Molbiol.ru | О проекте | Справочник | Методы | Растворы | Расчёты | Литература | Орг.вопросы Web | Фирмы | Coffee break | Картинки | Работы и услуги | Биржа труда | Zbio-wiki NG SEQUENCING · ЖИЗНЬ РАСТЕНИЙ · БИОХИМИЯ · ГОРОДСКИЕ КОМАРЫ · А.А.ЛЮБИЩЕВ · ЗООМУЗЕЙ Темы за 24 часа [ Вход* | Регистрация* ] Форум: | |
jerry-maori |
Сам я в этой теме совсем недавно, но есть твёрдое убеждение, что задача достаточно тривиальная. Правда не NCBI, не ENSEMBLE как-то не помогли. Тот же NCBI при запросе (Fas mRNA) AND "Homo sapiens"[porgn:__txid9606] выдаёт тонны всего. Я правильно понимаю, что мне нужны строки с названиями вида: Homo sapiens Fas cell surface death receptor (FAS), transcript variant 2, mRNA ? А всё остальное можно смело не принимать во внимание? Или есть какая иная база, спецом заточенная именно под сиквенсы для альтернативных мРНК? Скачал документ, где приводятся 15 баз. DMR alternative splicing databases include HS3D, ASDB, Xpro, the AEdb in ASD, and EVDB. CSA alternative splicing databases include ASTRA, ASAP, AltSplice and AltExtron in ASD, ASHESdb, EASED, ECgene, SpliceNest, ExInt, H-InvDB, MAASE, and FAST DB. Но половина из них мертва, вторая половина как-то оказалась для меня неочевидной в работе. Заранее спасибо! |
ship Постоянный участник Moscow |
|
nigoal123 IP-штамп: frXqkB4MpP2jQ гость |
The best way to help our |
nigoal123 IP-штамп: frGvfkzt/vMtQ гость |
The planning stage is |
« Предыдущая тема · Молекулярная и клеточная биология · Следующая тема » |