Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
nedoluzhko Москва |
Сообщение было отредактировано nedoluzhko - 20.07.2007 12:20 |
mlog Постоянный участник |
(nedoluzhko @ 20.07.2007 10:19) В базе данных NCBI нашли последовательность гена, мы хотели бы его отсеквенировать у сразу нескольких особей. В первый раз подобным занимаюсь: подскажите праймеры создавать на концевые последовательности гена или как-то по другому? Есть ли какая-нибудь литература, где можно было бы об этом почитать подробнее (русскоязычная или англоязычная)??? Пока не очень понятно, что Вы имеете в виду. Нашли последовательность для одного вида, а хотели бы секвенировать у нескольких других видов, так что ли? Тогда желательно найти все известные последовательности (скажем, все известные ортологи этого гена у всех цветковых растений - Вы же вроде растениями занимаетесь), построить выравнивание, выявить наиболее консервативные участки и к ним подобрать праймеры. Смотрите не только на нукл. последовательность, но и на белковую: лучше выбирать для праймеров такой участок, в котором вероятность синонимичных замен меньше. Если особи того же вида, то и вовсе не вижу проблемы. Тогда можно подбирать в первом приближении к любым участкам (по крайней мере, кодирующим), зотя о возможности синонимичных замен тоже лучше не забывать. |
nedoluzhko Москва |
|
nigoal123 IP-штамп: frAafNuYANUh2 гость |
who have mastered the |
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |