Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Ответ в R Help

Иконка сообщения*  [ Без иконки ]   Важно!   Вопрос   Информация     Обмен опытом   Шутка, забавная история     Поздравления, благодарности   Возмутительно!   Проблема   Картинки, фотографии
Введите имя

 [вст. закрывающие теги*

*


*



Смайлик: согласен Смайлик: не согласен Смайлик: улыбка Смайлик: пожалуйста, умоляю! Смайлик: помираю со смеху Смайлик: подмигивание Смайлик: подшучивать, дразнить Смайлик: смущение Смайлик: мне стыдно Смайлик: жуть! Смайлик: не понял Смайлик: закатывать глаза Смайлик: недовольство, огорчение Смайлик: рёв в три ручья Смайлик: злость Смайлик: супер Смайлик: умник Смайлик: чайник Смайлик: сходка Смайлик: Ура! Смайлик: не получается!
Перевод выделенного текста из латиницы в кирилицу. Текст в квадратных скобках '[]' не преобразуется

Пример: biologija -> биология [b] - полужирный шрифт

Пример: [b]полужирный[/b] [i] - курсив

Пример: [i]курсив[/i] [u] - подчёркнутый

Пример: [u]подчёркнутый[/u] [sup] - верхний индекс

Пример: температура 37[sup]o[/sup]C [sub] - нижний индекс

Пример: H[sub]2[/sub]O - вода [QUOTE] - применяется для цитирования чужих сообщений, цитата вставляется с небольшим отступом от края текста

Пример: [QUOTE]цитата[/QUOTE] [code] - форматирование как при вводе
Применяется для вывода теста как он есть, с предотвращением форматирования (автопереноса на новую строку), без интерпретации кодов форума и смайликов; вставляется с небольшим отступом от края текста.

Пример: 
[code]
программный код
	1 строка
	2 строка
[/code] [list] - список:
возможны опции: 1, a, A, i, I
[list] неупорядоченный; 
[list=1] нумерованный; 
[list=A] упорядоченный по буквам A-Z

Пример:
[list=1]
[*] первая строка;
[*] вторая строка;
[/list] Тег [hr] - горизонтальная разделительная линия

Пример: 
Абзац 1
[hr]
Абзац 2 [url] - гиперссылка

Примеры:
[url]www.ncbi.nlm.nih.gov[/url]
[url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/]NCBI[/url] [email] - ссылка на адрес электронной почты

Пример: [email]masha@mail.ru[/email] Тег [img] - рисунок
[img] - в строке;
[imgL] - выравнивание по левому краю; 
[imgR] - выравнивание по правому краю.

Пример:
[img]http://molbiol.ru/izo/rl.gif[/img] [ru] - только для русских читателей

Пример:
[ru]это увидят только те, кто использует русский интерфейс[/ru] [en] - только для английских читателей

Пример:
[en]это увидят только те, кто использует английский интерфейс[/en] [self] - текст виден только вам и администрации

Пример:
[self]это увидите только вы сами[/self]
[left] - выравнивание по левому краю

Пример: [left]текст слева[/left] [center] - выравнивание по центру

Пример: [center]текст в центре[/center] [right] - выравнивание по правому краю

Пример: [right]текст справа[/right] [just] - выравнивание по обоим краям

Пример: [just]выровненный текст[/just]

     размер сообщения / макс. размер:  / 15360


Последние 10 сообщений [ в обратном порядке ]
23432432432432dd Отправлен 20.01.2024 15:44
  user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
user posted image
ИНО Отправлен 07.09.2022 22:41
  Увы с картой при помощи Вашего кода ничего не вышло. Делал на новом рабочем пространстве. Прикрепляю фрагмент с матюками:

CODE

> plot(bb, cols=0)
Warning messages:
1: In plot.window(...) : "cols" is not a graphical parameter
2: In plot.xy(xy, type, ...) : "cols" is not a graphical parameter
3: In axis(side = side, at = at, labels = labels, ...) :
 "cols" is not a graphical parameter
4: In axis(side = side, at = at, labels = labels, ...) :
 "cols" is not a graphical parameter
5: In box(...) : "cols" is not a graphical parameter
6: In title(...) : "cols" is not a graphical parameter
> points(bb$x, bb$y, pch=1, col=cc[rr]) # next step: deal with legend
Error in bb$x : $ operator is invalid for atomic vectors


При том выдается не карта, а обычный скаттерплот с незакрашенными точками. Возможно играют роль версии ПО, в моем случае это R 3.3.1 и spatstat 1.46-1.

В то время как plot(сн_2017Pgppp) работает вполне корректно у меня, никаких error. И проблемы с кириллицей видел только в заголовках столбцов таблиц. Наверное, дело в операционке. Ну, уберите из названия объекта эти две незнакомые буржуям буквы, если мешают, это ж просто пример, мне б принцип понять.

С деревом можно никаких файлов не грузить, а обойтись простым синтетическим примером:

CODE
y<-c(rnorm(10, 0, 1), rnorm(10, 0, 100))
x<-factor(c(rep(1,10), rep(2,10)))
xy<-cbind(x, y)
ctree(y~x, data=xy)#ветвление дерева нет, так как проверяется разница в средних, а надо чтобы проверялась разница в дисперсиях (или любом другом параметре масштаба).

xy$z<-c(abs(y[1:10]-mean(y[1:10])), abs(y[1:20]-mean(y[1:20])))#модуль отклонений от среднего в каждой группе
ctree(z~x)#теперь различия уловлены правильно


Надо чтоб преобразование y в z проходило автоматически в зависимости от формулы, переданной ctree(). По идее для этого есть в ctree() аргумент ytrafo, но как его правильно задавать, я так и не понял.
plantago Отправлен 07.09.2022 07:21
 
(ИНО @ 06.09.2022 10:49)
Ссылка на исходное сообщение  Как заставить ctree() из {party} работать не с положением (средними), а с масштабом (дисперсией) зависимой переменной? Насколько понял из руководства, для этой цели можно использовать трансформацию при помощи аргумента ytrafo, но как именно им пользоваться так и не уразумел. Что только не перепробовал и с готовыми ytrafo из {coin}, на которые дается ссылка в том же руководстве и с самопиской функцией, считающей абсолютное отклонение от среднего, - либо матерится разными матюками, либо молча считает различия в средних, точно так же как с настройками по умолчанию, будто бы никаких манипуляций с ytrafo и не было.


К сожалению, без конкретных примеров и ссылок не смог ничего понять.
plantago Отправлен 07.09.2022 07:20
 
(ИНО @ 06.09.2022 11:37)
Ссылка на исходное сообщение  Прицепом еще один вопрос. Есть у меня точки на карте (файлы прилагаются):

CODE
library(spatstat)
load("сн_2017Pgppp.Rda")
load("сн_2017Pg_lL.Rda")
plot(сн_2017Pgppp)


Задача - залить их цветом в зависимости от значений сн_2017Pg_lL, и приделать сбоку цветовую шкалу в виде б. м. непрерывного градиента и подписями значений соответствующего показателя через равные интервалы.


CODE

library(spatstat)

load("сн_2017Pgppp.Rda")
load("сн_2017Pg_lL.Rda")

# plot(сн_2017Pgppp) # error!

aa <- (get(ls()[1])) # does not always work; if not, use rm(list=ls()) _before_ load()
bb <- (get(ls()[2])) # and please do not name R objects with anything except [A-z0-9_.]

rr <- rank(aa, ties.method="last")
cc <- terrain.colors(max(rr))

plot(bb, cols=0)
points(bb$x, bb$y, pch=1, col=cc[rr]) # next step: deal with legend


Про шкалу можно, наверное, посмотреть сюда https://stackoverflow.com/questions/1335517...-legend-in-base
ИНО Отправлен 06.09.2022 18:37
  Прицепом еще один вопрос. Есть у меня точки на карте (файлы прилагаются):

CODE
library(spatstat)
load("сн_2017Pgppp.Rda")
load("сн_2017Pg_lL.Rda")
plot(сн_2017Pgppp)


Задача - залить их цветом в зависимости от значений сн_2017Pg_lL, и приделать сбоку цветовую шкалу в виде б. м. непрерывного градиента и подписями значений соответствующего показателя через равные интервалы.
ИНО Отправлен 06.09.2022 17:49
  Как заставить ctree() из {party} работать не с положением (средними), а с масштабом (дисперсией) зависимой переменной? Насколько понял из руководства, для этой цели можно использовать трансформацию при помощи аргумента ytrafo, но как именно им пользоваться так и не уразумел. Что только не перепробовал и с готовыми ytrafo из {coin}, на которые дается ссылка в том же руководстве и с самопиской функцией, считающей абсолютное отклонение от среднего, - либо матерится разными матюками, либо молча считает различия в средних, точно так же как с настройками по умолчанию, будто бы никаких манипуляций с ytrafo и не было.
plantago Отправлен 27.11.2021 12:47
  Вот и замечательно, что Вы все сами нашли. Только paste0(...) -- без пробела между скобками и именем команды (это для красоты smile.gif и именно paste0() а не paste(), потому что второй без дополнительных аргументов вставляет пробел, в то время как Excel -- нет.
Алекс3212 Отправлен 26.11.2021 20:42
  Очень долгие ответы тут, если вдруг кому то нужно, то используйте
paste () , где в кавычках перечисляете столбцы которые надо присоединить
Алекс3212 Отправлен 26.11.2021 15:53
  Подскажите пожалуйста аналог в R , знака & с помощью которого я могу присоединить одну яцейку к другой. Пока что приходится умножать на н значение и складывать с другой ячейкой. Мож знает кто более легкий способ. Например
A B C
10 3 13
в R C <- ((A*100)+B)
в excel C= A&B
plantago Отправлен 08.03.2021 02:54
  https://www.google.com/search?q=R+package+daytime+length
Посмотреть тему (откроется в новом окне)

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 28.03.24 17:40
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft