Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Подбор праймеров для выделения гена -- Подбор праймеров для выделения гена --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


 
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! nedoluzhko

Москва



 прочитанное сообщение 20.07.2007 12:19     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #1 множественное цитирование

В базе данных NCBI нашли последовательность гена, мы хотели бы его отсеквенировать у сразу нескольких особей. В первый раз подобным занимаюсь: подскажите праймеры создавать на концевые последовательности гена или как-то по другому? Есть ли какая-нибудь литература, где можно было бы об этом почитать подробнее (русскоязычная или англоязычная)??? confused.gif

Сообщение было отредактировано nedoluzhko - 20.07.2007 12:20
Участник оффлайн! mlog
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 20.07.2007 16:21     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #2 множественное цитирование

(nedoluzhko @ 20.07.2007 10:19)
Ссылка на исходное сообщение  В базе данных NCBI нашли последовательность гена, мы хотели бы его  отсеквенировать у сразу нескольких особей. В первый раз подобным занимаюсь: подскажите праймеры создавать на концевые последовательности гена или как-то по другому? Есть ли какая-нибудь литература, где можно было бы об этом почитать подробнее (русскоязычная или англоязычная)??? confused.gif

Пока не очень понятно, что Вы имеете в виду. confused.gif Нашли последовательность для одного вида, а хотели бы секвенировать у нескольких других видов, так что ли? Тогда желательно найти все известные последовательности (скажем, все известные ортологи этого гена у всех цветковых растений - Вы же вроде растениями занимаетесь), построить выравнивание, выявить наиболее консервативные участки и к ним подобрать праймеры. Смотрите не только на нукл. последовательность, но и на белковую: лучше выбирать для праймеров такой участок, в котором вероятность синонимичных замен меньше.
Если особи того же вида, то и вовсе не вижу проблемы. Тогда можно подбирать в первом приближении к любым участкам (по крайней мере, кодирующим), зотя о возможности синонимичных замен тоже лучше не забывать.
Участник оффлайн! nedoluzhko

Москва



 прочитанное сообщение 22.07.2007 21:10     Сообщение для модератора         Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес  ICQ
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #3 множественное цитирование

Спасибо за советы! Мысль такая, провести анализ SNP по гену, кодирующему субъединицу запасного белка. Как внутри вида так и между видами. По некодирующим элементам это подобные анализы проводились (хотя выборка была несколько иная и цель ставилась тоже другая), но не дали сколько-нибудь значимых результатов, то есть различия между видами были минимальны, вот и пришла идея провести анализ по последовательности, по которой шёл искуственный отбор (речь идёт о культурной сое и её диком родиче)...
nigoal123
IP-штамп: frAafNuYANUh2
гость



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  21.05.2022 07:20     Сообщение для модератора       
Цитировать Поместить сообщение в колонку новостей  URL #4 множественное цитирование

Writing an article takes บาคาร่าออนไลน์ a lot of effort on the slot xo side of the writer. 11hilo Content writers สล็อต freelance writers and 123GOAL copywriters are people

who have mastered the nigoal without which they ลิงค์รับทรัพย์ would not be able to พ ริ ต ตี้ เกม มิ่ง content for social media ราคา บอล make their mark as Hotgraph a writer of any kind.

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 19.04.24 02:05
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft