Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Технологии секвенирования следующего поколения. -- Куда двигаться дальше? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Кураторы темы:* genseq
Чёрный список: Fikkefuchs
     NB! в теме нельзя обсуждать тех, кто внесён в чёрный список
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 12:10     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(Carbon Copy @ 09.11.2017 19:48)
Ссылка на исходное сообщение  Молодец, genseq, грамотно изложил первоочередные задачи советской власти! Ты только это, последний абзац убери или перепиши как-нибудь от греха подальше. Можно то же самое сказать, но другими словами.


Прошла ровно неделя после появления на Geektimes "жёсткого" варианта "Первоочередных задач":
https://geektimes.ru/post/295313/
Можно подвести первые итоги.
Новостей, как обычно, две. Одна - хорошая, другая - плохая. Начну с хорошей. Опус всего за неделю набрал 9 тысяч просмотров. jump.gif
Плохая новость заключается в том, что почти все комментарии (143 шт./7 дней) весьма негативные. weep.gif

P.S.: Carbon Copy был абсолютно прав. Писать нужно было не о "взломе ПО", а о "информационной безопасности" и о "реверс-инжиниринге программного обеспечения". Теперь хоть знаю, как это называется у профессионалов. wink.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 19.11.2017 17:35
Участник оффлайн! ksm
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 12:14     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

" ...весьма негативные" - хипстеры лютуют!
да, среди негативных пустозвонства тоже >95%, по моим скромным оценкам.
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 13:07     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

genseq, мне кажется Вы немного неправильно понимаете аудиторию geektimes. Для Вас секвенатор - это глобальная идея, а для читателей - очередная прикольная штуковина. Про то, как эту штуковину собрать читать прикольно, про то, как Россия должна догнать и перегнать - нет. Geektimes это не политический ресурс.
Но так как про сбор секвенатора на кухне или подробностей функционирования от опытного сервис инженера информации в статье нет, то и "выхлоп" соответствующий - обсуждение фразы про взлом.

Всего благодарностей: 2Поблагодарили (2): ksm, dk
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 17:27     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(kblag @ 19.11.2017 11:07)
Ссылка на исходное сообщение  genseq, мне кажется Вы немного неправильно понимаете аудиторию geektimes.


Аудиторию понимаю правильно. Именно в этой навозной куче можно найти требуемые жемчужные зёрна. Но в комментариях они не светятся. Пишут на личную почту. wink.gif

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): ksm
Участник онлайн! vb
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.11.2017 23:26     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 19.11.2017 15:27)
Ссылка на исходное сообщение  Аудиторию понимаю правильно. Именно в этой навозной куче можно найти требуемые жемчужные зёрна. Но в комментариях они не светятся. Пишут на личную почту.  wink.gif

ну удачи, коли так.

Всего благодарностей: 7Поблагодарили (7): Bern5, citypizza, meteo, bee3, магнитный штатив, genseq, dk
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 18.12.2017 10:52     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Сегодня - небольшая круглая дата. Количество просмотров публикации "Задачи отечественного секвенаторостроения" на geektimes.ru перевалило за 10 тысяч. beer.gif

Особых новостей в области NGS пока не вижу, хотя 1 декабря в Нью-Йорке завершилась конференция Oxford Nanopore. Её основные итоги описаны здесь:
http://omicsomics.blogspot.ru/2017/12/2017...ty-meeting.html
http://albertsenlab.org/ncm17-day-1-new-te...g-applications/
http://albertsenlab.org/ncm17-day-2-into-the-unknown/
Заметным событием (для тех, кто понимает) стала сборка гексаплоидного генома пшеницы (Triticum aestivum).
Новые секвенаторы SmidgION и PromethION обещают выпустить в продажу только во второй половине 2018 года. shuffle.gif

Ещё недавно появилась публикация о проблемах мобильного секвенирования (т.е. о MinION). Рекомендую: umnik.gif
скачать файл Challenges_2017.pdf
размер: 1.81мб
кол-во скачиваний: 50



И ещё в минувшую пятницу появилось сообщение о первом риде, длина которого превысила миллион нуклетидов (1,015 Mb):
https://nanoporetech.com/about-us/news/worl..._source=twitter

Сообщение было отредактировано genseq - 31.12.2017 12:55
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 07.01.2018 14:26     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Из-за праздников пропустил описание запуска MinION в Санкт-Петербурге от 31.12.2017:
https://vk.com/feed?w=wall254879850_165

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): ksm
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 19.01.2018 10:32     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Ещё одна пропущенная новость. Illumina недавно объявила о том, что продажа секвенаторов iSEQ 100 (проект Firefly) начнётся в I квартале этого года. Прибор довольно дешёвый (~$20 тыс.) и компактный (30.5×33×28 см, 16 кг). Способен за 17,5 часов секвенировать до 3000 ампликонов (2х150 bp):
https://www.genengnews.com/gen-news-highlig...eq-100/81255358
https://www.illumina.com/content/dam/illumi...70-2017-020.pdf

Сообщение было отредактировано genseq - 19.01.2018 10:34

Картинки:
картинка: Illumina_iSeq_100.jpg
Illumina_iSeq_100.jpg — (24.22к)   

Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 22.01.2018 13:42     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

А стоимость расходки неизвестна пока?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  22.01.2018 14:39     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

http://omicsomics.blogspot.ru/2018/01/iseq.html

The 2x150 cartridges are priced at $625 each, with small (~5%) discounts for packs of four.
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 22.01.2018 15:36     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

Генсек, подавай в суд, там тебя нагло используют:
http://anpro.group/#news
Очень крутой кит! tongue.gif
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 22.01.2018 16:08     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Новый компонент набора – Реагент В заменяет магнитные частицы AMPure® Beads на этапе финальной очистки библиотек* после стадии преамплификации.

так может частицы Генсека и он в доле wink.gif
Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.01.2018 10:14     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 22.01.2018 12:39)
Ссылка на исходное сообщение  http://omicsomics.blogspot.ru/2018/01/iseq.html
The 2x150 cartridges are priced at $625 each, with small (~5%) discounts for packs of four.

Тогда я чего-то не понимаю - а смысл менять Майсек вот на это? Что-то среднее получается между микрокитом за $800 с 8 млн. PE и нанокитом за $500 с 2 млн. PE. И вместо того, чтобы выпустить 4 млн. за $600 для майсека, они делают отдельный прибор. Опять маркетологи постарались, гениально просто.
Конечно, в качестве нового прибора цена вкусная, но в качестве удешевления NGS-анализа (например, 400-500 тыс. ридов за 100 баксов) опять глухо, при наличии майсека светлячок просто не нужен. А ведь могли бы занять нишу индивидуального таргетного секвенирования, для запуска 1-2образцов многие были бы готовы купить в дополнение к существующему зоопарку.
Участник оффлайн! ksm
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.01.2018 10:30     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

так новый прибор под амплисеки, чтобы цену на расходники клиентом отбивать, а ниша, о которой вы пишите - Сэнгер
Участник оффлайн! avial
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.01.2018 11:10     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

На панель размером меньше одной мегабазы (а это генов 20-30) на майсек надо копить 12 или 24 образца и то покрытие избыточное для герминальных. Вариантов дешево поставить такую панель для 1-2-3 образцов на сегодняшний день для иллюмины не существует - микро и нанокиты все равно слишком дороги. А потребность ставить 1-2-3 образца есть.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): sceptique
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.02.2018 22:14     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Новости нанопорового секвенирования:

1. В начале февраля прошли запуски MinION в Нижнем Новгороде и в Оболенске (!!!?):
http://www.skygen.com/novosti/nanoporovoe_...spotrebnadzora/
http://www.skygen.com/novosti/v_fbun_gnts_...ushchen_minion/

2. On 8th Feb 2018, Clive G Brown provided a tech update on Oxford Nanopore by webcast.
https://nanoporetech.com/about-us/news/tech...d-other-goodies
Key updates included:
A pathway to a sub-$1,000 genome using PromethION (and longer term, MinION). PromethION pricing is now on the store.
Introducing Flongle, an adapter for MinION and GridION that enables smaller, single-use flow cells for smaller samples. Flongle may be used in the lab for smaller tests of quality checks, outside the lab, or may be developed into tests for applications like diagnostics, agriculture, food safety, water testing, education. First Flongles will be available for Early Access around the London Calling conference.
As Oxford Nanopore aims to get closer to our anyone/anywhere goal, we are launching MinIT, a pre-configured IT solution that replaces a laptop for MinION or Flongle.


Картинки:
картинка: minit2.jpg
minit2.jpg — (94к)   



Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): LMP
Участник оффлайн! kblag
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 11.02.2018 22:31     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Про Оболенск подтверждаю - закуплено три штуки и пробный запуск был. У меня там брат работает rolleyes.gif
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.02.2018 10:46     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

А по-подробней можно? shuffle.gif
Как получилось.
Или пока рано?))
Участник оффлайн! SkyGen
Участник
Москва



 прочитанное сообщение 12.02.2018 12:00     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Коллеги, мы со своей стороны можем пригласить вас на вебинар - о нашем опыте инсталляций шести систем MinION в России - зарегистрироваться можно тут: goo.gl/tx9mq3

Сообщение было отредактировано SkyGen - 12.02.2018 12:03
Участник оффлайн! LMP
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.02.2018 12:12     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(SkyGen @ 12.02.2018 10:00)
Ссылка на исходное сообщение  Коллеги, мы со своей стороны можем пригласить вас на вебинар - о нашем опыте инсталляций шести систем MinION в России - зарегистрироваться можно тут: goo.gl/tx9mq3
ссылка не открывается. Вы бы программу вебинаров что ли выложили, а то звучит как реклама скаджина: чего её слушать она и так в "фирмах" висит.
Участник оффлайн! SkyGen
Участник
Москва



 прочитанное сообщение 12.02.2018 13:03     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Фотография  Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(LMP @ 12.02.2018 13:12)
Ссылка на исходное сообщение  ссылка не открывается. Вы бы программу вебинаров что ли выложили, а то звучит как реклама скаджина: чего её слушать она и так в "фирмах" висит.


Спасибо за ответ!
У нас ссылка открылась в сокращенном варианте - который указан выше.
На всякий случай вот оригинальная ссылка на регистрацию: https://events.webinar.ru/2966963/909971
вот сокращенная:
goo.gl/tx9mq3

Вы можете скопировать ее в браузер.

Название вебинара:
Успешные запуски секвенаторов MinION от Oxford Nanopore Technologies в России – теория и практика от СкайДжин

Анонс:
Технология нанопорового секвенирования сегодня занимает новые позиции в мировой науке: каждый день приходят новости о новых решаемых задачах и улучшении точности получаемых данных.
СкайДжин – официальный дистрибьютор Oxford Nanopore Technologies – приглашает вас принять участие в вебинаре, на котором мы расскажем не только о технологии, но и поделимся успешным опытом по запускам первых MinION в октябре 2017 - феврале 2018 года в российских лабораториях.

Дата: 26 февраля 2018 г
Время: 16.00 по московскому времени
Регистрация: требуется

Всего благодарностей: 3Поблагодарили (3): genseq, LMP, sceptique
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 13.02.2018 10:51     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Семинар "Три поколения секвенирования – что нового, сравнение, совместное применение" (15 февраля):
https://www.dia-m.ru/news.php?newsid=60530

Картинки:
картинка: _______.JPG
_______.JPG — (92.44к)   


*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 21.02.18 13:48
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft