Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Технологии секвенирования следующего поколения. -- Куда двигаться дальше? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Кураторы темы:* genseq
Чёрный список: R-J-Dio, breznak, Acer-X
     NB! в теме нельзя обсуждать тех, кто внесён в чёрный список
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


страницы (24): « < 18 19 20 21 22 > »  
Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 08.06.2017 11:28     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Первые поставки пошли через СкайДжин, но они не являются эксклюзивными представителями Oxford Nanopore, а желающих заработать на продаже нанопоровых секвенаторов немало. jump.gif

Стартовый кит MinION (Basic) стоит $1000:
https://store.nanoporetech.com/minion/sets/?___SID=U
Если наценка восьмикратная ($8000), то это многовато. Двукратную вряд ли найдёте из-за "заморочек" с холодовой цепью, но на трёхкратную вполне можно рассчитывать. Так что соберите несколько коммерческих предложений и выберите на свой вкус. Если самой лень, то обращайтесь в личку. Из любопытства сейчас позвонил в одну из компаний и запросил коммерческое предложение. Не сегодня-завтра обещали прислать. shuffle.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): NMR-guy
Участник оффлайн! NMR-guy
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 08.06.2017 18:29     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Выложите ПОЖАЛУЙСТА первые батчи сырых данных этого прибора в архивах в текстовом формате. ОЧЕНЬ настоятельно прошу.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.06.2017 09:44     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(NMR-guy @ 08.06.2017 16:29)
Ссылка на исходное сообщение  Выложите ПОЖАЛУЙСТА первые батчи сырых данных этого прибора в архивах в текстовом формате. ОЧЕНЬ настоятельно прошу.


http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERR1898537
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5426553/

Сообщение было отредактировано genseq - 10.06.2017 09:49

Файл/ы:

скачать файл Long_2017.pdf
размер: 3.79мб
кол-во скачиваний: 222


Участник оффлайн! vak
Постоянный участник
Мюнхен



 прочитанное сообщение 30.06.2017 11:56     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Народ, повангуйте, когда появится некий "23andme++" или там "23andme NextGen".

(23andme стартовал так задорно, но я разочарован нынешним положением дел спустя 5 лет)

Вообще, ИМХО, нужно было изначально разделять сервисы на две важные составляющие:

1. качественное секвенирование -- деливерить данные и не заниматься в рамках этой компании ничем больше, чтобы не воевать со всякими FDA и прочими мафиями

2. качественный анализ на основе данных, залитых заказчиком

причем анализ делать в странах без е**нутых законов и воинствующих клериканских настроений -- например, в этих ваших скандинавиях, в новых зеландиях, австралиях, даниях, нидерландах и даже прочих уругваях, где рейтинги свобод просто зашкаливают.
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 30.06.2017 14:06     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

2. качественный анализ на основе данных, залитых заказчиком

причем анализ делать в странах без е**нутых законов и воинствующих клериканских настроений -- например, в этих ваших скандинавиях, в новых зеландиях, австралиях, даниях, нидерландах и даже прочих уругваях, где рейтинги свобод просто зашкаливают.


то есть Вы считаете это нормально, если человек прочитает, что у него предрасположенность к раку и покончит жизнь самоубийством?
Участник оффлайн! vak
Постоянный участник
Мюнхен



 прочитанное сообщение 30.06.2017 14:23     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(kblag @ 30.06.2017 12:06)
Ссылка на исходное сообщение  то есть Вы считаете это нормально, если человек прочитает, что у него предрасположенность к раку и покончит жизнь самоубийством?

а вы считаете нормальным, что психически неустойчивые должны определять, к чему иметь доступ психически устойчивым? confused.gif

а что быть с этим, тоже закрыть?
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%D1%80%...%83%D0%BE%D0%BB

а ножи домохозяйкам тоже больше не продавать, потому что у некоторых психически неустойчивых бывают плохие настроения?

Повесьте при входе в сервис жирную объяву, что все результаты являются вероятностными и носят лишь экспериментальный характер, что псих неустойчивым этим сервисом пользоваться КАТЕГОРИЧЕСКИ не рекоммендуется. И что на PubMed'e невероятно высокая квота ошибочных посылов.

Вообще, зачем эти полумеры, лучше запретить все буквы, а то ведь можно что-нибудь такое прочитать, от чего застрелиться захочется, я вам больше того скажу -- уже было и было не одну тысячу раз. Так что, будем последовательны и запретим буквы? shuffle.gif

из-за людей, люто защищающих свои неврозы, остальных делают обслуживателями этих самых неврозов -- huge dislike. wall.gif

P.S. я не буду в этой ветке оффтопить и обсуждать классический патерналистский бред этого типа. можно открыть эту тошнотворную тему отдельно wink.gif

Сообщение было отредактировано vak - 30.06.2017 14:28

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): Bern5, ржу громко, dk
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.07.2017 15:12     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

7 Jul 2017, publ: 17 Jul 2017
A world of opportunities with nanopore sequencing / Richard M. Leggett , Matthew D. Clar

Рекомендую:
https://peerj.com/preprints/3090.pdf

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): sceptique
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 21.07.2017 20:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Если хотя бы половина из Вами прикрепленного файла - правда, то весьма скоро, лет через 5-10, большая часть генетических лабораторий будут не нужны. Как сейчас никому не нужны печатные машинки.

И секвенировать проблему будут прямо на месте ее встречи все, кому продадут эти приборчики. А зная китайцев, думаю, "британские ученые" в этой области недолго будут монополистами.
Участник оффлайн! RYM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 02.08.2017 07:44     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

https://geektimes.ru/post/291613/

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): dk, genseq
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 02.08.2017 18:49     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(RYM @ 02.08.2017 05:44)
Ссылка на исходное сообщение  Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

https://geektimes.ru/post/291613/


Немного о предыстории этого проекта:
https://yadi.sk/i/EB3Il4HzkTniz
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 02.08.2017 19:24     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(RYM @ 02.08.2017 08:44)
Ссылка на исходное сообщение  Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

Полностью согласен с мнением одного из участников обсуждения, на все 100%:

Проделанная автором работа впечатляет и заслуживает всяческих похвал. Однако, как это зачастую бывает с работами талантливых инженеров, практический «выхлоп» от этого ре-инжиниринга пока невелик.
Использование, и даже многоразовое использование фирменных картриджей, на руку их производителю. С ходу назову две причины:

1. Как и производители мешков для пылесосов, картриджей для принтеров и Неспрессо-кофе и т.п., даже несанкционированное повторное использование оригинальных картриджей «льёт воду на колесо» продаж производителя. Пускай даже обладатель самодельного анализатора и не купит сам прибор, но при активной работе сколько-то картриджей он всё-равно потребит. Опять же, это косвенный промоушен определённого бренда в пику другим производителям аналогичных товаров и услуг.

2. Потребитель картриджей «сидит на крючке» производителя и не представляет для него ни конкуренции ни угрозы. Так, в своё время, Стив Балмер из Майкрософта публично благодарил пиратов за распространение их ОС, потому как вторую другую ОС на тот же компьютер, за редким исключением, никто не устанавливал. Так и с картриджами. Собственно, с их продаж производители и расчитывают получать главную прибыль. Копируя что-то можно только всё время догонять оригинального производителя, но никогда его не превзойти. Собственно говоря, ре-инжиниринг ценен именно тем, что даёт понимание как сделать по-другому и лучше.

Как бы в такой ситуации действовал Западный предприниматель?
1. Изучил оригинальный патент,
2. сравнил его с результатами ре-инжиниринга,
3. разработал альтернативу «в обход» патента,
4. запатентовал свою разработку,
5. наладил производство с качеством не хуже и по меньшей цене,
6. начал вовсю использовать свой продукт сам, и уже затем
7. предложил пользователям оригинального продукта. Только на этом этапе оригинальный производитель может «увидеть» конкурента. Тут и потребуются «мускулы» стоящей за спиной юридическо-бюрократической системы для защиты интеллектуальной собственности.

Конечно, это не под силу одному, даже очень талантливому человеку. Для этого существуют Инновационные Инкубаторы и т.п. За ними стоят или государство, или большие деньги, или и то и другое. За примерами далеко ходить не нужно имея под боком опыт технологического взлёта Китая. Опять же, существует немало российских хай-тек фирм, разработки которых успешно реализуются Западными корпорациями по вышеописанной схеме.

На этом остается завершить пост и пожелать автору Здоровья и Удачи!

Там еще Kriminalist правильные вещи излагает.


От себя два слова - из пустого в порожнее... no.gif,и вечные догонялки. frown.gif

Генсек, пора делами более космическими заняться. smile.gif

Кстати, там наш kblag тоже репликами пытается что-то выразить.


Сообщение было отредактировано -Ъ- - 02.08.2017 19:26

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): esp
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 02.08.2017 20:06     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Полностью согласен с Ъ.

Так напрягаться, даже до развода, чтобы родить никому не нужную альтернативу, которая никогда не пройдёт ни лицензирований, ни регистраций, и которой нужны грязные б/ушные проприетарные чипы устаревших поколений этих пылесосов по заоблачным ценам - сразу фтопку.

Я, начиная читать, подумал что аффтар в итоге отправит готовые шаблоны чипов в Зеленоград и ждет установочную партию для проверки в своей стендовой модели, но ошибся. Он ждёт электровентиль и мечтает о рынке моечных машин для нелицензионной и преследуемой законом о защите патентов в любой стране кроме китая рекуперации проприетарных чипов.

Лучше бы поступил на ФизТех или в Бауманский и воспроизвел поровый секвенатор. Это, в отличие от помоечных (в буквальном смысле) чипов прошлой эпохи секвенирования, вполне может быть его уровень. Если угадает с длиной линкера при белковом инжиниринге поры в мембранах. А также с АЦП егойного USB-шного патч-клямпа.

Сообщение было отредактировано sceptique - 02.08.2017 20:07
guest: ASDF
IP-штамп: fr4I3qoC2Qq4.
гость



 прочитанное сообщение 04.08.2017 08:57     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     

Ъ, вы кажется не совсем понимаете суть ключевого здесь термина DIY )))
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 04.08.2017 10:24     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

Вы такую конкретику шарахнули, а я и не понимаю о чем речь.
О каком термине DIY идет речь, где это было?
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 04.08.2017 10:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Пан ASDF шутит. Намекая что в случае описанного "гения"-реконструктора важнее был не результат, а сам процесс. Чем бы дитя не тешилось, типа.
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 07.08.2017 14:35     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(guest: ASDF @ 04.08.2017 09:57)
Ссылка на исходное сообщение  Ъ, вы кажется не совсем понимаете суть ключевого здесь термина DIY )))

К моему стыду, я вообще не знал о существования этого термина.
Сегодня, случайно наткнулся на него...
Век живи, век учись, а дураком помрёшь. no.gif

Всего благодарностей: 8Поблагодарили (8): esp, Bern5, bee3, citypizza, trump2, meteo, Guest1-1, Alex Soldatov
guest: ASDF
IP-штамп: fr4I3qoC2Qq4.
гость



 прочитанное сообщение 10.08.2017 20:33     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы     

(sceptique @ 04.08.2017 10:32)
Ссылка на исходное сообщение  Пан ASDF шутит. Намекая что в случае описанного "гения"-реконструктора важнее был  не результат, а сам процесс. Чем бы дитя не тешилось, типа.

Да почему шучу то? DIY - своя вселенная, пересекается с биохакингом, и вообще ...))). У них даже конференции свой проводяться, так что все серьезно.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 31.08.2017 19:20     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Кстати, о DIY-секвенаторе. Недавно появился посвящённый его разработке сайт:
http://sokolov.expert/
Там уже и старенький ДНК-синтезатор разобрали.
Участник оффлайн! kb1
Участник



 прочитанное сообщение 01.09.2017 14:24     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 31.08.2017 20:20)
Ссылка на исходное сообщение  Кстати, о DIY-секвенаторе. Недавно появился посвящённый его разработке сайт:
http://sokolov.expert/
Там уже и старенький ДНК-синтезатор разобрали.


А старенький запорожец ре-инженирить они не пытались? smile.gif Это встретило бы куда больший отклик на просторах Рунета

С одной стороны, стремление познать устройство вещей весьма похвально, и возможность многократно использовать одноразовые чипы для кого-то может быть полезным (помню как на заре своей трудовой деятельности мыл носики и эппендорфы), но "разрабатывать" что-либо где ключевой элемент это б/у расходники из помойного ведра... Конечно, каждый волен направлять свои усилия на достижения собственных целей, но зачем же гордо заявлять, что мы на пороге создания, хоть и скопированного, но своего секвенатора. А ну как чипы на помойке закончатся? Что делать будем?
Участник оффлайн! КапризныйПрофессор




 прочитанное сообщение 05.09.2017 01:50     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

Секвенирование ДНК в домашних условиях
https://geektimes.ru/post/291613/
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  05.09.2017 08:59     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

https://yadi.sk/i/EB3Il4HzkTniz
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 05.09.2017 11:50     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

Спрашивается на фига тему клонировать. Про этого Соколова уже обсуждали:
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=484510&st=950
А это из обсуждения (на мой взгляд самый меткий отзыв):

Секвенирование ДНК в домашних условиях: как на коленке собрать прибор за 10 миллионов

Ъ полностью согласен с мнением одного из участников обсуждения, на все 100%:

Проделанная автором работа впечатляет и заслуживает всяческих похвал. Однако, как это зачастую бывает с работами талантливых инженеров, практический «выхлоп» от этого ре-инжиниринга пока невелик.
Использование, и даже многоразовое использование фирменных картриджей, на руку их производителю. С ходу назову две причины:

1. Как и производители мешков для пылесосов, картриджей для принтеров и Неспрессо-кофе и т.п., даже несанкционированное повторное использование оригинальных картриджей «льёт воду на колесо» продаж производителя. Пускай даже обладатель самодельного анализатора и не купит сам прибор, но при активной работе сколько-то картриджей он всё-равно потребит. Опять же, это косвенный промоушен определённого бренда в пику другим производителям аналогичных товаров и услуг.

2. Потребитель картриджей «сидит на крючке» производителя и не представляет для него ни конкуренции ни угрозы. Так, в своё время, Стив Балмер из Майкрософта публично благодарил пиратов за распространение их ОС, потому как вторую другую ОС на тот же компьютер, за редким исключением, никто не устанавливал. Так и с картриджами. Собственно, с их продаж производители и расчитывают получать главную прибыль. Копируя что-то можно только всё время догонять оригинального производителя, но никогда его не превзойти. Собственно говоря, ре-инжиниринг ценен именно тем, что даёт понимание как сделать по-другому и лучше.

Как бы в такой ситуации действовал Западный предприниматель?
1. Изучил оригинальный патент,
2. сравнил его с результатами ре-инжиниринга,
3. разработал альтернативу «в обход» патента,
4. запатентовал свою разработку,
5. наладил производство с качеством не хуже и по меньшей цене,
6. начал вовсю использовать свой продукт сам, и уже затем
7. предложил пользователям оригинального продукта. Только на этом этапе оригинальный производитель может «увидеть» конкурента. Тут и потребуются «мускулы» стоящей за спиной юридическо-бюрократической системы для защиты интеллектуальной собственности.

Конечно, это не под силу одному, даже очень талантливому человеку. Для этого существуют Инновационные Инкубаторы и т.п. За ними стоят или государство, или большие деньги, или и то и другое. За примерами далеко ходить не нужно имея под боком опыт технологического взлёта Китая. Опять же, существует немало российских хай-тек фирм, разработки которых успешно реализуются Западными корпорациями по вышеописанной схеме.

На этом остается завершить пост и пожелать автору Здоровья и Удачи!

Там еще Kriminalist правильные вещи излагает.


От себя два слова - из пустого в порожнее... no.gif,и вечные догонялки. frown.gif

Генсек, пора делами более космическими заняться. smile.gif

Кстати, там наш kblag тоже репликами пытается что-то выразить.

Сообщение было отредактировано -Ъ- - 02.08.2017 20:26
Участник оффлайн! R-J-Dio
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 05.09.2017 12:24     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

по пункту 5 или 6. Он не наступает, тк. после п.5 идет продажа компании большому игроку, а
бабло тратится на создание чего-то нового, как правило, намного менее успешного, ибо на долю человека (за искл. гениев) приходится один хит за жизнь
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 05.09.2017 14:03     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Кстати, там наш kblag тоже репликами пытается что-то выразить.

надеюсь это комплемент smile.gif
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 05.09.2017 14:51     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(kblag @ 05.09.2017 15:03)
Ссылка на исходное сообщение  надеюсь это комплемент smile.gif

Не фига, зайдите на Комментарии и найдете себя.
kablag, если "ошибился" - пардон.
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 05.09.2017 15:10     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

да я в курсе, что писал там. А что конкретно вызвало Ваше недовольство?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.09.2017 12:07     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

https://leader-id.ru/event/4902/
21 сентября в Агентстве стратегических исследований (г. Москва, Малый Конюшковский переулок, д. 2) состоится "стретегическая сессия" на тему «Технологии секвенирования следующего поколения в России – что нам делать своего?»

Первоочередной вопрос:
"Нужно ли разрабатывать в России собственные технологии секвенирования следующего поколения ...?"
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 10.09.2017 14:03     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Скажите там всем, что кроме порового секвенирования через 5-10 лет в мире ничего не останется.

Пусть заказывают не лажу, которую уже направляют на помойку на Западе (то есть - в наши взяткооткаточные круги), а поровые секвенаторы. На вопрос "что нам делать своего?" - прямой ответ: поровые секвенаторы. И делать должны не дедушки с именами и альцгеймерами (и тяжелым алкоголизмом в терминальной стадии) и не их горе-потомки, а реально самые свежие и опытные группы на текущий момент времени. Иначе дедушки опять всё попилят, а их потомки начнут ныть что у них ничего нет для клиники давайте отдадим все деньги зарубежным корпорациям, на службе которых они состоят.

Всего благодарностей: 4Поблагодарили (4): Neo 777, criplenie, -Ъ-, dk
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.09.2017 14:44     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Меня там, скорее всего, не будет. Так что скажите всё сами. У них, если не ошибаюсь, участие возможно и в режиме веб-конференции.
Участник оффлайн! Neo 777
Участник



 прочитанное сообщение 10.09.2017 18:38     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Ответ, наверное, простой:
помимо всего "заказанного", мы должны уметь производить все свое - методики, секвенаторы, расходники и т.п. - качеством не хуже зарубежных. Головы у нас хорошие, была бы задача четко поставлена. Лучше - Кремлем.
Хотя, судя по качеству наших отечественных автомобилей и отсутствия на рынке адекватных моделей ноутов и сотовых телефонов, - далеко нам еще до отечественных секвенаторов и технологической независимости...
Участник оффлайн! MMM
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 10.09.2017 20:28     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Кроме голов там нужны элементарные деньги и просто квалифицированные кадры для создания того, что называется отраслевой инфраструктурой.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 14.09.2017 19:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

В США тратят на проект PMI (секвенирование миллиона американцев) больше 300 млн.$ в год. umnik.gif
Сколько миллионов (или миллиардов) рублей в год нужно тратить в России, чтобы догнать и перегнать Америку? confused.gif
Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 14.09.2017 21:19     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Как уже здесь писали - нет инфраструктуры. Один из ключевых элементов американской программы - использование слинкованных с частью геномных данных электронных медицинских карт. Уже пошли публикации с анализом 50 тысяч электронных карт с экзомами.
А у нас 60 геномов сделали в рамках Геномов России. Великое дело. Целых 32 экзома раковых вот недавно с постером на ЕСМО ездили (результаты РНФ, между прочим). Еще пару десятков экзомов уже третий год по российским конференциям с одним докладом катаются. Дальше продолжать?)

Причем все сделать можно, не сразу, не завтра, но можно. Подняв заодно пару соседних отраслей - от медицины до бигдата-аналитики. Но только это тяжело, нудно и в жизнь чиновника может не поместиться. Поэтому лучше 60 геномов - так безопаснее. А деньги здесь уже неважны.

Сообщение было отредактировано avial - 14.09.2017 21:23

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): criplenie, sceptique, Neo 777
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 17.09.2017 02:36     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Авиал, я Вас немного ещё дальше расстрою: на мой взгляд, у нас в медицинских картах такое пишется и иногда в таких целях, даже в электронных картах, что это даже хорошо, что пока к ним ничего не пытаются линковать. lol.gif Будет еще хуже, чем сейчас, если миллион карт таким образом косвенно проверят генетикой и куда-то захотят подшить. lol.gif

Если такое кто сделает - слетит много дегенерировавших за 80-90 лет жизни голов. Которые сейчас на месте лишь по причине дружеской фальсификации статистики. А если часть маркеров будут высокозначимыми (OR 3-5 и выше), а в наших историях всплывёт вся кривая по политическим мотивам диагностика на их фоне - это ж как пилить сук на котором сидишь. Понятно, что больше 20-100 геномов, по десятку на патологию lol.gif, обычно - поставленную самими авторами исследований в своих отделениях, никто никому расследовать не даст. Во избежание, так сказать.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): Neo 777
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 17.09.2017 09:53     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

По данным Минздрава в 2016 году количество новых случаев ВИЧ-инфекции уменьшилось на 6,3%. По данным Роспотребнадзора это количество увеличилось на 5,3% (до 103,5 тысяч случаев). А за всё время наблюдения в России к началу 2017 года зарегистрировано 1114 тыс. носителей ВИЧ. Правда, с учётом умерших (243 тыс.) эта цифра будет меньше.

Расхождения связаны с тем, что Роспотребнадзор учитывает все положительные пробы, а Минздрав в этом году начал считать количество пациентов, вставших на учёт в антиспидовских центрах.

До недавних пор официальными считались данные Роспостребнадзора, но ни у кого не вызывает сомнений (кроме сомневающихся), что данные Минздрава по новым случаям более объективны. Да и умерших носителей ВИЧ пересчитывать нет смысла. Отсюда следует, что в начале следующего года официальными будут считаться данные Минздрава. И к выборам президента эпидемия ВИЧ пойдёт на убыль.

А при чём здесь секвенирование? Да ни при чём. Просто навеяло. shuffle.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 17.09.2017 10:24

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): sceptique, Neo 777
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 17.09.2017 22:34     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Дался вам этот спид, с ним вопрос уже закрыт давно.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 18.09.2017 08:21     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Вопрос ещё только открывается. Тем более, что количество ВААРТ-резистентных вариантов ВИЧ быстро растёт, и определять эти варианты лучше всего при помощи NGS.

Эпидемия ежегодно даёт больше 100 тысяч клиентов, готовых платить за секвенирование ВИЧ. И скоро их будет ещё больше. что может служить неплохим стимулом для развития NGS в России.

Цинично, конечно, наживаться на смертельно больных людях, но лучше так, чем никак.
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 18.09.2017 10:42     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Накой его секвенировать, если к каждому новому резистенту все равно не успеют сварить лекарство? Если бы у меня нашли ВИЧ, я бы не стал особо разбрасываться деньгами и имуществом - смысла нету никакого, и это в какой-то мере даже хорошо, в смысле есть определенность что точно через несколько месяцев-лет подохнешь от пневмонии или саркомы.
Участник оффлайн! Neo 777
Участник



 прочитанное сообщение 19.09.2017 01:20     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Скажу только одно, господа-товарищи.
В России много сейчас развалено. Наука тоже развалена. Все выживают, как могут в их гребаном азпромовском капитализме.
В науке и медицине МОЖНО решить много интересных кардинальных проблем, если заняться этим всем вместе, слаженно, скоординровано, с энтузиазмом, при полной поддержке государства.
Но ни наука, ни ученые нашему государству нахер, я извиняюсь, не нужны. Везде только БАБЛО на первом месте. Да еще мы собачимся друг с другом. Горько. Позор.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.09.2017 09:49     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Наука интернациональна. То, что вклад России в неё заметно уменьшился - это, конечно, обидно. Но причиной являются не столько нищенские зарплаты российских научных работников, сколько нехватка у них мозгов. Наиболее сообразительные сбежали за бугор, а оставшихся, как правило, интересует не столько наука, сколько возможность заработать на ней деньги. И если наука в России всё ещё жива, то это благодаря чудакам, которые, несмотря на наличие мозгов, не сбежали. И не стали молиться золотому тельцу.

Но вернёмся к нашим баранам.
Насколько мне известно, сейчас в России имеется два NovaSeq 6000 - в НИЦ "Курчатовский институт" и в ООО "ЦГРМ "ГЕНЕТИКО".
Может быть, есть и другие?

И ещё:
сколько сейчас в России нанопоровых секвенаторов MinION?

Хотелось бы украсить завтрашний доклад свежей информацией.
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 21.09.2017 18:53     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Можно из этой презентации брать слайды для своих докладов с измененной темой оформления и указания на Вас как на источник?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.09.2017 19:00     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Естественно. smile.gif
Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.09.2017 21:58     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Генсек, не удалось попасть на сегодняшнее сборище, но присутствющие передавали респект за доклад)
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 22.09.2017 19:16     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Спасибо за респект. И буду признателен за любые замечания, дополнения и предложения. Постараюсь их учесть в докладе на ВДНХ (зал №1, 13 октября, 11.00-13.00 Секция «Медицина 5 «П»: настоящее и будущее»):
http://congress.fedlab.ru/

И ещё немного о секвенировании:

скачать файл ______________4.pdf
размер: 93.54к
кол-во скачиваний: 232



Замечания и дополнения также приветствуются.
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 22.09.2017 20:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 22.09.2017 17:16)
Ссылка на исходное сообщение  Спасибо за респект. И буду признателен за любые замечания, дополнения и предложения. Постараюсь их учесть в докладе на ВДНХ (зал №1, 13 октября, 11.00-13.00 Секция «Медицина 5 «П»: настоящее и будущее»):
http://congress.fedlab.ru/

И ещё немного о секвенировании:

скачать файл ______________4.pdf
размер: 93.54к
кол-во скачиваний: 232



Замечания и дополнения также приветствуются.

Маниловщина и wishful thinking. Хоть бы один обычный ди-деокси секвенатор или нормальный реал-таим ПЦР циклер построили и олиги по-нормальному синтезировать и метить научились, а уж потом о постройке некстген секвенатора задумывались. Хотя для попила бюджета любой отмаз хорош.
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 22.09.2017 23:17     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Поровым секвенаторам меченые олиги не нужны. Нужна хорошая электроника, по типу как у патч-клямп-микроэлектродного усилителя на каждой ячейке. А с этим у нас вполне могут справиться.

Обычные олиги - уже давно научились.

Можете сколько угодно доказывать преимущества прецизионного клонирования без метионина на конце и какие все у нас безрукие и неспособные (это правда только про завлабов и академиков). А все уже будут через лет 5 секвенировать геномы, экзомы и микробиомы в приборах размерами с лазерный принтер и Вам глубоко сочувствовать.
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 22.09.2017 23:46     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 22.09.2017 20:16)
Ссылка на исходное сообщение  Спасибо за респект. И буду признателен за любые замечания, дополнения и предложения. Постараюсь их учесть в докладе на ВДНХ (зал №1, 13 октября, 11.00-13.00 Секция «Медицина 5 «П»: настоящее и будущее»):
http://congress.fedlab.ru/

И ещё немного о секвенировании:

скачать файл ______________4.pdf
размер: 93.54к
кол-во скачиваний: 232



Замечания и дополнения также приветствуются.

Замечание всего одно: завхозам и всяким дегенерировавшим академикам выгодно необратимое отставание РФ в области секвенаторостроения. Поскольку откаты с американского старья и софта лучше и безопаснее оставлять в оффшорах, чем напрягаться и нервничать чего-то разрабатывая с риском не справиться у себя дома. Нашим местным деятелям на самом верху кормовой цепочки экономически невыгоден наш же местный прогресс в этой области. Жить рантье на проценты с оффшоров после отползания за срок давности по всяким коррупционным расследованиям - это их вполне устраивает. А возня и риски в конструировании своих нанопоровых секвенаторов - нет... frown.gif

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): -Ъ-, -bI
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 25.09.2017 11:13     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

sceptique, одобрям! smile.gif, Вы правы, цветочки от меня. Но где выход то из метро!? eek.gif
А ведь Карбоныч прав на 100%. frown.gif

Генсек, охота тебе ликбезом заниматься. no.gif Способствуешь процветанию мракобесия чинуш в области "секвенаторостроения", вводишь в заблуждение неокрепшие умы, пардон.
А теперь что будем делать с порами, сужать или расширять? wink.gif
Слава богу не поддался твоему вредному влиянию лет 10 или 15 назад.
Участник оффлайн! sceptique
Постоянный участник
временной жизни



 прочитанное сообщение 25.09.2017 11:33     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Поры нужны только с моноканальным усилителем класса "патчклямп" с наносекундной постоянной времени усиления или оцифровки сигнала. Тут дело не в одной поре, а в комбинации работы максимального отношения сигнала к шуму, минимальной постоянной времени измерения и поры, которая протягивает через себя всё не слишком быстро, но и не слишком медленно, чтобы можно было измерять и назначать сигнал за время прохождения поры ровно одним нуклеотидомЪ wink.gif

Пилить госбюджет и выводить его себе на Кипр и в ЛюксембургЪ - всяко проще. Сейчас, кстати, разворачивается нешуточная борьба за пост конкурсного банкротного управляющего РАН, который следующие 5 лет будет иметь верховное право распродавать ее активы. Вы за кого болеете в этом ВысокомЪ Соревновании?

Выход из метро, дорогой неошибающийся -Ъ-, в том, чтобы не быть маньяком и не вовлекаться в то, что и так создано чтобы развалиться и погребсти под развалинами всех, кто живёт ради не совсем правильных вещей.

Сообщение было отредактировано sceptique - 25.09.2017 11:40
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 25.09.2017 11:53     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(sceptique @ 25.09.2017 12:33)
Ссылка на исходное сообщение  
Пилить госбюджет и выводить его себе на Кипр и в ЛюксембургЪ - всяко проще. Сейчас, кстати, разворачивается нешуточная борьба за пост конкурсного банкротного управляющего РАН, который следующие 5 лет будет иметь верховное право распродавать ее активы. Вы за кого болеете в этом ВысокомЪ Соревновании?

Я вне РАН давно и голосовать мне не придется. Ну если только позовут. wink.gif
А ведь я тоже люблю на Кипре отдыхать, регулярно. shuffle.gif

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 16.04.24 14:43
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft