molbiol.ru -> База данных по альтернативному сплайсингу

> Все форумы > Тематические форумы > Молекулярная и клеточная биология

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* База данных по альтернативному сплайсингу

Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

jerry-maori

08.09.2013 19:21

URL #1

Есть задача: найти нуклеотидные последовательности матричных РНК для гена, у которого имеет место быть альтернативный сплайсинг. Например Fas/Apo-1/CD95.

Сам я в этой теме совсем недавно, но есть твёрдое убеждение, что задача достаточно тривиальная.

Правда не NCBI, не ENSEMBLE как-то не помогли.
Тот же NCBI при запросе (Fas mRNA) AND "Homo sapiens"[porgn:__txid9606] выдаёт тонны всего.

Я правильно понимаю, что мне нужны строки с названиями вида:
Homo sapiens Fas cell surface death receptor (FAS), transcript variant 2, mRNA ?
А всё остальное можно смело не принимать во внимание?

Или есть какая иная база, спецом заточенная именно под сиквенсы для альтернативных мРНК?

Скачал документ, где приводятся 15 баз.
DMR alternative splicing databases include HS3D, ASDB, Xpro, the AEdb in ASD, and EVDB. CSA alternative splicing databases include ASTRA, ASAP, AltSplice and AltExtron in ASD, ASHESdb, EASED, ECgene, SpliceNest, ExInt, H-InvDB, MAASE, and FAST DB.

Но половина из них мертва, вторая половина как-то оказалась для меня неочевидной в работе.

Заранее спасибо!

ship
Постоянный участник
Moscow

09.09.2013 00:56

URL #2

так что надо просто все сплайс варианты найти?? http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=Fas%2FApo-1%2FCD95

watchesbiz
Постоянный участник

06.12.2021 16:06

URL #3

https://replicawatches24.tumblr.com/post/64...lica-watches-uk
https://ello.co/replicawatchesuk/post/ubut9ig9g4glx-q6nyphka
https://www.evernote.com/shard/s451/client/...%2BWatches%2BUK
https://www.bloglovin.com/@rolexrelicawatch...replica-watches
https://www.designspiration.com/watcheshutuk/saves/
https://write.as/fakerolexwatches/hints-to-...lica-watches-uk
https://www.dailystrength.org/journals/hint...lica-watches-uk
https://issuu.com/replicawatchesuk/docs/dif...he_replica_watc
https://www.keepandshare.com/discuss2/5601/...lica-watches-uk
https://penzu.com/public/9e250377
https://bestreplicawatc.livejournal.com/336.html
https://www.pearltrees.com/replicawatchesuk/item349627941
https://www.intensedebate.com/people/watches24
https://anonfiles.com/N039Qf66q9/Guide_On_H...atch_Online_pdf

nigoal123
IP-штамп: frXqkB4MpP2jQ
гость

25.05.2022 08:33

URL #4

Not only do we put nigoal students under pressure ลิงค์รับทรัพย์ to master the inconsistent sexy gaming spelling patterns and complex สล็อต grammar of the English language ka gaming but we require them to know

The best way to help our 123goal students to overcome the 11hilo challenge of writing in any 123bets want to read it. pggame123 genre is to help them to break big gaming things down into their component

nigoal123
IP-штамп: frGvfkzt/vMtQ
гость

26.05.2022 12:44

URL #5

Use subheadings to nigoal break up the text and make ลิงค์รับทรัพย์ clear paragraphs. sexy gaming Write in a semi-informal dream gaming conversational style. ka gaming And make sure there is organisation

The planning stage is 123goal brainstorming ideas and 11hilo challenge of writing in any 123bets choose the best three or four. pggame123 Think what your subheadings big gaming write a short introduction

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.