Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
guest: Дарья IP-штамп: frbCgyJ2/3doE гость |
У меня имеются данные о аминокислотах и кодонах последовательности белка. В белке есть домена. Например, аланин - его кодируют четыре кодона GCT GCC GCA GCA Количество (в процентах %) кодонов(находящихся в домене белка): GCT = 26,98; GCC = 37,72; GCA = 24,74; GCG= 10,56 Вне домены: GCT = 26,89 GCC = 37,76 GCA = 24,85 GCG = 10,51 и, например, цистеин - его кодируют два кодона TGT, TGC Количество (в процентах %) кодонов(находящихся в домене белка): TGT = 49,81 TGC = 50,19 Вне домены: TGT = 49,14 TGC = 50,86 и такого рода информации имеется обо всех аминоксилотах и их кодонах. Вопрос в том, мне нужно сравнить процентное количество кодонов находящееся в домене и в не домены и связать это с тем, как эти кодоны в доменах и вне - влияют на скорость трансляции. Я вижу, что небольшая разница в процентном количестве, но я не могу понять, как связать это со скоростью трансляции и какой вывод я могу сделать. ***************************
сейчас текст сообщения виден только автору и модераторам; все остальные посетители увидят его только после утверждения модератором (письмо-уведомление модератору отправлено); автор сообщения МОЖЕТ редактировать текст ещё до утверждения |
Alexferguson123 |
Web Source: |
Diusha Участник Питер |
(guest: Дарья @ 28.08.2017 13:19) Если у Вас имеется информации о скорости трансляции (количество молекул белка в единицу времени) для разных белков в клетках организмов одного вида, то у меня есть идеи как подступиться к этой задаче. Могу вступить в соавторство и попытаться что-то сделать. Но не гарантирую, что будет быстро (со временем туговато). (guest: Дарья @ 28.08.2017 13:19) Я думаю, что вывод будет такого плана: какую лепту в скорость вносит кодон каждого типа. Т.е. можно получить среднее время задержки рибосомы на кодоне каждого типа (для организмов данного вида). Есть, правда, подозрение, что такие работы уже делались. Вы проверяли это? P.S. Никогда ранее не встречал, чтобы слово «домен» употреблялось в женском роде |
Diusha Участник Питер |
|
vidmate online IP-штамп: frUm3UvBGE2u. гость |
|
Online Java Assignment Help IP-штамп: frd3CQzGtnNIQ гость |
|
dissertation help online IP-штамп: frd3CQzGtnNIQ гость |
|
danny IP-штамп: frUyPz14V6dqs гость |
|
« Предыдущая тема · Мусорница · Следующая тема » |