 * |   |
|
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда |  Zbio-wikiNG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: |
|
Правила
* Перевод терминов на русский язык (биоинформатика). Прошу
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.
   |
 SP |
 16.11.2003 19:58
Проблема такая: Никак не можем найти точные русские эквиваленты английских терминов signature, amidase signature, и особенно amidase signature group или amidase signature family или (еще хуже!) - GGSS signature-containing amidase family. В качестве примера употребления терминов могу привести такие ссылки: http://scop.bic.nus.edu.sg/data/scop.b.d.je.b.b.A.html http://www.scripps.edu/cb/cravatt/pdf/Patr...vattJBC2000.pdf http://www.blackwell-synergy.com/links/doi...1.01378.x/full/ Смысл терминов абсолютно понятен! Варианты перевода тоже вроде бы есть : signature - "консенсус", "консервативный участок", "мотив" и т.п. Но нет ли более точных русских вариантов? И, главное, как короче и точнее перевести название семейства - amidase signature family? Спасибо. |
|
|
16.11.2003 20:16
|
|
Nastja Постоянный участник Новосибирск |
17.11.2003 08:00
|
|
Murat Постоянный участник RU |
17.11.2003 12:59
1. 1) подпись autograph signature, manual signature — собственноручная подпись fictitious signature — поддельная подпись specimen signature — образец подписи to deny one's signature — отказываться от своей подписи to disown one's signature — снять свою подпись to authenticate a signature — удостоверить подпись to affix one's signature — поставить подпись to bear the signature (of) — быть подписанным ( кем-л. ) over the signature — за подписью to forge smb.'s signature — подделывать чью-л. подпись to scrawl one's signature — наспех расписаться, "нацарапать" подпись 2) характерная черта; нечто идентифицирующее The episode is a sort of reticent signature, like Alfred Hitchcock's appearances in his own films. — Этот эпизод является скрытым знаком, подобным появлениям Альфреда Хичкока в собственных фильмах. The Concorde's signature from a given height will be less ponderous than that of the Boeing. — Характерный след Конкорда (на экране радара) на данной высоте будет менее крупным, чем след Боинга. - signature tune 3) подписание date of signature — дата подписания ( напр. соглашения ) 4) , сигнатура 5) тетрадь; сфальцованный лист 6) знаки при ключе ( указывающие тональность и размер ) There are two kinds of signature, the time-signature and the key-signature. — Имеется два типа знаков при ключе: для размера и тональности. 2. 1) ставить подпись 2) ставить сигнатуру Так говорил Lingvo 8.0 По мне, так п.1.2 полностью передает смысл, дальше - дело фантазии и мастерского владения родным языком
|
|
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
17.11.2003 13:14
|
|
SP |
17.11.2003 22:20
|
|
SP |
17.11.2003 22:30
Термин "сигнатура" мне тоже встречался, но не в биоинформатике. |
|
Zvezdochet Участник |
18.11.2003 01:10
Я предлагаю термин "характеристическая подстрока". Конечно, звучит слишком сухо, но зато более-менее точен. |
|
Nastja Постоянный участник Новосибирск |
18.11.2003 18:08
|
|
SP |
18.11.2003 20:09
OK. Спасибо. Жду. To Zvezdochet Я посмотрела в русскоязычных журналах. Там проходит и "мотив" и "консенсус" и т.п. Только надо указывать, что это мотив семейства. Например, "мотив пероксидазы". |
|
Zvezdochet Участник |
19.11.2003 07:50
Консенсус определяется как результат алайнмента, либо строчного, либо структурного. Я бы его не советовал использовать. А то что проходит он иногда в журналах - это не показатель. У мотива определение более расплывчитое. Но очень часто его привязывают к конкретной функции белкового семейства/структурного класса (с чем я лично не согласен и пытаюсь определять "структурные мотивы"). На мотивы могу кинуть "классические" статьи. ;-) |
|
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
19.11.2003 12:27
Автор - Zvezdochet: Я что-то не понял в чём принципиальная разница между "уникальным участоком сиквенса", характерным для семейства белков и "наличием сходных строчных характеристик" у белков семейства? Не является ли первое частным случаем второго??? А разве выявление "уникального участка сиквенса" не может быть сделано путём выравнивания??? Пожалуйста, поясните свои утверждения.
Здесь, по моему, сигнатура не подходит.. Здесь именно имеется в виду уникальный участок сиквенса. Мотив не подойдет тоже - у него вполне точное определение. Консенсус тем более. Два последних - есть результат сравнительного анализа и показывают наличие сходных структурных/строчных характеристик. А signature это скорее противоположное понятие. Консенсус определяется как результат алайнмента, либо строчного, либо структурного. Я бы его не советовал использовать. А то что проходит он иногда в журналах - это не показатель. У мотива определение более расплывчитое. Но очень часто его привязывают к конкретной функции белкового семейства/структурного класса (с чем я лично не согласен и пытаюсь определять \"структурные мотивы\"). |
|
SP |
19.11.2003 20:18
Ну уж нет Вот этот кусок намного непонятнее! Автор - Zvezdochet: Это как это "противоположное"? А signature это скорее противоположное понятие.  Если для мотивов и консенсусов - "строчность/структурность", то для сигнатур "колоночность/хаотичность" что ли?  Кстати, а что вы скажете о таком разделе поиска на http://www.ebi.ac.uk/ как "Protein signatures"? В этом разделе ищут ЛЮБЫЕ мотивы, консенсусы и т.п., взяв в качестве ключа их индекс по базам Prosite, Pfam или SMART. Следовательно, слово signatures в данном случае используется как обобщающее название характерных участков сиквенса. |
|
AVS Постоянный участник UK - Russia |
19.11.2003 20:26
|
|
daniil naumoff Постоянный участник Moscow, Russia |
20.11.2003 12:19
мне кажется, что Zvezdochet понимает под "signature" совсем другую вещь, чем Вы. Возможно, что в литературе этот термин имеет существенно разные определения. Я думаю, что вполне достаточно подходящих Вам терминов и без него: мотив, консенсус, профиль, паттерн... |
|
Zvezdochet Участник |
20.11.2003 14:41
Ну что, буду по порядку. 1) Понятие signature молекулярного обьекта/семейства обьектов в молекулярной информатике (т.е. не только bioinformatics но и chemoinformatics) определена достаточно строго как вектор of features который позволяет однозначно распознать данный обьект/семейство среди набора обьектов/семейств. В вашем случае, SP, данный вектор of features есть набор подстрок общий для данного семейства, уникальный для данного семейства. 2) Мотив обычно характеризует определенную функцию семейства. Однако, во-первых такая функция может присутствовать ив других семействах. В таких случаях мотив не уникален и не может называться signature данного семейства. Во-вторых, когда смейство многофункциональное, оно будет содержать более чем один мотив (хотя по прежнему одну signature). Наконец, существуют участки сиквенса специфические для данного семейства не связанные с каой либо из известных функций семейства. Такие участки не попадут в мотив, но опять таки попадут в signature. 3) Понятие консенсуса - это формальное понятие в методах алайнмента и употребляется только с этими методами. Консенсус (а) зависит от испольуемого метода алайнмента (б) не всегда есть набор общих для семесйтва подстрок (т.к. нахождение махимальной обще подстроки есть только один из частных случаев задачи алайнмента). Т.е. в консенсусе могут содержаться позиции осутствующие в некоторых строках семейства. Исходя из выщесказанного, хочу попробывать еще раз отговорить вас от использования консенсуса ;-) Из вариантов перечисленных Даниилом, самый лучший это - паттерн. Ну и если уж совсем хочется, можно мотивом назвать. |
|
SP |
21.11.2003 22:10
Я именно так и понимаю: как термин имеющий много определений. Но в данном случае я докапываюсь до одного из таких определений. To Zvezdochet Классно!!!  Вот это именно то, что МНЕ надо (это КРОМЕ всякой статьи, с которой я наконец расправилась [За что всем еще раз - Спасибо за помощь!] и уже сдала ее шефу. Мы взяли - "мотив семейства" и как вариант выбора - "паттерн семейства". "Профиль" в нашем случае не подходит).Я пыталась сформулировать все эти понятия самостоятельно. Но не все удалось объяснить словами. Как умный студент или пёс: все понимаю, а сказать не могу Где Вас так хорошо научили? А без шуток - откуда эти определения терминов?
|
|
Zvezdochet Участник |
24.11.2003 11:38
|
|
watchesbiz Постоянный участник |
 30.06.2021 13:41
|
|
watchesbiz Постоянный участник |
06.09.2021 02:30
? |
 vrida2Постоянный участник |
26.01.2022 00:09
|
|
vrida2 Постоянный участник |
12.10.2022 00:11
|
|
vrida2 Постоянный участник |
10.12.2022 10:16
|
|
Guest IP-штамп: frDMk0UzOKfQ6 гость |
12.12.2022 15:05
|
|
Guest IP-штамп: frDMk0UzOKfQ6 гость |
12.12.2022 15:05
|
|
Apzo Media |
12.12.2022 20:39
|
|
watches89 Постоянный участник |
05.12.2023 07:41
|
|
vrida2 Постоянный участник |
28.02.2024 15:00
|
| « Предыдущая тема · Научный язык · Следующая тема » |
 |
· Викимарт - все интернет-магазины в одном месте · Доска объявлений Board.com.ua ·
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---
Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Powered by Invision Power Board(Trial) v2.0.0 © 2024 IPS, Inc.