Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Анализ данных полногеномного секвенирования -- к кому обратиться? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! -Vald-
Постоянный участник
Питер..



 прочитанное сообщение 08.10.2016 10:33     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

Добрый день коллеги.

Подскажите, пожалуйста, кто в РФ обладает высокими компетенциями в области анализа данных полногеномного секвенирования?

Суть нашей работы заключается во внесении генных модификаций в клетки человека с помощью одного из инструментов редактирования генома и нам необходимо спланировать и провести оценку off target эффектов. Так как сами в этих вопросах по сути "профаны" было бы правильно по этому вопросу работать с компетентными специалистами.

Спасибо!
Участник оффлайн! Nett
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 08.10.2016 16:14     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

Конкретно по ред.генома человека вроде бы в Сколково "собаку съели"
(ну или притворяются))
Вам с возможностью офиц.коллаборации или просто за советом?
Участник оффлайн! -Vald-
Постоянный участник
Питер..



 прочитанное сообщение 08.10.2016 16:50     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Да, с возможностью оф коллаборации.
Участник оффлайн! MACS2




 прочитанное сообщение 08.10.2016 19:37     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

(-Vald- @ 08.10.2016 17:50)
Ссылка на исходное сообщение  Да, с возможностью оф коллаборации.

http://liulab.dfci.harvard.edu/MACS/
Участник оффлайн! MACS2




 прочитанное сообщение 08.10.2016 19:41     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #5 множественное цитирование

(Nett @ 08.10.2016 17:14)
Ссылка на исходное сообщение  Конкретно по ред.генома человека вроде бы в Сколково "собаку съели"
(ну или притворяются))
Вам с возможностью офиц.коллаборации или просто за советом?

похоже в скольково тока собак едят smile.gif
Участник оффлайн! MACS2




 прочитанное сообщение 08.10.2016 19:44     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #6 множественное цитирование

(Nett @ 08.10.2016 17:14)
Ссылка на исходное сообщение  Конкретно по ред.генома человека вроде бы в Сколково "собаку съели"
(ну или притворяются))
Вам с возможностью офиц.коллаборации или просто за советом?

ну выдайте хоть одну прогу маде ин скольково
Участник оффлайн! MACS2




 прочитанное сообщение 08.10.2016 19:55     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #7 множественное цитирование

(Nett @ 08.10.2016 17:14)
Ссылка на исходное сообщение  Конкретно по ред.генома человека вроде бы в Сколково "собаку съели"
(ну или притворяются))
Вам с возможностью офиц.коллаборации или просто за советом?

http://dbarchive.biosciencedbc.jp/kyushu-u...get/CTCF.1.html
Участник оффлайн! Flyamer
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 08.10.2016 20:59     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #8 множественное цитирование

Я бы ПЦРом и Сэнгером проверил топовые потенциальные оффтаргеты и забил на полногеномное секвенирование...
Участник оффлайн! Sergeant
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 08.10.2016 23:03     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #9 множественное цитирование

(Flyamer @ 08.10.2016 18:59)
Ссылка на исходное сообщение  Я бы ПЦРом и Сэнгером проверил топовые потенциальные оффтаргеты и забил на полногеномное секвенирование...

Сделать 2-3 разных мишени. Можно и на разных экзонах.
Для каждого клона клеток сделать Сенгера на район мишени. И на офтагеты забить и мозги полногеномом не маять. Цезарю-цезарево, а слесарю-слесарево.
Участник оффлайн! ship
Постоянный участник
Moscow



 прочитанное сообщение 09.10.2016 02:23     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #10 множественное цитирование

я бы еще посмотрел ссылку на статью где после криспера прям вот везде все оффтаргет порезалось,
без стеба, интересно, занимаемся почти тем же самым

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 24.02.20 06:00
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft