Ткнулся сюда из-за знакомого ребёнка, которому в школе поручили подготовить несколько вопросов по охране природы и по КК и не удержался - пролистал всю тему.  Интересно. 
Пара мыслей, как реакция на прочитанное.
Безусловно, охранять надо не виды, а их биотопы.  Но до этого мы ещё не доросли - это гораздо дороже, чем объявить виды охраняемыми, отчитаться, отгрести денег за "работу" и на этом успокоиться.
А с принципом отбора видов в КК - здесь уже проскакивала мысль, что вносить и охранять надо крупные и легкоопозноваемые виды, которые представляют интерес (коллекционный, пищевой, бытовой, сырьевой и т. д.) для неорганизованных и малоорганизованных граждан (если виды попадают в сферу интересов организаций, то их охрана производится совсем другими методами).  Нет смысла писать списки мелких (даже очень редких видов), которые практически никого не интересуют и погибают только случайно - их можно сохранять только через охрану биотопов.
И прав bahurin - попадая в КК вид резко подскакивает в цене на чёрном рынке, что только усугубляет его положение.
В общем, подходить к включению видов в КК надо индивидуально, обдуманно, а не опираясь только на численность вида в регионе (это вообще практически ни о чём не говорит).