watches-08-03
https://issuu.com/home/published/_6_.docx
https://www.gta5-mods.com/paintjobs/watchesswiss
https://omegawatches89.onweb.it/
https://padlet.com/omegawatches89/je3eq9ol3xzmb9bp
https://www.pinterest.com/omegawatches89/
https://knowyourmeme.com/users/omegawatches89
https://bitcointalk.org/index.php?topic=76487.new#new
https://omegawatches89.blog.hu/
https://knowyourmeme.com/forums/general/top...f-so-why?page=1
https://penzu.com/p/c6f21f5d
https://www.reddit.com/user/omegawatches89/...are_so_popular/
https://www.vingle.net/posts/4647076
https://penzu.com/p/c68b65cc
https://diigo.com/0pige9

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 19.03.24 08:33
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft