Rambler's Top100
Лёгкая версия форума* Виртуальная клавиатура  English  
Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы
Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Междисциплинарный биологический онлайн-журналZbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ


Темы за 24 часа  [ Вход* | Регистрация* ]  
   



Форум: 
 

Щёлкните, чтобы внести в Избранные Темы* Next-gen секвенирование в России -- Оно уже есть, или как? --
ИнтерЛабСервис - передовые технологии молекулярной диагностики
Кураторы темы:* genseq
Чёрный список: RJ Dio, Bern55
     NB! в теме нельзя обсуждать тех, кто внесён в чёрный список
Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.


Добавить сообщение в темуСоздать новую темуСоздать голосование
Участник оффлайн! LOGOVAZ




 прочитанное сообщение 20.12.2020 02:56     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 19.12.2020 16:46)
Ссылка на исходное сообщение  Проблема не в идеях. А в том, что Редактор давно не выходит на связь. Если он жив (и здоров), то форум ещё можно спасти. А если нет? frown.gif

Next Generation Sequencing
Tatiana Borodina
(030) 9406 1341
Tatiana.Borodina@mdc-berlin.de
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.12.2020 08:17     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Написал вчера Бородиной. Пока не отзывается. rolleyes.gif
Участник оффлайн! кузя007




 прочитанное сообщение 21.12.2020 13:38     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 21.12.2020 09:17)
Ссылка на исходное сообщение  Написал вчера Бородиной. Пока не отзывается. rolleyes.gif

в Берлине карантин с 10 вечера до 5 утра на улицу не выходить smile.gif

(genseq @ 21.12.2020 09:17)
Ссылка на исходное сообщение  Написал вчера Бородиной. Пока не отзывается. rolleyes.gif

дк вчера было воскресенье а мейл рабочий сильно сомневаюсь что Таня на работе при локдауне Берлина eek.gif confused.gif

(кузя007 @ 21.12.2020 14:48)
Ссылка на исходное сообщение  дк вчера было воскресенье а мейл рабочий сильно сомневаюсь что Таня на работе при локдауне Берлина eek.gif  confused.gif

Anal Biochem
. 2003 Oct 1;321(1):135-7. doi: 10.1016/s0003-2697(03)00403-2.
DNA purification on homemade silica spin-columns
Tatiana A Borodina 1, Hans Lehrach, Aleksey V Soldatov
Affiliations expand
PMID: 12963065 DOI: 10.1016/s0003-2697(03)00403-2
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение 21.12.2020 16:27     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(кузя007 @ 21.12.2020 14:38)
Ссылка на исходное сообщение 
Anal Biochem
. 2003 Oct 1;321(1):135-7. doi: 10.1016/s0003-2697(03)00403-2.
DNA purification on homemade silica spin-columns
Tatiana A Borodina 1, Hans Lehrach, Aleksey V Soldatov
Affiliations expand
PMID: 12963065 DOI: 10.1016/s0003-2697(03)00403-2

Ооогоо, какая инфа всплыла в поисках контактов чела! jump.gif
Ну вроде давно обсуждали, что молбиол КТО-ТО КОМУ-ТО продал, типа хозяин сменился. Нет?
Участник оффлайн! Ash
Участник



 прочитанное сообщение 21.12.2020 16:34     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(-Ъ- @ 21.12.2020 14:27)
Ссылка на исходное сообщение  Ооогоо, какая инфа всплыла в поисках контактов чела! jump.gif

А что за история?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 08.01.2021 19:00     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

В России в 2020 году появился первый секвенатор PromethION (на 24 ячейки, в НИИ ФХМ). beer.gif Второй (на 48 ячеек) тоже пришёл в прошлом году, но устанавливать будут уже в этом. jump.gif Есть ещё около десятка заявок, но они пока-что ждут появления обещанных правительством денег. rolleyes.gif
Участник оффлайн! -Ъ-
Постоянный участник
Москва



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  13.01.2021 16:25     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо

(genseq @ 12.01.2021 09:31)
Ссылка на исходное сообщение  rolleyes.gif

beer.gif
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 12.04.2021 09:07     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Интересно, появились ли обещанные деньги (и секвенаторы)? Тем более, что за прошедшие месяцы точность нанопорового секвенирования превысила Q20 (>99%):
https://nanoporetech.com/about-us/news/new-...q20-99-raw-read

Оксфордца по-прежнему на коне! Начали продават киты для чтения ультрадлинных ридов:
https://nanoporetech.com/about-us/news/oxfo...cing-ultra-long
Участник оффлайн! AFLP




 прочитанное сообщение 12.04.2021 21:53     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 12.04.2021 10:07)
Ссылка на исходное сообщение  Интересно, появились ли обещанные деньги (и секвенаторы)? Тем более, что за прошедшие месяцы точность нанопорового секвенирования превысила Q20 (>99%):
https://nanoporetech.com/about-us/news/new-...q20-99-raw-read

Оксфордца по-прежнему на коне! Начали продават киты для чтения ультрадлинных ридов:
https://nanoporetech.com/about-us/news/oxfo...cing-ultra-long

кривых ридов как вакцина Оксфорд астразенека
https://yandex.ru/search/?text=%D0%B2%D0%B0...&clid=1961774-1
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 21.04.2021 18:21     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Программа конференции "День ДНК - 2021":
https://cloud.mail.ru/public/oNGz/5uWiAosC3
Состоится 23 апреля в Пущино (ул. Институтская, д.3, конференцзал ИТЭБ РАН).
Вход свободный.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 22.04.2021 08:17     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

До начала конференции остался один день.
Участник оффлайн! Arsenij Jazenuk




 прочитанное сообщение 22.04.2021 14:33     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 22.04.2021 09:17)
Ссылка на исходное сообщение  До начала конференции остался один день.

генсек я в Пущино был последний раз при Иваницком и Феликсе Белоярцеве

https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%91%D0%B5%...%B2%D0%B8%D1%87
Участник оффлайн! Carbon Copy
Постоянный участник
So close no matter how far



 прочитанное сообщение 22.04.2021 20:39     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 21.04.2021 16:21)
Ссылка на исходное сообщение  Программа конференции "День ДНК - 2021":
https://cloud.mail.ru/public/oNGz/5uWiAosC3
Состоится 23 апреля в Пущино (ул. Институтская, д.3, конференцзал ИТЭБ РАН).
Вход свободный.

Вау! Саша Солонин ещё жив, здравствует и читает лекции! И Игорь Грановский тоже!
Участник оффлайн! adessa




 прочитанное сообщение 23.04.2021 12:30     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(Carbon Copy @ 22.04.2021 21:39)
Ссылка на исходное сообщение  Вау! Саша Солонин ещё жив, здравствует и читает лекции! И Игорь Грановский тоже!

вамщето день днк 25 апреля в пущино часы бегут
Участник оффлайн! adessa




 прочитанное сообщение 23.04.2021 12:49     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 22.04.2021 09:17)
Ссылка на исходное сообщение  До начала конференции остался один день.

eek.gif confused.gif
вамщето 25 апреля День ДНК eek.gif confused.gif
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 23.04.2021 12:51     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(adessa @ 23.04.2021 10:30)
Ссылка на исходное сообщение  вамщето день днк 25 апреля в пущино часы бегут


Решили перенести на пятницу. Чтобы в институте был рабочий день. Да и представителей компаний неудобно приглашать выступать в нерабочее время. А представители будут почти все (имеющие отношение к NGS).

Конференция сейчас в разгаре. Пока всё идёт строго по плану (по программе). wink.gif

Сообщение было отредактировано genseq - 23.04.2021 12:51
Участник оффлайн! adessa




 прочитанное сообщение 23.04.2021 12:53     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 23.04.2021 13:51)
Ссылка на исходное сообщение  Решили перенести на пятницу. Чтобы в институте был рабочий день. Да и представителей компаний неудобно приглашать выступать в нерабочее время. А представители будут почти все (имеющие отношение к NGS).

Конференция сейчас в разгаре. Пока всё идёт строго по плану (по программе). wink.gif

панятно 25 все сбегут на дачи smile.gif
Участник оффлайн! kb1
Участник



 прочитанное сообщение 24.04.2021 22:09     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 21.04.2021 19:21)
Ссылка на исходное сообщение  Программа конференции "День ДНК - 2021":
https://cloud.mail.ru/public/oNGz/5uWiAosC3
Состоится 23 апреля в Пущино (ул. Институтская, д.3, конференцзал ИТЭБ РАН).
Вход свободный.

А видеоролики с докладами будут?
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 25.04.2021 07:45     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

(kb1 @ 24.04.2021 20:09)
Ссылка на исходное сообщение  А видеоролики с докладами будут?


Черновой вариант записи здесь:
https://disk.yandex.ru/d/lwEKbPI02WlOtQ?w=1
На сайте института доклады будут после обработки.

Всего благодарностей: 1Поблагодарили (1): kb1
Участник оффлайн! nnnnnn123




 прочитанное сообщение 11.05.2021 21:20     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

(genseq @ 23.04.2021 13:51)
Ссылка на исходное сообщение  Решили перенести на пятницу. Чтобы в институте был рабочий день. Да и представителей компаний неудобно приглашать выступать в нерабочее время. А представители будут почти все (имеющие отношение к NGS).

Конференция сейчас в разгаре. Пока всё идёт строго по плану (по программе). wink.gif

да ысче к вам в Пущино низя без вакцины от кавид smile.gif
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 06.09.2021 15:33     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Выложил записи докладов конференции "День ДНК - 2021" на rutube.ru:
https://rutube.ru/channel/23593406/
Самый интересный - доклад Я.И.Алексеева. Рекомендую:
https://rutube.ru/video/d4fabb13f43aeadbcd9475ad17429ceb/
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение Сообщение на английском  16.10.2021 10:41     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

https://i.postimg.cc/qMZV72kd/Poster-on-the...X-1-5m-tall.jpg

user posted image
Участник оффлайн! mangga2bet




 прочитанное сообщение 17.10.2021 06:18     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

очень полезная информация. Благодарность smile.gif
Участник оффлайн! kb1
Участник



 прочитанное сообщение 18.10.2021 17:09     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Позвольте спросить, каким годом датирована картинка?
Я думал, что деньги собраны и контора давно закрыта.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 18.10.2021 19:25     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

Картинка этого года. Завтра и послезавтра (19-20 октября сего года) AXBIO будет представлять свой первый прибор на выставке "Диагнополис" в павильоне М8. Правда, это будет ещё не секвенатор, а нанопоровый анализатор ампликонов. Но я надеюсь, что секвенатор они всё-таки доработают. Если, конечно, перестанут ориентироваться на рошевскую технологию и модифицируют свой чип (уменьшат количество сенсоров с миллиона до 10000, повысят частоту считывания сигнала и т.п.) для использования с оксфордскими нанопорами.
https://1drv.ms/u/s!Aj-K-u-yGV9230Wt2xC...fScm2q?e=eluDzm
https://1drv.ms/u/s!Aj-K-u-yGV9230cr_mH...mM8Obp?e=xqVBS7
Участник оффлайн! kb1
Участник



 прочитанное сообщение 19.10.2021 15:48     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Гора родила мышь. И кому нужно анализировать ампликоны когда есть RT-PCR?
Их основная проблема - отсутствие биопоры. Сами создать они ее не могут, а делиться сними никто не хочет.
Участник оффлайн! kb1
Участник



 прочитанное сообщение 19.10.2021 15:48     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Гора родила мышь. И кому нужно анализировать ампликоны когда есть RT-PCR?
Их основная проблема - отсутствие биопоры. Сами создать они ее не могут, а делиться сними никто не хочет.
Участник оффлайн! kb1
Участник



 прочитанное сообщение 19.10.2021 15:55     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail

Да, их анализатор не нанопоровый, а на базе банального микроэррея с электрохимической детекцией
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 24.10.2021 09:49     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

В среду удалось попасть на выставку "Диагнополис" и заглянуть в павильон Axbio.

Секвенатор обещают выпустить в следующем году, хотя его экспериментальные образцы уже работают. Технология - рошевская. Т.е. нанопоровая, но с ДНК-полимеразой phi29 на входе в биопору и со специальными субстратами (модифицированными dNTP). Точность многократного чтения довели до Q30. Для определения снипов этого недостаточно, но идентифицировать любые возбудители метагеномным секвенированием препаратов можно. Производительность - 10 Gb/run, причём это всего за час. У MinION производительность 20...30 Gb/run, но это за двое суток.
Секвенирование одной пробы (чип + пробоподноговка +расходники) будет стоить ~$100.
Все прочие подробности можно будет узнать 25 апреля 2022 года на конференции "День ДНК - 2022" (Пущино, ИТЭБ РАН). Пообещали приехать туда с докладом.
Участник оффлайн! genseq
Постоянный участник



 прочитанное сообщение 25.10.2021 09:21     Сообщение для модератора  Сообщение для куратора темы       Личное письмо  Отправить e-mail  Web-адрес

В среду удалось попасть на выставку "Диагнополис" и заглянуть в павильон Axbio.

Секвенатор обещают выпустить в следующем году, хотя его экспериментальные образцы уже работают. Технология - рошевская. Т.е. нанопоровая, но с ДНК-полимеразой phi29 на входе в биопору и со специальными субстратами (модифицированными dNTP). Точность многократного чтения довели до Q30. Для определения снипов этого недостаточно, но идентифицировать любые возбудители метагеномным секвенированием препаратов можно. Производительность - 10 Gb/run, причём это всего за час. У MinION производительность 20...30 Gb/run, но это за двое суток.
Секвенирование одной пробы (чип + пробоподноговка +расходники) будет стоить ~$100.
Все прочие подробности можно будет узнать 25 апреля 2022 года на конференции "День ДНК - 2022" (Пущино, ИТЭБ РАН). Пообещали приехать туда с докладом.

*




Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.
Имя:

 преобразовывать смайлики · показать смайлики
Назначение кнопок:

   Поблагодарить автора сообщения — поблагодарить автора
   Удалить сообщение — удалить
   Редактировать сообщение — редактировать
   Поместить сообщение в колонку новостей — поместить в колонку новостей
   Цитировать — цитировать сообщение
   не входит в цитирование/входит в цитирование — цитировать несколько
   Отметить СПАМ-сообщение — обозначить спам
   Сообщение для модератора — связь с модератором
   Участник онлайн!/Участник оффлайн! — автор онлайн/оффлайн
   Фотография — фотография автора

   - остальные обозначения -
 
   *
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема »
Быстрый ответДобавить сообщение в темуСоздать новую тему

Rambler   molbiol.ru - методы, информация и программы для молекулярных биологов              

 ·  Викимарт - все интернет-магазины в одном месте  ·  Доска объявлений Board.com.ua  · 
--- сервер арендован в компании Hetzner Online, Германия ---
--- администрирование сервера: Intervipnet ---

Хеликон · Диаэм · ИнтерЛабСервис · Beckman Coulter · SkyGen · ОПТЭК · BIOCAD · Евроген · Синтол · БиоЛайн · Sartorius · Химэксперт · СибЭнзим · Tecan · Даниес · НПП "ТРИС" · Биалекса · ФизЛабПрибор · Genotek · АТГ Сервис Ген · Биоген-Аналитика
Ваш форум  ·  redactor@molbiol.ru  ·  реклама  ·  Дата и время: 28.10.21 20:32
Bridged By IpbWiki: Integration Of Invision Power Board and MediaWiki © GlobalSoft