 * |   |
|
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда |  Zbio-wikiNG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: |
|
Правила
* Оборудование для бюджетной ПЦР лабы -- Посоветуйте пожалуйста --
Кураторы темы:* Coincedence
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.
   |
 Coincedence |
 29.09.2019 22:09
Возникла задача собрать более- менее бюджетную лабу где в научных и учебных целях будут ставить ПЦР прокариот и иногда высших растений. Прошу вашего совета, поскольку подозреваю, что есть более выгодные решения на рынке современной аппаратуры. Задачи: RT- PCR. Циклер: В уме держим какой - то из CFX 96 от BIO-RAD, но может сейчас есть что -то новее и бюджетнее...? Центрифуга: Eppendorf MiniSpin plus. может есть Elmi по дешевле? Самое интересное, в чем больше всего сомневаюсь: Система гель-документирования: В уме Bio-rad Gel-doc XR+ но есть другие, гипотетически дешевле, настораживают возможности нового софта и работа оного в основном под win10, а хотелось бы 7, накрайняк 8. Биорадовский как то привычнее. Настольный деионизатор, кто чем пользуется, кто - то бидистиллятом, кто просто дистиллятом из автоклава, но тем не менее систему очистки решено взять, чтобы не грешить на воду, если что не так... Есть ли бюджетные отечественные установки? Всем спасибо. |
|
автобан А9 |
30.09.2019 19:46
  примерно 100 баксов по ценам 1989 года 
|
|
vb Постоянный участник |
01.10.2019 05:09
риск, конечно, есть, не не больше, здесь на фопуме консультироваться. |
|
Guest IP-штамп: frLlk1iUohrRs гость |
01.10.2019 11:52
Торгашей у нас не много, и выбить постараются максимум - проверено (поэтому полагаться на них не очень хочется). Выйти напрямую на Диа-м или кого то еще, это само собой, просто хотелось бы "разведать почву", вдруг кто - то с высоты своего опыта решит дать совет. Общаясь с поставщиками все равно нужно держать в уме конкретную схему... |
|
MMM Постоянный участник |
01.10.2019 14:36
|
|
Schuler |
01.10.2019 14:41
RT- PCR. ваамщето RT-PCR амплификасия cDNA после обратной транскрипции можно сделать на Терцике   |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
01.10.2019 17:10
центрифугу Biosan или Eppendorf MiniSpin plus (дешево во время акций), бюджетное решение для гель документации российское решение от ИЛС или "Хеликона" Вода: или малая установка "Медиана фильтр" с прибамбасом для обессоливания водопроводной воды.или "Витал". У них тоже новый компактный агрегат. |
|
Coincedence |
01.10.2019 21:31
(MMM @ 01.10.2019 15:36)  Мне не очень понятно, почему вы покупаете Real Time и не покупаете обычный циклер и при этом вам нужна система визуализации в гелях и опять же нет ничего для гель фореза. Вы начальство пугать мулежами хотите или что-то делать в этой лаборатории. Если делать, то что. КДЛ, исследования, типирование.По поводу фореза просто особых колебаний не было - Bio-Rad PowerPac Basic. Опять же если есть другие аналоги - буду рад советам. Просто конкретно на этом аппарате сам работал, нареканий нет, вроде полностью устраивает. Муляжами чего? Гелей? Первая задача, если интересует - мониторинг наличия /отсутствия некоторых генов у прокариот, выделение последовательностей, может с перспективой отправки на сиквенс. |
|
Coincedence |
01.10.2019 21:34
(Vadim Sharov @ 01.10.2019 18:10) RT- PCR: от ДНК-технологии. центрифугу Biosan или Eppendorf MiniSpin plus (дешево во время акций), бюджетное решение для гель документации российское решение от ИЛС или "Хеликона" Вода: или малая установка "Медиана фильтр" с прибамбасом для обессоливания водопроводной воды.или "Витал". У них тоже новый компактный агрегат. Вот за это спасибо, гляну. Знать бы когда/где эти акции на эппендорф... Кажется есть центрифуга Elmi с подходящими параметрами, на 12 мест, понимаю что эппендорф круче, но все же... Гарантия лет 5. |
|
voron |
01.10.2019 21:43
(Coincedence @ 01.10.2019 22:34) Вот за это спасибо, гляну. Знать бы когда/где эти акции на эппендорф... Кажется есть центрифуга Elmi с подходящими параметрами, на 12 мест, понимаю что эппендорф круче, но все же... Гарантия лет 5. у еппера только фуги и пипетки ну шейкеры все циклера Еппера говно Знать бы когда/где эти акции на эппендорф... только не покупайте ето чюдо юдо |
|
voron |
01.10.2019 22:39
(Vadim Sharov @ 01.10.2019 18:10) RT- PCR: от ДНК-технологии. центрифугу Biosan или Eppendorf MiniSpin plus (дешево во время акций), бюджетное решение для гель документации российское решение от ИЛС или "Хеликона" Вода: или малая установка "Медиана фильтр" с прибамбасом для обессоливания водопроводной воды.или "Витал". У них тоже новый компактный агрегат. вадик ваамщето основателя BioSan в Латвии я знаю лично LowTech жылизяки |
|
us ed |
02.10.2019 08:17
|
|
us ed |
02.10.2019 08:56
|
|
Coincedence |
02.10.2019 10:34
(us ed @ 02.10.2019 09:01) можно собрать бесплатно из сэконд хенд кликните клич кто выбрасует пцр лабу Думаю в самой МСК желающих полно, но мысль интересная. На счет циклеров Эппендорфа - и в мыслях не было... |
|
us ed |
02.10.2019 11:06
(Coincedence @ 02.10.2019 11:34) Думаю в самой МСК желающих полно, но мысль интересная. На счет циклеров Эппендорфа - и в мыслях не было... позвоните в ИБХ ИМБ ну наконец в МГУ |
|
dk Постоянный участник Россия |
02.10.2019 11:26
Если из заявленных вами целей "мониторинг наличия/отсутствия генов" - то зачем вам реал-тайм? Именно наличие генов легко проверяется "классическим" ПЦР и визуализацией продукта "на геле". RT больше нужно больше для массовых анализов наличия продукта. Разница большая: у девочек тоже есть ген тестостерона, но, к счастью, они из-за этого мальчиками не становятся. Так что определитесь что и для чего вам конкретно нужно. Про оборудование - вы закладываете совершенно астронимический Био-Радовский гель-док, но при этом выбираете центрифугу подешевле? Честно сказать, я бы не экономил на центрифуге. Возьмите что-то нормальное из Эппендорфов 54-й серии - она точно проработает много лет. Элми/Биосан - это больше микроцентрифуги и "трясучки", не рассчитаны они на большие ускорения и долгую работу с максимальной нагрузкой. В той же 50-й Элми можно и пробирки крутить, но всё же лучше её использовать как хороший вортекс. Ну и можно для того же наш "Циклотемп" посмотреть. ПЦР-ницу от Эппендорфа покупать, может, и не стоит, но и обгаживать их нет никаких поводов. Да, дорогие, но греют-остужают годами. А так-то ломаются все - я и ABI видел убитыми, и "Терцик" (хотя не понимаю как его можно сломать). В принципе новые С-1000 с 96-й "головой" от БиоРада - нормальный бюджетный вариант RT. Правда, непонятно зачем он для ваших задач. Но его же можно легко использовать и как обычную ПЦР-ницу (а ещё в нём можно плашки сушить!). Про форез - вы назвали Bio-Rad PowerPac Basic - это всего лишь блок питания. При этом не имеет никаких особых преимуществ перед отечественным "Эльф", только стоит в разы дороже (про "надёжность" БиоРада не надо рассказывать). А вот про камеру - вы ничего не сказали. Проще всего камеры от "Хеликон" - есть и горизонтальные, и вертикальные. Хотя, если хочется широкие под многоканальные пипетки - то придётся брать набор от БиоРада типаSubCell GT (но это если вы планируете по плашке за раз гнать). Нареканий к ним нет, главное не разбить при периодической мойке - какой-то у них пластик "стеклянный". Далее, водоподготовка. Если очень хочется - то наша "Медиана-фильтр". Но тогда вы водой 1 типа и мыться сможете. Такую установку имеет смысл покупать если вы планируете большой расход хч воды, например, для приготовление сред. Но тогда нужен ещё ламинар, автоклав и остальная культуральная "кухня". Судя же по вашим потребностям можно обойтись покупкой готовой воды, несколько литров в год можно купить хоть в том же "Синтоле". А вот нормальный дистиллятор пригодится однозначно. Лучше брать наш ЛОиП или "Листон" - только сразу и пару наборов запасных тэнов к ним. Опять же гель-док - он точно вам такой нужен? Вы точно планируете вешать метки и смотреть дифференцированно-окрашенные носители? Если вы ещё и поглядываете в сторону отечественного "нано-чуда" типа системы "Взгляд" - то сразу выкиньте из головы эту мысль. Берёте обычный цифровой фотоаппарат, проковыриваете дырку в плотном почтовом ящике - всем этим накрываете транс. Всё, получаете тоже самое. Краденый софт для обработки изображений найдёте сами. К слову, ни про сам транс, ни про термостаты, ни про разные пипетки и пластик вы не упоминаете - а это тоже выйдет в очень немалую сумму. А так вам правильно тут говорят: или чётко напишите планируемые задачи (с возможным вариантом расширения спектра исследований), планируемый объём образцов в месяц, количество сотрудников - или просто пишете в "Диа-М" какой-нибудь симпатичной менеджерице: хочу ПЦР-лабораторию "под ключ".
|
|
Coincedence |
02.10.2019 12:50
На счет системы документирования - да, планируется мониторинг с разными метками, и возможно анализ блотов, это не только моя затея, на нем еще другая лаба будет работать (поэтому решили и особо не колебались). Извиняюсь если картина исказилась, просто я написал только те позиции в которых сомневаюсь, само собой кюветы для фореза и прочее подразумевается, и дозаторы / наконечники /штативы, и прочее. Про "громкоговоритель" систему "взгляд" -да, видел. Не впечатляет. Если колхозить из ящиков и камер - это другая история, принцип работы я конечно понимаю, но думаю начальство не оценит такого естествоиспытательства. На счет покупки готовой воды - не хотелось бы. (это крайний случай). В бюджетной организации закупки можно ждать годами, а могут и вообще послать. И вообще объяснять бухгалтерии зачем это, и каждый раз испытывать укоризненные взгляды хуже, чем разово потратиться, и гнать воду когда надо. Всё культуральное и так на ходу, автоклавы/ламинары, это всё само собой, я сознательно опустил этот вопрос. На счет "эльфа" как раз смотрю. P.s. а как здесь почистить тему? Это не модератором делается (не нашел), да загаживаются темы со сверсхсетовой скоростью. Сообщение было отредактировано Coincedence - 02.10.2019 12:51 |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
02.10.2019 14:06
О Третьякове (die Taube из Йены) авторе ников. Tretyakov A Department of Cell and Molecular Biology, Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology-Hans Knöll Institute (HKI), Jena, 07745, Germany. (yack @ 15.05.2019 11:11) Во-вторых, у меня нет возможности соревноваться с Третьяковым в вопросе, кому из нас больше нечего делать. Онанирует он на свои посты, или просто страдает недержанием в пьяном угаре - более я не располагаю временем его деятельность пресекать. |
|
dk Постоянный участник Россия |
02.10.2019 15:02
to Coincedence - вот, когда вы объяснили подробнее что и для чего - вам же самому стало гораздо проще ("Объяснял-объяснял - аж сам понял"). Тем более, как теперь понятно, вы создаёте лабораторию не "с нуля" а уже имея неплохой базис. Про конкретное оборудование, что вы упоминали на своём опыте могу сказать следующее. BioRad C-1000 + СFX-96 вполне рабочая вещь, вроде сейчас вылечили "болезнь" первых серий (какая-то микросхема ломалась ровно по окончании гарантийного срока). Его же вы сможете использовать как обычную ПЦРницу. Правда, кто серьёзно занимается экспрессией, метилированием и подобными тонкими штуками BioRad не любят. ИП "Эльф" - можете взять 4 или 8 (если потребуется большая мощность). Работают годами, без нареканий (хотя и про BioRad PP ничего плохого сказать не могу, кроме того что дорого). Водоподготовку - можно, конечно, взять "классическую" Milli-Q или отечественную "Медиана-фильтр". Самые малопроизводительные будут стоить примерно одинаково, но буржуйские картриджи будут сильно дороже, да и для питания им нужен ну очень хороший дистиллят. Гель-документация - это от задач зависит, там лицензионный софт занимает львиную долю в стоимости. |
|
Coincedence |
02.10.2019 16:10
Интересно почему...? И самое главное что они любят... Согласен, сборка BioRad C-1000 + СFX-96 и предполагалась, думаю ничего лучше нам все равно не потянуть. У них же есть как я понимаю самый "безмозглый" вариант основания - в вариации "Connect" там нет никаких процессоров и органов управления, всё делает ПК через USB. По практике, кроме их же вошеров, не видел смысла управлять приборами встроенными средствами, у нас не КДЛ, и отчеты печатать с приборов на принтер не надо. Но это лирика, думаю тут кому как нравится. По водоподготовке: да, Millipore хороший вариант, но цена... Еще есть RePhile PURIST UV по параметрам примерно то же самое. Кто что скажет? |
|
MMM Постоянный участник |
03.10.2019 07:01
Гель док если у вас много денег можете купить. Но большинство бюджетных именно лабораторий покупают транслюм(1000уе), ставят его в бывшую фотокомнату добавляют к нему бытовой фотоаппарат (типа олипус/сони 300-500уе) прикручивают к нему совейский ораньжевый фильтр, купленный на авито(ну еще штатив нужен для фотега(100уе), и радуются жизни. А так на гель док еще 15000 уе. Что касается белковых гелей и блотов, то они сканятся бытовым сканером Epson VX00, Х=3-8 это не дороже 800уе. ECL делается под рентгеновской пленкой. Потом сканится на том же сканере. Софт для обработки открытый - ImageJ. Все! Цетрифуги элми и биосан брать можно, но они хуже миниспина и не на много дешевле. Эльф 8 брать смысла не вижу, 4 более понятный. И они не такие уж дешевые, в сравнении с низко бюджетной линейкой биорада не так уж дешево. У биорада правда размеры не походные. Кстати тоже можно сказать про их(ДНК-технологии) амплификаторы с оптической детекцией, они не на много дешевле, дешевых импортных. И я совершенно не понимаю почему они ничего не делают со своим терциком. Стоит он как космос, а уровень технологий вторая половины 90х прошлого века. Неужели нельзя разработать что-то более новое и технологичное. Сообщение было отредактировано MMM - 03.10.2019 07:25 |
|
avor moderator |
03.10.2019 07:12
Теперь у вас появились новые значки в чужих постах. Вы можете удалять и редактировать чужие сообщения и кажется закрывать на самомодерирование. Но с Третьяковым самомодерирование бесполезно. Он никогда не возвращается к тому, что написал, что бы что-то исправить. Вот вернуться и разразится еще какой-нибудь повторной или новой серией тирад он может. Судари, простите, но что меня удивляет на этом форуме, Вот когда вы станете, старым и все знающим, не понятым и от того внутренне одиноким, посмотрим как вы будете смотреть на потуги юных молокососов. У Третьякова встречаются светлые мысли и его опыт не пропьешь(за это я и не веду с ним тотальных войн, как делал yack). Только вот со временем, чтобы извлечь ценные крупицы из его воплей, приходится все больше и больше сливать в помойку.
|
|
us ed |
03.10.2019 09:53
(Ossi @ 03.10.2019 10:47)  вадик, вадик на рояле нам играет девочки танцуют 
|
|
MMM Постоянный участник |
03.10.2019 12:16
(Coincedence @ 02.10.2019 17:10) да, Millipore хороший вариант, но цена... Еще есть RePhile PURIST UV по параметрам примерно то же самое. Кто что скажет? Для ПЦР вполне катит автоклавированная вода для инъекций из аптеки и нужны ее ну буквально мл. Для всего остального достаточно дистиллята. |
|
us ed |
03.10.2019 13:10
(MMM @ 03.10.2019 13:16) Для ПЦР вполне катит автоклавированная вода для инъекций из аптеки и нужны ее ну буквально мл. Для всего остального достаточно дистиллята.ваамщето обычный водопровод сойдет ммм ну я делал ПЦР на водопроводной воде полет нормальный никакой задницы не увидел мммыч придлагаю тебе организовать контору Вода ДЛя ПЦР
|
|
us ed |
03.10.2019 13:30
(MMM @ 03.10.2019 13:16) Для ПЦР вполне катит автоклавированная вода для инъекций из аптеки и нужны ее ну буквально мл. Для всего остального достаточно дистиллята.кстати на старых ионках прет такая ***ня что ингибирует ПЦР водопроводка даже рядом не лижала
|
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
03.10.2019 13:49
(Coincedence @ 02.10.2019 14:10) По водоподготовке: да, Millipore хороший вариант, но цена... Насколько я понимаю Merk ужо Виталовские водоподготовки, настольные или напольные около 200 тыр. Рублей!! На производство я брал "Медиану". Но там 16 тонн в сутки. В 5 раз дешевле западной. |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
03.10.2019 14:05
(MMM @ 03.10.2019 10:16) Для ПЦР вполне катит автоклавированная вода для инъекций из аптеки и нужны ее ну буквально мл. Для всего остального достаточно дистиллята.автоклавированная вода? "Вода для инъекций из аптеки" разве не фильтрация? |
|
vb Постоянный участник |
03.10.2019 14:53
(Vadim Sharov @ 03.10.2019 12:05) автоклавированная вода?"Вода для инъекций из аптеки" разве не фильтрация? а говоришь на производстве работал. предпочтительным методом стерилизации продукта является термическая стерилизация после укупорки контейнера. если таковая невозможна из-за свойств продукта, тогда допускаются иные методы. |
|
Coincedence |
03.10.2019 22:24
Насчет транслюма. Я понимаю что по сути это ящик с лампами, и если бы была цель только извлечь графическую информацию из гелей - я бы не колебался. Но тут еще существует некая образовательная задача, на этом должны будут учиться магистро-аспиранты всякие (учить не мне, но должно быть)... в т.ч. возможно и иностранные.. Всякий колхоз я бы для себя сделал, а тут боюсь начальство не оценит. Поэтому решили думать про этот гель-док. К тому же с софтом от него коллеги работали и знают что как. |
|
Coincedence |
03.10.2019 22:26
|
|
MMM Постоянный участник |
03.10.2019 23:39
Хотя если вам шашечки, то отговаривать бессмысленно. Лучше деньги сохранить на ферменты реактивы и наборы. Но вам виднее. У нас как всегда на ракету деньги есть, а на портянки не хватает. |
|
Vadim Sharov Постоянный участник Россия |
04.10.2019 00:51
(vb @ 03.10.2019 12:53) а говоришь на производстве работал.предпочтительным методом стерилизации продукта является термическая стерилизация после укупорки контейнера. если таковая невозможна из-за свойств продукта, тогда допускаются иные методы. Как я понимаю, Вам наплевать не только на русский язык, но и на правила форума На форумах сайта принято использовать "Вы" (а не "ты") при обращении к тем участникам, с которыми вы не знакомы. "Вода для инъекций" фасуется без автоклавирования после стерилизации фильтрованием на фильтре с порами 0,22 нм. Вода для инъекций вода с удельной электропроводностью не более 1,1мкСм/см, стерильная, апирогенная (вода для инъекций по ФС 2.2.0019.15 и EP 8.0 изд. 2014). "Автоклавирование после укупорки в контейнеры"? Вода будет золотой. |
|
Coincedence |
04.10.2019 09:21
У меня была мысль взять в фирме как раз старую систему, тоже какой - то гельдок наверное, квадратный весь такой ящик, и камеру нормальную приделать к нему, хоть не полный колхоз... Коллеги по - старше сказали что за старьё? Стали сомневаться. Вопрос по софту, к такому колхозу что посоветуете? Я честно говоря не знаю бесплатных систем анализа гелей по функционалу близких к Quantity / ImageLab или хоть напоминающих... Есть вроде надстройки над ImageJ, но не приходилось использовать. На счет китов / реактивов да, полностью согласен. Поверьте, нам то как раз "ехать", но существует много разных "но". Проявим инициативу, по такой оптимизации, потом за любой косяк - кто ответственный? |
|
электрик василий |
04.11.2019 17:48
(Coincedence @ 04.10.2019 10:21) На счет сохранить деньги скорее всего не получится. Они выделяются разово, и на них комплектуются несколько лаб. Мы можем сэкономить да, но нам другие скажут в стиле "спасибо, и идите на фиг" Но это лирика, не относящаяся к делу. У меня была мысль взять в фирме как раз старую систему, тоже какой - то гельдок наверное, квадратный весь такой ящик, и камеру нормальную приделать к нему, хоть не полный колхоз... Коллеги по - старше сказали что за старьё? Стали сомневаться. Вопрос по софту, к такому колхозу что посоветуете? Я честно говоря не знаю бесплатных систем анализа гелей по функционалу близких к Quantity / ImageLab или хоть напоминающих... Есть вроде надстройки над ImageJ, но не приходилось использовать. На счет китов / реактивов да, полностью согласен. Поверьте, нам то как раз "ехать", но существует много разных "но". Проявим инициативу, по такой оптимизации, потом за любой косяк - кто ответственный? коинседенс ПСР народ делал в СССР с 1988 за рубли и при помощи лаборанток и трех бань не еби людям моски |
|
электрик василий |
04.11.2019 17:51
(электрик василий @ 04.11.2019 18:48) коинседенс ПСР народ делал в СССР с 1988 за рубли и при помощи лаборанток и трех бань не еби людям моски |
|
watchesbiz Постоянный участник |
 04.11.2021 09:34
|
|
watchesonline89 Постоянный участник |
25.12.2022 10:30
|
| « Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |
 |
· Викимарт - все интернет-магазины в одном месте · Доска объявлений Board.com.ua ·
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---
Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Powered by Invision Power Board(Trial) v2.0.0 © 2024 IPS, Inc.