molbiol.ru -> From: Бисульфитная конверсия

> Все форумы > Служебные форумы > Мусорница

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* From: Бисульфитная конверсия -- deleted by yack // id: 587867 --
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

DocCow

11.10.2018 16:04

URL #1

(Vares @ 11.10.2018 09:48)

Коллеги, подскажите какие существуют методы для оценки эффективности бисульфитной конверсии?

Можно ли как-нибудь оценить конверсию в рамках генома или только отдельные фрашменты с помощью ПЦР?

нафига вам нужен метилом и на каких клетках все давно в открытом доступе
скачайте с ENCODE Project

DocCow

11.10.2018 16:09

URL #2

(DocCow @ 11.10.2018 17:04)

нафига вам нужен метилом и на каких клетках все давно в открытом доступе
скачайте с ENCODE Project

https://www.encodeproject.org/

seQQgene

12.10.2018 06:32

URL #3

(Vares @ 12.10.2018 07:22)

Спасибо, я вот тоже праймеры на эти последовательности ищу, но пока безуспешно.

на кого праймеры

seQQgene

12.10.2018 06:35

URL #4

(Vares @ 12.10.2018 07:22)

Спасибо, я вот тоже праймеры на эти последовательности ищу, но пока безуспешно.

залейте клетки в агарозные шарики потом бисульфит избавитесь от геммора

seQQgene

12.10.2018 06:38

URL #5

(Vares @ 12.10.2018 07:35)

Праймеры на метилированную последовательность ДНК (которая не должна измениться в процессе конвертации) и на неметилированную (там где С переходит в U).

блин сиквенс праймеров чей промотер

seQQgene

12.10.2018 06:43

URL #6

(Vares @ 12.10.2018 07:37)

У нас очень маленький объем ДНК (от 20 до 100ng).

И есть вот такой набор https://www.abcam.com/fast-bisulfite-conver...t-ab117127.html

У нас

у кого у вас ?

ваамшето бисульфит начинается с клеток а не с днк

seQQgene

12.10.2018 06:46

URL #7

(Vares @ 12.10.2018 07:42)

Это не важно, может быть любой ген.

Будет полногеномный анализ.

кого

seQQgene

12.10.2018 06:49

URL #8

(Vares @ 12.10.2018 07:42)

Это не важно, может быть любой ген.

Будет полногеномный анализ.

посмотрите сначала ENCODE Project может до вас уже все сделано

seQQgene

12.10.2018 06:56

URL #9

(Vares @ 12.10.2018 07:22)

Спасибо, я вот тоже праймеры на эти последовательности ищу, но пока безуспешно.

нахера праймеры когды полногеномка адаптеры на иллюмину

seQQgene

12.10.2018 07:04

URL #10

(Vares @ 12.10.2018 07:42)

Это не важно, может быть любой ген.

Будет полногеномный анализ.

не морчьте людям яйца читайте тут
https://www.genome.gov/27553900/encode-tutorials/

seQQgene

12.10.2018 07:28

URL #11

(Vares @ 12.10.2018 07:22)

Спасибо, я вот тоже праймеры на эти последовательности ищу, но пока безуспешно.

ваамщето вы меня задолбали то вам праймеры то вам полногенмка

seQQgene

12.10.2018 07:35

URL #12

(Vares @ 12.10.2018 07:42)

Это не важно, может быть любой ген.

Будет полногеномный анализ.

девушка вы кабы определитесь с желаниями

seQQgene

12.10.2018 09:06

URL #13

(Vares @ 12.10.2018 07:35)

девушка если вам нужен промотер гена назовите хотябы ИМЯ ГЕНА

ИМЯ

seQQgene

12.10.2018 09:15

URL #14

(Vares @ 11.10.2018 09:48)

Коллеги, подскажите какие существуют методы для оценки эффективности бисульфитной конверсии?

залить клетки в легкоплавкую агарозу в виде шариков потом всю херню бисульфитом и отмывками

seQQgene

12.10.2018 09:22

URL #15

(Vares @ 11.10.2018 09:48)

чей прмотер гоняете

seQQgene

12.10.2018 09:30

URL #16

(ksm @ 11.10.2018 15:01)

https://www.illumina.com/science/sequencing...e-seq-wgbs.html
https://www.thermofisher.com/ru/en/home/lif...enrichment.html
короче, не могу найти, вроде юзают еще контроли с известными последовательностями и соответственно с заданной степенью метилирования. по ней перекалибровываются

короче, не могу найти

ксмыч гиномы бактерий точно не бисульфит