molbiol.ru -> Синтез модифицированных олигов

> Все форумы > Тематические форумы > Молекулярная и клеточная биология > Организация работы группы/лаборатории

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Синтез модифицированных олигов -- в первую очередь флюоресцентных --
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

Veshka
Постоянный участник
Москва

15.02.2017 13:42

URL #1

Коллеги, кто где заказывает? Синтол в глухой несознанке по этому поводу, попробовал в одном месте (пока не буду называть, может случайность) - сделали абсолютное УГ и в низкой концентрации...

Есть свежий позитивный опыт?

Nik-AD
Постоянный участник

15.02.2017 16:58

URL #2

Синтол тоже так себе делает, но делает. Альтернатив пока не нашли... Присоединяюсь к поиску.

Veshka
Постоянный участник
Москва

15.02.2017 19:13

URL #3

(Nik-AD @ 15.02.2017 14:58)

Синтол тоже так себе делает, но делает. Альтернатив пока не нашли... Присоединяюсь к поиску.

Так мне на вопрос об олигах дали...мэйл Кузубова и сказали "а спросите у него, БУДУТ делать или нет" Это пипец, извините....

Guest
IP-штамп: fryeFLOjWSNnc
гость

16.02.2017 17:35

URL #4

Мы тоже очень ищем такое место. Причем нам обязательно нужно чтобы было несколько (4-5) флуоресцентных меток на один олиг.
Пока нам такое сделали только в Lumiprobe. К сожалению, пока не могу точно сказать насколько адекватно они нам сделали зонды - до сих пор разбираемся с результатами.

austinov

Москва

16.02.2017 21:35

URL #5

(Guest @ 16.02.2017 18:35)

Спасибо, обращайтесь к нам, считайте онлайн https://ru.lumiprobe.com/order-oligo/. Сложные олиги и модификации это наш профиль, но и простые конечно делаем.

Если что-то не работает, пишите - мы отвечаем за качество и будем разбираться, в чем проблема. Несколько флуоресцентных красителей это не всегда более высокий уровень сигнала, часто возможны разные неожиданности.

С уважением,
Алексей Устинов
Lumiprobe / ООО "Биотех-Индустрия"

Guest
IP-штамп: frJnUpZA9X..w
гость

20.02.2017 09:04

URL #6

(LMP @ 16.02.2017 18:20)

Это уже после оплаты?

Нет, у нас в Синтоле standing order. Написал Кузубову, кто-то из сотрудников ответил, попросил прислать последовательности, дальше опять лаг. Посмотрим, но в принципе такой подход вызывает, по меньшей мере, вопросы. При том, что раньше они вс делали, и делали хорошо.

-Ъ-
Постоянный участник
Москва

20.02.2017 18:29

URL #7

(Guest @ 16.02.2017 18:35)

Причем нам обязательно нужно чтобы было несколько (4-5) флуоресцентных меток на один олиг.

На фига зонду такое ожерелье, пардон за офтоп.

А в ДНК синтез обращались?

genseq
Постоянный участник

20.02.2017 18:44

URL #8

(Veshka @ 15.02.2017 11:42)

Коллеги, кто где заказывает? Синтол в глухой несознанке по этому поводу, попробовал в одном месте (пока не буду называть, может случайность) - сделали абсолютное УГ и в низкой концентрации...
Есть свежий позитивный опыт?

Есть старый опыт. При попытке включить в один олиг пару флуорофоров получилось абсолютное УГ и в низкой концентрации. Это если концентрацию оценивать "строго на глаз", по окраске. Похоже, идёт не только тушение флуоресценции, но и снижение поглощения света. Причём последние явно противоречит общепринятым теоретическим представлениям.

Так что если засунуть в один олиг пять флуорофоров, то кроме УГ низкой концентрации ничего получить не удастся.

P.S.: кстати. А что такое "УГ"?

NMR-guy
Постоянный участник
временной жизни

20.02.2017 18:46

URL #9

Ожерелье нужно для максимального подавления фона. Включается взвешенный биновый спектральный фильтр на ожерелье и фон уходит на 4-5 измерительных декад сигнала в ноль...

Товарищи хотят приблизиться по чуйствительности к радиометкамЪ.

-Ъ-
Постоянный участник
Москва

20.02.2017 19:26

URL #10

(NMR-guy @ 20.02.2017 19:46)

Включается взвешенный биновый спектральный фильтр на ожерелье и фон уходит на 4-5 измерительных декад сигнала в ноль...

Переведи.

NMR-guy
Постоянный участник
временной жизни

20.02.2017 21:52

URL #11

Они занимаются скорее всего флуоресцентной микроскопией и им важно колоркодить зонды не в 10 раз ярче фона (как с одним красителем), а в 100 000, как когда накладываются 5 независимых окон на спектральную развертку детектора флуоресценции. И перемножаются друг на друга. Шум по амплитуде не становится выше от умножения себя на себя (или при сложении, что в общем почти одно и то же), а вот полезный мультиплексный сигнал может возрасти при такой фильтрации на столько декад, сколько линейно независимых (или приведенных к такому состоянию силком фильтрацией в ноль всего вне узких полос) флуорофоров удастся повесить на зонд.

ship
Постоянный участник
Moscow

22.02.2017 12:05

URL #12

УГ-унылое говно.
Общение с Синтолом - это чтото с чем-то, начиная от хамоватой тетки отвечающей на звонки, и кучи другх ньансов. Иногда чуть ли не 2 недели ждади заказ, иногда курьеры теряли олиги в других институтах, мрак вообщем. Они обыкновенные олиги то с ошибками варят, и у меня у коллег были случаи.
Предолату выбрали у них - и досвиданья.
У Карпова за 10 лет ни одной ошибки не было.

Sky7walker
Участник

22.02.2017 14:17

URL #13

(NMR-guy @ 20.02.2017 22:52)

Они занимаются скорее всего флуоресцентной микроскопией

Это действительно так.

Хотим сделать очень чувствительный РНК-фиш. По протоколу полагается около 10 зондов - каждый из которых с 4-5 флуорофорами. Пока мы не преуспели.
Будем рады советам (извините за оффтоп в этой теме).

MMM
Постоянный участник

27.02.2017 01:10

URL #14

Есть еще ДНК-СИНТЕЗ и в Питере открыли лабу в алкор-био, но мы у них пока ничего не заказывали.
Насколько мне известно вся флуоресцентная метка в олигах это пост продакшн. А единственный способ это сделать с множественным введением флуоресцентной метки-это введение мелкой устойчивой модификации в синтетический олиг, которую потом пост продакшн можно пометить флуоресцентным красителем.

Nik-AD
Постоянный участник

01.03.2017 12:12

URL #15

Спасибо за инфу.
В апреле (когда деньги появятся) будем пробовать заказывать. Нам нужно пару хороших RNA beacon сотворить.

sceptique
Постоянный участник
временной жизни

27.06.2017 00:07

URL #16

(ship @ 22.02.2017 13:05)

Иногда чуть ли не 2 недели ждади заказ

Это очень для них немного.

За последний год они сильно сдали...

Вероятно, синтез олигов на заказ перестал приносить прибыль и они им грузят только то время на синтезаторе, которое остаётся свободным от более дорогих заказов "под ключ" внутри своей фирмы.

В последнее время все предпочитают продавать не олиги, а наборы с ними, или готовые смеси. Поскольку имеющемуся безрукому контингенту потребителей с деньгами они удобнее, чтобы продавать свои "услуги" и "разработки".

semi
Постоянный участник
Москва

28.06.2017 10:30

URL #17

(Sky7walker @ 22.02.2017 15:17)

Возможно, уже поздно, но всё же..

Делали РНК-FISH с пробами Stellaris (48 олигов, помеченных одной молекулой флуорохрома каждый).
Пробы, которые были фирменного дизайна, работали очень хорошо и стабильно.

Пробы на наши мишени, сдизайненные при помощи их онлайн-программы, не сработали. Однако на сайте было предупреждение, что обычно нужно несколько подходов прежде, чем найдёшь рабочий вариант. У нас, к сожалению, денег на дополнительные попытки не было.

Думаю, если везти в кармане из-за бугра готовые пробы, будет намного дешевле, чем заказывать что-либо подобное здесь.
https://www.biosearchtech.com/products/rna-...aris-probe-sets

Сообщение было отредактировано semi - 28.06.2017 16:49

watchesbiz
Постоянный участник

22.06.2021 11:50

URL #18

https://jumpshare.com/v/QxZ9Rn2mfDCaBq2AdBG1
https://www.edocr.com/v/znnrba3z/watcheshut...lica-Watches-UK
https://www.tuugo.us/Companies/best-replica...s/0310006695505
https://topsitenet.com/article/988178-hints...ca-rolex-watch/
http://simp.ly/p/nxGlWb
https://telegra.ph/Hints-on-Choice-of-a-Hig...lex-Watch-02-22
https://replicarolexwatche2.blog.fc2.com/blog-entry-1.html
https://www.knowpia.com/s/blog_60f7e7c31014a97a
https://zenwriting.net/replicawatches24/hin...ica-rolex-watch
https://globalcatalog.com/replicawatchesuk.us/en
http://www.cplusplus.com/articles/iE1wvCM9/
https://eatsleepride.com/c/346210/hints_on_...ica_rolex_watch
https://www.myminifactory.com/users/watcheshutukcom
https://www.mioola.com/ReplicawatchesUK/post/199764/
https://en.gravatar.com/allreplicawatches24
https://8tracks.com/replicawatchesuk

merry89

09.05.2022 12:48

URL #19

https://www.360cities.net/profile/merry55
https://cannabis.net/user/118869
https://commiss.io/merryja
https://gab.com/imerry22
https://nootheme.com/forums/users/merry55/
https://coub.com/merry9915465
https://moparwiki.win/wiki/Post:Henry88
https://cycling74.com/author/6261302fc683e72b78bf55f5
https://deepai.org/profile/merry12
https://doodleordie.com/profile/merry500
https://fairygodboss.com/users/profile/XrIhCqRFNH/Merry-Ja
https://storium.com/user/merry44
https://themehunt.com/profile/merry44
https://www.bestadsontv.com/profile/406557/Merry-Ja
https://www.bitsdujour.com/profiles/GXG1Pu

Ufa1688
Постоянный участник

26.10.2022 17:03

URL #20

The arrest came 123goal the same week Britain warned 123goal dozens of former military pilots 123VEGA to stop working in China เครดิตฟรี or face prosecution สล็อตออนไลน์ on national security grounds ufa1688 under new laws. Australia ยูฟ่า1688 is also investigating reports some ufabet เข้าสู่ระบบ ทางเข้า of its former fighter pilots ลิงค์รับทรัพย์ have been approached UFA1688 to work in China.

guest: 123vega
IP-штамп: frXqkB4MpP2jQ
гость

12.11.2022 11:29

URL #21

A long, beautiful stretch SUPERSLOT เครดิตฟรี of sand in Australia's สล็อต โร มา เว็บตรง tropical far north, Wangetti Beach, was Toyah ทดลองเล่นสล็อตโรม่า Cordingley's favourite beach. It is also where she died, in what ROMA SLOT has been called a "frenzied and brutal and sadistic" attack. SLOT JOKER The 24-year-old had gone to the SLOTXO beach to walk her dog on 21 October 2018, as she เครดิต ฟรี กด รับ เอง 50 บาท had done countless times before, but never came home. The PG SLOT ซื้อฟรีสปิน next morning her father found her "messed up" body half buried in sand dunes. Her JOKER ROMA เว็บตรง beloved dog was tied up nearby, unharmed. Four PG SLOT ทางเข้า years on, Australian authorities are appealing for the public's help in an international hunt to find the man they believe killed Toyah - Rajwinder Singh.

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.