molbiol.ru -> Методы анализа мол. динамики

> Все форумы > Тематические форумы > Биофизика и матметоды в биологии

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Методы анализа мол. динамики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

mr5nob

26.05.2014 22:20

URL #1

Как еще можно проанализировать данные молекулярной динамики кроме RMSD и визуализации в VMD? Help!!

NMR-guy
Постоянный участник
временной жизни

27.05.2014 09:48

URL #2

А какие данные вы собрались анализировать? Какая программа их родила?

mr5nob

27.05.2014 10:50

URL #3

Данные были получены в программе NAMD, ставил белок на динамику, входные файлы для динамики делал в Amber.

NMR-guy
Постоянный участник
временной жизни

27.05.2014 21:21

URL #4

А цель-то какова была? Анализируют что-то обычно пытаясь ответить на вопрос. Вы хоть в общих чертах намекните на тот вопрос, который нужно решить...

mr5nob

27.05.2014 22:09

URL #5

вкратце, у моего белка активный центр образуют пять аминокислотных остатков и ион железа, в идеале я хотел бы посмотреть динамику именно с железом в активном центре, но не получилось овладеть методикой которая позволяет это сделать, то есть подготовить входные файлы для динамики белка с ионом металла, поэтому поставил белок на динамику без железа и по результатом динамики хочу оценить динамику белка в целом и непосредственно пяти аминокислотных остатков между собой или даже конкретных атомов которые были связаны с железом ионной связью

какими методами можно оценивать динамику, кроме выше сказанных? так же встает вопрос о подготовке файлов для динамики белка в котором есть железо?

guest: great
IP-штамп: frj5GEfdEWR5M
гость

31.10.2018 18:24

URL #6

Much obliged to you for setting aside an ideal opportunity to distribute this data extremely valuable!
http://www.classdee.com

guest: 123
IP-штамп: frJhOCvSv9ICE
гость

31.05.2022 09:11

URL #7

SINCE LAUNCHING AMB CASINO HIS INVASION OF UKRAINE, RUSSIA'S FC SLOT PRESIDENT VLADIMIR PUTIN 88KTC HAS FACED AN UNPRECEDENTED 11HILO GLOBAL RESPONSE, FROM CULTURAL BOYCOTTS TO 123GOAL COUNTRIES RADICALLY 123VEGA TRANSFORMING THEIR ALLBET FOREIGN POLICIES. BUT THE สูตรสล็อต LONGER THE CONFLICT CANDY BURST GOES ON, THE MORE SIGNS THERE ปั่นสล็อต ARE OF DIVISIONS.

12
IP-штамп: frXqkB4MpP2jQ
гость

08.06.2022 12:46

URL #8

South Korea 123VEGA and the US launched WAZDAN eight missiles WM CASINO on Monday, in AFFILIATE response to a ลิงค์รับทรัพย์ volley of ballistic missiles fired by North Korea the 123GOAL previous day. It comes 88KTC as Pyongyang continues FC SLOT to escalate its AMB CASINO missile tests. South 11HILO Korea's president Yoon Suk-yeol.

guest: 123
IP-штамп: frAWeMdOsBSXM
гость

11.06.2022 10:46

URL #9

Saxon Mullins 123VEGA says she once had PRAGMATIC PLAY romantic dreams of what her 'first time' would ICONIC GAMING be like. In none was หวยปิงปอง she paralysed by fear in a Sydney ปั่นสล็อต alleyway, aged 18, with a 123GOAL man she had met only minutes earlier. Ms 88KTC Mullins has always maintained FC SLOT this incident - in 2013 - was rape. It spurred AMB CASINO her to push for legal 11HILO reform in Australia, after a long court battle ended with a judge finding the man involved did not realise she hadn't consented to sex.

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.