molbiol.ru -> Выравнивание ДНК

> Все форумы > Тематические форумы > Биофизика и матметоды в биологии

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* Выравнивание ДНК
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

а.р.

15.04.2010 20:35

URL #1

Где лучше выравнять п-ти ДНК (около 150) (копии одного и того же ) между собой? Что ещё можно с ними сделать около-биоинформатического? Как оценить степень дупликаций, делеций и т.п.?

Mike Shelk
Участник
Москва

15.04.2010 21:24

URL #2

Clustal, Muscle, T-Coffee. Всё это есть в программе JalView. Можно ещё дерево построить, например

Pryanik
Постоянный участник
Redwood City, California

29.04.2010 07:25

URL #3

А они у вас абсолютно идентичные? Если да, то ничего сделать нельзя, только сказать что идентичные, а следовательно появились совсем недавно. А откуда последовательности?

Gregory

13.03.2019 15:46

URL #4

Я попробовал выравнять последовательности (ДНК) в T-Kofee, он отказался, т.к. есть буквы N в последовательности. Как лучше поступить в данном случае? Есть проги которые переваривают N?

simonenckostepan

Москва

14.03.2019 23:33

URL #5

У вас опыт в этой сфере есть?

Guest
IP-штамп: frgj57YPV3UUU
гость

15.03.2019 19:50

URL #6

(Gregory @ 13.03.2019 15:46)

Скачайте Ugene, там встроено несколько программ для выравнивания, попробуйте.

dk
Постоянный участник
Россия

01.04.2019 09:14

URL #7

Поддерживаю - uGene достаточно дружественный по интерфейсу и есть неплохой туториал (англ.) и уроки (русс.)

guest: 123
IP-штамп: frJhOCvSv9ICE
гость

31.05.2022 09:11

URL #8

SINCE LAUNCHING AMB CASINO HIS INVASION OF UKRAINE, RUSSIA'S FC SLOT PRESIDENT VLADIMIR PUTIN 88KTC HAS FACED AN UNPRECEDENTED 11HILO GLOBAL RESPONSE, FROM CULTURAL BOYCOTTS TO 123GOAL COUNTRIES RADICALLY 123VEGA TRANSFORMING THEIR ALLBET FOREIGN POLICIES. BUT THE สูตรสล็อต LONGER THE CONFLICT CANDY BURST GOES ON, THE MORE SIGNS THERE ปั่นสล็อต ARE OF DIVISIONS.

guest: 123
IP-штамп: frXqkB4MpP2jQ
гость

08.06.2022 12:58

URL #9

South Korea 123VEGA and the US launched WAZDAN eight missiles WM CASINO on Monday, in AFFILIATE response to a ลิงค์รับทรัพย์ volley of ballistic missiles fired by North Korea the 123GOAL previous day. It comes 88KTC as Pyongyang continues FC SLOT to escalate its AMB CASINO missile tests. South 11HILO Korea's president Yoon Suk-yeol.

guest: 123
IP-штамп: frpYd0YygcNIA
гость

09.06.2022 09:35

URL #10

Elon Musk has 123VEGA threatened to เกมสล็อต walk away from his JOKER GAMING $44bn takeover DREAMGAMING of Twitter, accusing เล่นสล็อต the social media company of "thwarting" his 11HILO requests to learn AMB CASINO more about its user base. In a letter filed FC SLOT with regulators, Mr Musk 88KTC said he was entitled 123GOAL to do his own measurement of spam accounts.

guest: 123
IP-штамп: frAWeMdOsBSXM
гость

11.06.2022 10:35

URL #11

Saxon Mullins 123VEGA says she once had PRAGMATIC PLAY romantic dreams of what her 'first time' would ICONIC GAMING be like. In none was หวยปิงปอง she paralysed by fear in a Sydney ปั่นสล็อต alleyway, aged 18, with a 123GOAL man she had met only minutes earlier. Ms 88KTC Mullins has always maintained FC SLOT this incident - in 2013 - was rape. It spurred AMB CASINO her to push for legal 11HILO reform in Australia, after a long court battle ended with a judge finding the man involved did not realise she hadn't consented to sex.

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.