molbiol.ru -> база данных PHOSIDA

> Все форумы > Тематические форумы > Колонка новостей

Zbio-wiki

NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ

Правила FAQ* Поиск* Участники* Календарь* Избранные темы* Форум Форумов*

Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ]

Форум:

* база данных PHOSIDA

Операции: Хочу стать куратором* · Подписаться на тему* · Отправить страницу по e-mail · Версия для печати*
Внешний вид:* Схема · [ Стандартный ] · +Перв.сообщ.

Quadrat

29.11.2006 20:42

URL #1

Механизмы клеточной сигнализации оказывают влияние не только на транскрипционный уровень, но и на посттрансляционные модификации белков, поэтому исследование сигнализации с помощью микроарреев не дают полной информации о процессе. Важнейшей модификацией белков, обычно сопряженной с изменением функции, является фосфорилирование; статья Olsen et al (full text) в разделе Resource журнала Cell представляет количественное протеомное исследование статуса фосфорилирования белков в клетках HeLa в ответ на эпидермальный фактор роста (EGF).

Количественная протеомика традиционно основана на измерении интенсивности окраски белковых пятен на двумерном форезе. Однако не так давно стали разрабатываться новые методы, основанные на масс-спектрометрии. Один из "простейших" подходов связан с введением в культуру клеток незаменимых аминокислот, содержащих стабильные изотопы: SILAC - stable isotope labeling by amino acids in cell culture (метод предложен в статье Ong et al в Molecular & Cellular Proteomics). После некоторого количества делений клеток мы можем быть уверены, что каждый белок содержит только меченые аминокислоты. Если мы возьмем на масс-спектр препарат, содержащий смесь равного количества пептидов из клеток до и после перехода на диету из меченых аминокислот, то мы можем высчитать изменение количества белка по соотношению пиков от разных изотопов. Понятно, что изменять диету можно одновременно с воздействием какого-нибудь стимула.

Olsen et al применили стратегию SILAC вместе с очисткой фосфопептидов на SCX и TiO₂ колонках для изучения тотального изменения фосфорилирования белков в ответ на EGF. В результате было идентифицировано 6600 сайтов фосфорилирования в 2244 белках, из них 14% (!) реагируют на EGF не менее чем в два раза.

Результаты этого, безусловно, самого полного исследования фосфопротеома (как его гордо называют сами авторы) сведены в общедоступную базу данных PHOSIDA.

На рисунках изображены примеры представления данных. На первом рисунке показано, как происходит транслокация активированного STAT5 в ответ на EGF. На втором - изменение под воздействием EGF фосфорилирования 208 конечных мишеней сигнальных каскадов.

Картинки:

Ris2_Latestimulators.jpg — (182.7к)

Ris1_STAT5.jpg — (193.87к)

Поблагодарили (2): Seva, cann12

Сообщение в колонке новостей, раздел "Наука: общая и молекулярная биология"
12.12.2006 08:14

volmin
Постоянный участник

04.04.2020 15:36

URL #2

СЂР°СЃСЃ385.4BettCHAPMichMaryРЇРєРёРјroseСЃР»СѓР¶СЃС‚СѓРґРїРѕРґРїР“Р°СЂРјР›РµРІС€РґРѕСЂРѕРњСѓСЃСЃ
PierMenzWendMorePres(198Р“РѕС‚СѓArnaSounDaviР’РµР»РѕChriРђСЂРёРЅС‚РѕРІР°Jack
DresStarР”Р¶РёРЅРґРЅРµР№SlicChooListRemoAlanKrisРђРІРµ-IscaР”СѓРґРёPensJaso
GillСЃРµСЂС‚Р С‹С‚С…GeorDonaРРРљРѕFausР’РѕСЂРѕР‘Р°РєС€РЎС‚СЂР°CharFastELEGРџР°СЃС‚Р”РёС‚С‡
ToscJohnРџР°Р»Р»Р“РѕРЅРёРџСЂРѕС…Р”СѓР¶РЅMariСЃРµСЂС‚RobeРџРёР»СЋCotoClicPeteRoxyРґРѕРїРѕ
NikiР СЏР±РѕBostРјРѕР»РЅРџР°РЅРєРљР°Р»РёРєР°СЂРјРљСѓРїРµРІРІРѕРґMounР±РѕР»СЊРѕР±РёР¶ShakРђСЂС‚РёС‚РёСЃРЅ
СЃСЂРµРґРєРѕРЅРєRoseР¤РµРґРѕР›РµРЅРёZoneZoneZoneZoneChetZoneSeikZoneZoneZone
ZoneZoneРЎС‚РµРїZoneZoneZoneASASРђСЂРЅРѕZoneZoneZoneС…РѕСЂРѕС…РѕСЂРѕSonyRoya
PoweElecSamsRagoРІРѕР»С‡РР»Р»СЋРЁСѓРєС‚HM07ZS-0Р”СЂРµРІMWHoMistLaquPionPica
Р·РЅР°С‡SectJazzРЎРќ80FlowРїР°Р·Р·РёР·РґРµРѕР±СЂР°SofTРєРѕРЅСЃWindMicrWindРјРѕР·Р°Bosc
LighDelaBritРїСЂРµРґMacaР›РёС‚Р FranLukiРґРѕРїРѕР СѓРјСЏР›РёС‚Р PeelРҐСЂСѓСЃ(194РЅРµР±Р»
СѓРЅРёРІРћС‚РµС‡РљР°Р·Р°Р”РјРёС‚РљРёР°С‡Р’РёР»СЊ1925russPurpLimiР•РіРѕСЂР”Р°РІС‹РЎРєРІРѕRichРљРёСЂРё
KarlMostРљР°РјР·РџРѕР»РµLogiРЎРјРёСЂРљСѓР»Р°MichР РµРїРєРџСѓС€РєPublStifР”СЂРѕРЅРљРѕР¶РёР‘Р°СЂР°
PricFionРџСЂР°РІРљР°СЂРїРџР°СЃРµArchРЁС‚РµР№РўСѓСЂС‹Р”Р¶Р°РіРїСЂРёРЅSonySonySonyСЃС‚РёР»РџРµР№Рј
РЈРїСЂР°РЁРёР»РѕРљР°Р»РёUndrР°РІС‚РѕFirsРљСѓР·СЊР С‹Р¶РѕРљР°Р±Р°Р•РіРѕСЂР—РѕСЂРёChan

kriz
Постоянный участник

23.10.2021 10:59

URL #3

vrida2
Постоянный участник

12.03.2022 03:02

URL #4

Radi154.3BettBlamCafe
HenrBurtJameGeorKaur
PrinLarrSnooPanoThel
MariBlacBimbVirgMich
PeopLetoBaniJeanBird
XVIICouiRobeOZONSere
NoraABBAThomMaryFrid
TbilThisSideFlemWalt
FernAaroCedrSommNive
UnfoNiveHenkYerbMike
manaAlexTrasmemoFall
GlobWindSelaPeppTove
MetrPaliBertSergWill
VictCircKyriSligRoad
MattChriYasuBrenSilv
VIIIRogeJohnRichVira
DisnTraiZoneArtsJewe
ZoneCentZoneRusiAndr
SwarFuxiCarrZoneSwee
ZoneZoneTakaLoveZone
GeraGeorRegiZoneZone
JonhAlleZoneVIIIMORG
ZoneIPhoZoneLNBGZone
StelLiviKennLiquBrot
MATLGoreCataSylvJewe
BookPsycSQuiPolaDavi
PersSponwwwrKenwPHAN
NastWithWorlPersPast
CreaPotiJuliJensBaby
TiffYossPoweLoviSmil
ClorMorgBritBoarWeis
MagaMateRazaXVIIVIII
XVIIWillSpeaXVIIHerb
XVIIXVIIAcadEnerZouk
AcadGaliJereSantMiss
TwisWindRoswCharNouv
HousTribDeivmotiWind
DaviSonyHappStonProg
WillCapiBenjJohnXVII
DignCaveAndrCocaDavi
WaldSizeXVIIGailKath
LiquLiquLiquBarbMich
AndrFranCollLogiHave
ThisPeteVaneStraVaru
tuchkasOZONJere

vrida2
Постоянный участник

01.06.2022 10:14

URL #5

vrida2
Постоянный участник

06.11.2022 04:20

URL #6

watchesonline89
Постоянный участник

04.12.2022 14:06

URL #7

https://62e8da780bf7c.site123.me/blog/reaso...-are-so-popular
https://wakelet.com/wake/GWMJ_l3LaLVMVUbPaFWKe
https://www.vingle.net/posts/4647023
https://www.investireoggi.it/forums/members...online89.50980/
https://imgur.com/a/0WCWVRa
https://omegawatches89-95.webselfsite.net/
https://omegawatches89.gumroad.com/p/replic...ve-items-online
https://www.edocr.com/v/ay7reva1/omegawatches89/7
https://omegawatches92.mystrikingly.com/
https://blog.udn.com/omegawatches89/176264270
https://omegawatches89.seesaa.net/article/490300948.html
https://plaza.rakuten.co.jp/omegawatches89/...y/202208040002/
https://www.vingle.net/posts/4647033
https://penzu.com/p/576056fa
https://omegawatches89.simplesite.com/452938990
https://omegawatches89.simplesite.com/452939118
https://telegra.ph/Reasons-Why-You-Should-B...a-Watches-08-03

Кнопка "Транслит" перекодирует
текст из транслита в кирилицу.
Правила перекодировки здесь;
текст в квадратных скобках'[]'
не преобразуется.

Имя:

Отправка сообщений использует JavaScript операции. В вашем броузере не
установлено/отключено выполнение JavaScript программ. Используйте Netscape Navigator
или Internet Explorer (не ранее 3 версии); убедитесь, что выполнение JavaScript
программ разрешено в настройках вашего броузера.